Entry information : PabPrx187(PAB00050613 / MA_66808g0010)
Entry ID 12717
Creation 2013-12-19 (Qiang Li)
Last sequence changes 2013-12-19 (Christophe Dunand)
Sequence status partial
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2021-04-13 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: PabPrx187(PAB00050613 / MA_66808g0010)
Name PabPrx187(PAB00050613 / MA_66808g0010)
Class Class III peroxidase     [Orthogroup: Prx008]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Pinaceae Picea
Organism Picea abies (Norway spruce)    [TaxId: 3329 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value PabPrx187
start..stop
S start..stop
PtaPrx128 591 0 1..324 1..323
PtaPrx127 573 0 1..324 1..323
PabPrx18 551 0 1..324 1..323
PtaPrx113 549 0 1..324 1..323
Literature and cross-references PabPrx187(PAB00050613 / MA_66808g0010)
Protein sequence: PabPrx187(PAB00050613 / MA_66808g0010)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   324 (296)
PWM (Da):   %s   34453.03 (31429.5) Transmb domain:   %s   i7-26o
PI (pH):   %s   7.05 (6.65) Peptide Signal:   %s   cut: 29 range:29-324
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MVALMKSLLA YIAVMVFLMC SITNSVHGQL NSTFYNNSCP AALSIVQAAV KQAVANEKRM GASLLRLHFH DCFVNGCDGS VLLDDSSTLT GEKTAIPNNN SARGFEVIDS IKSQLENACS  GVVSCADILA IAARDSVVEL GGPSWTVMLG RRDSTTASLS AANANIPPPT SNLSSLISLF QAQGLSTMEM VTLVGSHTIG QARCVSFRGH IYNDTDIDST YSTSLRTKCP PTNGSGDSNL 
SPLDFITPTV FDNNYYNNLK SNKGLLHSDQ EIFNGGSTVS QVTIYNTNQN TFFSDFAAAI VKMGNIKPLT GSSGEIRKNC RKPN 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic. Correct prediction.
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGTTGCTT TGATGAAGAG CCTCCTCGCA TACATTGCTG TAATGGTGTT TCTCATGTGT TCGATTACTA ACAGCGTGCA TGGGCAACTG AACTCAACGT TTTATAACAA TTCTTGCCCG  GCAGCGCTGT CGATAGTGCA GGCCGCAGTG AAGCAAGCAG TGGCCAACGA AAAACGGATG GGGGCATCGC TTCTCCGCCT CCACTTCCAC GACTGCTTTG TTAATGTGAG TAAAATAATT  TAGGTTAATC ATTGAACGTG CTTAACAACG GTATTCATTA ATGGCGATAT TTTGCTGGGT GTTTCTTTTA TTTATTTTGT GAATATAGTA GTTTAGTTTA AGTGTTTTAT GTTTTTGTTT  TTTTTTTTAT ATATTTTTGG ATTTTTATTG AAATTTAATT GGAAGTTGAA GTTGTTGTAT TTGTAGATTT GAGTGGTTAA TTTTATGTAA TCTAAGTGTT TCAAAGGTTT TTTTAACAAG  GTGAATTCAT TTCTGCATTC AAAAATGTAA TTTAAAGATT TAGTTAAATC TATATAGAAT TAACTAAAAA TACAAAAATG TAAAACAGTT AGACAAGGCA AATTTAAAAG TTATGCACAA  TATCTTTGAT AAATTTATGG ATGTATGGTA TAGTAGTGTA TTTAATCAAA GGTTACCTAC TGAAGAAATT AAATATCCAC TAAAAAAATA AAAATGTAAA ACAGTTAGAC AAAGCAAATT  TAAAGGTTAT GCACAATATA AAAATGTAAA ACAGTTAGAC AAAGCAAATT TAAAGGTTAT GCACAATATC TTTGGTAAAT TTATAAATGT ATGGTATAGT AGTGTATTTA AACAAAGGTT  ACCTAAGGTA CATTGAAGAA GTTAAATATC CAATTAAATT TATAAATTTA AACTTTAATT TAATTAAAAT CAGAAATAGA GATTCAATAA CATAATAACA GTGAGACCAC ATAGAAGTGA  GACTACTTCA CACTTTTCAT CTCAATTTAA TAAATTGTAT ACAAATATTA AATTGTATAC AAATATATAA GCTAGGATAT CTGGTAACAG TCTCCTTAAT ATGTGGATTT GAAAACCATT  TAAACTATTT CTTAATTATG