Entry information : PabPrx173 (MA_54671g0010)
Entry ID 12705
Creation 2013-12-19 (Qiang Li)
Last sequence changes 2017-06-08 (Justine Latour)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2017-06-08 (Justine Latour)
Peroxidase information: PabPrx173 (MA_54671g0010)
Name (synonym) PabPrx173 (MA_54671g0010)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx093]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Pinaceae Picea
Organism Picea abies (Norway spruce)    [TaxId: 3329 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value PabPrx173
start..stop
S start..stop
PabPrx38 401 1e-140 76..364 40..329
SmPrx38-1_2 353 9e-122 75..367 34..327
SmPrx38-2_97 353 2e-121 75..367 34..327
SmPrx81-1_124 351 1e-120 52..364 18..330
Literature and cross-references PabPrx173 (MA_54671g0010)
Protein sequence: PabPrx173 (MA_54671g0010)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   369
PWM (Da):   %s   40560.47  
PI (pH):   %s   8.34
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MVARKAFKAK LAYHYRQKQM AYYRNVSEIL LQCNIAYPWN PERCGAALCR FLQCFVPGRG FDSIRDYEKA GKRIEVDSIV FETMKKLANE SNVVPPSTLR LFFHDCFIEG CDASIMISST  PNNKAERDLR ENNIAQNAFD AIVQVKKAVD SVCPRVVSCA DIIALAARDA VRLLGGPNWE VPKGRLDGLV SQAARAQGKV PGANTNVSQL IETFAALNLS VLDLVVLSGA HTVGFSHCDQ  FTNRLYNFSS VAKTDPSLNR SFASALEQRC PVGGNPSEFQ AFDVVTPFNF DNQYFKNLKV GQGLLFSDQD LVNNSSTAEM VNRFALSQEI FFSNFVVSMV KLGNVGVKTS SSQGNVRTDC 
TAFNPVPLQ 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic. Correct prediction.
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGTGGCGC GCAAGGCCTT CAAAGCCAAG CTTGCATATC ATTACAGACA GAAGCAAATG GCGGTCCGAT GACGCGGATT CTCCTCAGAG AAAGGGGCAT ATTTGACGGA CATTGTTTTA  CTGAGATCTA TTTCTTGCTC GGAATCAATC GCTGTGATAT TCTGATTCAT CAGAGAATAT TGCTCAGCTC GTTTATCGAA GGAATTTCTG CTTTGGGTAC CCTATATATG GCTGTGACGG  TCTTTCTAAA AAGAAATCTA TAGTATCGCA GCAGCATCTG CAACATTCTC ATTCAAAGAT CAGTGGGCTC TTCCGATATT GGCCTGCAGT ACTATAGAAA TGTCAGCGAA ATTCTTTTGC  AGTGTAATAT TGCTTATCCA TGGAATCCAG AGCGTTGTGG GGCAGCTCTC TGTAGATTTC TACAGTGTTT CGTGCCCGGC CGTGGATTCG ATAGTATTCG AGACTATGAA AAAGCTGGCA  AACGAATCGA AGTGGATTCG ATAGTATTCG AGACTATGAA AAAGCTGGCA AACGAATCGA ATGTCGTTCC TCCTTCGACA CTCCGGCTCT TCTTCCACGA CTGTTTTATT GAGGTTACTG  GTGTTTCACA CAGCAAATAC ACTTTCCCTG CCCTCCCTTT TTATTGTAAA TTTGATGATA ACAGAGCAGT TTTTTCAGAG ATTGGTTATT GACTAATACC TAATGTTTTA TTTGTCATTT  GTTCCCAAGC TTAACTGTGT TTGCTGCTGT CAGAAAACAA TATTTTTCCA AAGCTGAAGT TCCGTGGACT TTGCATTTGC ATTTTGACAG GGATGCGATG CTTCCATCAT GATTAGCTCA  ACGCCAAACA ATAAAGCAGA AAGGGATCTC CGTGAGAATA ATATAGCTCA GAATGCCTTC GACGCTATCG TCCAGGTGAA GAAAGCTGTG GACAGTGTCT GCCCAAGAGT TGTATCGTGC  GCAGACATTA TAGCTCTGGC AGCAAGGGAT GCTGTGAGAT TGGTAATGAA TTCTCAGTAA CACAATACTT GAGCTTAAAA TCAGGAATCC ACCGTCAGAT TTAAGGATGT TTTTGGTTTG  TTTGAAACAG TTGGGAGGAC CGAATTGGGA AGTGCCCAAA GGCAGATTAG ATGGCCTGGT CTCGCAAGCT GCCAGAGCGC AGGGGAAGGT TCCCGGGGCC AACACTAATG TAAGCCAACT  TATCGAGACA TTTGCTGCTC TAAACTTGTC