Entry information : AtrPrx01
Entry ID 1201
Creation 2006-08-08 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2016-03-23 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Achraf Jemmat
Last annotation changes 2016-03-23 (Achraf Jemmat)
Peroxidase information: AtrPrx01
Name AtrPrx01
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx031]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Amborellaceae Amborella
Organism Amborella trichopoda    [TaxId: 13333 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type Flower buds
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value AtrPrx01
start..stop
S start..stop
PtPrx08 481 7e-173 17..320 28..331
PtrePrx03 479 2e-172 17..320 27..330
HaPrx29 476 5e-171 18..320 23..325
VvPrx38 476 6e-171 17..318 26..327
Literature and cross-references AtrPrx01
Literature dePamphilis,C., Soltis,D., Soltis,P., Farmerie,W., Ma,H., Tanksley,S., Leebens-Mack,J., Field,D., Buzgo,M., Kim,S., Ilut,D., Landherr,L., Hu,Y., Wall,K., Albert,V., Carlson,J., Doyle,J., Frohlich,M., Miller,W., Oppenheimer,D. and Theissen,G.
unpublished (2002)
EST ref. GenBank:   CD484081 [5' end]
Cluster/Prediction ref. Broad:   18440482
Protein sequence: AtrPrx01
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   322 (303)
PWM (Da):   %s   35508.8 (33572.9)  
PI (pH):   %s   6.78 (6.60) Peptide Signal:   %s   cut: 19 range:19-321
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MRMAIMVAMV VSMRGASGEE GLVLNYYKES CPRAEEIVKE KVQELYNKHG NTAVSWLRNL FHDCMVKSCD ASLLLDSVGS VSSEKGSARS FGMRNFKYVN TIKDALEKEC PKTVSCADIV  ALSAREGALM LGGPNVPMKT GRRDSRESEV DVVEQHIPNH NDSIPFVLSR FQSIGINTEG TVALLGAHSV GRVHCKNLVG RLYPEIDPSL DPNYAIYLKG RCPSPNPDPR SVAYARNDRV 
TPMILDNEYY KNVLAHKGLL LVDQQLISHP ETAPFVEKMA SDNEYFHGRF STALLVLSEN NPLTGDQGEV RVDCRLVNKD G* 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic and 1 EST.
