Entry information : PabPrx38 (MA_1038g0010)
Entry ID 12776
Creation 2013-12-19 (Qiang Li)
Last sequence changes 2017-06-08 (Justine Latour)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2017-06-08 (Justine Latour)
Peroxidase information: PabPrx38 (MA_1038g0010)
Name (synonym) PabPrx38 (MA_1038g0010)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx093]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Pinaceae Picea
Organism Picea abies (Norway spruce)    [TaxId: 3329 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value PabPrx38
start..stop
S start..stop
PabPrx173 401 1e-140 40..329 76..364
SmPrx81-2_146 343 5e-118 12..330 13..331
SmPrx81-1_124 339 1e-116 12..330 13..331
SmPrx38-2_97 338 3e-116 31..330 26..325
Literature and cross-references PabPrx38 (MA_1038g0010)
Protein sequence: PabPrx38 (MA_1038g0010)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   331 (312)
PWM (Da):   %s   35904 (33880.9)  
PI (pH):   %s   5.16 (4.98) Peptide Signal:   %s   cut: 20 range:20-331
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MSAKFILSLV VMIIYGISGD RSAVLGQLSP DFYRFSCPNV DQIVFETLRT LSARSNVVAP SILRLFFHDC FIQGCDASIM ISSTPFNRAE RDLAENNIGQ TAFDTISEIK REVERACPGV  VSCADIIALA AKDAVALLGG PNWQVPKGRL DGLTSQAATS VGRIPGGNVN SRQLINSFSA LGFSVVEMVV LSGAHTVGFS QCREFSNRLY NFSPVMRTDP SMEPGFVRTL EASCPLTGDP 
SKFQAIDIST PFVFDNTYFK NLVAGRGLLF SDQDLFSGDN ETRDIVMRLA NSQELFFSNF AAAMIKLGSL GVRTDRSNGE IRQDCTAFNS H 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic. Incorrect prediction (extra 5' : corrected on peroxibase, uncorrect on MA_1038g0010-exon1&intron1 nonexistent)
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGTCAGCCA AGTTTATTCT CAGTCTTGTT GTGATGATAA TCTATGGAAT ATCGGGGGAT CGCTCCGCCG TCCTCGGCCA ACTCTCGCCG GATTTCTACA GGTTTTCGTG TCCTAATGTA  GATCAGATAG TGTTTGAAAC GCTGAGAACG CTGTCAGCCC GATCAAATGT GGTTGCCCCT TCCATTCTGC GCCTCTTTTT TCATGACTGC TTTATTCAGG TGCCCATTTC TTCAAGCATT  AACGCAATGA AATATGAATT GTTTTGTCTG AATTCTTGAT TGTCCAGGCT GACTGTTCTC AGGATTTAAA TTACAGCGAA AAAACATTTG AAATTTTGTT TACAGAGGTC TATTTTGTTT  TCAAACATTT TTATTCGAGT CTCGCCAATA TAACCATATC AGATACTGTT TAGAAATATG GCCTTTCCGA TAATATGTTT CCTATATTAG TCTGAAGATA