GGTGCTGGAC TTGGTTGTTT TATCAGGTAT TTGTCCATTC AATTAAAGGT ATTTGTCCAT TCAATTAAGC ATTGGGTATT TGTTCATTTA  ATTGCAATAA TATAGCAGTG GGTATTTTTC CATTTAATTG CAATAATAGA GCGGTTGCAA TGATACAGCC GTGGGATAAG AGAAATAATA TGGTTTTTTC ACCTTCCCCA AATAGATATG  TATATAAGTT TGCTATATTT GAAAAAAAAA ATTGATGAGT TTTGAAAACG GTTAAAAAAA AAAAAAAATG GAGTAAGCTG TAATCTTCTC TCTTTTCAGA TTAAAAAATG GGATTGAATT  TCGCTAAATT TTTAGGAGTA GTTTGAGTTT GGCATGAATC AAAATTTCAT GCATTTCAGA ATCTTATCTT TAGTTTTTGC TCCATTTTAA ACCAAAAAAA TGGGCTTGAA TCCCACTAGA  TTTTTAAAAG TAGCCTGAGT TTGGTGTAGA TCAAAATTTC ATGCATTTCA GAACCTTACC TCTAGGGTTT TGCCCCATTT TAAACCAAAA AAATGGGCTT GAATCCTGCC AGATTTTCAG  GCTAGGAGTA GCTTGAGTTT AGCGTGGATC AAAATTTCAT GCATTTCAGA ACCTTACCTC TAGGGTTTTG CCCCATTTTA AATCAATCTT GAGGTTTTGC CCCATTTTAA ACCAACCCAG  ATGTTCAGAA AATCTATCAA ACTTCTAAAT TGACTAAAAA ACTTACAAAC TTCTAAATTG AATAAAAAAA ACTTACAGAA AAAATAACTA GAAAAGCAAG ATTGCTCCCT AATTAGCACA  CTCAAAAAAA AAAAAAATAC TCCATTTAAA AAAGCCCGCC CCCTGCCTTT TGGTTATTCC CATGTTGCTC AGACCGAATA TTTTGACTCT TAATCACCAT TAATGCTCTG ACAAATATAT  TTAATGGCTG CATTAATGTT TGCAGGTGCG CATACCGTTG GGTTTTCTCA TTGCGATCAA TTTACGAACC GCCTGTACAA TTTCTCCTCC GTAGCAAAAA CCGACCCGTC TCTGAATAGG  AGCTTCGCTT CGGCCCTTGA GCAAAGATGC CCAGTGGGCG GAAATCCCAG CGAATTCCAG GCCTTCGATG TTGTCACCCC ATTTAATTTC GACAATCAGT ATTTCAAGAA CTTGAAGGTT  GGGCAGGGTC TGCTATTTTC GGATCAGGAT CTTGTTAATA ACAGTTCTAC CGCAGAGATG GTCAATCGTT TCGCTCTCTC ACAGGAGATT TTCTTCTCCA ATTTCGTGGT GTCAATGGTG 
AAACTTGGCA ACGTCGGGGT GAAGACTAGT TCCAGCCAGG GGAACGTTCG GACGGACTGC ACCGCATTCA ATCCTGTCCC TCTGCAGTAA 

Retrieve as FASTA  
CDS
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.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGTGGCGC GCAAGGCCTT CAAAGCCAAG CTTGCATATC ATTACAGACA GAAGCAAATG GCGTACTATA GAAATGTCAG CGAAATTCTT TTGCAGTGTA ATATTGCTTA TCCATGGAAT  CCAGAGCGTT GTGGGGCAGC TCTCTGTAGA TTTCTACAGT GTTTCGTGCC CGGCCGTGGA TTCGATAGTA TTCGAGACTA TGAAAAAGCT GGCAAACGAA TCGAAGTGGA TTCGATAGTA  TTCGAGACTA TGAAAAAGCT GGCAAACGAA TCGAATGTCG TTCCTCCTTC GACACTCCGG CTCTTCTTCC ACGACTGTTT TATTGAGGGA TGCGATGCTT CCATCATGAT TAGCTCAACG  CCAAACAATA AAGCAGAAAG GGATCTCCGT GAGAATAATA TAGCTCAGAA TGCCTTCGAC GCTATCGTCC AGGTGAAGAA AGCTGTGGAC AGTGTCTGCC CAAGAGTTGT ATCGTGCGCA  GACATTATAG CTCTGGCAGC AAGGGATGCT GTGAGATTGT TGGGAGGACC GAATTGGGAA GTGCCCAAAG GCAGATTAGA TGGCCTGGTC TCGCAAGCTG CCAGAGCGCA GGGGAAGGTT  CCCGGGGCCA ACACTAATGT AAGCCAACTT ATCGAGACAT TTGCTGCTCT AAACTTGTCG GTGCTGGACT TGGTTGTTTT ATCAGGTGCG CATACCGTTG GGTTTTCTCA TTGCGATCAA  TTTACGAACC GCCTGTACAA TTTCTCCTCC GTAGCAAAAA CCGACCCGTC TCTGAATAGG AGCTTCGCTT CGGCCCTTGA GCAAAGATGC CCAGTGGGCG GAAATCCCAG CGAATTCCAG  GCCTTCGATG TTGTCACCCC ATTTAATTTC GACAATCAGT ATTTCAAGAA CTTGAAGGTT GGGCAGGGTC TGCTATTTTC GGATCAGGAT CTTGTTAATA ACAGTTCTAC CGCAGAGATG  GTCAATCGTT TCGCTCTCTC ACAGGAGATT TTCTTCTCCA ATTTCGTGGT GTCAATGGTG AAACTTGGCA ACGTCGGGGT GAAGACTAGT TCCAGCCAGG GGAACGTTCG GACGGACTGC 
ACCGCATTCA ATCCTGTCCC TCTGCAGTAA 

Retrieve as FASTA