Entry information : LuRboh230
Entry ID 12251
Creation 2013-05-30 (Qiang LI)
Last sequence changes 2013-05-30 (Qiang Li)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2013-05-30 (Qiang Li)
Peroxidase information: LuRboh230
Name LuRboh230
Class Respiratory burst oxidase homolog    [Orthogroup: Rboh001]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Linaceae Linum
Organism Linum usitatissimum (flax)    [TaxId: 4006 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value LuRboh230
start..stop
S start..stop
LuRboh159 1709 0 1..904 1..931
PtRboh02 1501 0 2..904 7..949
PtRboh03 1499 0 2..904 7..948
LuRboh178 1498 0 1..904 1..963
Literature and cross-references LuRboh230
DNA ref. Phytozome 11:   scaffold1253 (426932..434410)
Protein sequence: LuRboh230
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   904
PWM (Da):   %s   102277.86 Transmb domain:   %s   o364-382i503-525o545-567i712-729o
PI (pH):   %s   9.86
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MRHERRGGAR SLAAKGxVPA RGATASSSSA GTSRGSSMTG EEFVEVTLDL QDDDTIILRS VEPATVINIA GGSDSEGGRE LAADRSTPAS APASRSPTIK RSSSNKLRQF SHELKVEAVA  KARQFSQELK AELRRFSWSH GLSSRNSPMH NNNNGGAATG FDSALAARAL RRQRAQLDRT RSGAQKGLCG ADFAQCIGMK DSKEFALELF DALGRRRRLK VEKISRDELY EFWSQITDDS  FDSRLQIFFD MVDKNEDGRI TEEEVKEIIM LSASANKLSR LKEQAEEYAA LIMEELDPER LGYIELWQLE TLLLQKDTYL NYSQALSYTS QALSQNLQGL RRRSPIKRMS TKLVYFLEEN  WKRIWVVSLW IMIMVGLFTW KFHQYKQKAA FKVMGYCLLT AKGAAETLKF NMALILLPVC RNTITRLRST RLAFLVPFDD NINFHKTIAT AIVIGVILHV GNHLACDFPR LEGSSLQDYN  LYLRNDFGHH KPSYWKLVRG PEGVTGILMV ICMIIAFTLA TRWFRRSLIK LPKPFDRLTG FNAFWYSHHL FVVVYILLVV HGEYLYLVHH WYKKSTWMYL SVPVLLYAGE RALRFFRSGS  HTVRLLKVAI YPGNVLTLQM SKPPQFRYKS GQYMHPFSIT SAPGDDYLSV HIRQLGDWTQ ELKRVFSEAC ERPVSGKSGL LRADETTKKS LPKLLIDGPY GAPAQDYRKY DVLLLVGLGI  GATPFISILK DLQNNIVTME EQADSLTDVN RASEQSFDAT RRKKALKTTN AYFYWVTREQ GSFDWFKGVM NEIADHDQRG VIEMHNYLTS VYEEGDARST LITMVQALNH AKNGVDVVSG 
TTVRTHFARP NWKKVLSKLS SKHCNARIGV FYCGAPVLAK ELGKLCYEFN QKGSTKFEFH KEHF 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic. No prediction. join(426932..427499,427500..427521,427665..427824,428121..428169,428958..429071,430721..431143,432361..432747,432832..433007,433120..433287,433377..433536,433632..433799,433889..434017,434116..434194,434301..434410)
