Entry information : PabPrx53(PAB00009100 / MA_10429595g0010)
Entry ID 12788
Creation 2013-12-19 (Qiang Li)
Last sequence changes 2013-12-19 (Christophe Dunand)
Sequence status partial
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2020-12-28 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: PabPrx53(PAB00009100 / MA_10429595g0010)
Name PabPrx53(PAB00009100 / MA_10429595g0010)
Class Class III peroxidase     [Orthogroup: Prx017]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Pinaceae Picea
Organism Picea abies (Norway spruce)    [TaxId: 3329 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value PabPrx53
start..stop
S start..stop
PtaPrx29 400 1e-142 2..237 93..328
WnoPrx03 353 5e-124 2..237 87..322
GbPrx16 343 7e-120 4..237 90..323
GbPrx26 337 3e-117 2..237 92..327
Literature and cross-references PabPrx53(PAB00009100 / MA_10429595g0010)
Protein sequence: PabPrx53(PAB00009100 / MA_10429595g0010)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   237
PWM (Da):   %s   25541.59  
PI (pH):   %s   4.63
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MPSHFRLQGF DVIENAKKQL ERICPRVISY TDIVALAAID AVALSNGPNY DVPTRRRDGM RSSIGDASDM PDPTDSVDVL KRKFAAKGLS ASDLVVLNGA HTIGTTACFF IEDRLYNFAA 
DGDADPSINP EYLTELRSTC PKGGDVNTRL ALDRGSEFQF DKEFLENMRE GNVALQSDSS MYQDGSTRGY IDSYFGLLGG LLGPSFESDF ADAIVKMGQV GVKTGSNGKI RTVCSAF 

Retrieve as FASTA  
Remarks Partial sequence from genomic. Incorrect prediction (exon 1 and start of exon 2 are missing due to scaffold border).
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGCCGAGCC ATTTCAGATT GCAGGGCTTT GATGTCATAG AAAATGCCAA GAAACAACTC GAGAGAATCT GTCCCAGAGT CATTTCCTAC ACCGACATCG TTGCATTGGC AGCCATAGAT  GCCGTAGCAC TGAGTAACGG ACCCAACTAT GATGTACCCA CTAGACGAAG AGATGGAATG AGGTCGTCTA TTGGGGACGC TTCAGACATG CCAGACCCTA CGGATTCAGT CGATGTCCTC  AAGCGTAAAT TTGCTGCAAA GGGTCTATCT GCATCAGATC TTGTTGTTCT CAATGGTAGG TCTATATCAT TCTTCAATTC AGTTACATAG ATTAATGGCT AGATATCCAC TAGATCTGTT  ATACATTTCC TAAAATGTGC TTTAGGATTG TTAGCATAAT AATGATAATA TATTTAATCG AATAGAAAGT AAAAACATTA TTTATGTTAG TGGAAAACCC TTTATGATGT ATACGACAGA  GTAACCCTGA AAATACTATC AGCCTAGAAC CTTGAAGGAC ACAACTATCT ATACCTTAGG TTTTGGGTCT GACTAGTAAA GCAAGGGTTT GGATGCAAGG AAAGTTTGAA CTATTCAATA  TGCGTTACCT GTCAGATTGA