Entry information : TcPrx17 (Thecc1EG001054)
Entry ID 12845
Creation 2014-02-04 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2014-02-04 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2014-04-10 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: TcPrx17 (Thecc1EG001054)
Name (synonym) TcPrx17 (Thecc1EG001054)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx018]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Malvaceae Theobroma
Organism Theobroma cacao (Cacao)    [TaxId: 3641 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value TcPrx17
start..stop
S start..stop
GrPrx17 588 0 2..323 1..323
GaPrx33 574 0 2..323 1..323
GhPrx17 573 0 1..317 1..318
MePrx22 565 0 2..323 1..324
Literature and cross-references TcPrx17 (Thecc1EG001054)
DNA ref. Phytozome 12:   scaffold_1 (4995064..4993334)
Protein sequence: TcPrx17 (Thecc1EG001054)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   324 (305)
PWM (Da):   %s   35592.84 (33590.7)  
PI (pH):   %s   4.95 (5.07) Peptide Signal:   %s   cut: 19 range:19-323
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MMSLLPSLFL LLVTMAAAIP LRPGFYSETC PPAEVIVRDV MRKAMIREPR SVASVMRFQF HDCFVNGCDA SLLLDDTPNM TGEKLALSNI NSLRSFEVID EVKEALEKAC PGTVSCADIV  IMAARDAVAL TGGPDWIVRL GRKDSLTASQ EDSDNIMPSP RANASFLIDL FSQFNLSVKD LVALSGSHSI GEGRCFSIMF RLYNQSGSGK PDPAIEPRFR EKLDKLCPLG GDENVTGDLD 
ATPRLFDNQY FKDLVAGRGF LNSDQTLFTF PQTRKYVKLF SEDQNAFFNA FVEGMLKMGD LQSGRPGEVR TNCRVANSRP VDV* 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic (introns 1 and 2).
Promoter
Send to BLAST
Send to cis Analysis
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ACAATGGACC ACTAATTTCA CTCATTTTTA CCTTTTTTTT ACAAGAAAAT TACTCACATC TTGAATAATA TAATTAATAA AATTATATAA TATTACAATA CAATCACGTT GCAGTCAATA  GAAATAATCA CATTATAACT AAAAATCAAT GTAATCTTAC TTTTACCACT TACTTAACAA AGTAAAAAAA AAAAAAATTG ATTTACTATT ATTGTCCCGT TGTCTTCTTC TTTTTTGACC  CAAAGAGACT CACTGTAGTA CTTTATTAAT AGAATCCTCT AAAGTAAGTA GTAAATCATA TGGTATTATT GCATTGTATT AATTTAATGG TGGATATATA TGTATATTTG TTTTTGTTTT  GGTTAGTATA AGTTAGAAAA AGGGTCAAAT GGACTTATTA GAGTTTAAGA TTTCATGATG AATTGCAAAA CCCTAGGCTA AAATTATGCT TAAACCCTTT TATGTTGCCA GAATTGAAGC  CCTTTGTCTA GTGGTGGGCC TAGATCCTTA CAACATACAT TTATCTCAAA ATGGGGTTTT CTTTTTCCAT AGGATAGATA CAAGCACAAA TCCTTGATCA GTGTTTCATT AACTTTTCAA  GCCTCTCCCA TGTGGCCCAT GAGTGTAAGA