Entry information : PabPrx118 (MA_180698g0010)
Entry ID 12657
Creation 2013-12-19 (Qiang Li)
Last sequence changes 2017-06-08 (Justine Latour)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2017-06-08 (Justine Latour)
Peroxidase information: PabPrx118 (MA_180698g0010)
Name (synonym) PabPrx118 (MA_180698g0010)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx008]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Pinaceae Picea
Organism Picea abies (Norway spruce)    [TaxId: 3329 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value PabPrx118
start..stop
S start..stop
PgPrx01 581 0 55..352 25..322
PabPrx155 551 0 60..356 34..349
PabPrx122 534 0 56..356 25..325
PabPrx101 529 0 55..356 26..327
Literature and cross-references PabPrx118 (MA_180698g0010)
Protein sequence: PabPrx118 (MA_180698g0010)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   356
PWM (Da):   %s   38877.62  
PI (pH):   %s   8.62
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MKSEHDEGRE LWFLLPPTEG SMKEENCGSF FPQRKALEAL TKFAFLTTRR TEYDNAAGGL ELNFYGKSCP GVSNVVEEVV AEYISKAPTL AAPLLRMHFH DCFVRGCDGS VLLNSTKSRK  AEKEAAPNLT LRGFQIIDAA KAAVEKVCPG VVSCADILAL VARDAVHMLG GPFWNVPTGR RDGLVSIQNE AVAKLPPPNG TFSKLKSIFA SNGLDVKDLV VLSGGHTIGI SHCNSFSSRL 
YNFTGKGDMD PSLDKSYAAH LKMKCKPGNN KTIVEMDPGS FRTFDTHYYV NVKKNRGLFQ SDAALLTNNE AQSYINKELE SSSFLRDFAR SMEKMGRIGV LTGTAGQIRR HCAFTN 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic. Correct prediction.
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAAATCGG AGCACGATGA AGGAAGAGAA CTGTGGTTCC TTCTTCCCCC AACGGAAGGC TCGATGAAGG AAGAGAACTG TGGTTCCTTC TTCCCCCAAC GGAAGGCTCT TGAGGCCCTC  ACAAAGTTTG CTTTCCTTAC AACGAGAAGA ACTGAGTATG ACAGTGAAAG AACTCCCTGC GATGTTGCCA ATGTGTTATC ATTAAAGAAT GAGTCCTTAA CAATCTTAGC AGCATAACAA  TGCCTGAAAT TCCTTGCGAA AACAATGTGT CTTCACGGCT TTTTATAGCA GATCCTCGGG CGATTATGTA ACCTCTTCAA AGTGTGAAAA GGGGCCCTTT AGGGCTTCCT TAGGTCATTA  ACCCACCTAC CCTGCAGATT CGGCTCGGAT TTGGGAGTCA AATCAGATTG GGAGCTnnnn nnnnnnnGGG AGTCAAATCA GATTGGGAGC CGGTCCGTAA GCGGTTGAGA GGTCGGCCAA  TTCAATAAAT GCATCGTTTT AGCAGGTGCG TGGGTTTTTT CATTGACAGT CGCGCGTCGT GCACACATGC ACGTAGAGTA CGTTCTTGTC CTACGCATGT GCGCGCACAC CAAACTACTG  TGAAGCGCCC TTCAATTTTT GGTTACTTTG TATAGTTTTT GACCCTTCTG GACAATTTTT GGTTACTTTG TATAGTTTTT GACCCTTCTG GAATGTTGTG AAATTAATTC AGTGCCATGA  ATGACTTCAT TGGTGTTTTG ACGATGCAGA GTTCTTTTCG CCATGTGCGG ACAAAATTTC GGTGATAACA ATCATGACCC CACCTTCACT AGCAATTAAT GACAAGAGTT GTTTTGGCTT  CAAGCTACCC AATTGAAGCT CATTTGGAAG CTTATTTACA TTGTTTTGAT TTGGATCAAC AAACCCAATT GGTGTAGTCA TTACCCTTGG TTGAATGGTG GCACAATAAT ACCTATCATG  GTGCTACTAA AATGACCCCC TTCGAGGAAA TCTATGGATA ACCACCACCG TCAGTGATCT