Entry information : GbPrx28(/ Peroxidase19)
Entry ID 12769
Creation 2013-12-19 (Qiang Li)
Last sequence changes 2015-03-04 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2020-11-25 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: GbPrx28(/ Peroxidase19)
Name GbPrx28(/ Peroxidase19)
Class Class III peroxidase     [Orthogroup: Prx029]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Ginkgoopsida Ginkgoaceae Ginkgo
Organism Ginkgo biloba    [TaxId: 3311 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value GbPrx28
start..stop
S start..stop
PabPrx102 538 0 4..326 3..325
AtrPrx25 429 4e-152 21..326 22..329
MguPrx13 427 3e-151 24..323 42..344
RcPrx49 427 3e-151 24..323 48..350
Literature and cross-references GbPrx28(/ Peroxidase19)
Protein sequence: GbPrx28(/ Peroxidase19)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   327
PWM (Da):   %s   36042.56  
PI (pH):   %s   9.6
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MRVVQLMKLV ILTWALRIRI TNAQLTVDFY SKTCPNVEAL VLGVARQKFV EAPVSAPATI RLFFHDCFVD GCDGSVLISS TPRQLAERDA DDNKNLAVEA FDAVNKAKAV VEAKCPGVVS  CADILAIAAK DFVVLAGGPN YPVKKGRRDG RVSLATRVRG NLPQANFTVD QLLRNFASKG LNRSDLVALS GAHTIGFSHC NGFLDRLYNF HGTNLPDPSM DPRLVKALKM SCPKVGGNAD 
IVEPFDVNTP FQFDHMYYQN LQRKMGLIGT DQALFSDPRT NFLVQYFGKT RNNFFQFFSL AMEKMGNIGV KTGKQGEIRK ECTKFNH 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic (no prediction from SymDB) and RNA seq (gba_locus_22527_iso_1_len_1280_ver_2). No EST found.
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGCGGGTGG TCCAGTTAAT GAAGCTGGTC ATTCTAACTT GGGCTCTGCG TATTAGAATC ACAAATGCTC AGCTTACTGT GGATTTTTAC TCAAAAACTT GTCCTAACGT GGAGGCATTG  GTATTGGGTG TGGCTAGACA GAAGTTTGTT GAAGCACCTG TGTCAGCTCC TGCCACAATC AGGCTTTTTT TCCATGACTG TTTTGTAGAT GTATGGTGAT CTTTCTTTAT GCCGAGAGAT  TTGATTGTAT GAACTATGAC AAAACGTTCC TCTGAGATAT GATAATTTAA GCTGAATTGT GCCATAGTTT GGTTTCATTA ATGGGCTGTG TTAGTTTGTT AAAATATGTT GAACCATTAT  TGAGTTTCAT TGTTGTTGTG ATTGTGTTAA ATTTTCAGGG GTGTTGTATG GTTAACCTCG TATTTGTTTT TAATCTATTT GCTTCCTAAG ATGCATTCTT TTGCAGGGAT GTGATGGATC  AGTGCTAATT TCTTCCACAC CAAGACAACT TGCTGAGAGG GATGCTGATG ATAACAAGAA CCTAGCAGTT GAGGCCTTTG ATGCTGTTAA CAAAGCTAAA GCAGTTGTGG AGGCCAAATG  CCCTGGTGTT GTCTCTTGTG CTGACATTCT CGCCATTGCA GCTAAAGATT TTGTTGTTTT GGTATGTGGG TTTTAAACAT ACGTTTCTGC CGCCCTTTTC AATGCTTTGC TTGTATTGTT  ATTTGTTTCT GTAACACTTT GAAGAATTAT GATCTCCATC AGCTTGCCAA AAAGATATAT ATTGTTCACA TAGTGTTACA TGCTTTTATT CTGTAATAAT CATCTGAAGT GTCATGCTCT  CAAAAAGATG TTTTTTTACC ATGGATTAAT ATGGTAACTG CCATCCCAAA GAGATTGTAT GCTGCTTATA TGATACATGT ATTTTTGGAT AGTCATCTGA