Entry information : SsAPx-R_AU1
Entry ID 12574
Creation 2013-11-12 (Qiang Li)
Last sequence changes 2014-01-29 (Qiang Li)
Sequence status complete
Reviewer Christophe Dunand
Last annotation changes 2016-03-03 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: SsAPx-R_AU1
Name SsAPx-R_AU1
Class Ascorbate peroxidase related    [Orthogroup: APx-R001]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Zygnemophyceae Zygnemataceae Spirogyra
Organism Spirogyra sp    [TaxId: 3181 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value SsAPx-R_AU1
start..stop
S start..stop
SpraAPx-R 417 5e-147 95..356 75..337
GmAPx-R 298 2e-100 96..358 57..318
MtAPx-R 298 4e-100 96..358 53..319
LjAPx-R 294 6e-99 96..358 52..316
Literature and cross-references SsAPx-R_AU1
Literature Looking for Ancestral Class III Peroxidases in Green Lineage
Protein sequence: SsAPx-R_AU1
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   358
PWM (Da):   %s   39423.86  
PI (pH):   %s   6.78
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MALALGRFGF SSRLAGGTTA PEDGAPEGSD RALRPGGGPP TPVSPFWGIG WSRSDAGLRD DFSDGNKRIR CGPKDFIVRN SMEESKRTKC EFRLNRRSAM SISSSFLLMP FVSPFTSTSA  GITPNENEMK VKLAIRGVIS TAQAPSLLRL AFHDSGTFSV LDDSGGLNGS IIYELERPEN FGLKRSIKFL QKAKDKLDPA IPVSWSDLIA VGGVEAVRIC KGPDFFVGLG RKDTSVPDEE 
NRLPSERLNA LELKQKFKEQ GFTVQEMIVL CGSHTLGGKG FGDPITFDNS YYTVLLKKPW LLEGEMNKMI GLSTDHALMD DEECVSWIKY YAEDQNRFFE DFPTAYLKMV NNGVRWSS 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic. Sequenced by EEP in LRSV.
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCGCTCG CGCTGGGGCG CTTCGGCTTC TCTTCGCGCC TCGCGGGGGG GACGACTGCC CCCGAGGACG GCGCTCCGGA AGGGTCCGAT CGCGCCTTAC GCCCCGGGGG CGGTCCCCCG  ACTCCCGTTT CGCCGTTTTG GGGGATAGGG TGGAGCCGCT CGGACGCCGG ACTACGGGAC GACTTTTCCG ATGGAAATAA GAGGATCCGA TGCGGGCCCA AGGATTTCAT CGTTCGGAAT  TCGATGGAGG AGTCTAAAAG GACGAAATGT GAATTTCGAT TAAGTGAGGA GTTCTTGGCT GTCGTCCGGT TCTTTTTTCT CTTCATTTTT TGTCGTGTTT TTGTCCTCGT GTTTTGGCGT  TACGTGTGAA CATGGAATTG GGATTTTATT TTTAATTTTC GGATCGTTTG ATTTTCATTC ATGAACTGGC TTGTTGATGT TCTGTCTATT GTTTAGATAG GAGAAGTGCG ATGTCCATCT  CGAGTTCGTT TTTGCTAATG CCTTTCGTGT CGCCATTCAC ATCGACCTCC GCTGGAATGT ACGTCGTGTT ATTACAAAGC GTCTCTATTC GTCATTTCAT TTTTATGAAA CAAATTCAGT  