Entry information : PabPrx93 (MA_119796g0010)
Entry ID 12819
Creation 2013-12-19 (Qiang Li)
Last sequence changes 2017-06-09 (Justine Latour)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2017-06-09 (Justine Latour)
Peroxidase information: PabPrx93 (MA_119796g0010)
Name (synonym) PabPrx93 (MA_119796g0010)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx011]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Pinaceae Picea
Organism Picea abies (Norway spruce)    [TaxId: 3329 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value PabPrx93
start..stop
S start..stop
PgPrx06 686 0 1..333 1..333
PsiPrx02 681 0 1..333 1..333
PpPrx04 652 0 1..333 1..333
PtaPrx54 645 0 1..333 1..333
Literature and cross-references PabPrx93 (MA_119796g0010)
Protein sequence: PabPrx93 (MA_119796g0010)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   333 (302)
PWM (Da):   %s   36015.07 (32802.3)  
PI (pH):   %s   8.63 (7.98) Peptide Signal:   %s   cut: 32 range:32-333
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MGSKKSARKP LELAGFVVWV LLGLCVSKGS AQLKENFYAK ICPNVESIVR NAVSQKFSQT FVTVPGTLRL FFHDCFVEGC DASVIIQSTS NNTAEKDFSD NLSLAGDGFD TVVKAKQAVE  KVCPNTVSCA DILTMAARDV VALAGGPQFN VELGRRDGLI SQASRVSGNL PKASFTLNQL NFLFARKGLS QTDMVALSGA HTLGFSHCNQ ISNRIYSFSA STPVDPSLNP SYATQLQQMC 
PKNVDPTIAI NMDPTTPRQF DNVYYQNLQS GKGLFSSDEV LYTDLRTRNA VNTFAQSSGA FNTAFVNAMR NLGRVGVKTG FQGEIRQDCS RFN 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic. Correct prediction.
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGGTTCCA AGAAATCTGC TAGGAAGCCA TTGGAGTTGG CTGGATTTGT CGTTTGGGTG TTGTTGGGAC TGTGTGTAAG CAAAGGATCA GCTCAACTTA AAGAGAATTT TTATGCAAAA  ATCTGTCCCA ATGTTGAATC CATTGTAAGG AATGCTGTTT CTCAAAAGTT CAGCCAGACG TTTGTGACAG TTCCTGGCAC ATTACGGCTC TTCTTCCATG ATTGCTTTGT TGAGGTATAA  GGACGTATAT TGGTTCAAAG CAATGAATTT GTATTTTTTT TTTTTAAATT GAAATTGAAA TTGAAATTGT TCTCTTTCAG TTTTACAAAT TGTTTGAAGT TAGTATTAGT AGTGTTACAT  GGGTTGATAT ATGGTGCTCA CAATAATACT AATAGATCAA ATGATCTGAT TTTCGTTTGG ATCTGAACAG GGATGTGATG CCTCTGTGAT TATTCAGTCT ACTTCAAACA ACACTGCTGA  GAAAGATTTT TCAGACAACT TGTCATTAGC TGGTGATGGA TTTGATACTG TCGTCAAGGC CAAGCAAGCT GTAGAAAAAG TGTGCCCCAA CACAGTGTCT TGTGCTGATA TCTTAACCAT  GGCTGCCAGA GATGTCGTAG CATTGGTAAG TGATTAGCAT TATCATAGGA CGTTTCTTCT CTTCATCACA GACATAGATA AATTAAAGTA CTTTTAGTGT GGAGTCAGCT AGATGGCCAA  GAATTTCATC CACACAAAGT AATAAGCAAC CTGTGTAGAC CTTTCCAGCA ACTATGAAAA CATGGTGCCT AATAAAGGCA TTGACCCCAA AAATGATTTG GCTTATGTAG TTTTGTATGT  GTGGACCTTC CCAGCAACTA TAAGAACAGG ATGCCTAATA ACTGGTTGTT AAGGCATTGA CCCCAAAAAT GATTTGTCTT TGTGTAGTTT TGTCTGTAGT TTTGTATTTT AGTAATTTTA  AGACTGGCCT TTAAATGATC TGATTACAGT TTGCTCAGTT ACTGATTTTA TTTTGTTCTT TTCATTTGCA GGCTGGAGGC CCACAATTCA ATGTGGAGTT AGGACGACGA GATGGACTGA  