Entry information : PtaPrx98(PTA00006650)
Entry ID 12719
Creation 2013-12-19 (Qiang Li)
Last sequence changes 2013-12-19 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2021-02-10 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: PtaPrx98(PTA00006650)
Name PtaPrx98(PTA00006650)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx003]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Pinaceae Pinus
Organism Pinus taeda (loblolly pine)    [TaxId: 3352 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value PtaPrx98
start..stop
S start..stop
PabPrx86 617 0 1..330 1..329
GbPrx05 536 0 4..327 13..336
PtPrx31 459 5e-164 25..328 29..331
CclPrx34 457 2e-163 23..327 25..329
Literature and cross-references PtaPrx98(PTA00006650)
Protein sequence: PtaPrx98(PTA00006650)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   330
PWM (Da):   %s   35930.92  
PI (pH):   %s   6.72
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MGAAALYVNV AVLVGFCCYG VVAQLSRDFY MNTCPNVERI VRNVVAQKLT EAPTSAPGAL RLFFHDCFVE GCDASVLIAN SSEDNVAEKD ADINLSLPGD GFDVFIRAKR ALELQCPNVV  SCADVMAIAT RDLVSMVGGP SWEVLKGRRD GLISKASRVA GNLPTVNMTV EQLISLFRSK GLSQVDLVTL SGAHTIGFSH CNEFIYRIYN YSKTSDIDPT MNPSYARSLR GICPQYGFDP 
TVVAFNDVST PTTFDNAYYQ DAIRGLGLLA TDQILYVDPR TRGYVNAFAK SGQSFFNNFA VSMIKLGNVG VKTGKQGEIR RDCASFNNYN * 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic. Incorrect prediction (two extra repeaded seq).
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGGGGCTG CAGCTTTGTA TGTAAATGTT GCAGTGCTGG TGGGATTTTG TTGTTATGGA GTTGTGGCGC AGCTGAGCAG AGACTTTTAC ATGAATACTT GCCCTAATGT AGAGAGAATC  GTGAGAAATG TGGTGGCTCA AAAGTTGACA GAAGCTCCCA CTTCGGCTCC CGGGGCCCTC AGACTCTTCT TCCATGATTG CTTTGTGGAG GTTGTGTTGC AGATTGTTTT TATTATAGTA  CAAAGTTCTG TAGCCGATTG TTTTTAATAT AGTAAGAAGT TCTGTTGCAG TTTGTTTTTA ATATAGCATC TCTGTAGTCA TCCTCTGTTT TAACATTTAT TTGCTGTGTT CTCCCCCAGT  CCCACCAGCC CCAGCTCTGT TAGAACTTGC TTAGATCGTC ATAGGGGCAG CGCTCAGAAG TATTAGAACT TTCCATGTAT ATGATCAGCC ACCACTTATT ATGCTTTAAT TTTGGATTAT  TTATCATTTT TTATTTTAGT TCAATGTCAG TGTTCATATT GGATGGAAGA ACAATTTTAT CTATAAAACA ATTTTTAACT CCATAAGTGA CTTTGATGCT CAACCCTTTT TTAGAAGATT  AATTTGATAA TCCTAGATAA TCTTCAACTA TTTCTAAAAC ATTTCAAAAA AAACAAAAAA TTAAATTCAG ACAAACCAAC TCATATATCT ATCATAAATC CTCACAATAT GTAATTTATG  TATATTCACC CCTTATTAAA ACACAAATAT TATATTTAAG TATAACCATT CAAATATTAT ATTTAAGTAT AATCATTTCA CTATTTGTAA ATATTTTATA AAATTnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnATTTT TTGTTTGATT AGCTAATTTA TTGGACAATT TGAACCAATA ATTTTTTGAC AGAAGTGTAT TAACAGTGCA CCCATTCAAT ATATTGTGTA TCTTATAAGT  GTTGAAAATG AATCTTTTTC AATATATTGT GTATCTTATG TTGAAAATGA ATCTTTATTT TTATATACTA TTTTGATTGG AAAATAATCC ATGTATAACC ACATAACTCT GATTTAACAG  CCATAATAAT TCAACAGCTT ACAACTCTGA TTCAACAGCC ATGACCACTA AACAGCTTAC AACTTCTTTT GCACTCTGGT CACTCTTCTT TAGGTTCCCA CTGGGCTCAC CCCTGTGCAT  GAGTGTCATC CACCAACTAA ATTTAGGATT GTGTATTTAG AAAGTTTTAA TACTTCTCCA CAGCACACTG ATCAGAGATC TGATGAGGTG CTACTATAAC AGCCTTGTAA TATTGGTTTC  ATATTTTTCT AAAGCTTTGA GTGTTTTTAA TGGAGTTCTG GTGTTACAGG GTTGTGATGC ATCTGTGCTT