ATTTTCAGGC AATTAAACTA  ATTGACTGTA AAATATTGGG ATTAATGTTA ATCTGATAAC TAGCACTCCA AAGTTGTTGG ATAAAGATGG GAACATTGTT TTTAGTACTA TGCAGCAACA ATTTCTGAAA AATAATGTTT  TCTTGCTCCT GGTGAAAATA AATTCCTATG TGAACACTGC ATCAGACCCA GTTAAGTTAA AGAGGTTTAC CCATTTACCA ACTTGGTTTT ATCATTTGGG CTTATGAGTG AACTGCATTC  ATTAAGGGAT GAAAATGGTT GATGTTACTG TACACAATGT ACGCAGGCTG GAGGTCCAAA TTATCCAGTG AAGAAAGGCA GAAGAGATGG AAGAGTATCC CTTGCAACTC GAGTTAGAGG  CAATCTCCCT CAGGCCAATT TTACAGTTGA TCAATTGTTG AGAAACTTTG CATCCAAAGG ACTAAACAGA TCAGACCTGG TGGCTCTATC TGGTGAAAAA TTCTAACCAA CACAGATCTT  TTGTTTTTTT TTTCGTTTTT CTATTGTTAA GAATTAGGTG AAGTGCCTAA ATCCTTTGAA TTTTCATTAT TTCAACAATT GAAACACATT TTTATGTTAA AATACATGCT TGTATCATAT  CACAAATTGT AAACTGTATT CCATAATTCT AGAATATATT TCAACGAGAT CAACTAATTC CATACTTATT TTTAGTTGAG AGCTTATATT TGTTTTATTT TAATTACAAT TTCCAATTTG  CATATAAAAA TCCTTCATGA GAACAAGTCC TATCAGGGCT AGAAGAATGA CAGAACTTTA ATTCCTGCCA ATTACATGAA TCTTACCATT CGATTCATGA CTGCAGGAGC CCACACCATA  GGATTTTCTC ACTGCAATGG TTTCTTGGAT CGTCTATACA ACTTTCACGG AACCAATCTC CCGGACCCTT CAATGGATCC AAGGCTGGTG AAAGCTCTGA AGATGTCATG TCCTAAAGTG  GGTGGCAATG CAGACATTGT TGAGCCATTT GATGTCAACA CACCCTTTCA ATTTGATCAC ATGTACTACC AGAATCTGCA GCGTAAAATG GGTCTTATTG GAACTGATCA AGCTCTCTTC  TCAGACCCGC GTACCAATTT CCTCGTCCAA TACTTTGGCA AAACCCGAAA TAATTTCTTC CAATTCTTCT CTCTCGCCAT GGAGAAGATG GGCAACATTG GTGTCAAAAC AGGAAAGCAG 
GGCGAAATCA GAAAAGAATG CACTAAATTC AACCATTGA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGCGGGTGG TCCAGTTAAT GAAGCTGGTC ATTCTAACTT GGGCTCTGCG TATTAGAATC ACAAATGCTC AGCTTACTGT GGATTTTTAC TCAAAAACTT GTCCTAACGT GGAGGCATTG  GTATTGGGTG TGGCTAGACA GAAGTTTGTT GAAGCACCTG TGTCAGCTCC TGCCACAATC AGGCTTTTTT TCCATGACTG TTTTGTAGAT GGATGTGATG GATCAGTGCT AATTTCTTCC  ACACCAAGAC AACTTGCTGA GAGGGATGCT GATGATAACA AGAACCTAGC AGTTGAGGCC TTTGATGCTG TTAACAAAGC TAAAGCAGTT GTGGAGGCCA AATGCCCTGG TGTTGTCTCT  TGTGCTGACA TTCTCGCCAT TGCAGCTAAA GATTTTGTTG TTTTGGCTGG AGGTCCAAAT TATCCAGTGA AGAAAGGCAG AAGAGATGGA AGAGTATCCC TTGCAACTCG AGTTAGAGGC  AATCTCCCTC AGGCCAATTT TACAGTTGAT CAATTGTTGA GAAACTTTGC ATCCAAAGGA CTAAACAGAT CAGACCTGGT GGCTCTATCT GGAGCCCACA CCATAGGATT TTCTCACTGC  AATGGTTTCT TGGATCGTCT ATACAACTTT CACGGAACCA ATCTCCCGGA CCCTTCAATG GATCCAAGGC TGGTGAAAGC TCTGAAGATG TCATGTCCTA AAGTGGGTGG CAATGCAGAC  ATTGTTGAGC CATTTGATGT CAACACACCC TTTCAATTTG ATCACATGTA CTACCAGAAT CTGCAGCGTA AAATGGGTCT TATTGGAACT GATCAAGCTC TCTTCTCAGA CCCGCGTACC  AATTTCCTCG TCCAATACTT TGGCAAAACC CGAAATAATT TCTTCCAATT CTTCTCTCTC GCCATGGAGA AGATGGGCAA CATTGGTGTC AAAACAGGAA AGCAGGGCGA AATCAGAAAA 
GAATGCACTA AATTCAACCA TTGA 

Retrieve as FASTA