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAGGCACG AGAGGCGGGG GGGAGCCCGA TCTTTGGCCG CGAAGGGCTn nGTGCCGGCA AGGGGGGCGA CGGCTAGCAG CAGCAGCGCA GGGACGTCTC GGGGGAGTTC GATGACAGGG  GAGGAGTTCG TCGAGGTCAC GCTTGATTTG CAGGACGATG ACACGATTAT CCTCCGGAGC GTCGAGCCGG CGACGGTCAT TAATATCGCC GGCGGGAGTG ATAGTGAAGG CGGAAGGGAG  TTAGCCGCAG ATCGTTCAAC TCCTGCTTCT GCTCCGGCTT CCAGATCGCC GACGATCAAG CGGAGCTCGT CAAACAAGCT GCGGCAATTC TCTCATGAGC TGAAGGTGGA GGCGGTGGCG  AAGGCGAGGC AGTTCTCTCA GGAGCTAAAA GCGGAGCTCA GAAGATTCTC CTGGAGCCAC GGACTGTCGT CTCGTAATTC GCCGATGCAC AATAATAATA ATGGCGGTGC AGCTACTGGA  TTCGATTCAG CGTTGGCTGC TCGAGCTCTG AGGAGGCAGC GAGCTCAGCT CGATCGGACC AGGTCCGGCG CTCAGAAGGG CCTTTGTGGG GCAGATTTCG CACAATGCAT AGGTTCTCCG  ATCGATTTCC CCCTTTCTCT GTCTCATCGG CTTTCCCCAA TTAGTCAAAA CATTTTAAAA ATATGCTTTT AGGTCTCAAC TACTCCTCCA ATATTTTTAT TTGGTTGCTT AGTTATTACG  TCTCTTGGAT TGAAGGGATG AAGGACTCCA AGGAGTTTGC GCTCGAACTG TTCGACGCAT TGGGGAGGAG AAGAAGGCTG AAGGTGGAGA AGATTAGCAG GGACGAGCTT TACGAGTTCT  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AGGGTTCTAC CAAGTTTGAG TTTCACAAGG AGCATTTCTA A 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
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ATGAGGCACG AGAGGCGGGG GGGAGCCCGA TCTTTGGCCG CGAAGGGCTn nGTGCCGGCA AGGGGGGCGA CGGCTAGCAG CAGCAGCGCA GGGACGTCTC GGGGGAGTTC GATGACAGGG  GAGGAGTTCG TCGAGGTCAC GCTTGATTTG CAGGACGATG ACACGATTAT CCTCCGGAGC GTCGAGCCGG CGACGGTCAT TAATATCGCC GGCGGGAGTG ATAGTGAAGG CGGAAGGGAG  TTAGCCGCAG ATCGTTCAAC TCCTGCTTCT GCTCCGGCTT CCAGATCGCC GACGATCAAG CGGAGCTCGT CAAACAAGCT GCGGCAATTC TCTCATGAGC TGAAGGTGGA GGCGGTGGCG  AAGGCGAGGC AGTTCTCTCA GGAGCTAAAA GCGGAGCTCA GAAGATTCTC CTGGAGCCAC GGACTGTCGT CTCGTAATTC GCCGATGCAC AATAATAATA ATGGCGGTGC AGCTACTGGA  TTCGATTCAG CGTTGGCTGC TCGAGCTCTG AGGAGGCAGC GAGCTCAGCT CGATCGGACC AGGTCCGGCG CTCAGAAGGG CCTTTGTGGG GCAGATTTCG CACAATGCAT AGGGATGAAG  GACTCCAAGG AGTTTGCGCT CGAACTGTTC GACGCATTGG GGAGGAGAAG AAGGCTGAAG GTGGAGAAGA TTAGCAGGGA CGAGCTTTAC GAGTTCTGGT CACAAATCAC CGATGACAGC  TTCGATTCAC GCCTCCAGAT CTTCTTCGAC ATGGTGGACA AGAATGAAGA TGGTAGAATT