Entry information : GbPrx30(Ginbil_Gb_30322)
Entry ID 12648
Creation 2013-12-19 (Qiang Li)
Last sequence changes 2015-03-04 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Christophe Dunand
Last annotation changes 2020-11-23 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: GbPrx30(Ginbil_Gb_30322)
Name GbPrx30(Ginbil_Gb_30322)
Class Class III peroxidase     [Orthogroup: Prx021]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Ginkgoopsida Ginkgoaceae Ginkgo
Organism Ginkgo biloba    [TaxId: 3311 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value GbPrx30
start..stop
S start..stop
GbPrx25 495 4e-178 1..334 1..333
PabPrx65 442 3e-157 11..334 6..327
GbPrx32 434 5e-154 1..334 1..329
PtaPrx05 432 2e-153 12..334 10..327
Literature and cross-references GbPrx30(Ginbil_Gb_30322)
Protein sequence: GbPrx30(Ginbil_Gb_30322)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   334 (308)
PWM (Da):   %s   36421.34 (33690.8) Transmb domain:   %s   i7-26o
PI (pH):   %s   5.18 (5.02) Peptide Signal:   %s   cut: 27 range:27-334
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MAKLPETVLT IFLLVALTCA LPAIHAEIPL LSVEYYDESC PCALPIVRSE VQLAVLKEAR MAASLLRLQF HDCFVQGCDA SLLLDDTPTF QGEKSSNANV NSARGYEVID AIKTRLETEC  PGVVSCADIL TIASRDAVIL SGGPYWDVHL GRKDSRTASF DDSNNNIPTP NSNLQTLIAL FEKQGLSVTD LVALAGAHTI GKARCTNFRS RMYNQSAGNG ALDSTFHEPH LSVVKSICPP 
SGGDDNVWPL DFPSPIIFDN SYYINLLRGL GLLSSDQVMY STEGSETREI VKKYAHDPLG FWKQFADSMV KMSNIVDPLS FIHGEVRKNC RVVN 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic and RNA seq (gba_locus_22623_iso_1_len_1277_ver_2). No EST found.
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCCAAAT TACCTGAAAC AGTTTTAACA ATTTTTCTTC TGGTTGCTTT GACATGCGCC CTTCCTGCCA TTCATGCAGA AATTCCATTA TTGTCTGTAG AATATTATGA CGAGTCATGT  CCCTGTGCTC TTCCAATTGT AAGATCAGAA GTTCAACTGG CAGTTCTGAA AGAAGCTAGA ATGGCAGCAT CCTTACTTCG TCTTCAGTTT CATGACTGCT TTGTCCAGGG CTGTGATGCG  TCTCTGTTGC TTGATGACAC CCCAACATTT CAGGGGGAAA AGTCATCCAA TGCGAATGTA AATTCTGCAA GAGGATATGA AGTGATAGAT GCCATCAAAA CCAGATTAGA GACTGAATGC  CCCGGTGTCG TATCTTGCGC AGATATCCTT ACCATTGCTT CCCGGGATGC TGTAATTCTG AGCGGAGGGC CATATTGGGA CGTACATTTG GGAAGGAAAG ACTCCAGAAC TGCAAGTTTC  GATGATTCAA ACAACAACAT TCCGACACCA AATTCCAATC TCCAAACTCT AATCGCTCTC TTTGAAAAGC AAGGCCTCTC AGTGACAGAC CTCGTAGCAC TTGCTGGGGC GCATACAATT  GGGAAGGCTC GATGCACAAA TTTCAGGTCA AGGATGTATA ACCAGAGTGC AGGGAATGGT GCTCTGGATT CTACCTTTCA TGAGCCACAT CTGTCCGTGG TGAAATCAAT ATGCCCTCCA  TCGGGTGGGG ATGACAATGT ATGGCCTCTA GATTTTCCCA GCCCAATTAT ATTCGACAAT TCTTACTACA TCAACTTACT GCGCGGATTG GGACTTCTCA GCTCCGACCA AGTGATGTAT  TCGACGGAGG GAAGCGAAAC GAGGGAGATA GTGAAAAAAT ATGCCCATGA TCCTTTGGGC TTTTGGAAGC AGTTTGCGGA TTCGATGGTG AAGATGAGCA ACATAGTCGA TCCTCTCTCT 
TTTATCCATG GTGAAGTGAG AAAAAACTGC CGCGTAGTCA ATTAA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
CTTGCAGCGC GCCTTTCGAG CTGAATTTGG CACAGTCAAG TGTTGCTGTC TGCTAATCAT AAACGGAGAA GATGGCCAAA TTACCTGAAA CAGTTTTAAC AATTTTTCTT CTGGTTGCTT  TGACATGCGC CCTTCCTGCC ATTCATGCAG AAATTCCATT ATTGTCTGTA GAATATTATG ACGAGTCATG TCCCTGTGCT CTTCCAATTG TAAGATCAGA AGTTCAACTG GCAGTTCTGA  AAGAAGCTAG AATGGCAGCA TCCTTACTTC GTCTTCAGTT TCATGACTGC TTTGTCCAGG GCTGTGATGC GTCTCTGTTG CTTGATGACA CCCCAACATT TCAGGGGGAA AAGTCATCCA  ATGCGAATGT AAATTCTGCA AGAGGATATG AAGTGATAGA TGCCATCAAA ACCAGATTAG AGACTGAATG CCCCGGTGTC GTATCTTGCG CAGATATCCT TACCATTGCT TCCCGGGATG  CTGTAATTCT GAGCGGAGGG CCATATTGGG ACGTACATTT GGGAAGGAAA GACTCCAGAA CTGCAAGTTT CGATGATTCA AACAACAACA TTCCGACACC AAATTCCAAT CTCCAAACTC  TAATCGCTCT CTTTGAAAAG CAAGGCCTCT CAGTGACAGA CCTCGTAGCA CTTGCTGGGG CGCATACAAT TGGGAAGGCT CGATGCACAA ATTTCAGGTC AAGGATGTAT AACCAGAGTG  CAGGGAATGG TGCTCTGGAT TCTACCTTTC ATGAGCCACA TCTGTCCGTG GTGAAATCAA TATGCCCTCC ATCGGGTGGG GATGACAATG TATGGCCTCT AGATTTTCCC AGCCCAATTA  TATTCGACAA TTCTTACTAC ATCAACTTAC TGCGCGGATT GGGACTTCTC AGCTCCGACC AAGTGATGTA TTCGACGGAG GGAAGCGAAA CGAGGGAGAT AGTGAAAAAA TATGCCCATG  ATCCTTTGGG CTTTTGGAAG CAGTTTGCGG ATTCGATGGT GAAGATGAGC AACATAGTCG ATCCTCTCTC TTTTATCCAT GGTGAAGTGA GAAAAAACTG CCGCGTAGTC AATTAATATG  TGTTTAGCAT GAAAAATAAA CAAATTAAGA TGTCGTATAA TATGATATTT TGAAACGAAA ATGATATTAT TTAGTACGAT TTGATTAGAT TATCGAAATA GACTAAATAG AGTTGGGGAA 
AGGAGTGCTG TGGTTATTTT AACCAAAGTT TCCTCAATCT CCTCAAGTGA AGATATTATG TTTTGGATGT TACCGAC 

Retrieve as FASTA