Entry information : LuRboh[P]217
Entry ID 12228
Creation 2013-05-29 (Qiang LI)
Last sequence changes 2013-05-30 (Qiang Li)
Sequence status theoretical translation / pseudogene
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2013-05-30 (Qiang Li)
Peroxidase information: LuRboh[P]217
Name LuRboh[P]217
Class Respiratory burst oxidase homolog     [Orthogroup: Rboh001]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Linaceae Linum
Organism Linum usitatissimum (flax)    [TaxId: 4006 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value LuRboh[P]217
start..stop
S start..stop
LuRboh[P]218 739 0 13..582 1..631
LuRboh90 582 0 1..322 37..473
PabRboh96 560 0 1..582 37..783
LuRboh[P]232 540 0 323..582 357..637
LuRboh[P]232 486 4e-166 13..322 11..267
Literature and cross-references LuRboh[P]217
DNA ref. Phytozome 11:   scaffold903 (289550..285636)
Protein sequence: LuRboh[P]217
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   581
PWM (Da):   %s   65193.53 Transmb domain:   %s   o198-217i282-301o316-335i417-434o
PI (pH):   %s   8.5
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
KSARFSDQQx xxYVEITLDL RDDSVAVSAR IRQVSQELRR DRTKSAAAHA LKGLKFISKA DGGSGWVAVE KRFDEITxDG MLPRSRFGEC IGMKESKEFA LELYDTLARV DKDADGRITE  EEVKEIITLS ASANKLSTIQ KQAEEYAALI MEELDPEHHG YILSKLLSQK LKPTLDENPI SRWLRDAKYF LLDNWQRVWV MALWIGVMAG LFAYKYVQYR NRAAYEVMGA CVCLAKGAAE  TLKLNMALIL LPVCRNTITW LRNKTKLGLA VPFDDNLNFH KVIAVAITIG VGIHGISHLA CDFPRLLDAS DEKWELMEPF FGL*VAIYPG NVLALHMSKP SGFRYKSGQY MFVNCAAVSP  FEWHPFSITS APGDDYLSVH IRTLGDWTRQ LRTVFSFPKI LIDGPYGAPA QDYKQYEVVL LVGLGIGATP MISIVKDIVN NMKFRTRRAY FYWVTREQGS FDWFKGVMNE VAELDQNQVI 
ELHNYCTSVY EEGDARSALI AMLQSLHHAK NGVDIVSGTR VKSHFAKPNW RNVFKQVAVH HPHSRVGVFY CGAPGLTKEL RNLALDFSHK TTTKFDFHKE NF 

Retrieve as FASTA  
Remarks Pseudogene from genomic. No prediction. Stop in frame. complement(join(285636..285742,286053..286362,286462..286605,287069..287165,287235..287356,287799..288278,288445..288555,288710..288757,288954..289006,289112..289262,289299..289337,289452..289508,289536..289550))
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