GCACTTTTTG ATATCAACAT TACAGGTATT CCCATCCATT CCTTTCGTCC CCTCTCTATT TCCTTTTTCT TTTCGGCATC GAACTTAAAC GTTTTCTAGA ACTCCGAATG AAAATGAGAT  GAAAGTCAAG CTTGCGATTA GAGGAGTAAT ATCCACAGCC CAGGCTCCTT CTTTGCTCAG ACTCGCCTTT CATGACTCGG GAACATTCTC CGTACTCGAC GATTCTGGTA CTTGCTTTTG  AGTGCCGACG GGTCTGTATT GCTCCACATC TTCATGTCGA TTCATAATAA TTATACCCCC GTGACACATA AAAAATGCAA CCAGTGGACA AAATTTTTGC AACCGCGGTA CTTGAGTTGC  ATTTTTTACG AACCAATTCA ACGCAATATG ATGTCCAAAT TTCAAATGCT CGATCAATTA AATGTCACTT TTATTTATTC TTCGCTTCTC CAAAGGCCTT CCTCCGGTGG GCACTATGTT  TGGGACACCA GGAGGTCGCA AAAAAAAATG CAACCTTTAG TCCGCTAACC GCAAAAAATA TGTCCATAAA AAATGCAACT TTTACTCCCA CGGTTGCAAA ACTTTTGTCC AGTGGTTGCG  CTTTTTATGT GTCACGGCGG TGCATCTTTT CCATTCAATC CGATGGAAAT CACTCCAATC TCTCGCAGCG ATCTCCTTTC AAATGACTTG TCGAGCTTTA AATAATCCAT TGTCATTTTT  ATTGAAGAGA GAGTGATCTA CCATTCCATT ATCTACCACT ATGGCACGTA CATTCTACTT AATGTTGATC ATATCCGGAT GGAATATGAA ACCTCTTGTG ATTCTGCGAA ATCATCGTCT  TTGATTTTAA GCGTTAATCG AATTTTACCA TTCGTGATGC GTTTTTTTGT AGGAGGGTTG AACGGGTCCA TAATTTATGA ATTAGAAAGG CCAGAAAATT TTGGCTTAAA ACGTTCGATC  AAAGTTCGTT ACTTCATATT TTCACTATTC ATTCTTTGAT CATGTCATTC ATTCCATTTT ATGGTTAACA AGTGTTCGTG CCTGTATTCC AAAAATCAAG TTCGAAGCTT ATTTGTGTCT  CAGCTGCTTA ATGTACCTAG ATTACTCCTC TCCCTTTATT TCCAATTCTT TTGGAACCCC TGTTACTTAT TTCTTATTTC AGTTCATTTC TCTACCACTG TTTAGTTTTT GCAAAAAGCC  AAAGATAAAT TGGATCCCGC AATTCCAGGC AGGAGAACTA TTATTTCTCA AATAAACATT ATTCGTTCTC CCATTTTAAC TACTCTCCAT GTCTGATACC TTTCATTCAT TAACTTTTTT  TCTTCATCAT TAGTTTCGTC TTTCATCCTT CATACTCTTA ATCGTTTCCT AATTATATCT CGATCTTTAT AACTTACCTC ACATACCCTT ATTTAGTTTT CTTTTGAGCC TAATTTTCCC  TGCATTCGAC TTTCAATCAT ACAACTATGT TTCTTCGATT CATTACTGCA CAATAGTTAG CTGGAGTGAT TTGATAGCAG TGGGTGGAGT GGAAGCTGTT CGAATTTGCA AGGGCCCAGA  TTTTTTTGTT GGATTGGGTA GGAAAGATAC AAGGTACGGA GCGAGCATCC ATTTTTGAAT CCAATTTCAT GATCAAAAGC AAAAAAAAAA AAAnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nTTTCCCGCC ATTCTTTTCC TTATTGTTAC AAGCATCGAA TTTGGCATCT ACGTCATCAC CAAAAGTTGC GTCTATGAAT  TTTCTCTTTT AATCCAAACT CTATGTGCGG ATATGAACTT CACTGCATAC TCATTCGGAA CATGTATACG CGTTTGCTTG AGACGTTCAC GTTTATCCAT TGAAATTGTA TCCATGTAGT  GTCCCAGATG AAGAAAACCG GTTACCTTCG GAAAGGTTGA ATGCTTTGGA ACTTAAACAA AAATTCAAGG AACAAGGATT CACGTAAGTG CACGATCGTC ATTCAGAAAT