Entry information : PabPrx102 (MA_132958g0020)
Entry ID 12644
Creation 2013-12-19 (Qiang Li)
Last sequence changes 2017-06-08 (Justine Latour)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2017-06-08 (Justine Latour)
Peroxidase information: PabPrx102 (MA_132958g0020)
Name (synonym) PabPrx102 (MA_132958g0020)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx034]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Pinaceae Picea
Organism Picea abies (Norway spruce)    [TaxId: 3329 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value PabPrx102
start..stop
S start..stop
GbPrx28 488 4e-176 39..325 1..287
CroPrx51 409 4e-144 23..322 47..349
MguPrx13 409 4e-144 23..322 42..344
AcoPrx14 405 2e-142 24..323 43..345
Literature and cross-references PabPrx102 (MA_132958g0020)
Protein sequence: PabPrx102 (MA_132958g0020)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   326 (304)
PWM (Da):   %s   35628.23 (33072.8)  
PI (pH):   %s   8.75 (8.54) Peptide Signal:   %s   cut: 23 range:23-326
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MGVRILRYLI IVWAVCIRIT DAQLSENFYS KTCPNVEGLV LAVARQKLAE APVSAPATIR LLFHDCFVDG CDASVLISST PKYLAERDAD DNKNLAVDAF DAVNQAKAAV EAKCPGVVSC  ADILAIAARD FIALTGGPNY PVKKGRKDGR TSLASRVRGN LPEPTFNVDL LLKTFGSKGL NRSDMVALSG AHTIGFSHCD GFLDRLYNYR RTNLADPSMD PRLLKALKMS CPKTGGNADI 
ITPFDVNTPF AFDNTYYKNL ELKMGLLGTD QALFSDPRTK YLVQYFANYR TQFFQAFSLA MDKMSSIGVK TGNQGEIRKV CTQVNV 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic. Correct prediction.
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGGCGTGA GAATACTTAG GTATTTGATC ATTGTTTGGG CTGTTTGTAT TAGAATTACA GATGCTCAAC TCAGTGAGAA TTTTTACTCA AAGACTTGTC CCAATGTGGA GGGCTTAGTG  TTGGCTGTAG CTAGGCAGAA GCTTGCAGAG GCACCTGTGT CAGCCCCAGC CACTATCAGG CTGCTCTTCC ATGACTGTTT TGTTGATGTA TGATCATACT CTTTCTCTTT TCTAAAATAC  ATGTGTAGGA TTAAGCTACA AGATGGTGGT GTATGAATTG ATTCACTGTA ATTAAGTTTG ATGGGTATTA TGAGACTATT GCTTGATCAA ATCCCTTTGT GGGTGGATTG ATTCACTGTA  AGAGAATATG CAGACACTTC CAAGTGATGT TTTATGGGCA TTGATATTTA TTGTATTATG TTTTTGGAGT AAGGATTAAT GTGCTTGATG TAATGTTTAA ATACAGGGTT GTGATGCATC  AGTGCTGATT TCTTCCACTC CAAAGTACCT GGCTGAAAGA GATGCTGATG ATAACAAAAA TTTGGCTGTT GATGCCTTTG ATGCTGTCAA CCAGGCTAAA GCAGCTGTAG AGGCCAAGTG  TCCTGGTGTT GTCTCTTGTG CTGATATTCT AGCCATAGCA GCTAGGGATT TTATTGCTTT GGTGAGTGAA TTTTGAAGTT GGTCTCTGCA ACCTATTTCA AATTCTGAGA GCTAGATTAA  TTTGTTGAAG TTGAATGATG GTATCTAGAA AAAAAAATGA TGGTATCTAG AAAAAAAACC AATACTTTGG AGGCCAGTCA TTCACTTGGC TTTGAGATTA TATCACTCAT TCATTTGGCT  TTGAGATTAT ATTCTTCAGT ACTCTTGTCT TGCTAGTCAT ATATACTGTA CAGAACTGAT CACTGTTTTT GGTTGCTGAC ATATGCATGC TCACACATAT ATAGACGGGA GGTCCTAACT  ATCCAGTGAA GAAAGGCAGA AAAGACGGAA GAACTTCTCT TGCAAGTCGG GTTAGAGGCA ATCTCCCTGA ACCCACTTTC AATGTCGATC TATTGTTAAA AACCTTTGGA TCAAAGGGCT  TAAACAGATC AGACATGGTA GCTCTATCTG GTGAGCAAAT TTTCCGGAAC ACCCTCATCG TTTATTTCTT CGTTCATGGA TGAAAAATTC AATGAAATTT AATAAAGGTC TATAATTCAA  TGTATCTGGG CAAAGCCAAG TCGGGTTCAG