Entry information : PabPrx161 (MA_48212g0010)
Entry ID 12695
Creation 2013-12-19 (Qiang Li)
Last sequence changes 2017-06-08 (Justine Latour)
Sequence status partial
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2017-06-08 (Justine Latour)
Peroxidase information: PabPrx161 (MA_48212g0010)
Name (synonym) PabPrx161 (MA_48212g0010)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: N/D] N/D
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Pinaceae Picea
Organism Picea abies (Norway spruce)    [TaxId: 3329 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value PabPrx161
start..stop
S start..stop
MePrx122 238 2e-78 1..229 91..343
GmPrx138 234 3e-77 1..230 71..324
MePrx88 232 2e-76 1..230 67..320
VvPrx54 229 2e-75 1..229 71..322
Literature and cross-references PabPrx161 (MA_48212g0010)
Protein sequence: PabPrx161 (MA_48212g0010)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   230
PWM (Da):   %s   24866.61  
PI (pH):   %s   4.8
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
GCDASVLLDS TATNLAEREA AANRFLRGLQ IIDDAKTALE AACPGVVSCA DILALSTRDA VGMLEDGPSW TVRTGRRDGL ISNQTEASNN LPSPFFHFSQ LRDIFATKGF SIPELIILSG 
DTDPSLDPDY AAHLKTICSP SARATAVPMD PDTPLVFDNN YYNLLKENKG LFRSDAALLV GNQGRGIVYD LSKGKDFRER FVKSMVKLVE LDVLTGIDGE IRKNCHFVNS 

Retrieve as FASTA  
Remarks Partial sequence from genomic. Incorrect prediction (5' is missing). Exon 1 and intron 2 undetected?
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
AATATATATA TATATATATA TATATATATA TATATATATA ACTACAATGA TATATATATG TTATATGGTT TTGCTTAGTT CAATTGTGGT TTTTTTCAAT TTCAGTGATA ATAATAATCT  AATTTTAAGG TCATGGTTAA GTTAGACATC AAATTGGTGT ATGAGAACCG ATAAGTTTAT AGATTTGATT AGTGAAGTTT GGAGTATACA TACCCTATCC TATCCTACCC TACCTCTTCT  AGATTTGACT TCTTAAGAAG AAACACATGT TATTAACCAT TAATCATTAG GTCTACTTAA ACTGTATTTG ATATATAGAT TACAAATTCT GATATGTTAA ACATGTTCTT GACATTAACC  ATTAGATCCA CTTAAACTAT ATTTTGATAT ATCTATTACA CATTCTGATA TATTAAACGT ATTTTTACTG TATTTTGAAG GGATGTGATG CATCTGTATT ATTGGATTCT ACTGCAACAA  ACTTAGCAGA GAGAGAAGCC GCTGCAAACC GCTTCCTGCG AGGACTTCAG ATCATCGACG ATGCCAAGAC CGCCCTGGAG GCTGCGTGTC CAGGAGTGGT GTCGTGTGCA GATATTCTGG  CTCTGTCTAC ACGAGATGCC GTAGGAATGG TATGAACTTC TATACATAGA TTTTTTGTGT GAAACATTGG CAGTATGGTA TTACGAGAAA TTTTGTTTCC TCCATTCAAG TCCAGGTTTT  GATCTTTGAA TTCAATACCT AATGGCTCTT TAACGGCCGG ATCTGACTCT TGCTTCTAAA TGTGTATTTT ATAGCTTGAA GATGGTCCTT CTTGGACTGT GCGAACAGGA CGCAGAGACG  GCCTTATATC GAACCAGACA GAAGCGTCTA ATAATCTGCC TTCCCCTTTC TTTCATTTTT CACAGCTCAG AGACATTTTT GCGACAAAGG GATTCAGTAT TCCGGAGCTT ATTATTCTAT  CAGGTATTTT CGCTTATATT CAAACTTCAA CTATCAAAAT TTTTAATATT GGTTTGTATT GTACGGGGAG AGAGAGAAAT GAGATCAACT ATCAAAATTT TTAATTTTGG TGTTGTATTG  TACGGAGAGA GACAAATTTT TTAATATTGA TGTTGTAGTG TACGGGGAGA GAGAAATGAG ATAAACTATC AAAATTTTTA ATAGAAAAAA GTATTTATAT TAGTGAATAT AAAGAGTTTT  TTACAAAATA AAGCTGCTGG AACAGCACTT GTTACTTTCC TATCTCATTC ATAAATATAA GTGGTAATAA TTATAGACCT CAGAAATTAC ATCTTTCATC ACTGGATTCA ATCATATGAC  ATAATAAGTA AAAATACATC TCCATCACTG ATTTTATAAA TACATTTAGT AAAAATATAG ATCTTGCATT CAAAAATATA TTTGGTAAAT ACTAGGCTCT AAATCTTCTG CTTTGCTGCA  TTGTTTTAAT AGTAGATTGG CAATTTTTCA AATCTCTTAA TTTGTTTTTC CATATCCACT GTAGAATATA TTCCTTCTTC CTCCATCTGC AAAGCTAGTT TTGATAGATG GTAGGCTTCG  TTATTATACT CTATGTAAAT GTGTTGTGAT TTTAGATGAT AAAATTTTCC ACTCAATGCA CATATCTTTT AACATCCATA GCTTTTTGAC ATCCACAAGT CTGTGATAGT ATATTCTCTT  TTCCATACCC ACTGCAAAAT ATATTCCTTC TTTCTCTATC TGCAAAGCAG TTTTGATAGA TGGTCGGCTT CCTTGTTATA CTCTCTGTAA ATGTGTTGTG GTTTTAGACT CTGTTCTTGT  TATACTCTCT GTAGATGTGT TGTGCTTTTA GACGATGAAA TTTTCCACTT AATCCACTTA TCTTTGACAT CCATGGCTTT TTGACATCCA TGGGTTTGTG GTAGTATATT CTCACAATGG  ATTTTAATTT TGAATTTATC GAGTTATTAA GAAAATCAAA TGGAAGATAT GAATTAAACC GTATTAATGT ATATGTGAAC ACAAAAACTT GTATAATGCA ACTCTGAACA GAAAACAAGT  TTTGATCGTT TTGTGTTGCA TCGCAGGAGC TCATACGATT GGAAGGGCTC ACTGCGGTTC GTTCTCAATT CGTCTATAAA ACAACAGCGG CGTAGGAGAC ACCGATCCCT CGCTCGACCC  AGATTACGCT GCCCATCTCA AAACAATCTG CAGTCCTTCT GCTAGAGCGA CGGCTGTGCC CATGGATCCA GACACCCCGC TAGTTTTCGA CAATAACTAC TATAATCTCT TGAAGGAAAA  CAAAGGGTTG TTCAGGTCCG ATGCAGCGCT TCTTGTAGGC AACCAGGGCA GAGGCATTGT ATACGACCTG AGCAAAGGGA AAGACTTTCG CGAACGCTTC GTTAAATCGA TGGTCAAGCT 
GGTCGAGTTG GATGTCCTGA CTGGAATTGA TGGAGAAATC AGGAAGAATT GTCATTTCGT AAACAGTTGA 

Retrieve as FASTA