Entry information : SsKat02_AU1
Entry ID 12580
Creation 2013-11-12 (Qiang Li)
Last sequence changes 2013-11-12 (Qiang Li)
Sequence status complete
Reviewer Christophe Dunand
Last annotation changes 2016-03-03 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: SsKat02_AU1
Name SsKat02_AU1
Class Catalase    [Orthogroup: Kat001]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Zygnemophyceae Zygnemataceae Spirogyra
Organism Spirogyra sp    [TaxId: 3181 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value SsKat02_AU1
start..stop
S start..stop
SsKat01_AU1 900 0 1..486 1..486
PpaKat01 893 0 1..492 1..492
PpaKat02 883 0 1..492 1..492
PsyKat01 852 0 1..492 1..492
Literature and cross-references SsKat02_AU1
Literature Looking for Ancestral Class III Peroxidases in Green Lineage
Protein sequence: SsKat02_AU1
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   492
PWM (Da):   %s   56975.15  
PI (pH):   %s   7.01
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MDPYKYRPSS AYDSPYWTTN QGAPVWNNNS SLTLGSRGPV LLEDYHLVEK LAQFDRERIP ERVVHARGTS AKGFFEVTHD ISHLTCADFL RSPGVQTPLI VRFSTVIHER GSPETLRDPR  GFAVKFYTRE GNFDMVGNNI PVFFIRDGIK FPDVIHALKP NPKTHLQEEW RIADFFSNIP ESCHMFTFVF DDWGIPSDYR HMEGFGVHTF KLINKAGKET YCKFHWKPTC GLKFLLEDEA  VIVGGQNHSH ATKDLYDNIA AGNFPEWKLY IQTMDPADED KYDFDPLDDT KIWPENLFPL QPVGRMILNR NVDNFFGENE QLAFCPGVIV PGIYYTDDKM FLTRVFSYSD TQRYRLGPNY  LMLPVNSPKC AHHNNHHEGF MNFMHREEEV NYFPSRFDPV RHAEVSPLTE QSYSGKREKA IIHKENNFSQ PGARFRSWPP DRQDRFIHRI AKLLSHPRVT PEIRSIWLSY WSQCDQGLAQ 
KLNSKISMMA AL 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic. Sequenced by EEP in LRSV.
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGATCCCT ACAAGGTGCG GTACTCGATC AAAGACGGAA TATGAGTTTT GTGCTTGAAG TTCCTTTGTT GAGATCTGTG TTTCTTATAT GCACTTTCTA GTCTTTAATT TGTAGATTCT  ATTTTATGTT TTTTGATTCA GTATCGTCCG TCTAGCGCGT ATGATTCTCC TTATTGGACT ACAAATCAAG GAGCGCCTGT TTGGAATAAC AATTCTTCAT TGACTCTTGG CTCCAGAGGT  ACGCCGATTA CTTAAGGAAA CATTGTAAAA AGCTACTGAA CAGTTCGATC TTTTTGAATT GGGATTCGCG TTTTGCTGAT CCATAATTTT TCTAAAAAAC TATATTTTTA TGCAGGTCCT  GTCCTCCTCG AAGATTATCA CTTGGTGGAA AAGCTTGCTC