GGCCATGGGC AGAATTTCTG TATGTGGAAT GCTATAGTTC ACAGAAATCT ATTAGGTGAA CAATATCTAC GGTGTTGTGT AGCATTCAAT GCTGTGAATG  TTGTGTAGAG TGGTCTCTAT TGAATGCATG TTGTGTAGGA TGGTCTCTAT TGTATGAGGT GGTTTATAAG TTGTTGGATT TGAAAAAAAT TCAAATCCAA TGACCTATAC ATCTGTAACA  ACCCTAGTTG TATTCATATT TCACTTGTTT TACTTTGGTA AATTTGTTTT TACATTTTCA ATTCGTATTG TTTnnnnnnn nnnAAGTTAT GAAGAATAAA TCACATTCAT TGATTTGGGA  GGACGACTAA GAATATTCCA GCATTTCTAT TGTTAGTCAT CAAATTAAAA TTTTAGATTA AAAAATGATT AATTGTACCC ATCTTCAATA GATATACACC TTTTGACATA ACTTTCGAAG  TAATAATATA TTTAATCAAA TAAAAAGTAA AAACATTATT TGTTAGTGGC ATACCCTTTA TGATCTATAC GACAGATTAA CCCTGAAAAT ACTATCAGCC AGAACCTTGA AGGACACAAC  TATCTGTACC TTAGGTTTTG GGTCTGCCCA GTAAAGCAAG GCTCTGAATG CAAGGCAGGT TTGAACTATT CAATATGCGT TACCTGTCAG ATTGAGACCA TGGGCAGAAT TTCTGTATGT  GGAACGCTGT AGTTCACATA AATCTATTAG GTGAACAATA CCTAAGGTGC TGTGCAGCAT TGAATGCTGT GTAGGGTGGT CTCTATTGAA TGAGGTGGTT TACAAGTTGT TGAATTGAAT  GCTGTGTAGG GTGGTCTCTA TTGTATAAGG TGGTTTATAA GTTGTTGGAT TTGAAAACAA TTCAAATCCA ATGACCTATA CATCATCCCC ACAACATATT CCTATACATC ATCCCCACAG  CATATTCCAC AGCCTTTATA TCTAACCCAT CCCCACAGCA TATTCCTATA CATCATCCCT ACAGCATATT CCACAGCCTT TATATCAAAC CCATCCCCAC AGCATATTCC TATACATCAT  CCCCACAGCA TATTCCACAG CCTTTAAGCT GTTGAATTGA AAACAATTAA AATCCTATAA CCTACATCAT CCCCGCAGCA TATTCGACAA CTTACACACC ACCCCACTCA GCATTGAACC  CTGATATTGA CTGCTGTTGA ATTTGAAAGC AATTCAAACT CTACAACCTA CATCATCCCC ACAGCATATT CGACAGCCTA CACACCACCC TACTCAGCAT TAAACCCTGC AGAGCAAGGT  GGATGTTGGC TGCCAATTTA TAAGAACCAG TCAACGCTGT ATTAATTGCA GTCAATGCTG TATTAATTGC AATTTTGAAG GGACAGGTAC TGTAGGTTGG AACAGTTCCC GCCAATCCAT  CAAACCTGTC CGTCATCAAA CCTGTCAGTT TAAGGTTATG GATATGATAA AAACAGGGTT GGCAGGCAGG TTGAAAAGGG GCAATGGCTA TCCATCATGT AGACTCTGCA TGGTGGATAG  CAATTCCGGT TGAACTGATT CCAACGTGCA TTGCCCATCA CTTCATATGT GGAGAGCAGT TACTTACACA ATGGATAAGC ACCGAGCAAC TCTGTGCTGA TTGCAATGTA CATTGATATA  TATACGGACC TAGTCTGAGA TGCTTCAGAT ATTATGGTAC ATATCCTGGT ATAGTCTGAG CTGATTGAAA TGTACATTGA TATATATACA ATTTGCATTG ATATATATAT ACGATCCTAG  TCTGAGATGC TTCAGATATT ATGGTACATA TTCTGGTATA GTCTGAGCTG ATTAAAATGT GCATTGATAT ATATACGGTC CTAGTCTGAG ATGCTTCAGA TATTATGGTA CATATCCTGG  TATAGTCTGA GCTGATTGAA ATGTACATTG ATATATATAC AATTTGCATT GATATATATA CGATCCTAGT CTGAGATGCT TCAGATATTA TTGTACATAT TCTGGTATAG