TATCCCAAGC CTCCAGAGTC AGTGGAAACC TACCAAAGGC TTCATTCACT CTCAACCAAC TAAACTTTCT ATTTGCAAGG AAGGGTTTGA GTCAGACAGA CATGGTAGCT CTATCTGGTA  ACTAGTAACT CATCTACTCC GGTTCCCATT AGTTCAATCT ATCAGTTTTG TTTTTTGTTT TTTCCCTTAA TGTTTTTAAT CACACCAACT CTGATACTCC ATATCTTATT CCAACTAATT  TGTCTAAAAA GAAGATACAG AATTGCATTC TTTGTCTGTT GTTGCTTGTT TCTAGCTCAT GAACAATGCA TCATATCCTC TATATAGATC ACTATATCTT CATAACTTAC ACTTGGCCTT  TGAGACAGAA ACCAATCCCT TTGTCTGTTG CTGGTTGTTC CTTTGGTGTG GATTGCAATA TCAAATTGAT TTCTCTGAAA TGGAGAATGC ATTTTTATTC CCAGTTCTGG GATATTTTGG  AAGGCTTGGT TTTAAAATGG ACAATCATAG GAAACAACTG TATGCTAAAG ATTTCAATAT CTTTTATCAT ACGTATATGA GGTAAATGGT AGCAAGCTAT ATAAAAAAAT TATGCAAATT  TCATTGGAGG AGGCACTCTA CCTCTTAGGT GGGAGAGATA TTTAACACTT CATTGGAGAA GGAGGCACTC TACCTCTTAG GTGGGGGGAT CTTAAACAGT TTTTAAATAT ATGTATAACA  TTATTAAATT AGGATAAATC TATTTTAATG ATGAATCTAT TCATGTAAGG AGATAAAAAA AACTATTGAA AATTTCCAAA ACTTTCACCA ACTAGGTTAG GATTTTGGAC CTCGAAAAAA  GTTATATTAT TAATGCATTT GAACCTGGGA AAACCAAAAT AAAGTTATTT TATCAGTGCC TTACAAGTGG TTTTAGTGAT GAATTATTTT TAGTAACTTT GTGTTTTTGG TGTTTTTACA  GGAGCCCACA CTCTGGGATT CTCTCACTGC AACCAAATCT CAAATAGAAT ATACAGTTTC AGTGCTAGTA CACCCGTGGA TCCAAGTCTG AATCCTTCCT ATGCCACTCA ACTCCAACAG  ATGTGCCCGA AGAACGTGGA TCCGACCATT GCCATCAACA TGGATCCCAC AACTCCCCGT CAATTTGATA ACGTCTATTA CCAGAATTTG CAGTCTGGGA AGGGACTTTT CTCGTCTGAC  GAGGTTCTAT ACACAGATCT GCGCACACGA AACGCAGTAA ACACATTTGC TCAGAGTTCA GGTGCGTTTA ATACGGCCTT CGTGAACGCC ATGAGAAACT TGGGCCGTGT GGGTGTTAAG 
ACGGGATTCC AGGGCGAGAT CAGACAAGAT TGCAGCCGCT TTAACTAA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGGTTCCA AGAAATCTGC TAGGAAGCCA TTGGAGTTGG CTGGATTTGT CGTTTGGGTG TTGTTGGGAC TGTGTGTAAG CAAAGGATCA GCTCAACTTA AAGAGAATTT TTATGCAAAA  ATCTGTCCCA ATGTTGAATC CATTGTAAGG AATGCTGTTT CTCAAAAGTT CAGCCAGACG TTTGTGACAG TTCCTGGCAC ATTACGGCTC TTCTTCCATG ATTGCTTTGT TGAGGGATGT  GATGCCTCTG TGATTATTCA GTCTACTTCA AACAACACTG CTGAGAAAGA TTTTTCAGAC AACTTGTCAT TAGCTGGTGA TGGATTTGAT ACTGTCGTCA AGGCCAAGCA AGCTGTAGAA  AAAGTGTGCC CCAACACAGT GTCTTGTGCT GATATCTTAA CCATGGCTGC CAGAGATGTC GTAGCATTGG CTGGAGGCCC ACAATTCAAT GTGGAGTTAG GACGACGAGA TGGACTGATA  TCCCAAGCCT CCAGAGTCAG TGGAAACCTA CCAAAGGCTT CATTCACTCT CAACCAACTA AACTTTCTAT TTGCAAGGAA GGGTTTGAGT CAGACAGACA TGGTAGCTCT ATCTGGAGCC  CACACTCTGG GATTCTCTCA CTGCAACCAA ATCTCAAATA GAATATACAG TTTCAGTGCT AGTACACCCG TGGATCCAAG TCTGAATCCT TCCTATGCCA CTCAACTCCA ACAGATGTGC  CCGAAGAACG TGGATCCGAC CATTGCCATC AACATGGATC CCACAACTCC CCGTCAATTT GATAACGTCT ATTACCAGAA TTTGCAGTCT GGGAAGGGAC TTTTCTCGTC TGACGAGGTT  CTATACACAG ATCTGCGCAC ACGAAACGCA GTAAACACAT TTGCTCAGAG TTCAGGTGCG TTTAATACGG CCTTCGTGAA CGCCATGAGA AACTTGGGCC GTGTGGGTGT TAAGACGGGA 
TTCCAGGGCG AGATCAGACA AGATTGCAGC CGCTTTAACT AA 

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