Entry information : PabPrx86 (MA_10g0010)
Entry ID 12813
Creation 2013-12-19 (Qiang Li)
Last sequence changes 2017-06-09 (Justine Latour)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2017-06-09 (Justine Latour)
Peroxidase information: PabPrx86 (MA_10g0010)
Name (synonym) PabPrx86 (MA_10g0010)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx134]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Pinaceae Picea
Organism Picea abies (Norway spruce)    [TaxId: 3329 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value PabPrx86
start..stop
S start..stop
GbPrx05 551 0 8..326 15..336
PtPrx31 468 2e-167 25..327 29..331
CclPrx34 457 2e-163 23..326 25..329
CsPrx42 456 9e-163 23..326 25..329
Literature and cross-references PabPrx86 (MA_10g0010)
Protein sequence: PabPrx86 (MA_10g0010)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   329 (305)
PWM (Da):   %s   35599.58 (33186.4) Transmb domain:   %s   i5-27o (i5-27o)
PI (pH):   %s   7.31 (7.36) Peptide Signal:   %s   cut: 25 range:25-329
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MGAAALYVNI IVLVGFCCYG GVAQLSTDFY MNTCPNVERI VRNVVAQKLK EAPTSAPGAL RLFFHDCFVE GCDASVLIAS SDNNVAEKDA DINLSLPGDG FDVFMRAKRA LESQCPNVVS  CADVMAIATR DLVSMVGGPS WEVLKGRRDG LISKASRVAG NLPTVNMTVD QLISLFHSKG LSQVDMITLS GGHTIGFSHC NEFMDRLYNY SRTSDIDPTM NPSYARTLRG ICPRYGLDPT 
VVAFNDVSTP TTFDNAYYHN AMKGLALLAT DQILYVDPRT RGYVNAFAKS RQSFFNSFAA SMIKLGNVGV KTGGQGEIRK DCGSFNNYN 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic. Correct prediction.
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGGGGCTG CAGCTTTGTA TGTAAATATT ATAGTGCTTG TGGGATTTTG TTGTTATGGA GGTGTGGCGC AGTTGAGCAC AGACTTTTAC ATGAATACTT GTCCCAATGT AGAGAGAATC  GTGAGAAATG TGGTGGCCCA AAAGTTGAAA GAAGCTCCCA CTTCGGCTCC CGGGGCCCTC AGACTCTTCT TCCATGATTG CTTCGTAGAG GTTCTGTTGC ATATTGTTTT TGATATCGAA  GCTCTGTAAT CATTCTTCGA TTTAACATGG ATTTGCTGCA TTTGATTGGA TTTGTTATGT TCTTCCCCAG CCCCAGATCT GCTAGCACTT GCTTAAATCC CTGATGGGTG TAATGCTCAA  AAGTATTAAA ACGTTCCATG TATACGATCT GTCAAACAAG AAACAAGAAT AGAAGATGCT TTGTGGTTAA TGTTTATTTT AAGGTTACCT TTAAGTCAAA CATCAAATTG GTGTATAAGA  TTTTTTGTTT GTGGGAAAAG GGACTCTCTT TGCAACTATT TAACTGCAAA AGTTTAAGGA AGTATACATA TCCTATCCTT CTGGGTTTGA ACTTGTAGTA AATACATGTT CTTAACTATT  AGGTCCGCTT GTGGATCATT CACCAAGTCA AACACCAAAT TGGTGTATAA GACTATTTGT TTGTGAGACA AGAGACCTTC CTAGCAGCTC TTAAACTGCA AAAGTCTACT GAGATACATA  TCCTACCCTT TTATTTAAAT CTGTAGTAAC CACATGTTCT TAACCATTAG ATCCATTTAT AAATTATTCA CAACTGATGT GGAAAAACAT TTTATAAGAT TATCAACAAA AATATTTTTA  TTTTACATCT TATGAATGTT GAAAATGATT CTTTTATTTT TATTTGACTG TTTTGTTTTA GATATAATCC CTATGTAACC ACATAACTCT GATTTAACAG CCATGACAAT TCAACAGCTT  ACAACTCCTC TGATTTAACA GCCATGACAA TTAAACAACT TACAACTCCT TTTAAGAGCA CACTGGTCAT TTTTTTTAGG TTCCCACCAG