AGTTTGACAG AGAGAGGATT CCGGAGGTAA CCGAATAATA TATCACGCAC AAAGTTTTAT AAAACTAATT TTTCTAATAT  TTAATAATTT TTTCATAGCG AGTTGTCCAT GCAAGAGGAA CAAGTGCAAA GGGGTTTTTC GAAGTCACAC ATGACATCTC GCATCTCACC TGCGCCGATT TCCTGCGCTC TCCCGGAGTT  CAAACTCCTC TCATCGTCCG CTTCTCCACT GTTATACACG AGAGAGGATC TCCCGAAACA TTGCGCGATC CCCGAGGATT TGCAGTCAAG TTTTATACCC GTGAAGGCAA TTTTGACATG  GTGGGGAATA ACATTCCTGT ATTTTTTATT CGTGATGGCA TTAAGGTAAT CTAATTATTT AATTAATGAT AGAATATATT TTACATAAAG GAAGTTTAAT AGTTGATTTA TTTCATTATA  ATCCATTATT CATTCCTAAA TTCTTTGTGC AGTTTCCGGA TGTCATTCAC GCCCTAAAAC CCAACCCCAA GACTCACCTG CAAGAGGAAT GGAGAATTGC AGATTTTTTT TCTAACATTC  CAGAAAGTTG TCACATGTTT ACTTTTGTGT TCGATGATTG GGGAATCCCA TCCGATTATC GGCACATGGA AGGATTCGGC GTTCATACAT TCAAGGTGTG AATTCCTTCA CGTTATTCAG  TTATGAAAGT CAATATTATC TTGTTCGATT GCATTTACTA ACCAAAAGTT TAGTTTCCCT TAATGGCATT GATTCCAATT TAAAGTATCG TTTGTTTATT TATTTTTAGC TGATCAACAA  GGCTGGAAAG GAAACCTATT GCAAATTCCA TTGGAAACCC ACATGTGGAC TCAAATTTTT ATTAGAAGAT GAAGCGGTGA TTGTAGGTGG TCAAAACCAC AGTCATGCAA CCAAAGATCT  GTATGATAAC ATAGCAGCTG GAAACTTTCC GGAATGGAAA CTTTATATAC AAACCATGGA TCCTGCAGAT GAAGATAAGT ATGACTTTGA TCCGTTGGAT GATACCAAAA TATGGCCTGA  AAACCTCTTC CCTCTTCAGG TTTGAATTAT TTGTTTTAAC AACGTAATAT TCTAGCATCC TTAACCCTTC CATATCACTG TTCATATTTC GCATTGTACA AACAATCTTA CCCATACTTT  CCTGCCATGA TACCTTGTTA CATCCTAATA TGTTCTGCTT TCTATTCATT GTATTACAGC CTGTGGGAAG AATGATACTA AATCGTAACG TGGATAATTT CTTTGGTGAA AATGAGCAGT  TGGCATTTTG CCCAGGAGTC ATCGTTCCTG GGATCTATTA CACTGATGAT AAAATGTTTT TGACTCGTGT ATTCTCGTAT TCTGATACCC AGCGCTATCG TTTGGGTCCA AATTATTTGA  TGTTGCCAGT AAACTCTCCG AAGTGTGCTC ATCATAACAA TCACCATGAA GGATTCATGA ACTTCATGCA CAGAGAAGAG GAGGTTAAGA TTATATTCAT TTTGGGGTTA TTGAATCAAC  TGTTAGCGAC TGAATATGTG ATTATTACTG AATCTCGATT AAATTATTTT TAGGTCAACT ATTTTCCTTC AAGATTTGAT CCAGTTCGAC ATGCTGAAGT CTCACCATTG ACTGAACAGA  GTTATTCAGG AAAACGTGAA AAGGTAAATG CATTTTTTAA ATTTCGTTCT TTATTTTCTA TTTATATTCT TTGCCGTTTC TCAATTATGA AACTCTTCTT CATTACATTC TTCAGGCTAT  AATTCATAAA GAAAATAATT TTTCTCAGCC TGGAGCACGT TTTCGTTCTT GGCCTCCGGA TAGGTGAATT TTTTCTATGT TTGTCCGACT GTAAAGTTTC GTCGTCATCT CGATAAGCAG  TACCATATAT TCTGATGACT