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAGAATGG CAATAATGGT GGCAATGGTA GTAAGTATGA GGGGGGCCTC AGGGGAGGAG GGTCTGGTGT TGAATTATTA CAAGGAGAGT TGCCCACGGG CAGAGGAAAT AGTGAAGGAG  AAGGTGCAAG AGTTGTACAA TAAGCATGGG AATACAGCCG TATCTTGGCT CAGGAACCTC TTCCACGATT GCATGGTCAA GGTAAGTGCG CAGGACCACA CTATACTCCT AGGACTCCTA  GTCTTGGGGT ATTACTATCA GTTTACTCTC TTGAGTAAAA ACCTAATGAG TGTGGTTTCT ATAAGGTTGC AACCTTAGAC AATCCAATTC AAGCGCACCT TAAAATCTAT CATAACATGT  AATTTTGTTG TAAAAAATTC TTAGTATTAT CTTAAAATCT ATTTTCGTAC CTAATTAGAA AATTTTAAAA TCCAAAAATG GTTAAAATCA AGTAGATCTA TAAATATATG AAAATCTTGA  AAATGGACGG TCTAGATAAT GTGCTGCAAG ATGCACTATT TCGAGGACTC AAAAACTTTT TTTTGTCATA TTCATACATC TCGATATCGA TATGATCGAT TAGAGGGTTT TTTCAACATT  AAAACAACAT TTCTGATAGA TTTTTGAGGT GCATCTGTGA TTCTACATTT TAAGGTTGAA ACCTTATATA AACTTTTCCC AAACCTAATA TAGGAGTAAT TTTAGTATCT CAAATTTTGG  GGATGCAACG TCTTCAGTCC GCCCATAGAC GAATCGTTAG TAAAAATAAT TTCCATATTG AACTCTTCAT TTACTAAAAC AAATAATGTC TCAAGATTGA ATAGACCGTC AATTTTTGAA  GGAAGTGATC AAAGTGTCAA AAAAAACTCA AAATTCAAGT ATTTTCTTTT GAAAATAGTT ATCTAGCGAT TATTAGCTGG TTCGCAAAAG TTCAGAGTAA AACAATCCTC CCAAGCATAT  ATTTCAACTG AGAGAGTAAA TGCACAATAA ACTCCCACTG GAGCATAGTA AATGTACTCT TATTTTATTT TAATTCTTTT AGAAGAGGGA TGTAGGTAAA TGATGGGTAG GATCAAATTG  GCTGGTGTTT AGATGAGCCA ACATAATTTT GGCAGTGGGG CAAGAATTAA ATGGAGTTTT GGTGATGGTG CAAATGAGCA TGGCTAATTC CTTGTTCCTT TCACACGATC TATATGGATC  AAACTACAAG TTGAAAATTA GGTTTATTAC GGTTTGCTGC TCATTACTTA TTTTGTTTTC TAAAATTTGT TTATTCTTCA CATATCTATT TATATTGGAA AAGGAAAACA AATCAAATTC  ATTTTTCTTT TTTTTGGGTG ATTGAGTGGG AAAGACGGAC CCTACCAGGT TTTCAAATCG TTTAGGAGTT AGTTTTTTGA AAGAGTTAGT AGGGTGGTGT CATTGGGATA TAGTTTAGGA  GTTAGGTTTT TGAAGGAGTT AGTGGGGTGG TGTTAGTGGG AATGAAAATC ACACCATGAT GGTTAGGGTG TGGGGGTGCT GCCACCACAA CCCAACCCTT TCCCAAAATA ATAACTATAA  ACCAAATTGC CATAAAAGTG CTTAATTACT GCCCCAATAC AAACCGTTTG ATGGTCAATT TTTGGTCATG AAAATATCAA GAATCAAATT ATTTATTGAT TGTATTGTAT TTTTTTCCCA  AAGCCTCAAC TGAGATCCAT TTCTTCTCGT ATCAAATGGA AGTCTATCTT CATTGAATTT GCCTTTGTAA AACAACTACT ATTTTCAAGG TTCCGTTTTG AAATTTTATT TGCAAGTGCA  AAACTTGAGC CTCAAAAAGT AGTGAACACA TAGGTAGTGC AAACGCTGCA GTGGTCCTTA AAAGCAAATC TTTTCCAGAG AGAGAAAGAG AGAGAGGGAG AGAGCTCTGT TATGAATCTT  AGGCAAGTGC TAAATCCGAA CTAACAAGGA AGTAATATGT GTGTGAATGA ATATGCAGTC ATGTGACGCT TCGCTTCTAC TGGACAGCGT GGGAAGCGTA TCATCAGAGA AAGGGTCAGC  TAGGAGCTTC GGTATGAGGA ATTTTAAATA TGTTAACACC ATCAAAGACG CCTTAGAGAA GGAGTGCCCC AAAACCGTTT CATGTGCTGA CATCGTTGCT CTTTCAGCCC GAGAAGGTGC  GCTCATGGTT AGTGCCCACT GTTGACCACC TTTCCATTTA AGATTCCAAA