GCTCACCTCT CCCCATGAGT GTCATCCACC  AACTACATTC AGGATTTTGT ATTTAGAAAG TTATAATACC TCTCAACAGT ATACTGATCA GGGATATGAT GAGGTGCTAG TATAACAACC TTGTAATATT GCTTTCATAT TCATTTTTAG  GGTTTCAGTT TTTCTGATGG AGTTCTGGTA TTACAGGGGT GTGATGCGTC TGTGCTTATT GCTTCCAGTG ACAATAATGT AGCGGAGAAA GATGCAGACA TCAACCTATC GTTGCCAGGA  GACGGATTTG ACGTTTTCAT GCGAGCAAAG AGAGCGTTGG AATCACAGTG CCCAAATGTC GTGTCTTGTG CTGATGTTAT GGCCATTGCA ACCAGAGATC TGGTCTCCAT GGTGTTCTCT  CATGACTCTA TACCCTCATG GTCACGTTTT CTCTGTTGTT TTTCTCAGTG TAATCAATCG GGGAAAGCAG AAGCGCAGTT ATGGTTGGCC TAGGACAGTA GTTATTTGTA AATGTTCCCA  TTAGTAATAT GGCTTTATGT GTTATATATC TCGCCTCATA ATGAAATCTG ACTGAACTAA TAGTCAATTT CATCATTGAA TTCAAATAAT TTGGTGATTC TCAAAGTTTA TTCCTCAAAT  TGCATAAAAT TTAACATTTT CAAAGACATG TTCACTGAAG AAATGCTTCA CTAATGTTTT CATGTATATT GAAAACAGGT TGGAGGTCCG AGTTGGGAAG TTCTGAAGGG ACGGAGAGAT  GGTCTCATCT CAAAAGCATC CAGGGTGGCA GGAAACTTGC CAACCGTGAA TATGACAGTC GATCAGCTTA TTTCACTCTT TCATTCTAAA GGATTAAGTC AAGTCGACAT GATTACTCTT  TCTGGTAATT CAGACATGAC GCCATGGATC CGTTTCTTCT TCTGAAATTT CAATTTTTTT GTCTGACCTA GTAGCGAATT TCATTTTTGA ATTTTTCTTT TTCTGCCAGG CGGTCACACT  ATTGGGTTCT CACACTGTAA CGAGTTCATG GATCGCTTAT ATAACTACAG CAGAACATCC GACATAGATC CGACGATGAA TCCAAGCTAT GCACGCACTC TCAGAGGTAT ATGTCCAAGG  TATGGGCTCG ATCCGACCGT GGTGGCGTTC AACGATGTGT CGACTCCCAC CACCTTCGAC AACGCCTATT ATCACAACGC CATGAAAGGA CTGGCGCTTC TTGCAACTGA CCAGATACTC  TATGTCGATC CTCGCACTCG TGGGTATGTT AATGCCTTTG CCAAGTCCAG GCAGAGCTTC TTCAACTCCT TTGCGGCGTC CATGATCAAA CTGGGGAATG TGGGTGTTAA GACCGGGGGA 
CAGGGAGAAA TCCGCAAAGA CTGTGGATCC TTCAACAACT ACAACTAG 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGGGGCTG CAGCTTTGTA TGTAAATATT ATAGTGCTTG TGGGATTTTG TTGTTATGGA GGTGTGGCGC AGTTGAGCAC AGACTTTTAC ATGAATACTT GTCCCAATGT AGAGAGAATC  GTGAGAAATG TGGTGGCCCA AAAGTTGAAA GAAGCTCCCA CTTCGGCTCC CGGGGCCCTC AGACTCTTCT TCCATGATTG CTTCGTAGAG GGGTGTGATG CGTCTGTGCT TATTGCTTCC  AGTGACAATA ATGTAGCGGA GAAAGATGCA GACATCAACC TATCGTTGCC AGGAGACGGA TTTGACGTTT TCATGCGAGC AAAGAGAGCG TTGGAATCAC AGTGCCCAAA TGTCGTGTCT  TGTGCTGATG TTATGGCCAT TGCAACCAGA GATCTGGTCT CCATGGTTGG AGGTCCGAGT TGGGAAGTTC TGAAGGGACG GAGAGATGGT CTCATCTCAA AAGCATCCAG GGTGGCAGGA  AACTTGCCAA CCGTGAATAT GACAGTCGAT CAGCTTATTT CACTCTTTCA TTCTAAAGGA TTAAGTCAAG TCGACATGAT TACTCTTTCT GGCGGTCACA CTATTGGGTT CTCACACTGT  AACGAGTTCA TGGATCGCTT ATATAACTAC AGCAGAACAT CCGACATAGA TCCGACGATG AATCCAAGCT ATGCACGCAC TCTCAGAGGT ATATGTCCAA GGTATGGGCT CGATCCGACC  GTGGTGGCGT TCAACGATGT GTCGACTCCC ACCACCTTCG ACAACGCCTA TTATCACAAC GCCATGAAAG GACTGGCGCT TCTTGCAACT GACCAGATAC TCTATGTCGA TCCTCGCACT  CGTGGGTATG TTAATGCCTT TGCCAAGTCC AGGCAGAGCT TCTTCAACTC CTTTGCGGCG TCCATGATCA AACTGGGGAA TGTGGGTGTT AAGACCGGGG GACAGGGAGA AATCCGCAAA 
GACTGTGGAT CCTTCAACAA CTACAACTAG 

Retrieve as FASTA