Entry information : PabPrx45(PAB00006931 / MA_10427332g0010)
Entry ID 12781
Creation 2013-12-19 (Qiang Li)
Last sequence changes 2013-12-19 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2021-02-09 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: PabPrx45(PAB00006931 / MA_10427332g0010)
Name PabPrx45(PAB00006931 / MA_10427332g0010)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx004]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Pinaceae Picea
Organism Picea abies (Norway spruce)    [TaxId: 3329 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value PabPrx45
start..stop
S start..stop
GbPrx03 532 0 67..386 34..351
CmichPrx07 491 4e-175 64..389 28..352
PtaPrx134 459 9e-163 68..391 29..347
PtaPrx135 456 3e-161 59..386 14..342
Literature and cross-references PabPrx45(PAB00006931 / MA_10427332g0010)
Protein sequence: PabPrx45(PAB00006931 / MA_10427332g0010)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   392 (358)
PWM (Da):   %s   43053.15 (39327.1)  
PI (pH):   %s   8.49 (8.30) Peptide Signal:   %s   cut: 35 range:35-392
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MIINSPLCQG FPHRRKVSLS LLSALVLLLP SLDNEEICYQ LCSRALHLVF ISHCNHVDCV SWISHDDEPP LVKGLSWSFY RKSCPDLKSI VKKRIDFFLS KDITQAAGIL RLHFHDCFVQ  GCDASILLDG SASGPSEQSA PPNLSLRAQA FKIINDIKEN VEAICPNTVS CADITTLAAR ESVKKAGGPS YRVPLGRRDG LSFAFKNVTV ANLPAPTSNI TTLINAFREK SLDKTDLVAL  SGGHTIGIGH CSSFSNRPYP TQDMSVEESF AQRLYKICPT NTTNSTTVLD IRSPNVFDNK YFVDLVERQA LFTSDHSLLS NSKTKKIVHS FANNQTLFFQ KFRRAIIKMG QVGVLTGKLQ 
GEIRSNCSAL NPPTSYASIL STLVDDAQIL EL 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic. Correct prediction.
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGATTATAA ATAGCCCATT GTGCCAAGGT TTTCCCCATC GAAGGAAGGT GAGCTTATCT CTTTTGTCTG CTCTAGTTTT GCTGCTTCCT TCCCTTGACA ATGAGGAAAT TTGTTATCAG  CTTTGTTCCC GTGCTCTACA TTTGGTTTTT ATCTCTCACT GTAACCATGT CGACTGTGTC TCCTGGATAT CTCATGACGA CGAGCCACCC CTGGTGAAAG GTTTGTCGTG GAGCTTCTAT  AGAAAGAGCT GCCCTGATTT GAAGTCCATT GTCAAGAAAC GCATCGATTT CTTTCTCAGC AAAGACATCA CACAAGCTGC AGGAATACTG CGACTCCATT TCCATGATTG CTTTGTGCAG  GTATTGAATA TTAATGGACT CCATCCAGTT CATGTTCTAT ATACTACCCC TGATAAGATC ATGTACACAT TTTATTTTTC ATTTGCAGGG ATGTGATGCT TCGATCTTGC TCGATGGCTC  GGCCAGTGGA CCAAGCGAGC AATCTGCTCC TCCAAATCTG AGTCTGAGAG CTCAGGCCTT CAAGATCATC AATGACATAA AAGAAAATGT GGAGGCCATT TGCCCCAACA CTGTTTCCTG  TGCAGATATC ACTACATTGG CAGCAAGAGA GTCTGTGAAG AAGGTAAGTA CAAATCGACC TGTTATATAC CAGCATTAAT GTAAGAGTGA TTTTATGAAA GCTTAGCCTA CTGCTGGAAA  TCAAAGATTA AATGTTTGAT TGAGTTCAGT GCTGAGAAGT ATAAAAACCC TTTAAATACA TTATATATTT AACTCAATGG ATTAATGGCC CTTTGCAACG AAAATGTGGA GGCCATTTGC  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CTAGTCGACG ATGCTCAGAT TCTCGAGCTG TAA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGATTATAA ATAGCCCATT GTGCCAAGGT TTTCCCCATC GAAGGAAGGT GAGCTTATCT CTTTTGTCTG CTCTAGTTTT GCTGCTTCCT TCCCTTGACA ATGAGGAAAT TTGTTATCAG  CTTTGTTCCC GTGCTCTACA TTTGGTTTTT ATCTCTCACT GTAACCATGT CGACTGTGTC TCCTGGATAT CTCATGACGA CGAGCCACCC CTGGTGAAAG GTTTGTCGTG GAGCTTCTAT  AGAAAGAGCT GCCCTGATTT GAAGTCCATT GTCAAGAAAC GCATCGATTT CTTTCTCAGC AAAGACATCA CACAAGCTGC AGGAATACTG CGACTCCATT TCCATGATTG CTTTGTGCAG  GGATGTGATG CTTCGATCTT GCTCGATGGC TCGGCCAGTG GACCAAGCGA GCAATCTGCT CCTCCAAATC TGAGTCTGAG AGCTCAGGCC TTCAAGATCA TCAATGACAT AAAAGAAAAT  GTGGAGGCCA TTTGCCCCAA CACTGTTTCC TGTGCAGATA TCACTACATT GGCAGCAAGA GAGTCTGTGA AGAAGGCTGG AGGACCAAGC TACAGAGTGC CATTGGGCCG CAGAGATGGG  CTGAGCTTCG CCTTTAAGAA CGTAACTGTT GCCAATCTGC CTGCTCCCAC TTCCAATATC ACCACCCTAA TCAACGCCTT CCGTGAGAAA TCCTTGGACA AAACAGACCT CGTTGCACTC  TCTGGTGGGC ACACAATAGG AATTGGGCAC TGCTCGTCCT TCTCGAACAG GCCGTATCCA ACGCAGGACA TGAGCGTGGA GGAGTCTTTT GCGCAGAGGC TGTACAAAAT ATGTCCCACC  AATACCACCA ACAGCACAAC TGTCCTCGAC ATTCGTAGCC CCAACGTGTT CGACAACAAA TACTTCGTAG ATCTGGTGGA GAGGCAGGCT CTCTTCACTT CTGATCACTC TCTTTTGTCC  AACTCCAAGA CCAAGAAGAT CGTGCACAGC TTCGCCAACA ATCAGACGTT GTTCTTTCAG AAATTTAGAA GGGCCATCAT AAAGATGGGG CAGGTGGGCG TGCTCACAGG CAAGCTTCAG 
GGAGAGATTC GCAGCAACTG CTCTGCTCTG AATCCCCCCA CCTCATATGC ATCGATACTT TCAACTCTAG TCGACGATGC TCAGATTCTC GAGCTGTAA 

Retrieve as FASTA