AGAGAATTTT AGAAGGTGTT CACTTATCAC ATGGTAGAAA ACTTGCCATA CTTTTAATTA TACAGGAAAT GTTGATTAGG TATTCACATG  TCAAACAGTT GCCTATAATG ATCCGAACAA CAGGCTTGTT TTCCACGTCT TCCAAGTCTA CTATTTTCTA CTGTACTCAT TTTGCTCCAC TTTTTTATAT TTTGGCCTAG ATTCTAATAA  TTGAAAACGC ATCATCAAAT CGTTGATAAT GATTAATGTA ATGTTACAGC AGCTACAGCT ACTTGGTAGC ATAGTAGTTG TAGGGTTGGT CGTCAGTATT CATCTTGTTA TGTAGTATTG  AATGTTTTTT TAGTCTTGTT TGTTCAATCT GAATTGTTTG ATGATTTTGA TTGGATTGAA TTATAATTAC TATTTATAAA TTCAAAATTA GTTTGAGTAA TATATAAATT TTAAAATATT  TGAATTGTTA ATAAAACATT CAGGTTTCAT CATTGATTTG ATTGATATAA AAGATATTTT TAATAAAACA TTCAGTTATA ATGATTGATT GATTATGGTG TAATTCAAAA TTAGTTTAAG  TAACTTATAA GGGATATTTG AAGTCAAGAC ATTCATGCCT CATGATTGAT TGATTATGGT GTAATTAGTA TTGCTTTTTG TTTGGTCATA TATAATATAA TATGTTTCCT TGATGATTAC  ACTTATTTGT GAAGCCTTCT CTTCTCTCTT CAATTTTGTT ACATCTTGAA ATAGTTTATA AAATCATGAA ATTTCATTTT AATGTTGATA TGATAAAAAA TCTTAATTTC ATTTTAATGT  TGATATTAAT TTTTTTTTAT GTTGTATATA AATGGATTAT CATTTTAATG TATTTATTGA TTAAGATAGA ATATCGTCAT ATAAACAAAA TTAAAAATAA TTTAAGTTTA ATTTTTTCAT  TAAATTAGAA TTCTGTAATT TTTTTTTATA GTGAAAAAAC TTATTATAAT TTAGTTGTCA ATAGACTTTG TAATCATAAT TGACTTTACT GATTATTGTC AGTAAGAAGA GAATGATAAA  ATTAATTTCC CAAAAAAGCT TAACTAAATT CATCAACCAA ATTAATTGAA ATAGACATGG ATAAGACAGT TTCATTCCAT ATTTTCCAAT ACTGTGTACA ACTTATCAGT TAACTATTCA  CTGCAGGAGC TCACACCATC GGTTTCTCTC ACTGCGACGG ATTCTTAGAC CGATTATACA ACTACCGCAG AACAAATCTG GCAGACCCTT CCATGGACCC AAGGCTTCTG AAAGCTCTGA  AGATGTCCTG TCCTAAAACG GGTGGCAATG CAGACATTAT CACGCCATTC GATGTGAACA CTCCATTTGC ATTCGACAAC ACGTACTACA AAAATCTGGA GCTTAAAATG GGGCTCCTTG  GAACCGACCA AGCTCTCTTT TCAGACCCAC GTACGAAATA CCTCGTCCAA TACTTCGCCA ACTACAGAAC CCAATTCTTC CAAGCTTTCT CTCTGGCCAT GGACAAGATG AGCAGCATTG 
GTGTGAAGAC AGGAAACCAG GGCGAAATCA GAAAAGTCTG TACTCAAGTC AACGTTTAG 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGGCGTGA GAATACTTAG GTATTTGATC ATTGTTTGGG CTGTTTGTAT TAGAATTACA GATGCTCAAC TCAGTGAGAA TTTTTACTCA AAGACTTGTC CCAATGTGGA GGGCTTAGTG  TTGGCTGTAG CTAGGCAGAA GCTTGCAGAG GCACCTGTGT CAGCCCCAGC CACTATCAGG CTGCTCTTCC ATGACTGTTT TGTTGATGGT TGTGATGCAT CAGTGCTGAT TTCTTCCACT  CCAAAGTACC TGGCTGAAAG AGATGCTGAT GATAACAAAA ATTTGGCTGT TGATGCCTTT GATGCTGTCA ACCAGGCTAA AGCAGCTGTA GAGGCCAAGT GTCCTGGTGT TGTCTCTTGT  GCTGATATTC TAGCCATAGC AGCTAGGGAT TTTATTGCTT TGACGGGAGG TCCTAACTAT CCAGTGAAGA AAGGCAGAAA AGACGGAAGA ACTTCTCTTG CAAGTCGGGT TAGAGGCAAT  CTCCCTGAAC CCACTTTCAA TGTCGATCTA TTGTTAAAAA CCTTTGGATC AAAGGGCTTA AACAGATCAG ACATGGTAGC TCTATCTGGA GCTCACACCA TCGGTTTCTC TCACTGCGAC  GGATTCTTAG ACCGATTATA CAACTACCGC AGAACAAATC TGGCAGACCC TTCCATGGAC CCAAGGCTTC TGAAAGCTCT GAAGATGTCC TGTCCTAAAA CGGGTGGCAA TGCAGACATT  ATCACGCCAT TCGATGTGAA CACTCCATTT GCATTCGACA ACACGTACTA CAAAAATCTG GAGCTTAAAA TGGGGCTCCT TGGAACCGAC CAAGCTCTCT TTTCAGACCC ACGTACGAAA  TACCTCGTCC AATACTTCGC CAACTACAGA ACCCAATTCT TCCAAGCTTT CTCTCTGGCC ATGGACAAGA TGAGCAGCAT TGGTGTGAAG ACAGGAAACC AGGGCGAAAT CAGAAAAGTC 
TGTACTCAAG TCAACGTTTA G 

Retrieve as FASTA