GTTTTACTTT GCTTTCCAAA TGCATAACCC AATATTCTTT CTGATTTGTT TGAGTGAATG TCTATTGGAT TCAGACAAGA CCGATTCATT CATCGAATTG  CTAAATTGCT ATCTCATCCT CGTGTGACTC CCGAAATCAG GAGCATTTGG CTGTCTTACT GGTCGCAAGT AATGTCTTTA CGATTCACAT TCATATATGT TTGTTTTTTG CACAAGTGTT  TGCACCAAAG ATAAGTATGC AACTTGTAAA TTCATGATTA TTCATTCGTT TATTTCTTGT CCATCGTTAC CCCGTTATTC CAGTGTGATC AAGGGCTGGC ACAGAAGCTG AACTCGAAGA 
TTAGTATGAT GGCCGCATTG TAGA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGATCCCT ACAAGTATCG TCCGTCTAGC GCGTATGATT CTCCTTATTG GACTACAAAT CAAGGAGCGC CTGTTTGGAA TAACAATTCT TCATTGACTC TTGGCTCCAG AGGTCCTGTC  CTCCTCGAAG ATTATCACTT GGTGGAAAAG CTTGCTCAGT TTGACAGAGA GAGGATTCCG GAGCGAGTTG TCCATGCAAG AGGAACAAGT GCAAAGGGGT TTTTCGAAGT CACACATGAC  ATCTCGCATC TCACCTGCGC CGATTTCCTG CGCTCTCCCG GAGTTCAAAC TCCTCTCATC GTCCGCTTCT CCACTGTTAT ACACGAGAGA GGATCTCCCG AAACATTGCG CGATCCCCGA  GGATTTGCAG TCAAGTTTTA TACCCGTGAA GGCAATTTTG ACATGGTGGG GAATAACATT CCTGTATTTT TTATTCGTGA TGGCATTAAG TTTCCGGATG TCATTCACGC CCTAAAACCC  AACCCCAAGA CTCACCTGCA AGAGGAATGG AGAATTGCAG ATTTTTTTTC TAACATTCCA GAAAGTTGTC ACATGTTTAC TTTTGTGTTC GATGATTGGG GAATCCCATC CGATTATCGG  CACATGGAAG GATTCGGCGT TCATACATTC AAGCTGATCA ACAAGGCTGG AAAGGAAACC TATTGCAAAT TCCATTGGAA ACCCACATGT GGACTCAAAT TTTTATTAGA AGATGAAGCG  GTGATTGTAG GTGGTCAAAA CCACAGTCAT GCAACCAAAG ATCTGTATGA TAACATAGCA GCTGGAAACT TTCCGGAATG GAAACTTTAT ATACAAACCA TGGATCCTGC AGATGAAGAT  AAGTATGACT TTGATCCGTT GGATGATACC AAAATATGGC CTGAAAACCT CTTCCCTCTT CAGCCTGTGG GAAGAATGAT ACTAAATCGT AACGTGGATA ATTTCTTTGG TGAAAATGAG  CAGTTGGCAT TTTGCCCAGG AGTCATCGTT CCTGGGATCT ATTACACTGA TGATAAAATG TTTTTGACTC GTGTATTCTC GTATTCTGAT ACCCAGCGCT ATCGTTTGGG TCCAAATTAT  TTGATGTTGC CAGTAAACTC TCCGAAGTGT GCTCATCATA ACAATCACCA TGAAGGATTC ATGAACTTCA TGCACAGAGA AGAGGAGGTC AACTATTTTC CTTCAAGATT TGATCCAGTT  CGACATGCTG AAGTCTCACC ATTGACTGAA CAGAGTTATT CAGGAAAACG TGAAAAGGCT ATAATTCATA AAGAAAATAA TTTTTCTCAG CCTGGAGCAC GTTTTCGTTC TTGGCCTCCG  GATAGACAAG ACCGATTCAT TCATCGAATT GCTAAATTGC TATCTCATCC TCGTGTGACT CCCGAAATCA GGAGCATTTG GCTGTCTTAC TGGTCGCAAT GTGATCAAGG GCTGGCACAG 
AAGCTGAACT CGAAGATTAG TATGATGGCC GCATTGTAG 

Retrieve as FASTA