Entry information : PabPrx109 (MA_166386g0010)
Entry ID 12651
Creation 2013-12-19 (Qiang Li)
Last sequence changes 2017-06-09 (Justine Latour)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2017-06-09 (Justine Latour)
Peroxidase information: PabPrx109 (MA_166386g0010)
Name (synonym) PabPrx109 (MA_166386g0010)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx011]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Pinaceae Picea
Organism Picea abies (Norway spruce)    [TaxId: 3329 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value PabPrx109
start..stop
S start..stop
PabPrx228 644 0 1..333 1..333
PabPrx81 574 0 28..333 1..306
PgPrx06 562 0 1..333 1..333
PabPrx93 562 0 1..333 1..333
Literature and cross-references PabPrx109 (MA_166386g0010)
Protein sequence: PabPrx109 (MA_166386g0010)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   333
PWM (Da):   %s   35930.93  
PI (pH):   %s   7.93
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MVSKKYARKP LELAGFVIWV IFGLCASKGS AQLRQNFYAA TCPNVESIVR NVVSQKLAQT LVTVPGTLRL FFHDCFVEGC DASVIIQSTP GNTAEKDYTD NLSLAGDGFD TVIKAKQAVE  NVCPNTVSCA DILTMAARDA VALAGGPQFN VELGRRDGMV SLASHVPGNL PEPTFNLNQL NALFTRKGLN QTDMIALSGA HTVGFSHCSK FTNRIYNFSA GRSVDPSLNP AYATQLQQMC 
PRNVDPNVAT SMDPITPSKF DNAYYQDLQS GKGLFTSDEV LFTDTRSRST VNTYAQSPDA FNRAFVNAMI KLGRVGVKTG TQGEIRLDCS SFN 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic. Correct prediction.
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGTTTCAA AGAAATATGC TAGGAAGCCA TTGGAGTTGG CTGGATTTGT CATTTGGGTA ATTTTTGGAC TGTGTGCAAG CAAAGGATCG GCTCAACTTC GTCAGAATTT TTATGCAGCA  ACCTGTCCCA ATGTTGAATC CATTGTAAGG AATGTTGTTT CTCAAAAGTT GGCGCAGACG CTTGTCACAG TCCCTGGAAC ACTGAGGCTC TTCTTCCATG ACTGCTTCGT TGAGGTAAGG  GTTCAGGGAC ATATATATAT ATATATATAT ATATGTTCAA AATAATGAAT GTGTTTTTCT TTCAAAATTG AAATTGAAAT TCTTTGTTCT TATAATTAAT ACATGGGCTG ATATATAGTA  TTGAGCTAGT ATTAGAATTA GAATTAATAC ATGGGCTGAT ATATAGTGTT GAACAATGTC AATTACAAGA TTATGAATGT CTGCATTGAG GTCAAATGGT CTAATTTTGC ATTTGGGTTT  GCACAGGGAT GTGATGCCTC TGTGATTATT CAGTCTACTC CAGGCAACAC GGCTGAGAAA GATTATACGG ACAACTTATC ACTAGCTGGT GATGGATTTG ATACTGTAAT AAAGGCCAAG  CAAGCTGTAG AGAATGTGTG CCCCAACACT GTGTCTTGTG CTGATATTCT AACCATGGCT GCCAGAGATG CTGTGGCATT GGTAAGTGAT TTGCATTTGT TGAAATATGT AATTTTTACT  TGTCTTAATA ATTGTATTGT CAGGAGATTA TGTTTGATAA TGAATTATTA TTATGAGGTA GAGAATAATC TCTACTTAAG TGGTTTGATC TCTATAATTT AGGAGATTGT TAGATAGTTG  AATGGAAGAG AGATTTTTTT CTACAAAGTT TTTTAGTCTT TTTTACTAAT TTGTTATTAA ATCAATAAAT ATAGTTTTGT TTGTGCAACA ATATACCTAT TCTCTCAATT TTTTTATTTA  GTATCACAGC CTACCTAGTA CAAAGGTCCA AAAACCACAA GGCTAAGTTG CCAACCTTCT ATTCAAGGAA AACATAGGGG AATTAATGGG TTTTTAGACC CATAGTAAGG AGGATGACTA  TGGTGAAAAT TATAAATAGA TAATCCATAC AGATGAACTG AAACTGGATA TTGGTGGAAA GGCTAAACCA AATATCTAAT TAGCATTTAG ATATGATTTG CAGAACAGGC AGTGGTAGTA  ATTGCATTCA CTAAAATTAA AAAGAAAAGA ATGGAATGGC TAAGGGAAGA ATAGATGTGA TCTTTCTAAC AGCAAATGAA ATGGCTGAAC CAAATATGTA ATTAGCACAT AATTAAAAAT  CGAAAATCTT ACTTTAGATT TGAGGATAAT TAACACTCTA AATTCAAATA