Entry information : PabPrx231 (MA_9457778g0010)
Entry ID 12752
Creation 2013-12-19 (Qiang Li)
Last sequence changes 2017-06-09 (Justine Latour)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2017-06-09 (Justine Latour)
Peroxidase information: PabPrx231 (MA_9457778g0010)
Name (synonym) PabPrx231 (MA_9457778g0010)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx014]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Pinaceae Picea
Organism Picea abies (Norway spruce)    [TaxId: 3329 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value PabPrx231
start..stop
S start..stop
PtaPrx15 588 0 55..360 1..306
PtaPrx32 479 5e-171 7..359 9..364
PpPrx06 459 2e-163 37..359 11..333
PtaPrx44 457 9e-163 6..359 6..336
Literature and cross-references PabPrx231 (MA_9457778g0010)
Protein sequence: PabPrx231 (MA_9457778g0010)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   360 (335)
PWM (Da):   %s   38572.15 (35988.0) Transmb domain:   %s   i9-31o (i9-31o)
PI (pH):   %s   7.1 (7.13) Peptide Signal:   %s   cut: 26 range:26-360
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
METNGCCKSA FFAVLFYALA GAAMSANLGV RVETPGLNIG IGTSQAPGVH EGLREGFYSL SCPDAEFAVF EVVKDAFINN PEVAAGLVRM HFHDCFVRGC DGSVLIDSMG KNVAEKDSPA  NNPSLHGFDV IDRAKAKLEA MCPKTVSCAD ILAFAARDSA KLASPLPYPL TWDVPAGRRD GSISLASDIP ANLPPPSFNA TQLTQRFAAK GLSQDEMVTL SGAHTIGVSH CSSFVTRLYN  FNSTHPTDPS LDPVYAMKLK SRCPNGSPDN KTTVPMEVNT PNILDNLYYE GVIKNRGLFT SDATLLTNLN TKKLVFANSG SFSMRRWQQN FAAAMVKMGK IEVLTGNEGE IRVNCRAVNK 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic. Correct prediction.
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGAGACGA ATGGTTGCTG CAAGTCGGCT TTCTTCGCCG TGTTATTCTA TGCCTTGGCT GGTGCTGCAA TGAGCGCCAA CCTTGGCGTT CGTGTTGAAA CACCTGGTCT TAATATTGGA  ATTGGTACGT CTCAAGCACC GGGTGTTCAT GAAGGTCTTA GAGAGGGTTT CTACAGTTTG AGCTGTCCGG ATGCAGAATT CGCTGTGTTT GAGGTGGTGA AAGATGCTTT CATAAACAAT  CCTGAAGTAG CTGCTGGATT AGTACGGATG CATTTCCATG ATTGTTTCGT TAGGGTATGG ATTTGCTTAT ATTCATATTA TTTACATAAT TATTTACTCC GATGCAATTG TATTAGGTTT  TTGAAATCTA AATGTTTCAA CGGTGAACGT GCATTTACAG GGATGCGATG GGTCGGTTCT CATTGATTCT ATGGGGAAAA ATGTGGCAGA GAAAGATTCA CCTGCTAACA ATCCAAGTCT  TCACGGATTC GACGTGATTG ACAGAGCGAA AGCCAAGCTA