Entry information : PabPrx228 (MA_941794g0010)
Entry ID 12750
Creation 2013-12-19 (Qiang Li)
Last sequence changes 2017-06-09 (Justine Latour)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2017-06-09 (Justine Latour)
Peroxidase information: PabPrx228 (MA_941794g0010)
Name (synonym) PabPrx228 (MA_941794g0010)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx011]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Pinaceae Picea
Organism Picea abies (Norway spruce)    [TaxId: 3329 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value PabPrx228
start..stop
S start..stop
PabPrx109 644 0 1..333 1..333
PabPrx81 591 0 28..333 1..306
PgPrx06 568 0 1..333 1..333
PabPrx93 568 0 1..333 1..333
Literature and cross-references PabPrx228 (MA_941794g0010)
Protein sequence: PabPrx228 (MA_941794g0010)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   333
PWM (Da):   %s   36224.18  
PI (pH):   %s   8.94
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MVSKKYARKP LQLAGFVIWV LFGLCVSKGS AQLRQNFYAA TCPNVESIVR NVVSQKFAQT FVTVPGTLRL FFHDCFVQGC DASVTIQSTP GNTAEKDYTD NLSLAGDGFD TVMKAKQAVE  NVCPNKVSCA DILTMAARDV VALAGGPQFN VELGRRDGMV SLASNVPGNL PEPTFNLNQL NALFTRKGLN QRDMIALSGA HTLGFSHCSK FANRIYNFSR GRSVDPSLNP AYASQLQQMC 
PRNVDPTIAI NMDPVTPNTF DNVYYQDLQS GKGLFTSDEV LFTDTRSRST VNTYAQSPAA FNKAFVNAMI KLGRVGVKTG TQGEIRLDCS RFN 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic. Correct prediction.
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGTTTCAA AGAAATATGC CAGGAAGCCA TTGCAGTTGG CTGGATTTGT CATTTGGGTA TTGTTTGGAC TGTGTGTAAG CAAAGGATCA GCTCAGCTTC GTCAGAATTT TTATGCAGCT  ACCTGTCCCA ATGTTGAATC TATTGTAAGA AATGTTGTTT CTCAAAAGTT TGCGCAGACG TTTGTCACAG TCCCCGGAAC ACTGAGGCTC TTCTTCCATG ATTGCTTCGT TCAGGTAAGG  GACATACATA TAGATATGTT CAAAATAATG AATGTGTTTT TATTTCTTGA ATTGAAATCG AAATTCTTTA TTCTTTCATT TTTTACCCAT TGTTGAGCCT ATTATTATTA TTAGTATTAA  ACATGGGCTG ATATATAGTG TTGGACAATG TCAATTACGA GATTATGAAT GTTTGCATTG AGATCAAATG GTCTGATTTT GCATTTGGGT TTGCTCAGGG ATGTGATGCC TCTGTGACTA  TTCAGTCTAC TCCAGGAAAC ACAGCTGAGA AAGATTATAC AGACAACTTG TCACTAGCTG GTGATGGATT TGATACTGTA ATGAAGGCCA AGCAAGCTGT AGAAAATGTG TGCCCCAACA  AGGTGTCTTG TGCCGATATC CTAACCATGG CTGCCAGAGA TGTTGTAGCA TTGGTAAGTG ATTTGCATTA TCACAGGGAT AAGTAGCCAA CCTTCTTTTG AAGGAAAACA TATGGATAAA  AAACCAAATT AATGGGTTTT TAGTCCATAG TAAGTCGGAT GAGGATGCTC AAAATCATAA GTAGTTTATC CATAGTATGA AGGGATTGAT AGAATGGTTG AACCACAAAT TTAATTAGTA  TATAAAGATA AAAATTGAAA ATCAGAGCGG GCAACTTTAT CAAATATATT TCTTTGTATC TAAATTTTGA AGGAATATGA TTTTTGTCAT