Entry information : SsKat01_AU1
Entry ID 12579
Creation 2013-11-12 (Qiang Li)
Last sequence changes 2014-03-23 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2016-03-03 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: SsKat01_AU1
Name SsKat01_AU1
Class Catalase    [Orthogroup: Kat001]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Zygnemophyceae Zygnemataceae Spirogyra
Organism Spirogyra sp    [TaxId: 3181 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value SsKat01_AU1
start..stop
S start..stop
SsKat02_AU1 900 0 1..486 1..486
PpaKat02 880 0 1..486 1..486
PpaKat01 877 0 1..484 1..484
AcvKat02 874 0 1..491 1..491
Literature and cross-references SsKat01_AU1
Literature Looking for Ancestral Class III Peroxidases in Green Lineage
Protein sequence: SsKat01_AU1
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   500
PWM (Da):   %s   57723.65  
PI (pH):   %s   6.68
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MDPYKYRPSS AYNSPYWTTN TGAPVWNNNA SLTVGTRGPI LLEDYHLVEK LAQFDRERIP ERVVHARGAS AKGFFEVTHD ISDLTCADFL RAPGVQTPLI VRFSTVIHER GSPETLRDPR  GFAIKFYTRE GNFDMVGNNI PVFFIRDGMK FPDVIHALKP NPKTHIQEGW RIADFFSNIP ESVHMFTWLL DDWGIPSDYR HMEGFGVHTF KLINKAGKET YCKFHWKPTC GVKFLLEDEA  VVVGGQNHSH ATKDLYDSIE SGNFPEWKLF IQTMDPADED KFDFDPLDDT KIWPENLFPL QPVGRMVLNK NIDNFFAENE QLAFCPGLVV PGIYYSDDKM FQTRVFSYSD TQRHRLGPNY  LMLPVNAPKC AHHNNHHEGF MNFMHRDEEV NYFPSRFDPV RHAEKYPIPS VELSGKREKI MIEKENNFAQ AGARFRSFDF ARQERFIQRF ADILLDSRVT PEIRSIWISY WAQCDADLGR 
RLAAKLDQHL NQSLAFKSAI 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic. Sequenced by EEP in LRSV.
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGATCCTT ACAAGGTGCC CCGACCGCGA ATTCCCTTTC CACTCCTGTT TCCATGCCAT GCCTCGCGAT TTTGTACGAT GCATCTTGCT GCGGAGCTTC TGCTCTCTCT ATCGATCCCT  TGGATGCCCT ACCTTCCCCG CATGATGCCC CCTTGGTTCC GTTGATTCAA GCTTTTTTCA TTCTTTCTGT GTTTGTTGTT TGTTTGCGGG TGACTGATGC GGCTTTGTAG TATCGTCCTT  CTAGCGCCTA TAACTCCCCT TACTGGACCA CGAACACCGG GGCACCCGTG TGGAACAACA ATGCCTCCCT CACCGTCGGA ACCAGAGGTT TGCTTTTCGC TCCCGCTTTT TGCTTTGTTT  TGATGAACGT TTTCCACATG TGTTTCATGG CGTGGAGTTG TCGTGGACAT GATTGACGTG TTGCCGAATT GTCTTTATGC CCCACGCAGG ACCGATTCTG CTGGAGGATT ACCACCTCGT  CGAAAAGCTC GCTCAATTCG ACCGCGAGCG CATCCCTGAG GTAAGGCTGT TGCCCTCCCT TTTCTACCCC TTTAATTGAT TTACGGTCGA AGTCGTACCC ATGGATGAGC TTCCATTCGA  GCGACTGTTA CCACATTCCT TTCTCCCTCT CCGCAGAGAG TGGTGCATGC CAGAGGGGCC AGCGCGAAAG GATTTTTTGA GGTCACTCAC GACATTTCCG ACCTCACATG CGCCGATTTC  CTGCGTGCTC CCGGAGTCCA AACTCCTCTC ATCGTCCGCT TCTCCACCGT CATCCACGAA AGAGGATCCC CCGAAACTCT GCGTGATCCC CGCGGGTTTG