AAGAGCGCGA GGTTCAACAT ACCTGCTGAT CAGACTAGCT CGTCCGACCA GCAGnnnnnn nnnTATGTTG AGATCACGCT CGATCTCAGA GACGACTCGG TGGCCGTTCA CAGCGTTAAA  GCTTCCAACG GCACAGAGGA AGATCCCGAG ATGACACTTC TAGCCAAAGG CTTGGAGAAG CGGTCGGCTT CCAATCTTGG TTCCTCTGCG ATGAGAAGTG CTTCTGCTCG AATCCGTCAA  GTTTCTCAAG AGCTGAGGCG GCTCACTTCC ATTAACAAAA GGCCCACGGG TCGGCTTGAC AGGACCAAGT CGGCAGCGGC TCATGCTCTC AAGGGTCTCA AATTCATCAG TAAGGCCGAC  GGTGGTTCTG GATGGGTTGC TGTGGAGAAG AGGTTCGATG AAATCACCnn nGATGGGATG CTTCCTCGCT CTCGCTTTGG GGAATGCATT GGTATGGCAT GCATACCAAC TGTCTGACAA  GTTGTCACTA GTGAGGATTA AAGAGATCCA TGATCAACTT CTCAATTATT ATGTATATCT TCTTAATCTG TGATAGGAAT GAAGGAGTCA AAGGAATTCG CCTTGGAGTT GTATGATACT  CTCGCTAGAA AGAGAAACAT TCAGAGGGAT TCAATCACCA AGTCTGAGTT GAAGGACTTC TGGGATCAGA TTTCCAACCA GAGCTTCGAT TCCAGGCTCC AGACTTTCTT TGACATGTAC  TAAATTACCT CTTTGTGTCC CTTTTGGTTA AATTGGGAAC ACAAAGTCAA TGTTGGGTAA TTTATATTGT GAAAATTATT TCAGGGTTGA TAAAGATGCA GATGGTAGAA TTACTGAAGA  GGAAGTCAAG GAGGTATGTA TGCGCCATTG ATCATTTTGA AGGGTTGACT TGACGACTAA CGTGGTTTCT GGAGGGAATT GTGGCATGTG CTTGAGATGA GAGGAGGATT TGGTCTGAAG  ATTTCCCCTT TTTTTGTTTT AATTCTAATT AATGAATATT TTTGCAGATC ATTACCCTCA GTGCATCTGC AAACAAACTC TCGACTATCC AAAAACAAGC AGAGGAGTAT GCTGCTTTGA  TTATGGAAGA ATTGGATCCT GAACACCATG GATACATCAT GGTAATGTAG AATTTGATTT CCTTAATAGC GCCATGCATA TATAGTGTAG CAGTAGTGGT AGGTGTCCTG AATGGATCCG  TTTGATTACA AACAGATAGA GAGCTTGGAA ATGCTGTTGC TGCAAGGACC AAGCCAGTCT GTGAGAGCAG CAGACAGCAA GAACCTGAGC AAACTGTTGA GCCAGAAGCT AAAGCCGACA  CTGGATGAGA ACCCAATCAG TAGATGGTTG AGAGACGCGA AATACTTTTT GCTGGACAAC TGGCAGAGAG TTTGGGTGAT GGCTCTGTGG ATTGGGGTAA TGGCTGGCCT ATTTGCTTAT  AAGTACGTGC AATATCGCAA CAGAGCTGCA TACGAGGTCA TGGGCGCTTG TGTCTGCCTA GCTAAAGGTG CTGCTGAAAC ACTCAAACTA AATATGGCTT TGATTCTGCT TCCTGTCTGC  CGGAACACAA TCACATGGCT CAGGAATAAG ACCAAACTAG GACTTGCTGT TCCTTTTGAT GACAACCTCA ACTTTCACAA GGTGATAGCG GTGGCAATAA CAATTGGAGT AGGCATCCAT  GGCATATCCC ATTTGGCCTG TGACTTCCCT CGTCTTCTAG ATGCAAGCGA TGAGAAATGG GAACTTATGG AGCCATTTTT TGGAGACCAG CCGTCGAGCT ACTGGCATTT CGTTAAGTCA  AAGGAAGGGG TTACTGGGAT TGTGATGGTT ATTCTGATGG CGATAGCTTT CACACTTTCC ACTCCTTGGT TCAGGCGAAA CAAGCTCAAT TTGCCACTGC GGAGCCTTTA ATTTTTATTC  