GAATTGGAAA TATCATTACA GTAGCAATAC CTTGTGCATT TAAATTTCCT GCAATTAATT GCGGAGCAAA TCATAGGGGG GGAAACTGAC  AAATCAAGAC CTAATAAAAA GCATAAAATA TTAAATTAGA AGATGACAGA CTTACGTCTT GCCAATAATA ATACAAATAA ATGAAAGTAC CAAGATAGCC TAACCTTGAA ATAATCCACT  CTCCCTTGAA ACAGAAACAC GTGAAATAAT ATATATAGTC TCTGAAAGTC TAATCCACGT AATGTATCAT TTCCAAGCTT TCTCCTTCAA TTATGGCCAA AAACTTTAGA TGATGCACCT  ACCACTTTAT CATCAACAAT TGCTGCCAAA ATCACCTCAT GCCTAGTTTT GTATCGTGAT TAAAAGAGAA TTTACCGTTG GCAAAAAAAG TAATTTGTGA TTAAATTCGT CTTCAATTCA  ACAATTGCAA TCAAATACAA CTCCAATCAC AAATATATGC CTCATCAACT TTTTAACCAT TTGATATCAA ATTGGCATGC AATACGCACA TTATCTTTAG ATTTTATTAA AATGGAAAGT  AGCAATGATG ACCGAGGATG CCATTGGTAA ATATGTTCAA GAAAGTGCAT TGAAGAATTT TCCTTCTTTT TTCTTTTTTT GTTTTTTAAT TTTTGGGAAA GGGATAAAGG ATATCTGTTG  ATGGCATAGT GGACGTCGCA ATTGCTGACC TATTCACTGG GGGGACATCC CCACCCCCCA CAACCACAAC AAGCTATGGA CTATTTTTCA GTTAACTCTC CCTCTCACAC TCTTAGCCAA  TTGGCTTGCC TTGCCTCCTT TTGTCATAGC AAAGCCCTCT TACCTGTTGA CACCCATGCA ATTAAAGAAT CTCACCTTCT TCTGTAACTT CCCACCCCCT CCACAAAAAT AATCAACAAA  GAATAAAAGG AAAACAAAAT GGCATATGTG ATTAGCTAGG TTCTCTCTTT TGGCTAAGTG AGATATAAGA AGTTTTTACC ATAAATAGTT TGTTTAATTT TTTTTTCATT TTTTACTGAA  ATAAATAGTT CATGTTAGTT CCATAAACCT CATTTCGTTT ACATGAATTG TACTTTTTAT AAATTATACA TAAGTATGCT TCAGATATGG GGTCTGATAA GACACAAATG AATAACTTTA  AAGGATTCTT TGGTTATTTA TTATTGTCTT TTATTTGATG GTGGTTCGAA CTGAAATTTT TAAGGTTAGT GTTAAAAACC AACCAACGAC ACCATCATAG CTCACCCATA GGCTCTAAGA 
ATACTTCCAA CAAGTTTAAA AACCCCATTC AAAAGCCTAA ATTGGTCTAC TTCACACACC CCATCCGCCA CTGTCCCCAA A 

Retrieve as FASTA  
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGATGTCTC TCCTTCCTTC ACTCTTTCTC CTACTAGTGA CCATGGCCGC TGCAATCCCT CTCCGGCCTG GTTTCTACTC TGAAACATGT CCACCAGCGG AAGTCATAGT CAGAGATGTG  ATGAGGAAAG CCATGATTAG GGAGCCAAGA AGCGTTGCCT CGGTCATGCG CTTTCAATTC CATGATTGCT TTGTTAATGT AAACTTTTTA CAAAGCTAAA GACCTCATAT ATGTTCCTGT  GTCTGCCTTT TTTTCTTGTT ACTTTGTATA TGATTTGTTA TTTTACCTCA TTTACAGGGC TGTGATGCTT CTTTGCTGCT AGATGATACA CCAAACATGA CAGGGGAAAA GCTAGCTCTT  TCCAATATAA ATTCGCTAAG ATCCTTCGAA GTCATCGATG AGGTCAAGGA AGCCTTGGAG AAGGCCTGTC CAGGAACAGT TTCTTGTGCA GATATCGTAA TCATGGCCGC CAGGGATGCT  GTTGCTCTGG TAACTAGTGT TAACTTTCCC CTGTTAGCTT TTTTTTATGC TTCAAAAACA AGCTGTATTC ACATTTGCCA TAAGGTAGCA TGATTGAGAT ATTCACTTCG CTGCTGAGTT  GCTTTTGCCA GAAATTCAGC AGAATGGGCG GTTTCTGTCC AAACTTTGTC AACTAGGGCA GTTTATAACC