Entry information : PabPrx183 (MA_651584g0010)
Entry ID 12713
Creation 2013-12-19 (Qiang Li)
Last sequence changes 2017-06-09 (Justine Latour)
Sequence status partial
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2017-06-09 (Justine Latour)
Peroxidase information: PabPrx183 (MA_651584g0010)
Name (synonym) PabPrx183 (MA_651584g0010)
Class Class III peroxidase     [Orthogroup: Prx002]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Pinaceae Picea
Organism Picea abies (Norway spruce)    [TaxId: 3329 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value PabPrx183
start..stop
S start..stop
PtaPrx32 491 4e-177 1..271 94..364
PtaPrx15 441 4e-158 1..272 36..306
PabPrx231 429 7e-153 1..272 90..360
PtaPrx19 425 2e-151 1..271 70..340
Literature and cross-references PabPrx183 (MA_651584g0010)
Protein sequence: PabPrx183 (MA_651584g0010)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   272
PWM (Da):   %s   29611.71  
PI (pH):   %s   8.86
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MHFHDCFVRG CDGSVLIDSI ANNSAEKDSP ANNPSLRGFD VIDAAKSRLE TVCPNTVSCA DILAFAARDS AKLASPYEYR LSWDVPAGRR DGRISRSSDI VGNLPPPFFN VSQLTQIFAA  KGLSQQEMVI LSGAHTIGIS HCSSFVSRLY NFNSTFQTDP SLDSNYARIL KAQCPQGSPS NAKTTVPMDV MTPNTLDNLY YDGLKRNRGL FTSDAGLLTN PNTRNVVNAN SGRYNLRRWQ 
LSFSAAMVKM GKIGVLSGNQ GEIRHNCRVI NR 

Retrieve as FASTA  
Remarks Partial sequence from genomic. Incorrect prediction (5' is missing and not found 2000nt downstream)
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
GAGACTTTCA GTTAATAGAA GTCAGTTTCC TTTCACATCT TTGTAAATCA TGTGTCAAAA CACTCGGAAT TGGAGGATCC AATCGAGGAT TGTTATGTTG TTATGACGGA GGTTTGATCA  TAGCAATATT GTGATCAGTT TTACTCAATT TCCTATGTTG TCTTGTTCTC TCTCGCACTG AATAGCTCAG AATTGGAAAA TTCAGTCGAG TTGTTGTAGT TGCACGGTGA TGGAGGTTTG  ATCATCACAC TATTGGAACT GTGTTATTTA GGCACATTTT AGTGTCTGAA ACTTGGGCTC GAAAGCATCA TTGAGCCTAA GTTTATCTTC TTTCAAGTTG CTAGAAGGCT GGATGCCCAT  AGCAGTCTTG TTCTCTTTTT CTCACCAAGT CTTCCCTCTG CTCACTTTTA AACTCAATCC ACTAATTGAT GTTAATATGG CCCTCACTTC CCTATGCATT TCTTGTCCGA TTATGTGTTG  TAACATCATT CTAGTGCTGA GTTTTGTCCA TTGACCTCCA CCCATTTAAA CCAACATCCA CCTATAACAT AAACTCATAA ACTCTGATGG GTATCAAACT TACCTCTGCA GCAATCTAGA  GAGGACTTTT GGTGCTAACA CACCCATAAA TCAGAATGTT GACCTGTCAT GATTTTAGCT CAGATATAAT ACTTGAAAAT CCAATGTAAA GCGTTTAGCA TTTATTGTCA TGAACGATTG  ACCTTTGAAC AAAAATATAT AAAGTGCAAG TTGATAGAAT CATAATCAAA CGAGCTTCCC ACGTTGTATC TTTCCAATTG TAGAGCAGCT GTAGAAAATA ATATGTCGTG AACACGTTCT  ATCTAAATCC AGATTGGAAA GCATGTTCTA CTTAACAAGA CGAATTCGTA GATAATATGT CTGACTTTTT CTCGATTCCA ATTCGCACAC TAAGAATTGA CCCTCCACAA TAATACCCAT  CTATAAATAC ATCCCTTCAA ATTCAAATGC TTATACGGGT TTGTTTCTCA ACCTTCTAAA GTGCTACTGC