CCCTGCTATA TATATGGATT CCGTAATGAA ACCTGAGCAG CCTTTAATTG GGAACTCTTA CAAAATTTCA GACCTGGATG TACTTGGCTG TTCCAGTCGT TCTTTATGGC AGCGAGAGGT  TGACAAGGGC ATTGAGGTCC AGCATCAAGG CAGTTACCAT AAGGAAGGTA ATTTCATTTG TCCAACCACA CAGAGTACAA TGATACAGTA GTCCATTTAA CATCTCATTA AAGAAATACA  AAGCAGGAGA GGATGAGCAC TGAAACCCGG TTTAATTTGT GGTTATTTAT AGGTGGCAAT TTATCCTGGA AACGTGTTGG CACTTCACAT GTCAAAGCCT AGTGGGTTCA GATACAAGAG  TGGGCAGTAC ATGTTTGTGA ATTGTGCTGC AGTGTCTCCA TTTGAATGGT ATACTAATTA ATAAATGAGC CATTTTACTT TACGGTTTTC ACTGACGAAA TTGTGAATAT CCAACAGGCA  CCCATTCTCC ATCACTTCTG CTCCCGGAGA CGATTATTTG AGCGTTCACA TTAGAACACT GGGTGACTGG ACGAGGCAGC TCAGAACTGT TTTCCAAGAG GTAAAAAATT ATATATTACC  ACTGGTCAGG TTTTGTGAAG TAAGATGCAT GTTTGCCTAA TATTAGTGGG ACGACTTGGG TAATTTTGTA ATTTCGTGGT TGTCTTTTTA TAGGTGTGTC AACCACCGGC GACAGGGAAG  AGTGGACTTC TCAGGGCGGA TGGATTTCAG GGAAACAACA ATCCTGAGTA AGTTGTTTGT AATTTTGTAA GTAGCGAATG GATGATTATA ATGACATTGA CAACAGTGAT AGAGACGACT  ATTATAAGCT GGCCCTTGAA AAACAACTCA TCATTTTACG ACCATTTCAA AGAGCTTAGC TTGGGAATAT GGTGTTTGTA CACTTCGATG ATGATTATTG AAGATCGCCA TATATTAATT  ACTGCCATCA GCCAAAATAC GTGTTGCTTT CATAATAAAA ATGAAGTCTG AAGTGTGTTA TAATAATGTT AATTGGCAGT TTCCCAAAAA TATTGATCGA CGGACCATAT GGAGCTCCGG  CACAAGACTA CAAACAATAC GAAGTGGTTC TGCTAGTGGG ACTCGGGATA GGAGCCACAC CCATGATCAG CATTGTCAAG GACATAGTAA ACAACATGAA GGCCATGGAT GACTTGGAGA  ACGGCGCAAC AACTACTGCA CCCAGCGCCG GGTCGCCGCC GTCTATAAGC CAGTACTCCA ACAGTAAGAG GAAAGAACAG TTCAGGACGA GAAGGGCCTA CTTTTACTGG GTAACAAGGG  AGCAAGGCTC CTTCGACTGG TTTAAAGGTG TGATGAACGA GGTTGCTGAA CTGGATCAAA ACCAAGTGAT CGAGCTCCAT AACTACTGCA CCAGTGTGTA CGAAGAGGGA GATGCACGTT  CTGCACTCAT TGCCATGCTC CAATCCCTTC ACCACGCTAA AAACGGGGTT GACATTGTCT CGGGGACACG TGTCAAGTCC CACTTCGCTA AACCCAACTG GCGTAACGTT TTCAAGCAAG  TTGCCGTTCA CCATCCTCAT TCTCGAGTTG GTACGTACAT CACCATCATC ATCCCTCGGT TATGTTTTGT TCAAATAAAA AAGAATCATC ATCTATATAT GAAGCAATGC ACATGATGAT  AATACAAGGG CAGACAAGTA GCTAGGGATA TAATTACCCT TCTTTTAATT TAATATAGAT AACCCTTTTC GAAAATCAAT CATTTTATTT TAATTAATCT TGTAGAGTTT CAAAGTTGTT  TTGTGGGTGG ATAATAGCAA ATACTTCCAA TTAATAAGCC ACTAATTAGA TGGTTAATTA TTTATGATAG TGGTTGATTA TGATACTGCT ACTACTGCAG GGGTGTTTTA TTGTGGGGCA 