GCATTTAGTC ATTATTATCC AACACTCTTA ATTAATAGAA AAATAGATAT ATGACAATTC AAACAAAAAC TTAAAATTTT TTTCAACTCA GATTTTTTAT  TTTTCTTTTT TTCAGATTCT GAATCTTCTA TGCATTTTCA ATTTAAGTCT TCCTCTTTTG CTGAAAATTT CATGTTTCAG CTTCTTATGC TTAATCTTCT TGTTAGAGTT TGTCATTAAT  CTGAAGATTA TTTCAGATTG TTCATGTTTA TCCTCTTTAA TTTTTTCTTC AAAAAATTGT TTGTATGTGA ACTGCTACCA CATACCATTC TTTATTGTTT GTTCTTCACC ATTAAGCTTA  TGATCATCAA TTTACTGCAA CATTAACATC TAATTCAGAC AACCAAACCT ACAATTTTAA CCATTTCCTA ACTATGGCAT TTGGCCATTA TTATCCAACC AATTTCGAAG ATGAATCTGA  TTCAATTAAC CAACTTCTTA TTTCACTACA ACTCATGCAT TTAATTATTC TGCTTAGGCA AATTTTGAGC GTGTAATTTC TTGCAGGGCT GCGATGGGTC AGTGCTGTTG GACGACTCCT  CGACTCTAAC TGGCGAGAAG ACCGCCATTC CCAATAACAA TTCGGCTAGG GGCTTCGAGG TGATCGATAG CATAAAGAGC CAACTCGAGA ATGCTTGCAG CGGAGTCGTT TCCTGTGCAG  ACATTCTCGC TATTGCTGCT CGTGATTCTG TCGTTGAAGT AAGCTCTGTT GTTCTTGCTT TGAATCATTT CTTAGAACTG AAGCCATCTG ATTATATCAG GTAATAATGA ATATATCTTA  TGGAATTATT AATTAATTAC CAGTTGGGTG GGCCTTCATG GACGGTGATG TTGGGGAGGC GAGACTCGAC AACAGCAAGC TTAAGCGCTG CAAACGCTAA CATTCCGCCG CCCACTTCCA  ATCTAAGCAG CCTCATCTCA CTATTCCAAG CGCAGGGGCT CTCCACAATG GAAATGGTTA CACTTGTTGG TAATATTATT TCTTAATGAA CATAAAAACC CATTTTTGCT GTTGATCGGA  AAAAATATAT ATTTATTTTT GGGTGGCGTT GAATTGATAC GCTATGATAT ATTCAATCCG TAGGTTCTCA CACTATCGGG CAAGCTCGGT GCGTGAGTTT CAGAGGCCAT ATTTACAACG  ACACTGACAT AGACAGTACG TACTCTACTT CATTGCGTAC AAAGTGTCCT CCTACCAACG GCTCTGGAGA CAGCAACCTC TCGCCATTGG ATTTCATCAC TCCCACCGTC TTTGACAACA  ACTACTACAA CAATCTGAAA AGCAACAAAG GACTTCTCCA CTCCGATCAG GAAATCTTCA ACGGAGGCTC AACTGTCTCA CAGGTGACTA TCTACAACAC CAACCAGAAC ACTTTTTTCT 
CCGACTTTGC TGCCGCCATA GTAAAGATGG GGAATATCAA ACCTCTGACG GGAAGCAGCG GAGAGATCCG AAAGAATTGC AGGAAGCCTA ACTGA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGTTGCTT TGATGAAGAG CCTCCTCGCA TACATTGCTG TAATGGTGTT TCTCATGTGT TCGATTACTA ACAGCGTGCA TGGGCAACTG AACTCAACGT TTTATAACAA TTCTTGCCCG  GCAGCGCTGT CGATAGTGCA GGCCGCAGTG AAGCAAGCAG TGGCCAACGA AAAACGGATG GGGGCATCGC TTCTCCGCCT CCACTTCCAC GACTGCTTTG TTAATGGCTG CGATGGGTCA  GTGCTGTTGG ACGACTCCTC GACTCTAACT GGCGAGAAGA CCGCCATTCC CAATAACAAT TCGGCTAGGG GCTTCGAGGT GATCGATAGC ATAAAGAGCC AACTCGAGAA TGCTTGCAGC  GGAGTCGTTT CCTGTGCAGA CATTCTCGCT ATTGCTGCTC GTGATTCTGT CGTTGAATTG GGTGGGCCTT CATGGACGGT GATGTTGGGG AGGCGAGACT CGACAACAGC AAGCTTAAGC  GCTGCAAACG CTAACATTCC GCCGCCCACT TCCAATCTAA GCAGCCTCAT CTCACTATTC CAAGCGCAGG GGCTCTCCAC AATGGAAATG GTTACACTTG TTGGTTCTCA CACTATCGGG  CAAGCTCGGT GCGTGAGTTT CAGAGGCCAT ATTTACAACG ACACTGACAT AGACAGTACG TACTCTACTT CATTGCGTAC AAAGTGTCCT CCTACCAACG GCTCTGGAGA CAGCAACCTC  TCGCCATTGG ATTTCATCAC TCCCACCGTC TTTGACAACA ACTACTACAA CAATCTGAAA AGCAACAAAG GACTTCTCCA CTCCGATCAG GAAATCTTCA ACGGAGGCTC AACTGTCTCA  CAGGTGACTA TCTACAACAC CAACCAGAAC ACTTTTTTCT CCGACTTTGC TGCCGCCATA GTAAAGATGG GGAATATCAA ACCTCTGACG GGAAGCAGCG GAGAGATCCG AAAGAATTGC 
AGGAAGCCTA ACTGA 

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