Entry information : PabPrx104(PAB00022853/ MA_13722g0010)
Entry ID 12646
Creation 2013-12-19 (Qiang Li)
Last sequence changes 2015-03-18 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2021-02-12 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: PabPrx104(PAB00022853/ MA_13722g0010)
Name PabPrx104(PAB00022853/ MA_13722g0010)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx011]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Pinaceae Picea
Organism Picea abies (Norway spruce)    [TaxId: 3329 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value PabPrx104
start..stop
S start..stop
PtaPrx132 569 0 2..334 1..333
PgPrx06 559 0 2..334 1..333
PabPrx93 559 0 2..334 1..333
PsiPrx02 556 0 2..334 1..333
Literature and cross-references PabPrx104(PAB00022853/ MA_13722g0010)
Protein sequence: PabPrx104(PAB00022853/ MA_13722g0010)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   334 (300)
PWM (Da):   %s   36562.53 (33118.7)  
PI (pH):   %s   8.69 (8.20) Peptide Signal:   %s   cut: 33 range:33-332
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MMGPKKSAMK PLQLVGLVIC VMLGQCVSKG SAQLREKFYA ATCPNVEYIV KKAVTKKFEN TFVTAPATLR LFFHDCFVEG CDASVIIQST PNNTAEKDFP DNLSLAGDGF DTVIKAKQAV  EEVCPNTVSC ADILTMATRD VVALTGGPQF NVELGRRDGL ISQASRVNGN LPKASNTLNQ LNYLFLKKGL RQADMIALSG AHTLGVSHCN KFANRIYDFS PRGSVDPILD PFYATQLQQM 
CPRNVDPTIV INMDPITPRQ FDNAYYKDLQ SGKGLFSSDQ FLFTDLRSRS TVNTFAESSV AFNTAFVNAM IKLGRVGVKT GREGEIRRDC SRFN 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic. Incorrect prediction (several frame shift, repeated and extra sequences).
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGATGGGCC CAAAGAAATC TGCCATGAAG CCATTGCAGT TGGTTGGCTT GGTCATTTGT GTCATGTTGG GACAGTGTGT AAGCAAAGGA TCAGCTCAGC TTCGCGAGAA ATTTTATGCA  GCAACTTGCC CCAATGTTGA ATACATTGTA AAGAAGGCTG TCACTAAGAA GTTTGAGAAC ACGTTTGTAA CAGCTCCTGC CACACTGCGG CTCTTCTTCC ATGACTGCTT CGTTGAGGTA  AGGGATATAT ATAGCATGGA GATATGTTCA AAGAATGAAT CTGTGTTTTT GTTATTTAAT TGAAAAATAA TTCCTCTATG ATTGTGTAGG TTTTTACAGT TGGTTGGTCA TATTGTGAAC  TTAAATTTTT GGGAAGTAAA CTGTGTAGAA AGTTTTGAAA TGTTTCAAAA CTTTTAACCT ATTTTACTTT CAGAAAGTTT AAGTTCAATA TGATTAACTG TGAAAAAACC TACCCAATTA  AAGAGGAATT TACACACATT TATATTGAAT TTAAATTTTT AGAAGTTTTG TGGAAGTAAA TTATGTAGGA AGTTTTGAAA TGTTTCAAAA CTTTTTACAC AATTTATTTC CAGAAAATTT  AGGTTAAGTT CAATATGAAT TTATTTGTTT TGTAAGACTT AGGCTAGGCT GTTTTCTAAG ATTTAACTCA TTATTGAGGT TATTATGATT ATTAATAATA ATTTTAATGA GGTATACATA  CCTTACTTTT CTGTATTTGA AATTTGTGAT TTTTTTAGGA GAAAATACAT ATTCTTAATC ATTAAGTTCA CTGAACTAAT AATATATAGA GTTGAACAAT ATCATTTACA AAATTATGAA  TATCTAATTG AGAGGTGAAC TCTTCTAATT TTGCATTTGG GTCGGCACAG GGATGTGATG CTTCTGTGAT CATTCAGTCT ACTCCAAACA ACACAGCTGA GAAAGATTTT CCTGACAACT  TGTCACTAGC TGGTGATGGA TTTGATACTG TAATTAAGGC CAAGCAAGCT GTAGAAGAAG TGTGCCCCAA TACGGTGTCT TGTGCTGATA TCCTAACCAT GGCTACTAGA GATGTTGTGG  CATTGGTAAG TGGATCCCCT