TTATAATATT TGCCTAAATT ATTTTATACT TTATCCCATC CAAGCTTTTA  AAAAGAACAG TTCTTTTCAT AACGTACACA AAACGCATAA ATTAATTATG TTATACAATG AAAATGATAC TACAGATTCC TTAAGTACTG TCACCTGATC TCATCATACT CGACCCTAAT  GAGGCCTGTT AATAAGTTAG TCCCCCCCCT CCCCCTAGTT TGAATATGAC ATAAAGGCTG ATTAATATTG CAGCTTTTAG TCCATGTTTT GTTTGCCATT GGGTCTCTCT TTTTAATCCT  TATATTTTTG TTATTAATGA ATTCTTGTTC TAGGTAGCGC AAAACTCTTT TAAGGTTTAT GCAGAGAATG TACAGTACTT GACAGCAGCC AATATTGTTT TGTTTAAGCT AACTTTGTTG  AAAAGTTTTA AAGCAAGCTC TGCTTCACAA TAAAGAGAGT TGCCTTATTC TTATTGTGTT TTAATCCAGA CTGGAGGACC TGATTGGATA GTGAGGCTGG GAAGAAAAGA TAGCTTAACA  GCAAGTCAAG AAGACTCAGA CAACATAATG CCAAGCCCGA GAGCAAATGC AAGTTTTCTC ATTGATCTCT TCAGCCAATT CAACCTATCT GTCAAGGATC TTGTAGCCCT TTCTGGATCA  CACTCAATCG GCGAAGGAAG GTGCTTCTCA ATAATGTTCA GGCTCTACAA CCAATCTGGC TCAGGCAAGC CCGACCCTGC CATTGAACCA AGGTTTAGAG AAAAGCTAGA CAAGCTTTGT  CCGCTTGGTG GAGATGAAAA TGTAACAGGT GATCTTGATG CAACACCAAG ATTGTTTGAT AACCAATACT TCAAGGACTT GGTTGCAGGG AGAGGATTTC TGAATTCGGA TCAAACGCTT  TTCACATTTC CTCAGACTAG AAAATATGTC AAGCTTTTTA GCGAAGACCA GAATGCGTTT TTTAATGCCT TTGTTGAGGG AATGTTGAAA ATGGGTGACT TGCAGTCCGG GCGGCCTGGT 
GAGGTTAGAA CCAATTGTAG GGTGGCCAAT AGCCGGCCAG TGGATGTATG A 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGATGTCTC TCCTTCCTTC ACTCTTTCTC CTACTAGTGA CCATGGCCGC TGCAATCCCT CTCCGGCCTG GTTTCTACTC TGAAACATGT CCACCAGCGG AAGTCATAGT CAGAGATGTG  ATGAGGAAAG CCATGATTAG GGAGCCAAGA AGCGTTGCCT CGGTCATGCG CTTTCAATTC CATGATTGCT TTGTTAATGG CTGTGATGCT TCTTTGCTGC TAGATGATAC ACCAAACATG  ACAGGGGAAA AGCTAGCTCT TTCCAATATA AATTCGCTAA GATCCTTCGA AGTCATCGAT GAGGTCAAGG AAGCCTTGGA GAAGGCCTGT CCAGGAACAG TTTCTTGTGC AGATATCGTA  ATCATGGCCG CCAGGGATGC TGTTGCTCTG ACTGGAGGAC CTGATTGGAT AGTGAGGCTG GGAAGAAAAG ATAGCTTAAC AGCAAGTCAA GAAGACTCAG ACAACATAAT GCCAAGCCCG  AGAGCAAATG CAAGTTTTCT CATTGATCTC TTCAGCCAAT TCAACCTATC TGTCAAGGAT CTTGTAGCCC TTTCTGGATC ACACTCAATC GGCGAAGGAA GGTGCTTCTC AATAATGTTC  AGGCTCTACA ACCAATCTGG CTCAGGCAAG CCCGACCCTG CCATTGAACC AAGGTTTAGA GAAAAGCTAG ACAAGCTTTG TCCGCTTGGT GGAGATGAAA ATGTAACAGG TGATCTTGAT  GCAACACCAA GATTGTTTGA TAACCAATAC TTCAAGGACT TGGTTGCAGG GAGAGGATTT CTGAATTCGG ATCAAACGCT TTTCACATTT CCTCAGACTA GAAAATATGT CAAGCTTTTT  AGCGAAGACC AGAATGCGTT TTTTAATGCC TTTGTTGAGG GAATGTTGAA AATGGGTGAC TTGCAGTCCG GGCGGCCTGG TGAGGTTAGA ACCAATTGTA GGGTGGCCAA TAGCCGGCCA 
GTGGATGTAT GA 

Retrieve as FASTA