GATGAATATC TTTACATTCA CTCCCTTGAG AAAAACTCAT TTTAAATAGT CAGTGAGAAT AAAAGCCACA  ATGTCAATTG AGTTACAGGG AGTGCTACCA CCACAGCGTC ATACCTTTTA CCATAGAGAG ATAATAACAT GAGAAGTTTT TGTTTTTGCA GCTTGGAGGA CCTAATGTTC CTATGAAGAC  TGGGCGACGA GATAGCAGAG AAAGTGAAGT GGATGTAGTA GAACAGCACA TTCCCAATCA CAATGATAGC ATACCCTTTG TGCTCTCACG CTTCCAATCC ATTGGCATCA ACACTGAAGG  AACTGTGGCA CTCTTAGGTC ACCCTATCTT CCTTTTATTT ATCCAAGTCA ATATTTTAGG GTCACAATAG GGGCATCTCC TCTCTTTTCT CCCACCAAAC CTACTTTGAG AGTATATGTA  GGACCCTAAA TAGAGGGATG TGACCTCTTT AAAGTTCAAA CTTCAACTTT GAAACATTTT GAAATAGAAA ATGTGATTAT TGTATCATAA ATTTTGCAGG AGCACACTCT GTAGGGAGAG  TTCACTGCAA AAATTTGGTG GGGAGGCTAT ACCCTGAGAT CGATCCAAGC CTCGATCCCA ATTATGCCAT ATACCTCAAA GGCAGGTGCC CCTCACCTAA CCCTGACCCG CGTTCAGTGG  CTTATGCAAG GAATGACAGA GTTACACCGA TGATATTGGA TAATGAATAC TACAAGAATG TTCTGGCTCA CAAGGGCTTG TTGCTTGTGG ACCAGCAGTT AATCTCCCAC CCTGAGACCG  CACCTTTCGT AGAGAAGATG GCATCAGATA ATGAGTACTT CCATGGCCGA TTCTCTACTG CCCTGCTTGT GTTGTCTGAG AATAACCCCC TTACTGGAGA TCAAGGAGAG GTTAGAGTCG 
ATTGTCGCTT AGTTAACAAG GATGGCTAA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAGAATGG CAATAATGGT GGCAATGGTA GTAAGTATGA GGGGGGCCTC AGGGGAGGAG GGTCTGGTGT TGAATTATTA CAAGGAGAGT TGCCCACGGG CAGAGGAAAT AGTGAAGGAG  AAGGTGCAAG AGTTGTACAA TAAGCATGGG AATACAGCCG TATCTTGGCT CAGGAACCTC TTCCACGATT GCATGGTCAA GTCATGTGAC GCTTCGCTTC TACTGGACAG CGTGGGAAGC  GTATCATCAG AGAAAGGGTC AGCTAGGAGC TTCGGTATGA GGAATTTTAA ATATGTTAAC ACCATCAAAG ACGCCTTAGA GAAGGAGTGC CCCAAAACCG TTTCATGTGC TGACATCGTT  GCTCTTTCAG CCCGAGAAGG TGCGCTCATG CTTGGAGGAC CTAATGTTCC TATGAAGACT GGGCGACGAG ATAGCAGAGA AAGTGAAGTG GATGTAGTAG AACAGCACAT TCCCAATCAC  AATGATAGCA TACCCTTTGT GCTCTCACGC TTCCAATCCA TTGGCATCAA CACTGAAGGA ACTGTGGCAC TCTTAGGAGC ACACTCTGTA GGGAGAGTTC ACTGCAAAAA TTTGGTGGGG  AGGCTATACC CTGAGATCGA TCCAAGCCTC GATCCCAATT ATGCCATATA CCTCAAAGGC AGGTGCCCCT CACCTAACCC TGACCCGCGT TCAGTGGCTT ATGCAAGGAA TGACAGAGTT  ACACCGATGA TATTGGATAA TGAATACTAC AAGAATGTTC TGGCTCACAA GGGCTTGTTG CTTGTGGACC AGCAGTTAAT CTCCCACCCT GAGACCGCAC CTTTCGTAGA GAAGATGGCA  TCAGATAATG AGTACTTCCA TGGCCGATTC TCTACTGCCC TGCTTGTGTT GTCTGAGAAT AACCCCCTTA CTGGAGATCA AGGAGAGGTT AGAGTCGATT GTCGCTTAGT TAACAAGGAT 
GGCTAA 

Retrieve as FASTA