TCTGAGCTGA  TTAAAATGTA CATTGATATA TATACGATCC TAGTCTGAGA TGCTTCAGAT ATTATGGTAC ATATCCTTGG ATAGTCTTGA GCTGCTTCCG ATATTATGGT ACATATCCAA TGCAACATAG  CTGGGTGTAT AATGCTTGCC CCAATCCACC TGTTATAATG AAGTTGTATA GTCTTGAGCT GCTTCAGATA TTATGGTACA TACCCTGGTT GTATAATGCT TGTCCCGATC CACCTGGTAT  AATGAAGCAG TCTAATCATG TATAGCAAAC ATCTTCTTTG GGTAGTTTGA CTGAATCAAG ACAATGAACA ATTGCAATTC TGACAATGAG ACTGTAGTTG GATTCATCAA TCCCATTTTC  ATTGAATAAC TCTAGTCTTC AACTTTAGCA ATCTAAACTT GAGATCTATT CTTCAAGTTT AGCAATCTAA ACTCGAGATT TGAAAATTTC AATGAAATAT AAGAAGAAAA GACACCGAAA  CAGAAAATGT TTGCTATGTT ATACATTATT AGCTTATTCT CAAATGATCT TTAAGGCATT GTAAACAGTT GTAAAGCCTG TAAAATTTTC AGTGGCTTAA CTTCCACTTC CATTTACTAC  AAGGTAGATT CATAACTCTT TAAGTCGGAG TAAACACTGA AAATTTTATA TGATCTATAG GACAGAGTAA CAGTTGTAAA GTCCGTACAA TAATTTTCGG GAGTTTCAAC TTTCATTTAT  TGCAAGGTTG TCTCTACCAT TTACTAGTTT AACGTACATA TATTTCAAGG TAGGTATATA ATGCTTGCCG TAATCCCACA TTTTATGATC TATAGGACAG AGTTGTCTCT ACCATTTACT  AGTTTAACGT ACATTTATGT CAAGGTTGTG AAGGGTCACT TTCATTTTTG TCAATGTTGT TTGTATAAAT TGTCTGTACT GGTTATATGT TTTTGGTTTT ATCAATATTT AGTGTTTTGT  ATGTTAAAAT ATATATTGTT TAATAAAACA TATATAGCAT ATATTTGTTG CTACTAGTCT ATATTGTTTG TTTGTCATAT TCGAAATTAT TATTTTTTGT TGTTTAAAAT TTATTTTGGA  ATGTAAAAAT GGATTTAGCA TAGTGAAAAA CTTCTGCAAC ATTCAATTAT ATAGAAATAA TCACTCAAAT TTGTGGATCT AACAATTTCT TACCAAATTA TGAATAAATG TCCCTTGAAA  AATGACTGGA GAAAAATCGT TTAATAGAAC TTTAAACTAC CACTTTGTCT AGCCATAATT ATCTTATTTT TTTAATGTTT TAGATATCCT AAACCTGTTT CAAACCCAAC TAACGAAGTA  AGCTAGCATC CCATGGCCCT CAAGTATAGA TGCTCTTCTC CGTTCATGCT CTTTTCCTGT GCTAGTGGAT GAGAGTTTAG CTTGAACCGC TATTTTCTTT GACAAGTTTT GTTGTCCTTC  CAATGTTTCA CACATCGATA AATTTCTCAT TTTCTTCAAC GATCTTGTTT ATTATTATTT TACCAAAATC AGAAATGGCT AATGGATTAC GAATATGAGC AGAATGTAGT GTTTTTTTGG  CAGGAGCACA CACGATCGGA ACAACTGCAT GTTTCTTTAT CGAGGACCGT CTCTACAACT TCGCAGCCGA TGGCGACGCA GATCCCTCTA TCAATCCCGA ATACTTGACG GAACTGAGAT  CAACTTGCCC CAAGGGCGGT GATGTTAATA CGAGGTTGGC TCTTGACAGG GGCTCCGAAT TCCAATTTGA CAAGGAATTC CTAGAAAACA TGAGGGAGGG GAACGTAGCG CTACAGTCTG  ATTCGAGCAT GTACCAAGAC GGTTCTACCC GCGGATATAT CGACTCCTAT TTTGGGCTGC TGGGCGGGCT TTTGGGGCCT TCATTTGAAT CCGACTTTGC AGATGCAATT GTTAAAATGG 
GGCAGGTCGG CGTCAAAACC GGTTCGAATG GAAAGATTCG TACCGTCTGT TCGGCCTTTT AG 

Retrieve as FASTA