Entry information : PtaPrx84
Entry ID 12708
Creation 2013-12-19 (Qiang Li)
Last sequence changes 2013-12-19 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2021-01-13 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: PtaPrx84
Name PtaPrx84
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx103]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Pinaceae Pinus
Organism Pinus taeda (loblolly pine)    [TaxId: 3352 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value PtaPrx84
start..stop
S start..stop
PabPrx01 528 0 1..339 1..340
PsiPrx06 515 0 1..339 1..341
PabPrx199 505 0 1..339 1..341
PtaPrx36 504 0 1..339 1..341
Literature and cross-references PtaPrx84
Protein sequence: PtaPrx84
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   339
PWM (Da):   %s   36610.44  
PI (pH):   %s   7.04
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MARIKRSRCL TLQFHSVLIM GVALISVMVL DAQSCHGLSL DFYNTSCPEA EEIIKSVVKD AVDKEARMAA SLLRLHFHDC FVKGCDASVL LDDTANFTGE KTAKPNQNSL RGFEVVDEIK  AELEKACPGV VSCADILAVA ARDSVVITGG PSWEVQLGRR DSRSASLQGA NDNLPAPNST HQTLETKFKL QGLDVVDMVT LSGAHTIGLA RCSSFKPRLY NQTGINPATA INGAYLQQLQ 
NICPQFGTDN NQTTSLDPVT PIKFDVNYYE NLVAGMGLLT SDQVLYSTKG SLTPTLVQSY TTNPNAFFKQ FAASMIKMGN ISPLNGSSGE IRLNCRKMN 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic. Incorrect prediction, two independent ORFs. Very long genomic full of NN!!!
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCACGGA TCAAACGTAG TCGCTGCCTT ACACTGCAGT TTCATTCTGT GCTGATTATG GGAGTCGCAT TGATTTCTGT AATGGTACTG GATGCTCAGA GCTGTCACGG TCTGAGTCTC  GATTTCTATA ACACATCCTG TCCCGAGGCC GAGGAAATCA TTAAATCTGT AGTAAAAGAT GCTGTTGACA AGGAAGCTAG AATGGCTGCT TCGTTGCTAC GTTTGCATTT TCACGACTGC  TTTGTTAAGG TAAGCACTCC TTGATGTTTC AGTTTAACTA AAACACCATT TTATGTACCC GTGTTTAATC CTAAAAGCAG TTCTGCAGTG GCAAACATTA TTCACCATGT AAACGCAAGT  TCGTACGTCA CAACCTTACT GCTATTCATT GATTCTGACT AGTTCCTGGA AAAAGTATGA TATGGATCAT TACGCTGCGA TTCATTGATT CTGACTAGTT CCTGGCAAAA GTGTGATATG  GATCATTATG CTTTTCTTTT ACTGAATTAT TTCTCCACTG TATTAAAATA GTGAATAGTG AATGGCTTTA TTATTAATAT AGATGTTATA TACTTGTATA AAATTATTTT TATTCTGGAT  TTATCAAGTT TTATTAATTT TTTTCCACTC TATACTAGTT TGTATATTTA GGTATTTTTT TGGACGCTTA GTAGATTCAC AGTAAAGATA GATCTATGGT GGTTTAATTC CCTTTTTAAG  TAGGTTACAT TTCATGTCAA TACCATGGAT CAATACCATT GATTCTCAAT ACCATGGGTC AATACCATGT GTCATATTTA TTTATTTTTT ATTAATATTA GGGTTAATAA TATTTTTTTG  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nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nCTTATATAT AAATATATTT TTTGGGTGCC TTGCTCGAGT CTCTACCTTT TATATATATA AAATATTAAA ATATCAGGTT CATTATAACA CATGATGAAC  CTTTGAAACA ATATGGCCTG AAAATAGAAA GGAACAATTT TACATATGTT TCTCTAGTTA TTCTTAACAT AAAAAAGTAA AGCAACTCTA TTGTTTAAGT ATTGACTGCC ACATACAATA  TGCACACACA ATCTTCTCCC ATATATATAC ATAAACAACA TTAGAAATAC TCATCAACAT GACATCCCAG ATATGGCCCT TACATCTAGG TGCTACCGGC TTCCTTAACC CATCAACCCA  TCAAGAGATT GCTCCAGTTT CTCAATTAAA AATATGGGTG TTAATTAGGA TGTCTTTAGC CTTTCTTTCT GCGAAGGTTT CAACTTAGCC TCATGTTTTG TGAGTAGTTC AGCGTATTTC  TCTATAAACT TTGTATTTCC CGACCCCAGG AAATGCCAGA ACTCCAAAAG AATAATTTTC AAAAATTCTG GAACTTTCCC AAGCTCCTAT TGCAATTCCG GTTGAAAAAA AAAATTCCCT  TACAATTTCC AAAACTCCAA AACTCCCTGG AACCCTAGAA CCATTAAAAC AAATTTCTCA ACTCTGGAGA GCGGTTCCGT GTAACAGCTA TATTATCTCA TGAATTATAA TCTGTTATCA  TTACATTGTC TTATGGATTT TGATCTGTTA TTGGTAGCCA TATAATAATG CCTGTGCTGA CTTTTGAGGT GTGGGTCGGT TAAAAAGGGT AATTGACGTC AAATATTACA TTCTGTTGAT  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nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnATTTAT AAACCCTAGG GTTTTGACCA AACCCTGGTC TATCTTTCCG TCAATGTTAT GACTGTATAT TTCGGCTTTT TTGTCTGGTA ATAAATTAAT GTTGTTGGAG  TTCCGTCCTG TTGATAACTC TGCTGGTGTC GAGGCTTATT TTACATGTAG TCTGTGATTC GAATGTTTAA ACTGTAACCT GGTCTATTCT TTAGTTACTC AGGTCGTATT ACTACATTGT  TTTCCTTGCT GTTCTGTGAC TATCTGGAGA TTTATATATA TCGTATGAAA AAGGAAAAGA AATGACTTAT TTCTCTGCTA CGGCATTCTA TTTCGACTAT TGAGTTATCG GGATTTTGGA  AATACCTGGG TTCTCTGTTT GCATACACAG ATTTCTTTGG TCTTCTAGTT TTAGAAATAT TTTCTTTATT TGAGTCTGCT TCTGCTGCGC CGTTCTCCGG GTGTACGCCT GTGTGTACAA  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CDS
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ATCAGTCCTC TCAACGGGTC TAGTGGTGAA ATTAGGCTGA ACTGTCGTAA AATGAATTGA 

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