CATACTTATG AGGCATCTAT AATGTTTAGG AGGTGGCCAA AACCCTAACA ACCCTCCTAC  AATTTTTCAT GCATTCAAGG ATAATTTGGT GTTGGCTCAT AATCACATGA AGCAAAAGGT CCATCAACAT CACTCTGAAC ACCTTTTTGA AGAAGGGGAT TAGGTGTATT TGTGTCTCTA  TCCCTATAAG CTTGCATCAT CAAGGAGAAT AACCATATAA AGTTAGCTCT TAATTTTTAC AAACCCTATA CTATACTCAG AGGTATAGAT GTAGTGTCTT ACAAATTGAC ACTACCTAAA  CATTCTAAAC TCCACCTTGT ATTTCATATG TCCTACTTGA AGAAAGTACG CAAGTCCAAC TACAAATTTA AAACCATCCT TCTATAATTG GATGAGGAGG GTTCCATTTT GTTGCATCCT  AAGATTGTTT TGGACAAACC TGAGCATCAT CTTCTCTGGC ATACTATCCA AGAAGTTTTG ATCTAATAGA AGGATACACA TCCTAAAGAT GCTACATGGG AACCAACAAA AATTCTCCAC  CAATTTTCTC ATCTCCATCC TTGAGGAAAA TACTAACTTG TAAGCATGTT AATGTTCCAA CCTAACTCCC TTAGTTAGGA GAAAACGTTT TTACTTAATG TATTGGGGGG GCATATTTAT  TAAATAAGGC CCACAAGGTA GTAGAGTGTG AAATCAATAA ATGTAAGTGG GATCATTAAA TAATCTTCAC TGGGCCTCAT TCATGGAGGT CCACTAGGTG GTTAGAATTT TGGTCAATTA  GAAACTATAT ATAATAGTAA AAACTACTAT ATATAATAGT AGAGGCTATG TAATTAGTTG TTGAATATTA TTGTATTTGG AGCTATGCTC ATGTTGGAGG TTACCGGCTA AAAGGGGCAA  GTAAACATTA CTCTTAATTC TCATATCAAT AAAAGTTTTC TTATTAGTTC TATTTCACAA TTCTATTTCT ATTTTTTTTT TCTTACAACC ATATTTCTAT TTTTTTTTAA CATTTACAAA  TGAAATGTTC ACATACTTAC ATGTACATAA TATTTAATAA AAAAAAACAT GATATGCTTA ACCATTTTCT ATGTAAATGT AAAATACCAA ACAGAGTGTT CACATACATA CATACACATC  ATAATATTAA TGTAGAAAAA CAAGATATAC TACAACAACT ACGTTTTGAT ATTGTTATCA ACTTTAAAAA AATAAATTTA ACTTATATTT AAAAAGCTAT TTCAATTTTC TGGCATGCAT  CTTCTTACAA TGTCTTAAAA GTTCCTCGTA CATATGAATC GAAGCAACAA AATGTCTGAA TGATCGTATG AGCTTACACA CCCTTCTAAA TTTTTATATT TACTATTTGA TTCTTTAGAG  TATGATTTGG AAGATGGAGT TTTATGGCAT TATATATAAT TTAGAATATG TATTTGTACT ATTTTATATA TGGTTTATTC ACATAGTATG GATAATGTAA TTTTATTAAG CGGTCATACA  AAGCATCTTG ACCTAATTGA ATAGTTTATG ATTGATAAGT GTCAAATTGG CAATGATTGC ATCGAGTTTT CTTATTAAAT GTGGCAGGTT TTTATTGATA CAAAAAATAT TGCTGTAGAT  AGAATTTAAA AAGAACAAAG AAGTTTTGAA AATAGGCTAA AGATGAACTG AATACAAGTG CTTTACGATT GGAGAGCATG GTCGTTAATA CAGCTAAAAT AATAATGTTT GGTCGGAGTC  ATACTATTTT TCTTTGTTGA TCTGCTAAGC GAAAACGATA TCTTGCCTCT TTCCATTATT ATTTTTATTC CTGTATCGTT TTCACTTGCC ACATAAAACT CCCACCTGTC ATTATTCTGT  CTGAATATAT GATGTAATTT AATTGGTTGG TACTATATCA AACTATCACC TGGGGACTGA GGATTTGGAA AACAAAATTG TGCAAAGATG TGGCAGCAAA TGAACCCTAG AAACAGACAA  CAAGGCAGCT CATTGAGTAG AGTAGGGATC TGCAGCTATA TATCATATGA GTCATATTTG GAGTAAACAA ATTACAGAAC TGGTTGAGAA ATTGTTTTTA AAGAAAAGTC GAGATACCAG  CCACGATGGC TATTGCACAT CCACCAAATC CAATCATCAA CCGTTTCCTT ATGTTTTCCT TGTTTGTGTT CGGTCAAAAT CAATACGCAA TGCCCTGCAC AACTGCCCAA CTATTCAGGC  TATAAATTGC GTTGCTGTCG AGGCTAATGC CATAGTTATA ACAGAATTGC TCTTTCCAAA GCATTCACAT GGCTAAAATG GCTACAATTT TGTTTTCTGC TGCAAGTTTT TTAATATTTG  CATGTTCATT GACAGATGCA GCTGGAGGAC