GAGGCTATGT GCCCCAAAAC AGTTTCTTGC GCAGATATCC TCGCATTTGC CGCTAGAGAT AGTGCAAAGC TGGTAATCTT  GTTCTCCAAA CTAGATATAG CATAGCAGAA AAATAATGTC CAATTCATTC TTATGACGAA CAAATTAATT GCAGGCATCT CCACTTCCAT ATCCCCTAAC ATGGGATGTC CCGGCTGGAC  GAAGGGATGG AAGTATTTCA CTAGCTTCAG ATATCCCGGC AAATCTACCT CCCCCTTCCT TCAATGCAAC CCAGTTAACT CAGAGATTTG CAGCCAAAGG ACTATCCCAG GACGAGATGG  TTACACTGTC TGGTATATTA AAAGACCTGT ATAACCTAAT ACTATTTTTA TATCTTAATG TTAGAGTGAG TATACTGACC ATCTTGTTCT CTGAGCTGTG ATACAGGTGC CCACACAATT  GGTGTCTCGC ATTGCTCTTC ATTTGTGACC AGGCTCTACA ACTTCAACAG TACGCATCCG ACTGACCCAT CTCTCGATCC TGTGTACGCT ATGAAGCTGA AGTCTAGGTG TCCCAATGGC  AGCCCCGACA ACAAAACGAC CGTGCCCATG GAAGTTAATA CGCCCAACAT TCTCGACAAT CTCTACTACG AAGGCGTCAT CAAGAACCGC GGTTTGTTTA CCTCCGATGC AACGCTGTTG  ACAAACTTAA ACACCAAGAA ATTGGTTTTT GCAAACTCCG GCAGCTTTAG TATGCGCAGA TGGCAGCAAA ACTTTGCTGC TGCGATGGTA AAAATGGGAA AGATCGAGGT ATTGACTGGC 
AACGAGGGAG AAATCCGCGT GAACTGCAGG GCTGTCAACA AGTAA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGAGACGA ATGGTTGCTG CAAGTCGGCT TTCTTCGCCG TGTTATTCTA TGCCTTGGCT GGTGCTGCAA TGAGCGCCAA CCTTGGCGTT CGTGTTGAAA CACCTGGTCT TAATATTGGA  ATTGGTACGT CTCAAGCACC GGGTGTTCAT GAAGGTCTTA GAGAGGGTTT CTACAGTTTG AGCTGTCCGG ATGCAGAATT CGCTGTGTTT GAGGTGGTGA AAGATGCTTT CATAAACAAT  CCTGAAGTAG CTGCTGGATT AGTACGGATG CATTTCCATG ATTGTTTCGT TAGGGGATGC GATGGGTCGG TTCTCATTGA TTCTATGGGG AAAAATGTGG CAGAGAAAGA TTCACCTGCT  AACAATCCAA GTCTTCACGG ATTCGACGTG ATTGACAGAG CGAAAGCCAA GCTAGAGGCT ATGTGCCCCA AAACAGTTTC TTGCGCAGAT ATCCTCGCAT TTGCCGCTAG AGATAGTGCA  AAGCTGGCAT CTCCACTTCC ATATCCCCTA ACATGGGATG TCCCGGCTGG ACGAAGGGAT GGAAGTATTT CACTAGCTTC AGATATCCCG GCAAATCTAC CTCCCCCTTC CTTCAATGCA  ACCCAGTTAA CTCAGAGATT TGCAGCCAAA GGACTATCCC AGGACGAGAT GGTTACACTG TCTGGTGCCC ACACAATTGG TGTCTCGCAT TGCTCTTCAT TTGTGACCAG GCTCTACAAC  TTCAACAGTA CGCATCCGAC TGACCCATCT CTCGATCCTG TGTACGCTAT GAAGCTGAAG TCTAGGTGTC CCAATGGCAG CCCCGACAAC AAAACGACCG TGCCCATGGA AGTTAATACG  CCCAACATTC TCGACAATCT CTACTACGAA GGCGTCATCA AGAACCGCGG TTTGTTTACC TCCGATGCAA CGCTGTTGAC AAACTTAAAC ACCAAGAAAT TGGTTTTTGC AAACTCCGGC  AGCTTTAGTA TGCGCAGATG GCAGCAAAAC TTTGCTGCTG CGATGGTAAA AATGGGAAAG ATCGAGGTAT TGACTGGCAA CGAGGGAGAA ATCCGCGTGA ACTGCAGGGC TGTCAACAAG 
TAA 

Retrieve as FASTA