ACAGAGGAAG AAGTAAAAGA GATTATTATG TTAAGTGCCT CCGCAAACAA ATTATCCAGA  TTAAAGGAAC AGGCCGAGGA ATATGCAGCA CTGATCATGG AAGAGTTGGA CCCCGAAAGA CTTGGCTACA TCGAGTTATG GCAACTGGAA ACGCTTCTTC TCCAGAAGGA CACGTATCTA  AACTACAGTC AAGCACTAAG CTACACGAGC CAAGCCCTGA GCCAGAACTT GCAAGGCCTA AGAAGGCGAA GCCCAATCAA GCGGATGAGC ACAAAGTTGG TCTACTTTCT GGAAGAGAAC  TGGAAACGAA TCTGGGTGGT GTCACTATGG ATCATGATCA TGGTCGGGCT ATTCACATGG AAGTTTCATC AGTACAAGCA GAAAGCCGCT TTCAAAGTGA TGGGTTACTG TCTCCTCACG  GCAAAAGGCG CAGCGGAGAC TTTGAAGTTC AACATGGCCC TCATCCTCCT CCCAGTCTGT AGAAACACCA TCACTCGGCT CAGGTCCACG CGGCTGGCTT TTCTTGTGCC TTTCGACGAC  AACATCAACT TTCACAAGAC TATTGCGACA GCAATCGTGA TTGGTGTTAT TCTGCATGTT GGAAATCACC TCGCCTGCGA TTTTCCTAGG CTCGAGGGTT CGTCTCTGCA GGACTACAAT  CTCTACCTTA GAAACGACTT TGGACACCAT AAACCCAGTT ACTGGAAACT GGTTAGAGGG CCAGAAGGTG TCACAGGGAT TCTGATGGTG ATTTGCATGA TAATTGCTTT TACCCTGGCA  ACCCGATGGT TCAGGCGTAG CCTTATTAAA CTACCTAAAC CATTTGACAG ACTCACAGGG TTCAATGCCT TCTGGTACTC ACACCATCTA TTCGTCGTCG TCTATATCTT GCTCGTCGTC  CATGGAGAAT ACCTCTACTT GGTCCATCAC TGGTATAAAA AATCGACCTG GATGTACCTC TCTGTTCCTG TATTGTTGTA CGCTGGTGAA AGAGCTCTCA GGTTCTTCAG GTCTGGCTCC  CATACAGTCC GGCTATTGAA GGTTGCAATT TATCCTGGAA ATGTGCTCAC GTTGCAAATG TCCAAGCCTC CTCAGTTCCG GTACAAGAGC GGGCAGTACA TGCACCCATT TTCCATCACT  TCTGCTCCAG GGGATGACTA CCTTAGCGTT CACATTCGGC AGTTGGGCGA CTGGACACAA GAACTCAAAA GGGTATTTTC GGAGGCGTGT GAGCGCCCAG TTTCTGGGAA AAGCGGCCTT  CTAAGAGCTG ATGAAACCAC CAAGAAAAGT TTGCCAAAGC TGTTAATAGA TGGTCCTTAC GGTGCCCCTG CGCAAGACTA TCGGAAATAT GATGTCTTGT TACTGGTCGG TCTCGGAATA  GGGGCGACTC CTTTCATCAG CATTCTCAAA GACTTGCAAA ACAACATCGT GACGATGGAG GAGCAAGCGG ATTCACTAAC GGATGTCAAC AGAGCATCAG AACAGAGCTT TGATGCTACG  AGACGGAAAA AGGCTTTGAA GACCACTAAT GCTTACTTCT ACTGGGTAAC AAGGGAGCAA GGCTCGTTCG ATTGGTTCAA AGGCGTGATG AACGAAATAG CGGATCATGA TCAGAGGGGG  GTCATTGAGA TGCACAATTA CTTAACCAGC GTATACGAGG AAGGCGATGC CAGATCAACC CTCATTACCA TGGTCCAAGC TTTGAACCAT GCCAAGAACG GGGTGGACGT TGTCTCCGGC  ACCACTGTAC GAACCCATTT TGCGAGGCCG AACTGGAAAA AGGTTCTTTC CAAACTGAGT TCCAAGCACT GTAATGCAAG GATAGGGGTG TTCTACTGTG GAGCGCCAGT TCTGGCGAAA 
GAACTTGGGA AGCTCTGCTA CGAGTTTAAT CAAAAGGGTT CTACCAAGTT TGAGTTTCAC AAGGAGCATT TCTAA 

Retrieve as FASTA