TGGAACTGAA CTTCTATGGC AAGAGCTGCC CCGGAGTTTC TAATGTAGTA GAAGAAGTAG TTGCAGAGTA CATATCCAAA GCCCCAACTC  TGGCCGCACC TCTTCTCAGA ATGCATTTTC ATGACTGCTT TGTCAGAGTG AGTATATTTA AGCTTTCACA CCTACTATCT ATATAGTAGA TATGGTGCAG TGAGACTAGA GCATAGCATT  TACAGGCTCA ATAGAATAGA TTGATATTTT TGACGAGAAC GTGAACTTGA TTGGTGCAGG GTTGCGATGG ATCGGTGCTG TTGAATTCAA CAAAATCAAG GAAGGCAGAA AAGGAAGCGG  CTCCGAATCT GACCCTGAGA GGATTTCAAA TCATCGACGC AGCCAAAGCT GCAGTGGAGA AGGTGTGTCC TGGAGTGGTG TCATGCGCCG ATATTCTTGC ACTCGTCGCA CGAGATGCTG  TTCATATGGT AACACAAATC ACTCAATAAA TCCCTTCATT TATTTTCCTG TTTAATCATC AGTTTTGCCC GACAGTCTTT AAGATGATAT TTAATTCATG AACATATTAG TTGGGTGGAC  CATTCTGGAA CGTTCCAACT GGACGTAGAG ATGGACTGGT GTCCATTCAG AATGAAGCCG TCGCAAAACT TCCTCCTCCC AACGGAACTT TCTCCAAACT AAAATCAATA TTTGCCAGCA  ATGGTCTTGA CGTTAAGGAT TTGGTCGTGC TGTCAGGTAA GTAATCCACT ACATTCCATA CTCCACAGCT ATTTATCTGC TATGTTAAAA GGAGATTGAA TTTAATTATT GCATCAAGAT  TTATATATAG TTCGCTACTG GGTGCAGGGG GCCACACAAT AGGGATCTCT CACTGCAACT CTTTTAGCAG CAGGCTTTAC AATTTTACAG GAAAAGGGGA CATGGATCCG TCCTTGGATA  AATCTTATGC AGCTCATCTC AAGATGAAAT GTAAGCCTGG GAACAATAAA ACGATAGTAG AGATGGATCC CGGTAGCTTT CGAACATTTG ACACGCATTA TTACGTGAAT GTAAAGAAAA  ACAGAGGCCT CTTTCAATCA GATGCTGCGC TTCTGACCAA CAACGAGGCA CAATCATATA TCAATAAGGA ATTGGAAAGC TCGTCATTCC TGCGGGATTT CGCAAGGTCG ATGGAGAAGA 
TGGGCAGAAT CGGCGTGCTA ACAGGGACTG CAGGGCAAAT CCGAAGACAC TGCGCTTTTA CAAATTAA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAAATCGG AGCACGATGA AGGAAGAGAA CTGTGGTTCC TTCTTCCCCC AACGGAAGGC TCGATGAAGG AAGAGAACTG TGGTTCCTTC TTCCCCCAAC GGAAGGCTCT TGAGGCCCTC  ACAAAGTTTG CTTTCCTTAC AACGAGAAGA ACTGAGTATG ACAATGCAGC TGGAGGACTG GAACTGAACT TCTATGGCAA GAGCTGCCCC GGAGTTTCTA ATGTAGTAGA AGAAGTAGTT  GCAGAGTACA TATCCAAAGC CCCAACTCTG GCCGCACCTC TTCTCAGAAT GCATTTTCAT GACTGCTTTG TCAGAGGTTG CGATGGATCG GTGCTGTTGA ATTCAACAAA ATCAAGGAAG  GCAGAAAAGG AAGCGGCTCC GAATCTGACC CTGAGAGGAT TTCAAATCAT CGACGCAGCC AAAGCTGCAG TGGAGAAGGT GTGTCCTGGA GTGGTGTCAT GCGCCGATAT TCTTGCACTC  GTCGCACGAG ATGCTGTTCA TATGTTGGGT GGACCATTCT GGAACGTTCC AACTGGACGT AGAGATGGAC TGGTGTCCAT TCAGAATGAA GCCGTCGCAA AACTTCCTCC TCCCAACGGA  ACTTTCTCCA AACTAAAATC AATATTTGCC AGCAATGGTC TTGACGTTAA GGATTTGGTC GTGCTGTCAG GGGGCCACAC AATAGGGATC TCTCACTGCA ACTCTTTTAG CAGCAGGCTT  TACAATTTTA CAGGAAAAGG GGACATGGAT CCGTCCTTGG ATAAATCTTA TGCAGCTCAT CTCAAGATGA AATGTAAGCC TGGGAACAAT AAAACGATAG TAGAGATGGA TCCCGGTAGC  TTTCGAACAT TTGACACGCA TTATTACGTG AATGTAAAGA AAAACAGAGG CCTCTTTCAA TCAGATGCTG CGCTTCTGAC CAACAACGAG GCACAATCAT ATATCAATAA GGAATTGGAA 
AGCTCGTCAT TCCTGCGGGA TTTCGCAAGG TCGATGGAGA AGATGGGCAG AATCGGCGTG CTAACAGGGA CTGCAGGGCA AATCCGAAGA CACTGCGCTT TTACAAATTA A 

Retrieve as FASTA