TTACGAATCG ATTCTCTGTG CCCATCCCCG TTTAGTGTCT TGAAACGGCA  ATGACGAAGC ACTGTAAATC CACCCTCCTT GTCATATTAT TTTGGGCCTT AGCTGGTATT GCAGTAAGCG TGGACCTTGG ATTTGTTAAT GAAATAGCGA GTGGTTTTAA CCTCGGAAAT  GGCACCTCTA AAGCACCGGG TTTTTATAGG GATCTTAGAG TGGGTTTCTA CCGTTGGACT TGTCCAGCTG CGGAATCCnn nGGGATCTTA GAGTGGGTTT CTACCGTTGG ACTTGTCCAG  CTGCGGAATC CATTGTGTTC GAGGCGGTGA GAAAGGGATT CATGAAAAAT AATGGAGTAG CGCCGGGACT CATTCGAATG CATTTCCATG ATTGTTTCGT CAGGGTACGC AATATTCAAT  CCATCATCTA CATTAACATT TTCTCCTGCC TGTGCTAACA GTTACATATT ATCATCATAT CTGTAACTCA CTCCAATGCA AATGCAATAA TAAAATATAT TCCAGGGATG CGATGGGTCT  GTTCTCATAG ACTCGATTGC CAACAACAGT GCAGAGAAAG ACAGTCCAGC TAACAATCCG AGTCTTCGCG GATTTGATGT GATTGACGCA GCGAAATCAA GATTAGAGAC CGTCTGCCCA  AACACTGTGT CTTGTGCAGA TATCCTCGCA TTTGCTGCTA GAGATAGCGC AAAGCTGGTA ATTATATTCT TCTCTTCGGA AATTTCTTCA TTTATGTTCA AATGGCATCA ATAAGCTGGT  AATTATAATA TTCTTAATCG TTGGCAGGCA TCTCCATATG AATATCGTCT GAGTTGGGAT GTTCCGGCTG GACGAAGGGA TGGAAGAATT TCACGATCTT CAGATATCGT GGGAAACCTA  CCTCCCCCAT TTTTCAATGT AAGCCAGCTA ACCCAGATCT TTGCAGCCAA AGGTCTATCA CAGCAAGAGA TGGTTATACT GTCGGGTACG TACTAATCCG TGGTTGGGTG CATATGAATA  TTAATATTGT TCATCATTGT AATATGTAAA GTTGGGTGCA TGCATGCAGG AGCACACACC ATTGGCATCT CTCATTGCTC CTCATTCGTG AGCAGGCTCT ACAACTTCAA CAGCACTTTT  CAGACGGACC CGTCTCTTGA TAGTAATTAT GCGAGGATAC TGAAGGCACA GTGTCCTCAG GGAAGCCCTA GCAACGCTAA AACGACCGTC CCCATGGATG TTATGACGCC CAACACTCTC  GACAATCTCT ACTACGACGG CCTTAAAAGG AACCGCGGTT TGTTTACCTC CGATGCAGGG CTGCTTACAA ATCCAAACAC CAGAAATGTG GTCAATGCAA ACTCCGGGCG CTATAACTTG  CGCAGGTGGC AGCTAAGCTT TTCTGCTGCC ATGGTTAAGA TGGGAAAGAT TGGCGTATTG AGTGGCAACC AGGGAGAAAT CCGCCACAAC TGCAGGGTCA TCAACAGATA ATCCAAGCGC  GAATTGCGAA TTAAAATAAT TCATCTCATC ATAGTCAATA ATTCGCTTGC TCGCTACTAG CGCTGCATAA GCCCACCATT CTTATATTCC TTTCACGAAT AAAACACAAA GAACCGTAGT  ACTCGCGAGT TTTACTTGTT ATTCGTCTTC CTCTCAACGA GATGAAAGTC TCGGGAGTTT TACTTGTTAT CTGTTTCCCT CTTAATGAGA TGAAAGTCTC TGTATCTTTG TATGAGGATG  AGATGAAATC TTTGTATCGA TTAACGATTT TGCATTAATG GATGTATATC TTTCAGAAAA TAATTTTATA TTAAAATAAA AATTTTAAAT TTATTTTAAA TTGGTATTTA TAAACAAAAT  TTAAAATATA ATTTTTTTCA TATTTTATTT TGATTTTTAT TAATTAAAAT TTATAAATAA AAATAATCAT CATCTAATTT TATTAATTAA AATTTATAAA TAATAATAAT TATTATCTAA  TTTAATTTTA AGATCACAAT TAAAATATTT AGACTAACAC AGTCACATAA TAATTATGTG GCTAATGAAA GCGAAAAGGC ATAATAAATC TACAAACTCT AAAATAAACC GTAATTAAAG  TTTTATTCAA AAATAACAAA TACAATTATT ACAATACAAT TAAGGTATAA TTAAAGTTTT ATTCAAAAAT AACAAATACA ATTATTACAA TACAATTAAG GTAAATTCAA TAATTTAAAG  CCTCTCTTTA CGCTTTATAT TTTAAAGACT CTTTACCCTT CATATTCACT TTGAAAGCGA CAGTCGCGCA TTCATTTTTA TTACCAGCAC CATACAAAAA AGTGTATTAA ATATGCCAGT  GTATTTTTAA AACGTTTTAA TTATTGGGAC AGCAAAGTCG CTGTTTACTT CAATGTTTTT