CAAATATATT TCCTTGTATC TAAATTGTGA  AGGAATATGA TTTTTGGTGT TTTTATTTAA AAAAAAACTG TAATGATGGA AATTGGTGAA ATTTCATTAA CAACCTCTGT GACCTTCCAA ACCACTGAAA AAAGAGGGTG CTCAAGTTCT  TCAAGGCATT GACCTAAGGA TTTATTTCAT GCAAATTTTC CGTTATTACA AATCTGAAAT TGTAATTATA GGATTTGGAT TTGGATTTAG ATGATCATAT TACATTTATT CATTCAATAA  TATTAGTTTG TTCTTCTCTT ATTTTGCAGG CTGGAGGCCC ACAATTTAAT GTGGAGTTAG GGCGACGAGA TGGAATGGTA TCACTAGCCT CAAACGTCCC AGGGAACCTC CCAGAGCCTA  CATTCAATCT CAACCAACTG AACGCTTTAT TTACAAGGAA GGGTTTGAAT CAGAGAGACA TGATAGCACT ATCTGGTAAT TAACTGCAAT TTTTATTTTT CCATTTACTT AGTAACTCTG  ATAGTCATAC TCCAACTTCT AACAAAAAAA CCATTTCTCT GATAGTCATA CTCCAACTTC TTAAAAAAAA CCATTTCATA GTCATACTCC AACTTCTAAA AAAAACCATT TCATAGAACA  ATTAATCAAT ATTTTTTAGT TATATTATTT AGTAGAACAG CTAATCAACA CCTTTTAGTT ATGTTATGGT GTAAACTTCC ACCCTCTTCT GAAATGTTAT TAAAATCCAC TCATATTTCT  CCTGTCACCA ACTTTCGTTT TTTGGTCTTT TTACAGGAGC TCACACTCTG GGATTTTCTC ACTGCAGCAA ATTCGCAAAT AGAATCTACA ATTTCAGTCG TGGGAGATCC GTGGACCCAA  GTCTGAATCC TGCGTACGCC TCGCAACTCC AACAAATGTG CCCTAGGAAC GTGGATCCGA CCATTGCCAT CAACATGGAT CCCGTAACTC CCAATACATT CGATAATGTC TATTACCAGG  ATTTGCAGTC TGGGAAGGGA CTGTTCACCT CTGATGAAGT TCTATTCACA GACACACGCT CACGGAGCAC AGTGAACACA TATGCACAGA GTCCAGCTGC GTTTAATAAG GCTTTCGTGA 
ACGCCATGAT TAAATTGGGA CGTGTAGGTG TTAAGACGGG AACACAGGGC GAGATCAGAC TAGATTGCAG CCGCTTTAAT TGA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGTTTCAA AGAAATATGC CAGGAAGCCA TTGCAGTTGG CTGGATTTGT CATTTGGGTA TTGTTTGGAC TGTGTGTAAG CAAAGGATCA GCTCAGCTTC GTCAGAATTT TTATGCAGCT  ACCTGTCCCA ATGTTGAATC TATTGTAAGA AATGTTGTTT CTCAAAAGTT TGCGCAGACG TTTGTCACAG TCCCCGGAAC ACTGAGGCTC TTCTTCCATG ATTGCTTCGT TCAGGGATGT  GATGCCTCTG TGACTATTCA GTCTACTCCA GGAAACACAG CTGAGAAAGA TTATACAGAC AACTTGTCAC TAGCTGGTGA TGGATTTGAT ACTGTAATGA AGGCCAAGCA AGCTGTAGAA  AATGTGTGCC CCAACAAGGT GTCTTGTGCC GATATCCTAA CCATGGCTGC CAGAGATGTT GTAGCATTGG CTGGAGGCCC ACAATTTAAT GTGGAGTTAG GGCGACGAGA TGGAATGGTA  TCACTAGCCT CAAACGTCCC AGGGAACCTC CCAGAGCCTA CATTCAATCT CAACCAACTG AACGCTTTAT TTACAAGGAA GGGTTTGAAT CAGAGAGACA TGATAGCACT ATCTGGAGCT  CACACTCTGG GATTTTCTCA CTGCAGCAAA TTCGCAAATA GAATCTACAA TTTCAGTCGT GGGAGATCCG TGGACCCAAG TCTGAATCCT GCGTACGCCT CGCAACTCCA ACAAATGTGC  CCTAGGAACG TGGATCCGAC CATTGCCATC AACATGGATC CCGTAACTCC CAATACATTC GATAATGTCT ATTACCAGGA TTTGCAGTCT GGGAAGGGAC TGTTCACCTC TGATGAAGTT  CTATTCACAG ACACACGCTC ACGGAGCACA GTGAACACAT ATGCACAGAG TCCAGCTGCG TTTAATAAGG CTTTCGTGAA CGCCATGATT AAATTGGGAC GTGTAGGTGT TAAGACGGGA 
ACACAGGGCG AGATCAGACT AGATTGCAGC CGCTTTAATT GA 

Retrieve as FASTA