CGATCAAATT TTACACTCGA  GAGGGAAACT TTGACATGGT CGGCAACAAC ATTCCCGTTT TCTTCATCCG CGACGGAATG AAGGTACCGA CACGCAAATG CATTTGTCAC TCATCTAAAA CGCATTCGCT CTCACCTTGT  GCAACGAAAA TCTCCGGAAG ATTGAACATT CCACGAACTC GACCCTCTCT TCTTTCTCCT GAATATATCG CTGCCATGGA AATCAGTACA TTATTTCTTC TTTTCGTCCC CCTCCCCTCT  CAGTGTTTCT CCCATGGGCC GCATTTTGTC CAACCCATTC CTGAACTCGT CGACATAAGT TAACTCCGTG AACCAATTGT TCATTCCTTA ATAGACGTCT GCAACTTGGT TTTTCACATT  CCACCCCATC ATCTAACGCC CAAATGCACT TTTCCACTCA GTTTCCGGAT GTCATCCACG CATTGAAACC CAACCCTAAG ACCCACATCC AAGAGGGATG GAGAATCGCA GACTTTTTCT  CCAACATCCC TGAAAGTGTC CACATGTTCA CGTGGCTTTT GGACGACTGG GGTATCCCTT CTGACTACAG GCACATGGAG GGATTCGGTG TCCACACCTT CAAGGTACGC CAACGCCACC  CTCATCGCCC TTGAAACCAT CTACCGTTTC CCTGACCTTA ATACCGAGTC TCCTTCTCCT TCACATTCCG CTTGCTACTC CACCCTTTTG CTGCCTTTTA CTACTTGGTC GAAAGGAAGT  GCTTCTAAAC AGACACCACT AGTGTGCGAC GCTTAAATGA TGATAGTCAT AGCTTACTTC GAACAAACGG CATAAGCAAT CCTTTTACCT GCCCATGGAT CCTCTTGCTT CACACACACA  CACACACGAG TTGCTCTGGA TGTAGTTGAA TGGTTACTCT ACGTACCACA CTCTGCATCT TTAGTAATCT CAAGTTTTTG AAAGAAATTT TACATCCATT TTTTTTCAGC TCATCAATAA  GGCTGGAAAA GAAACCTACT GCAAGTTTCA CTGGAAACCC ACATGCGGCG TTAAATTCCT TTTGGAGGAT GAAGCCGTTG TGGTTGGAGG ACAGAACCAC AGTCATGCCA CCAAAGATTT  GTACGACTCC ATCGAATCCG GAAACTTCCC TGAATGGAAG CTCTTCATCC AAACCATGGA CCCTGCCGAT GAAGACAAGT TTGACTTTGA TCCTTTGGAT GACACCAAAA TATGGCCAGA  GAACCTGTTT CCTCTGCAAG TGAGTAAAAT GTTGCGCGGT TCATATTTGC CTCCTTTTAA ACTTCCTTCC CCCAACCTCC AATCACCCAT TCCATGATGA CTTCTTACCC TTGTCTTGCT  CTGAACTCTT TCTCCCTACC AACCTCCTAC TTTACTCAAC GACTCACCGT CAAAGATGCT ACTGGGGTAT TACACAAGTA GCCTCATAAG GAACCATTCT AAATCAGTCA TCAACAATTT  CATGCCAATC TCACCGCTAA CTACGTAATC GCAATGTTTA CTCAATGTTT TCACAGCCCG TAGGAAGAAT GGTCCTGAAC AAAAACATAG ACAACTTCTT TGCGGAAAAC GAGCAGTTGG  CGTTCTGTCC CGGCTTGGTG GTGCCCGGCA TCTACTACAG CGATGATAAA ATGTTTCAGA CTCGCGTCTT CTCATACTCC GACACACAGC GCCACCGACT TGGACCCAAC TATTTGATGC  TCCCTGTCAA CGCTCCCAAA TGCGCCCACC ACAACAACCA TCACGAGGGA TTCATGAACT TTATGCACAG AGACGAGGAG GTACAAATCC ATTCTTCTGA ATGAAGGAAA TGATTGTGTC  CTCGTTACTC GACACATACA CTCAGTTGCT TCGTTTCCCC AGACTCCAAC ACATCTGGTT GCGTGTCACG AATTTCATTT CTCTTGTCCT CGAGTCGAGC TTTCCTTAAT ACTCTAAGAC  CTCCACTTTT CCAGGTTAAC TACTTCCCTT CCCGATTCGA CCCCGTCAGA CACGCTGAGA AGTACCCCAT CCCCTCGGTT GAGCTGTCTG GAAAGAGAGA AAAGGTGAAT ACCTAAATAA  ACAATTCTTT CCATGATTTA TTCTGCAACT GACCAGTATT TCGTGCACCA ATCTTTGCCC CTTTTCGTCA CTCGAATACT CAGCCCTAAA GTTCTTTTGG CCACCCTGCT TCTCTTCTTC  TCTTCTTTAC CCATACTTAT TCAGATTATG ATTGAGAAGG AGAATAACTT CGCACAGGCT GGAGCTCGCT TCCGCTCCTT CGACTTCGCA AGGTAAATCC ATTTCTAGAT