GGGATTTCAA AACAAGTGGC GGCTGTTACA GTAACCCGCA GTTGAAATGT GATCCGCGAA  TATGGAAAAC TTGAAGTATG CATTCATATT TGTTTTCTCC ATTCTGTCTA ACGTAATCAC TTCACTCCAG TAGATAAATA ATAAGTTGTG GGCACTTCAT AATCCACAAA CATGGGGTAA  GGAGGCGGTG GTTTAATCTT ACTTAATCAT TTAAATGTGG CAATTACATA TCCTTACCGT AATTTTTTAA TGTGATTAGA TAAATGTTAA AAAGTAAACA TGTTAACGGA TGCCTTTATA  AATGCAAGAA AGTTATGAAC AATAAATCTG ACCCATTGAT TTTGGAGGAC GACTAAGAAT ATACCAGCAT CTTCAATGCA TAGCCATATG CATTTCCATG ATTGTTTCGT CAGGGTACGC  AATATTCAAT CCATCATCTA CATTAACATT TTCTCCTGCC TGTGCTAACA GTTACATATT ATCATCATAT CTGTAACTCA CTCCAATGCA AATGCAATAA TAAAATATAT TCCAGGGATG  CGATGGGTCT GTTCTCATAG ACTCGATTGC CAACAACAGT GCAGAGAAAG ACAGTCCAGC TAACAATCCG AGTCTTCGCG GATTTGATGT GATTGACGCA GCGAAATCAA GATTAGAGAC  CGTCTGCCCA AACACTGTGT CTTGTGCAGA TATCCTCGCA TTTGCTGCTA GAGATAGCGC AAAGCTGGTA ATTATATTCT TCTCTTCGGA AATTTCTTCA TTTATGTTCA AATGGCATCA  ATAAGCTGGT AATTATAATA TTCTTAATCG TTGGCAGGCA TCTCCATATG AATATCGTCT GAGTTGGGAT GTTCCGGCTG GACGAAGGGA TGGAAGAATT TCACGATCTT CAGATATCGT  GGGAAACCTA CCTCCCCCAT TTTTCAATGT AAGCCAGCTA ACCCAGATCT TTGCAGCCAA AGGTCTATCA CAGCAAGAGA TGGTTATACT GTCGGGTACG TACTAATCCG TGGTTGGGTG  CATATGAATA TTAATATTGT TCATCATTGT AATATGTAAA GTTGGGTGCA TGCATGCAGG AGCACACACC ATTGGCATCT CTCATTGCTC CTCATTCGTG AGCAGGCTCT ACAACTTCAA  CAGCACTTTT CAGACGGACC CGTCTCTTGA TAGTAATTAT GCGAGGATAC TGAAGGCACA GTGTCCTCAG GGAAGCCCTA GCAACGCTAA AACGACCGTC CCCATGGATG TTATGACGCC  CAACACTCTC GACAATCTCT ACTACGACGG CCTTAAAAGG AACCGCGGTT TGTTTACCTC CGATGCAGGG CTGCTTACAA ATCCAAACAC CAGAAATGTG GTCAATGCAA ACTCCGGGCG  CTATAACTTG CGCAGGTGGC AGCTAAGCTT TTCTGCTGCC ATGGTTAAGA TGGGAAAGAT TGGCGTATTG AGTGGCAACC AGGGAGAAAT CCGCCACAAC TGCAGGGTCA TCAACAGATA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGCATTTCC ATGATTGTTT CGTCAGGGGA TGCGATGGGT CTGTTCTCAT AGACTCGATT GCCAACAACA GTGCAGAGAA AGACAGTCCA GCTAACAATC CGAGTCTTCG CGGATTTGAT  GTGATTGACG CAGCGAAATC AAGATTAGAG ACCGTCTGCC CAAACACTGT GTCTTGTGCA GATATCCTCG CATTTGCTGC TAGAGATAGC GCAAAGCTGG CATCTCCATA TGAATATCGT  CTGAGTTGGG ATGTTCCGGC TGGACGAAGG GATGGAAGAA TTTCACGATC TTCAGATATC GTGGGAAACC TACCTCCCCC ATTTTTCAAT GTAAGCCAGC TAACCCAGAT CTTTGCAGCC  AAAGGTCTAT CACAGCAAGA GATGGTTATA CTGTCGGGAG CACACACCAT TGGCATCTCT CATTGCTCCT CATTCGTGAG CAGGCTCTAC AACTTCAACA GCACTTTTCA GACGGACCCG  TCTCTTGATA GTAATTATGC GAGGATACTG AAGGCACAGT GTCCTCAGGG AAGCCCTAGC AACGCTAAAA CGACCGTCCC CATGGATGTT ATGACGCCCA ACACTCTCGA CAATCTCTAC  TACGACGGCC TTAAAAGGAA CCGCGGTTTG TTTACCTCCG ATGCAGGGCT GCTTACAAAT CCAAACACCA GAAATGTGGT CAATGCAAAC TCCGGGCGCT ATAACTTGCG CAGGTGGCAG 
CTAAGCTTTT CTGCTGCCAT GGTTAAGATG GGAAAGATTG GCGTATTGAG TGGCAACCAG GGAGAAATCC GCCACAACTG CAGGGTCATC AACAGATAA 

Retrieve as FASTA