AATTTGGCGT GTTAGAAAAG  TTATTGAAGC AGTTGGTTGC CTAACTCCAA ATAACTAAAA CCATACAACT GCTTTCATGC GATTTTTCAC ATAGGGTTCC TTCTTATTTC AGATGGAGTC GTTGGCCAAA TCAATGCAAA  CACGGAAAAT AACAATAAGC CGTAGAATAT ATGATCAATC TTCTTCAATT AGCAAAAGTT ACAGTGCGAA TAAGCCAATC AAAATAGGAT ATGATGATAC ACCTTTAGTA TATATATAAG  GCGATATGAA GACGTGCAAG AAATCAATAT CGTTAAAATT CCCGGTCGTT GACCAAATTC AATCAAATCT AACAATATTA TTTGGCAACC CACCCTCAGA CTGTCAGGCA AAATTCGTGA  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GGCTTTGTTT TTTTGGTAAT ATTTTATGTG GATAATATTT TCTGTTGAGT TTTGCTTGAA ATTTGGCTAG AATTTGTTGT TTTAAGTTTT GGCTTTTTGA CTTTTTTTTG TAATATTTTA  TGTGGATAAT ATTTTCTGTT GAGTTTTGCT TGAAATTTGC TTTTGAAATT CGGCTAGAAT TTGTTGGATA TGCAGATTTA AATGATTAAT TCTGTATAAT CCCAGTGACC CTTGAACTTT  CAAGAACTTT TGAAACAATT GAAACAATGC CTTAGAATGG CATAGAAAAC AATGACATTG GAACAATGCC TATGACATTG GAACAATGCC TTAGAGTGGC ATAGAAAACA ATTTCAAAGT  GGCATAGAAA ACAATTTCAG CAAGCTGAAA CTCATAAATA AAACAATGGC ATATAATAGC ATAGAAAACA ATGACATATA ATAGCATAGA CTCTTAAATA GACTTCAATG ACATATAATA  GCATAGAAAA CAATTACATA TAATAATATA GACTCATAAA TAGAAAACAA TTCATATAAT AACATAGACT CATAAATAGA AAACAATTCA TAAATAGATA CTTTGGGAGG GGGGCATTAA  TAGATAAAAT GTGTATATAA TATACACATT TTATCTATTA ATGCTTCCCC TCCCACCCTC TATAATAGCA TAGACTCTTA AATAGACTTT TTAAATAGAA TAAATAGAAT AGTTGATTAA  ATAGACTTCA TAAATAAAAT AGTTGATTGT TATCCTTTTC ACCCAGGTTC ATTTCTCTCA ATTCTCCATA ACCTCTGACA TGTTATTATC TCTGTTGAGC TTTTAACCTG GAAAAAAATC  ATAAAAACCA TTTGAATGAA AAAAAAAAAT AACATCATTT GAATGCAAAA AAATAGCATC AATTACATAT AATAGCATAG ACTCATAAAT AGAAAACAAT TACATATAAT AGCATAGACT  CTTAAATAGA ATAGTTGATT AAATATACTT CATAAATAAA ATAATTGATT GTTATCTTTT TCATCCAGAT TCATTTCTCT CACTTCTCCA TAACCCTCCA TAACCTCTGA CATGTTACTA  TGTCTGTTGA GCTTTTAACC TGCAAAAAAA TCATAAAAAC CATTTGAATG CAAAAAAAAC TAACATCATT TGAATGCAAA AAAAATAGCA TCTGAATGTT GAGCTTTTAA CCTGCAAAAA  AATCATAAAA ACCATTTGAA TGCAAAAAAA ACTAACATTA TTTGAATGCA AAAAAAATAG CATCTGAATG CAAAAATATT AGTACCATTA ATCTCTCAAT AACCTCTTTA ATTATTCTTT  ATCGTGACCT GCTACTTAAT CTTTTAAATT CATCTGAGAC ATGACCTGTT TACTTATTTT TTATCATGAA TCCTGTATCT AAAATTTCTC TTGAGAACAA TCTGAACCAT TTCTATAAAA  AAAATGTCTG TATATTAAAC TACCACAATC ATATTAAAAG TGACTGGTGT AAACCAATAA ACAGCTTCCA CACTGAAAAC ATAATGCAAA