CCTGGATTGA CGAAGGAGCT CCGCAACTTG GCTCTGGATT TCTCGCATAA GACCACCACC AAGTTTGATT TCCACAAGGA GAACTTC 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
AAGAGCGCGA GGTTCTCCGA CCAGCAGnnn nnnnnnTATG TTGAGATCAC GCTCGATCTC AGAGACGACT CGGTGGCCGT TTCTGCTCGA ATCCGTCAAG TTTCTCAAGA GCTGAGGCGG  GACAGGACCA AGTCGGCAGC GGCTCATGCT CTCAAGGGTC TCAAATTCAT CAGTAAGGCC GACGGTGGTT CTGGATGGGT TGCTGTGGAG AAGAGGTTCG ATGAAATCAC CnnnGATGGG  ATGCTTCCTC GCTCTCGCTT TGGGGAATGC ATTGGAATGA AGGAGTCAAA GGAATTCGCC TTGGAGTTGT ATGATACTCT CGCTAGAGTT GATAAAGATG CAGATGGTAG AATTACTGAA  GAGGAAGTCA AGGAGATCAT TACCCTCAGT GCATCTGCAA ACAAACTCTC GACTATCCAA AAACAAGCAG AGGAGTATGC TGCTTTGATT ATGGAAGAAT TGGATCCTGA ACACCATGGA  TACATCCTGA GCAAACTGTT GAGCCAGAAG CTAAAGCCGA CACTGGATGA GAACCCAATC AGTAGATGGT TGAGAGACGC GAAATACTTT TTGCTGGACA ACTGGCAGAG AGTTTGGGTG  ATGGCTCTGT GGATTGGGGT AATGGCTGGC CTATTTGCTT ATAAGTACGT GCAATATCGC AACAGAGCTG CATACGAGGT CATGGGCGCT TGTGTCTGCC TAGCTAAAGG TGCTGCTGAA  ACACTCAAAC TAAATATGGC TTTGATTCTG CTTCCTGTCT GCCGGAACAC AATCACATGG CTCAGGAATA AGACCAAACT AGGACTTGCT GTTCCTTTTG ATGACAACCT CAACTTTCAC  AAGGTGATAG CGGTGGCAAT AACAATTGGA GTAGGCATCC ATGGCATATC CCATTTGGCC TGTGACTTCC CTCGTCTTCT AGATGCAAGC GATGAGAAAT GGGAACTTAT GGAGCCATTT  TTTGGATTAT AGGTGGCAAT TTATCCTGGA AACGTGTTGG CACTTCACAT GTCAAAGCCT AGTGGGTTCA GATACAAGAG TGGGCAGTAC ATGTTTGTGA ATTGTGCTGC AGTGTCTCCA  TTTGAATGGC ACCCATTCTC CATCACTTCT GCTCCCGGAG ACGATTATTT GAGCGTTCAC ATTAGAACAC TGGGTGACTG GACGAGGCAG CTCAGAACTG TTTTCAGTTT CCCAAAAATA  TTGATCGACG GACCATATGG AGCTCCGGCA CAAGACTACA AACAATACGA AGTGGTTCTG CTAGTGGGAC TCGGGATAGG AGCCACACCC ATGATCAGCA TTGTCAAGGA CATAGTAAAC  AACATGAAGT TCAGGACGAG AAGGGCCTAC TTTTACTGGG TAACAAGGGA GCAAGGCTCC TTCGACTGGT TTAAAGGTGT GATGAACGAG GTTGCTGAAC TGGATCAAAA CCAAGTGATC  GAGCTCCATA ACTACTGCAC CAGTGTGTAC GAAGAGGGAG ATGCACGTTC TGCACTCATT GCCATGCTCC AATCCCTTCA CCACGCTAAA AACGGGGTTG ACATTGTCTC GGGGACACGT  GTCAAGTCCC ACTTCGCTAA ACCCAACTGG CGTAACGTTT TCAAGCAAGT TGCCGTTCAC CATCCTCATT CTCGAGTTGG GGTGTTTTAT TGTGGGGCAC CTGGATTGAC GAAGGAGCTC 
CGCAACTTGG CTCTGGATTT CTCGCATAAG ACCACCACCA AGTTTGATTT CCACAAGGAG AACTTC 

Retrieve as FASTA