GTCTCCAACT  GTCTTTGGAC TCGAACTAGA CAGTCTCAAG GATGCATTCA AAAATGTCAA TTGCTGCACC TCCATTTCAA TGTTTTCTTT AATTCTTTCC CCAGTAATTC CTTCATTGTC ACACGCTATA  AATTCATTGC TTGATTGAAT TTATGGTTCG TTATCAAATG CCTTCATGCA GGGTTCAAGA GATGATTGTT TTGTGTGGAT CACACACATT AGGCGGCAAA GGTTTCGGAG ATCCCATCAC  TTTTGACAAT TCCTATTACA CAGTCTTGTT GAAAAAGCCA TGGTTGTTAG GTAAACTCTG TCTGTATGGT CTCCAAGACT CGCGTTTGAT GTTGATAGCT TTTTTTCACT CCCCTTGTAC  CTTTCACATC CTCCTCAACC ACACACCTCC AATCTTTATT TTTATTATCC ATTCTTTTGT TCGCATGGCT CTCAAGAGGG TGAAATGAAT AAAATGATCG GTTTGAGTAC CGATCATGCC  TTGATGGACG ACGAAGAGTG TGTGAGGTAA ATAACTAAGA TTATTCAACC ATTCATACTC ATCCTCCTTT GGGGCATCCA AGCATCCACA CATCTCACCA ACCTCTGTCA TTTGCTCAAC  GCCATCCGAC TTGTTCAATT CCGTCCATTT CCTTGAATCC ATTCCCCGTC TGCCCCGTCC TTGTTCCTGT GGAATGCGTG TTTCCTCCTA GTTCTGAATG TCCTTACACT GCATACTTTC  ATGCTTTTAC TGCGTGTTGT TGGTGGGGGG CATTTCAAAT TTCTAGTTGG ATCAAGTACT ATGCCGAAGA CCAAAATCGA TTCTTTGAAG ATTTTCCTAC CGCCTACCTC AAAATGGTGA 
ACAATGGGGT TCGATGGAGC AGCTGA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCGCTCG CGCTGGGGCG CTTCGGCTTC TCTTCGCGCC TCGCGGGGGG GACGACTGCC CCCGAGGACG GCGCTCCGGA AGGGTCCGAT CGCGCCTTAC GCCCCGGGGG CGGTCCCCCG  ACTCCCGTTT CGCCGTTTTG GGGGATAGGG TGGAGCCGCT CGGACGCCGG ACTACGGGAC GACTTTTCCG ATGGAAATAA GAGGATCCGA TGCGGGCCCA AGGATTTCAT CGTTCGGAAT  TCGATGGAGG AGTCTAAAAG GACGAAATGT GAATTTCGAT TAAATAGGAG AAGTGCGATG TCCATCTCGA GTTCGTTTTT GCTAATGCCT TTCGTGTCGC CATTCACATC GACCTCCGCT  GGAATAACTC CGAATGAAAA TGAGATGAAA GTCAAGCTTG CGATTAGAGG AGTAATATCC ACAGCCCAGG CTCCTTCTTT GCTCAGACTC GCCTTTCATG ACTCGGGAAC ATTCTCCGTA  CTCGACGATT CTGGAGGGTT GAACGGGTCC ATAATTTATG AATTAGAAAG GCCAGAAAAT TTTGGCTTAA AACGTTCGAT CAAATTTTTG CAAAAAGCCA AAGATAAATT GGATCCCGCA  ATTCCAGTTA GCTGGAGTGA TTTGATAGCA GTGGGTGGAG TGGAAGCTGT TCGAATTTGC AAGGGCCCAG ATTTTTTTGT TGGATTGGGT AGGAAAGATA CAAGTGTCCC AGATGAAGAA  AACCGGTTAC CTTCGGAAAG GTTGAATGCT TTGGAACTTA AACAAAAATT CAAGGAACAA GGATTCACGG TTCAAGAGAT GATTGTTTTG TGTGGATCAC ACACATTAGG CGGCAAAGGT  TTCGGAGATC CCATCACTTT TGACAATTCC TATTACACAG TCTTGTTGAA AAAGCCATGG TTGTTAGAGG GTGAAATGAA TAAAATGATC GGTTTGAGTA CCGATCATGC CTTGATGGAC 
GACGAAGAGT GTGTGAGTTG GATCAAGTAC TATGCCGAAG ACCAAAATCG ATTCTTTGAA GATTTTCCTA CCGCCTACCT CAAAATGGTG AACAATGGGG TTCGATGGAG CAGCTGA 

Retrieve as FASTA