AAGGCCCGGT TGATTAGTGC AACGAAATAA  TATTTTCTGT TGAGTTTTGC TTGAAATTTG CTCTTGAAAT TCGGCTAAAA TTTGTTGTTA TAAGTTTTGG TTTTGTTTTT TTGGGTAATA TTTTATGTGA ATAATATTTT CTGTTGAGTT  TTGCTTGAAA TTTGCTCTTG AAATTCGGCT AAAATTTGTT GTTCTATGGC TTTGTTTTTT TGGTAATATT TTATGTGAAT AATATTAATA TTTTCTGTTA AAATTTGTTG TTCTAAGTTT  TGGCTTTGTT TTTTTGGTAA TATTTTATGT GAATAATATT TTCTGTTAAA ATTTGTTGTT TTAAGTTTTC GCTTTGTTTT TTTTGGTAAT ATTTCATGTG AATAATATTT TCTGTTGAGT  TTTGCTTGAA ATTTGCTCTT GAAATTCGGC TAAAATTTGT TGTTCTAAGT TTTGGCTTTG TTTTTTGGGT AATATTTTAT GTGAATAATA TTTTCTGTTG AGTTTTGCTT GAAATTTGCT  TTTGAAATTC AGCTAAAAGG CTAAAATTTG TTGTTTTAAG TTTTGGCTTT GTTTTTTTGG TAATATTTTA TGTGGATAAT ATTTTTTGTT GAGTTTTGCT TGATAGAATT TGTTGTTCTA  AGTTTTGGTT TTTTGGTTTT TTTTGGTAAT ATTTTATATG GACAATATTT TCTGTTGAGT TTTTCTTGAA ATTTGCTTTT AAAATTCCGC TAGAATTTGT TGGACATGCA GATTTAAATG  ATTAATTCTG TATAATCCCA GTGACCTTTG AACTTTTTAA GGACTTTTAA AACAATTGGA ACAATGCCTT AGAATGGCAT AGAAAACAAT GGCATTGGAA CAATGCCTAT GACATTGGAA  CAATGTCTTA GAATGGCATA GAAAACAATT TCAGCAAGCT GAAACTCATA AATAAAAAAC AATGACATAT AATAGCATAG ATTCATAAAT AGAAAACAAT GACATATAAT AGCATAGAAA  ACAATTACAT ATAATAGCAT AGACTCATAA ATAGAAAACA ATTATATACT ATATATATAA TAGTATAGAG TCTTAAATAG ACTTTTTAAA TAGAATAGTT GATTAAATAG ACTTCATAAA  TAAAATAGAA AACAATTATA TATAATAGTA TAGACTCTTA AATAGACTTT TTAAATAGAA TAGTTGATTA AATAGATTTC ATAAATAAAA TAGTTGATTG TTATCCTTTT CACCTAGGTT  CATTTCTCTC AATTCTCCAT AACCTCTAGT TGATTGTTAT CCTTTTCACC TAAGTTCATT TCTCTCAATT CTCCATAACC TCTGACATAT TACTATCTCT GTTGAGCTTT TAACCTGGAA  AAAAATCATA AAAACCATTT GAATGAAAAA AAAAATAACA TCATTTGAAT GCAAAAAAAG TAGCATCAAT TACATATAAT AGCATAGACT CATAAATAGA AAACAATTAC ATATAATAGC  ATAGACTCTT AAATAGACTT CTTAAATAGA ATAAATAGAA TAGTTGATTA AATAAACTTC ATAAATAAAA TAGTTAATTG TTATTCTTTT CATCCAGGTT CATTTCTCTC AATTCTCCAT  AACCTCCATA AAATCTGACA TGTTACTATC TCTGTTGAGC TTTTATCTCT GTTGAGCTTT TAACCTGCCA AAAAATCATA AAAACCATTT GAATGCAAAA AAAAATAATA TCATTTGAAT  GTAAAAAAAA AATAGCTTGA ACCTCCATAA AGTCTGACAT GTTACTATCT CTGTTGAGCT TTTAACCTGC AAAAAAATCA TAAAAACCAT TTGAATGCAA AAAAAATAAC ATCATTTGAA  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TTAATGTAGT AATTTTATTT GTTCATATAT TGGAGATGAA ACATCATATT TATCTGATCT TCACTATTCA