TTTTCACCCC  GTAGACGGCT GGTTCCCGAC GCTTGCACTC CAATATTTTT GTGTGTTTAT GATCCTTGCC ACCACAACCG CAAATAGCAn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnA ACAACTGGAA TGAGGAACTA CGAAATAATT CATGCTAATG CTCTTGTTCG  TCTGTTTGTT TGCTTGTTTG TTTGTTTGTT TGTTTGTTTG TTTGTTnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnT GTTTGTTTGT GTCTGCAATG AGTGTTGAGT TGATGCGGAT GTCTTTCTCG AATTCCTGAC GATACCCGTT TATTAAATTT  GGGTGTTTAA ATTTCAGACA AGAGAGATTC ATTCAGAGGT TCGCCGACAT CTTGCTCGAC AGCCGTGTCA CCCCTGAAAT CCGCAGCATC TGGATATCTT ATTGGGCCCA GGTTCGTTCA  TCATTTCCAT CGATCATCCC GTGTATCAAT CATCTGAAGC ATCCGATCCG ACCCGGAACC ATTCCCCCAA ATCCGATTTC ACCGTCACCA CCCCATTTCA TTTCCCGGTT CCCTGGCTCA 
TGAACCCCCC AAACTTGTGT GCAACCTTTG TGCAGTGCGA CGCCGATTTG GGACGCCGGT TGGCCGCCAA GCTCGACCAG CACTTGAACC AATCCCTCGC CTTCAAATCC GCCATCTAA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGATCCTT ACAAGTATCG TCCTTCTAGC GCCTATAACT CCCCTTACTG GACCACGAAC ACCGGGGCAC CCGTGTGGAA CAACAATGCC TCCCTCACCG TCGGAACCAG AGGACCGATT  CTGCTGGAGG ATTACCACCT CGTCGAAAAG CTCGCTCAAT TCGACCGCGA GCGCATCCCT GAGAGAGTGG TGCATGCCAG AGGGGCCAGC GCGAAAGGAT TTTTTGAGGT CACTCACGAC  ATTTCCGACC TCACATGCGC CGATTTCCTG CGTGCTCCCG GAGTCCAAAC TCCTCTCATC GTCCGCTTCT CCACCGTCAT CCACGAAAGA GGATCCCCCG AAACTCTGCG TGATCCCCGC  GGGTTTGCGA TCAAATTTTA CACTCGAGAG GGAAACTTTG ACATGGTCGG CAACAACATT CCCGTTTTCT TCATCCGCGA CGGAATGAAG TTTCCGGATG TCATCCACGC ATTGAAACCC  AACCCTAAGA CCCACATCCA AGAGGGATGG AGAATCGCAG ACTTTTTCTC CAACATCCCT GAAAGTGTCC ACATGTTCAC GTGGCTTTTG GACGACTGGG GTATCCCTTC TGACTACAGG  CACATGGAGG GATTCGGTGT CCACACCTTC AAGCTCATCA ATAAGGCTGG AAAAGAAACC TACTGCAAGT TTCACTGGAA ACCCACATGC GGCGTTAAAT TCCTTTTGGA GGATGAAGCC  GTTGTGGTTG GAGGACAGAA CCACAGTCAT GCCACCAAAG ATTTGTACGA CTCCATCGAA TCCGGAAACT TCCCTGAATG GAAGCTCTTC ATCCAAACCA TGGACCCTGC CGATGAAGAC  AAGTTTGACT TTGATCCTTT GGATGACACC AAAATATGGC CAGAGAACCT GTTTCCTCTG CAACCCGTAG GAAGAATGGT CCTGAACAAA AACATAGACA ACTTCTTTGC GGAAAACGAG  CAGTTGGCGT TCTGTCCCGG CTTGGTGGTG CCCGGCATCT ACTACAGCGA TGATAAAATG TTTCAGACTC GCGTCTTCTC ATACTCCGAC ACACAGCGCC ACCGACTTGG ACCCAACTAT  TTGATGCTCC CTGTCAACGC TCCCAAATGC GCCCACCACA ACAACCATCA CGAGGGATTC ATGAACTTTA TGCACAGAGA CGAGGAGGTT AACTACTTCC CTTCCCGATT CGACCCCGTC  AGACACGCTG AGAAGTACCC CATCCCCTCG GTTGAGCTGT CTGGAAAGAG AGAAAAGATT ATGATTGAGA AGGAGAATAA CTTCGCACAG GCTGGAGCTC GCTTCCGCTC CTTCGACTTC  GCAAGACAAG AGAGATTCAT TCAGAGGTTC GCCGACATCT TGCTCGACAG CCGTGTCACC CCTGAAATCC GCAGCATCTG GATATCTTAT TGGGCCCAGT GCGACGCCGA TTTGGGACGC 
CGGTTGGCCG CCAAGCTCGA CCAGCACTTG AACCAATCCC TCGCCTTCAA ATCCGCCATC TAA 

Retrieve as FASTA