TTCTCAGACG GCTTGCCTTC TTTTCAGCAT AAGCATAGAG GAATTAATAA TCTTTCAGCT AGATGCTAAG CAGTTAATCC ATACAAATTA GAAAGCAGCA  TGTGTGGACT TTCCATAAAG CATTGGTTCC ATAAAGGGTT ACGTCTTGTA GTATTCTATG ATCAGTAATT TTAAGACTAC TATCTGGTTT AGTAATTTTA AGAGTGCTAT CTATGATTAG  TTCTATCAAA AGTTGAGTCA CTAATTGTGT TTTGTTCTTC TCTAATTTGC AGACTGGAGG CCCACAATTT AATGTGGAGT TAGGGCGACG AGATGGGCTG ATATCCCAAG CCTCCAGAGT  TAATGGAAAC CTGCCAAAGG CTTCAAACAC TCTTAACCAA CTGAACTATC TATTTTTGAA GAAGGGATTA CGTCAGGCAG ACATGATAGC TCTATCTGGT AGTCAACTGC ACTTCTTACA  TTCCCAATTG CATATTAGAC TGGTCACTCA TCTACTCCTA CTCCCATTAG TTAAATCCTA CATACAGAGA CAATATTGTT TCTTACATCA TATCTTATAT ATAGATCACC ATATCTTCAT  AACTTACTGC GCATCTCCGA ACTAACGAGG AGTACGTCAG ACAGAATGCA TTCTCTCTGT CTATTGCCGA TTGTTCTTTT GTTGTGGATT GCAAGATGAA AATGGTTTCT CTGTTCTTGT  CCGATTCGAT TCCCACAAAA AACCAAATTG TTTTAGCCAA GGAGGATTGA TGGCGAGAAC TGTGTACTTT TATTCCAAGT TCTGTATCAT AATCAGTTTG AAAGACCTGG TGATCCAAAT  GCAACTAAGT GAAGAAATTT TCAACCGTTT TTAAATACTT AGGTGTGAAC ATTATCATCA AGAACCCCAG ACTGGTACTA TTTGCCTCGC CTAAGGCCTC CATTAACATA GATCAATGCT  GATTGTAACT TTCGTTTTTT AAAGAAAAAT AAATAATAAC TATTACAATT GGTAGTACTG ATCAAATATA ATTTTAATAA CCTGTTCCTT GGTGTTTTAC AGGAGCCCAC ACATTAGGAG  TTTCTCACTG CAACAAATTT GCAAACAGAA TTTACGATTT CAGTCCTCGT GGATCCGTGG ACCCAATTCT GGATCCTTTC TACGCCACCC AACTCCAACA GGTGGATCCG TGGACCCAAT  TCTGGATCCT TTCTACGCCA CCCAACTCCA ACAGATGTGC CCGAGAAACG TGGATCCGAC CATTGTGATC AACATGGACC CCATAACTCC TCGTCAATTC GATAACGCCT ATTACAAGGA  TTTGCAGTCA GGAAAGGGAC TATTCTCATC TGATCAGTTT CTGTTCACAG ACCTACGCTC ACGGAGCACA GTGAACACAT TTGCAGAAAG TTCAGTTGCG TTTAATACGG CATTTGTGAA 
CGCCATGATT AAATTGGGTC GTGTGGGTGT TAAGACGGGA AGAGAGGGCG AGATCAGACG AGATTGCAGC CGCTTTAATT GA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGATGGGCC CAAAGAAATC TGCCATGAAG CCATTGCAGT TGGTTGGCTT GGTCATTTGT GTCATGTTGG GACAGTGTGT AAGCAAAGGA TCAGCTCAGC TTCGCGAGAA ATTTTATGCA  GCAACTTGCC CCAATGTTGA ATACATTGTA AAGAAGGCTG TCACTAAGAA GTTTGAGAAC ACGTTTGTAA CAGCTCCTGC CACACTGCGG CTCTTCTTCC ATGACTGCTT CGTTGAGGGA  TGTGATGCTT CTGTGATCAT TCAGTCTACT CCAAACAACA CAGCTGAGAA AGATTTTCCT GACAACTTGT CACTAGCTGG TGATGGATTT GATACTGTAA TTAAGGCCAA GCAAGCTGTA  GAAGAAGTGT GCCCCAATAC GGTGTCTTGT GCTGATATCC TAACCATGGC TACTAGAGAT GTTGTGGCAT TGACTGGAGG CCCACAATTT AATGTGGAGT TAGGGCGACG AGATGGGCTG  ATATCCCAAG CCTCCAGAGT TAATGGAAAC CTGCCAAAGG CTTCAAACAC TCTTAACCAA CTGAACTATC TATTTTTGAA GAAGGGATTA CGTCAGGCAG ACATGATAGC TCTATCTGGA  GCCCACACAT TAGGAGTTTC TCACTGCAAC AAATTTGCAA ACAGAATTTA CGATTTCAGT CCTCGTGGAT CCGTGGACCC AATTCTGGAT CCTTTCTACG CCACCCAACT CCAACAGATG  TGCCCGAGAA ACGTGGATCC GACCATTGTG ATCAACATGG ACCCCATAAC TCCTCGTCAA TTCGATAACG CCTATTACAA GGATTTGCAG TCAGGAAAGG GACTATTCTC ATCTGATCAG  TTTCTGTTCA CAGACCTACG CTCACGGAGC ACAGTGAACA CATTTGCAGA AAGTTCAGTT GCGTTTAATA CGGCATTTGT GAACGCCATG ATTAAATTGG GTCGTGTGGG TGTTAAGACG 
GGAAGAGAGG GCGAGATCAG ACGAGATTGC AGCCGCTTTA ATTGA 

Retrieve as FASTA