TCTCCACACC CCTGATATTT AGTATAGTAG TTTTATTTGT TCATATATTG  GAAATGAAAG CGTCGTCTGA TCTTCACTAT AAATAAGTTA TGTACTAAAA GCAAAAGAAA AATCTTGCAG TGATATTGAT TTGGGTGCAA TACTAATTAA GGTAATTGAT AGGGCTGCGA  TGCGTCAATC ATGATTTCTT CTACCCCATT CAACAGGGCG GAAAGAGATT TGGCAGAGAA TAACATTGGC CAAACCGCGT TCGACACAAT CAGTGAGATT AAGAGAGAAG TGGAAAGGGC  CTGTCCGGGC GTGGTCTCAT GTGCCGATAT TATAGCATTA GCAGCCAAAG ATGCAGTGGC ATTGCTCGGA GGTCCAAATT GGCAAGTCCC AAAAGGAAGA TTAGACGGGC TCACCTCTCA  GGCTGCCACT AGTGTGGGTA GGATTCCCGG AGGTAACGTG AACTCTCGCC AGCTTATCAA CAGCTTTTCT GCCTTGGGCT TCTCTGTGGT GGAAATGGTT GTTTTATCAG GTAAGCTGTA  GGTAACAGTA TAAGCTCATT CACAACTAAA GTTTTCCATT CCAATTAAAC ATGGTTGATA TTATTGAGAG ATTTTTCCAT TCCAGTTCAA CTTGGTTGAT ATAATTGAAA TATTTTTGTA  TATCTGATCA GGTGCACATA CTGTGGGTTT CTCCCAGTGC CGAGAATTCA GCAATCGGCT CTACAATTTT TCTCCGGTGA TGAGAACTGA TCCGAGCATG GAGCCAGGCT TCGTCAGAAC  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CTTGGGAGTC AGGACTGATC GCAGCAACGG AGAAATTCGC CAAGATTGCA CTGCATTTAA CTCCCATTAA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGTCAGCCA AGTTTATTCT CAGTCTTGTT GTGATGATAA TCTATGGAAT ATCGGGGGAT CGCTCCGCCG TCCTCGGCCA ACTCTCGCCG GATTTCTACA GGTTTTCGTG TCCTAATGTA  GATCAGATAG TGTTTGAAAC GCTGAGAACG CTGTCAGCCC GATCAAATGT GGTTGCCCCT TCCATTCTGC GCCTCTTTTT TCATGACTGC TTTATTCAGG GCTGCGATGC GTCAATCATG  ATTTCTTCTA CCCCATTCAA CAGGGCGGAA AGAGATTTGG CAGAGAATAA CATTGGCCAA ACCGCGTTCG ACACAATCAG TGAGATTAAG AGAGAAGTGG AAAGGGCCTG TCCGGGCGTG  GTCTCATGTG CCGATATTAT AGCATTAGCA GCCAAAGATG CAGTGGCATT GCTCGGAGGT CCAAATTGGC AAGTCCCAAA AGGAAGATTA GACGGGCTCA CCTCTCAGGC TGCCACTAGT  GTGGGTAGGA TTCCCGGAGG TAACGTGAAC TCTCGCCAGC TTATCAACAG CTTTTCTGCC TTGGGCTTCT CTGTGGTGGA AATGGTTGTT TTATCAGGTG CACATACTGT GGGTTTCTCC  CAGTGCCGAG AATTCAGCAA TCGGCTCTAC AATTTTTCTC CGGTGATGAG AACTGATCCG AGCATGGAGC CAGGCTTCGT CAGAACACTG GAGGCCAGCT GCCCCTTAAC GGGCGATCCC  TCCAAATTCC AAGCAATTGA TATAAGCACG CCGTTCGTAT TTGATAACAC TTACTTTAAG AATCTGGTGG CGGGCAGAGG GCTTTTGTTC TCAGACCAAG ATCTGTTTAG CGGAGATAAC  GAAACGAGGG ACATAGTAAT GAGATTGGCG AACTCTCAGG AGCTCTTTTT CTCCAACTTC GCAGCGGCCA TGATAAAGCT GGGGAGCTTG GGAGTCAGGA CTGATCGCAG CAACGGAGAA 
ATTCGCCAAG ATTGCACTGC ATTTAACTCC CATTAA 

Retrieve as FASTA