TAATATTAAA ATTTGAAAAT ATGACCTAAG ATCTATAAAG ATAGTAACAC AGATTAAGTG TTAAAATTTG  GAAATATGAC CTAAGATCTA AAGATAACAC AGACCAAAGG TTAAAATTTG GAAATATGAT CTAAGATCTA AAGATAAATA ACATAGTCTA AGGGTTGAGA AATTTGTTAT ATAAATTTGG  AAATAATATT ATTTTTGGTG TTTTTATTTT AGAGAAATTG TAATGATGGA AAATGGTCAA ACTTCATTTA TGATTTTTGG TGTTGTTATT TAAAAATAAC GATAAATAAC ACAGACCAAA  GGTTGAGAAA TTTGTCATAT AAATTTGGAA ATAATATTAT TTTTGGTGTT TTTATTTTAG AGAAATTGTA ATGATGGAAA ATGGTCAAAC TTCATTTATG ATTTTTTGGT ATTGTTATTT  AAAAATAAAC TATTATGATT ATTGGTGTTG TTATTTAAAA ATAAACTATA ATAATGGAAA ATGGTGAAAT TTCATAAACA ACATGTGTGA CCTTCCAAAC CAGTATAAAA AATGGGGTGC  CCGAGTTCTT GAGGCATTGG CCTAAGGATT TATTTCATAC TAATTTTCCA TTATTGCAGT ACTTTTAGGA TTTGGTTTTA GATGATCGTA TTACATTTAC TCATTCATTA ATGTTATTTT  GTTCTTCTCT TATTTTGCAG GCTGGAGGCC CACAGTTTAA TGTGGAGTTA GGGCGACGAG ATGGAATGGT GTCACTCGCC TCACACGTCC CAGGGAACCT GCCAGAGCCA ACATTCAATC  TCAACCAACT GAACGCTCTA TTTACGAGGA AGGGTTTGAA TCAGACAGAC ATGATAGCTC TATCTGGTAA TTAACTGCAA TTCTTATTGA TCCAACTCTG TTACATTTCT GTTACCTCTT  ACCTTGATCC AACTCCACTT CAAATCCTTA AAATTTAATG AATTAGGAGG ATGATCCGAT CCCTTCCCTG AGCTCCTCCT GTACCTATCC AACCACTAAT CCCAATTCCC CAGTAAATTT  TAAAAATAAA ATAGGCAGAT TGGGAGACTC AATCCTAAAA TAAGGGAATT ACATGGAAAA TATAAATACA ATGAAATTCA AAATGATTTT AATTATGTTA TCAACTCCCT CTCTCTTGTA  TAATGTTATT AAAATCTTCT CATATTTATA CTGTCACTAA CTTTTGTTTT TTATCTTTTT ACAGGAGCAC ACACGGTGGG ATTTTCTCAC TGCAGCAAAT TCACAAATAG AATCTACAAT  TTCAGTGCTG GGAGATCTGT GGACCCAAGT CTGAATCCTG CCTACGCCAC CCAACTCCAA CAAATGTGCC CGAGGAATGT GGATCCGAAC GTTGCCACAT CTATGGATCC CATAACTCCC  AGTAAATTCG ATAATGCCTA TTACCAGGAT TTGCAGTCCG GGAAGGGACT CTTCACCTCT GATGAAGTTC TATTCACAGA CACACGCTCA CGGAGTACAG TGAACACATA TGCACAGAGT 
CCAGATGCGT TTAATAGGGC TTTCGTGAAC GCCATGATTA AATTGGGCCG TGTGGGTGTT AAGACGGGAA CACAGGGCGA GATCAGACTA GATTGCAGCA GCTTTAATTG A 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGTTTCAA AGAAATATGC TAGGAAGCCA TTGGAGTTGG CTGGATTTGT CATTTGGGTA ATTTTTGGAC TGTGTGCAAG CAAAGGATCG GCTCAACTTC GTCAGAATTT TTATGCAGCA  ACCTGTCCCA ATGTTGAATC CATTGTAAGG AATGTTGTTT CTCAAAAGTT GGCGCAGACG CTTGTCACAG TCCCTGGAAC ACTGAGGCTC TTCTTCCATG ACTGCTTCGT TGAGGGATGT  GATGCCTCTG TGATTATTCA GTCTACTCCA GGCAACACGG CTGAGAAAGA TTATACGGAC AACTTATCAC TAGCTGGTGA TGGATTTGAT ACTGTAATAA AGGCCAAGCA AGCTGTAGAG  AATGTGTGCC CCAACACTGT GTCTTGTGCT GATATTCTAA CCATGGCTGC CAGAGATGCT GTGGCATTGG CTGGAGGCCC ACAGTTTAAT GTGGAGTTAG GGCGACGAGA TGGAATGGTG  TCACTCGCCT CACACGTCCC AGGGAACCTG CCAGAGCCAA CATTCAATCT CAACCAACTG AACGCTCTAT TTACGAGGAA GGGTTTGAAT CAGACAGACA TGATAGCTCT ATCTGGAGCA  CACACGGTGG GATTTTCTCA CTGCAGCAAA TTCACAAATA GAATCTACAA TTTCAGTGCT GGGAGATCTG TGGACCCAAG TCTGAATCCT GCCTACGCCA CCCAACTCCA ACAAATGTGC  CCGAGGAATG TGGATCCGAA CGTTGCCACA TCTATGGATC CCATAACTCC CAGTAAATTC GATAATGCCT ATTACCAGGA TTTGCAGTCC GGGAAGGGAC TCTTCACCTC TGATGAAGTT  CTATTCACAG ACACACGCTC ACGGAGTACA GTGAACACAT ATGCACAGAG TCCAGATGCG TTTAATAGGG CTTTCGTGAA CGCCATGATT AAATTGGGCC GTGTGGGTGT TAAGACGGGA 
ACACAGGGCG AGATCAGACT AGATTGCAGC AGCTTTAATT GA 

Retrieve as FASTA