ATTGCTAACA AGGCTTTCAG TGTTTCTAAT AAGGTTCTGG TGTTGCAGGG  GTGTGATGCA TCTGTGCTTA TTGCTTCCAG TGAGGATAAT GTAGCGGAGA AAGATGCAGA CATTAACCTA TCGTTGCCAG GAGATGGATT TGATGTTTTC ATTCGAGCAA AGAGAGCGTT  GGAATTACAG TGCCCAAATG TGGTGTCTTG TGCTGATGTA ATGGCCATTG CAACCAGAGA TCTGGTCTCC ATGGTGTTCT CTCATGACTC TATACCTCTG GTCACTTTTT CTCTGTTGTT  TTAGTGTATT CAATTGTAGA AAGCAGAAGC ACCGTCATGG TTGACATAGG ACAGTAGTTA TTTGTAAAAG TTCCGGGTTG ATAATCTGGT TTTTTTGTGT GGTATATATA GCTTAGTAAT  GAAATTAGGA AAAAAAAAAA TATGAATTAC TCAATCAGGG TAATGGTTAG GTAAATTTCA GAAATATTAT AGTAGATTTC AGGAATGTTT TGGAATTTGA TGGACAAGAA TAAGATCAAA  TCTCATTTTG TTGTTCAGAA CCAGGTTAAA ATATTGACTT TGATTTCTCT CTCAAATTCA AAAATATTTC TAAAATTTGT AATTGCAATA AATTCAACTA GCTAAAATTA AATTGCAAAT  TCTTGACGAT CAAATTTTTC AAATATTCCA AAATTTACAA TCTATATGTA CAAATAACTC ACTAGTCAAT TATGCAAGCT AGTGCACGAT GTGACGGTCA GGGCGGTTGG TTTGCACGCC  CCAGCCTAGT TCGAGTCCTG CTGAGCTTCA GCGTATTCTG CCCCATGTGG TTGTAATGTG ATCGTTTCAA TGTGATGGTT GTCAGGGTGT CTGATACGAA AAAAAAACCA TAATATTTCT  AAAGAAAACT AGCCCCTCCC ATTTCAAAAA AAACTCAGTA ATCAATTAAA TTCAAATAGT TCGAAGATTA TTAAAATTGA CTAAATTCAA ATAGTTCGAA GATTATTAAA GTTTATTCTC  AGATTGAATC AAATTTAACA TTTTGAAAGA CATTTTCACT GAAGAAACGC TTCACTAATG TATTGTATAC TGAAAGCAGG TCGGAGGTCC GAGTTGGGAA GTTCTAAAGG GCCGCAGAGA  TGGCCTCATC TCAAAGGCAT CCAGGGTGGC AGGAAACTTG CCGACCGTAA ATATGACAGT CGAACAGCTT ATTTCACTCT TTCGGTCTAA AGGATTAAGT CAAGTCGACC TGGTTACTCT  TTCTGGTAAT TCAGACATAA ACGCCATGGA TACCTTTCTT CTGAAATCCG AGTCTTTTTA ATGCCTGATA TACCGAATTA CATTGTAGAA TTTTTCTCTT TTGCCATGAT CATTAGAATA  TGGTCCTTTG GTAGACTAAA TACCGGAATT TGAAGAAAAG TAGGGTAATA TGTAGATTAT TTTTGTTTTA GTTGAAGATT ATATAACATT TTTAAAATTT AATAATTGTT TAATATTAAC  AAATTTTATA TTCGTCCCTA CTTTCCAAAT TTTCAAAATA TTTCATAATT CATGATGAAA TTAATTTCCA AAGTATACGT AGAAAATGTA GAAAATGTTC AAAATTAAAT ATATGTAGAA  AATGTAGGAA TTGAGTAAAA ACCCTATGCT ATGCCGTTGC AATAAATCAC TAATAAACAA CCTAGTTACC AAATTCGCAA ATTCAACAAT GGATTTGAAT AGTTACATGA AATTCAATTA  TGTTTGTTTA TAGATTTATT TATTTACGGG TGTATATTTA ATTTTAAAGT ATTAGACAAC AAATTGGTGT ATGAGATTTT TTTGTTTGTG GGATAAAGAA CCCACTTCTA CCCAGTGATT  TGACTGCGAA ATCTATCAAA GCATAAATAT TAATATTCTG CCTCTCTAGC TTTGAATATA TGACTCAGAT TAACACATCT AAATAACCAC CTGCATGTAA AAACAAAAAA TATAAATAAT  CATCCTAACT TTGAAAAGTT GGAAAGTCAT GAAAGTAGGA AAAAAAAATT GTGAAAGTGT GCATTACTGA TTTTCTATAT ATGTTCTTAT CTTAGATAAA TAATAAAGAA ATTTAGAAAC  TAAAAAACCA TGTTAGATTT AAATTTTGTT AAACCTAGGA AGAAAAAGGA AATTTGAAGG TTTTTTTCGA TAAATTGCAT GTAAGGTTGT TATATTAGGT AGAGTTATCA GAAATGACTC  AAATAAATTA GGAAGAAAAT TATCTGTAAC ATGGATATTC TTTTTTAGCA GGTGCTCACA CCATTGGGTT CTCACACTGT AACGAGTTCA TTTACCGCAT ATACAACTAC AGCAAAACCT  CTGACATAGA TCCAACGATG AATCCAAGCT ATGCGCGCAG TCTTCGGGGT ATATGCCCTC AGTATGGTTT CGATCCGACT GTGGTGGCGT TCAACGATGT GTCAACTCCC ACCACCTTCG  ACAACGCCTA CTATCAAGAC GCCATCAGAG GGCTGGGGCT TCTGGCAACC GACCAGATAC TGTATGTCGA TCCTCGCACT CGTGGGTATG TTAATGCATT TGCCAAGTCC GGGCAGAGCT 
TCTTCAACAA CTTTGCGGTG TCCATGATCA AGCTGGGGAA TGTGGGCGTT AAGACTGGGA AACAGGGAGA AATCCGCAGA GACTGTGCAT CCTTCAACAA CTACAACTAG 

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