Entry information : GrPrx17 (Gorai.007G234600)
Entry ID 12846
Creation 2014-02-04 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2014-02-04 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2014-04-10 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: GrPrx17 (Gorai.007G234600)
Name (synonym) GrPrx17 (Gorai.007G234600)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx018]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Malvaceae Gossypium
Organism Gossypium raimondii    [TaxId: 29730 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value GrPrx17
start..stop
S start..stop
GaPrx33 645 0 1..323 1..323
GhPrx17 637 0 1..317 2..318
TcPrx17 577 0 13..323 13..323
CclPrx39 546 0 7..323 6..322
Literature and cross-references GrPrx17 (Gorai.007G234600)
DNA ref. Phytozome 12:   chr07 (30577549..30580055)
Protein sequence: GrPrx17 (Gorai.007G234600)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   324 (305)
PWM (Da):   %s   35613.77 (33607.7)  
PI (pH):   %s   4.66 (4.72) Peptide Signal:   %s   cut: 19 range:19-323
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MSLYPSVLFV LLVTMAAAET LRPGFYAQTC PEAEAIVRYE MMKAMIREPR SVASVMRFQF HDCFVNGCDA SLLLDDTPNM LGEKLALSNI NSLRSFEVVD EVKEALEKAC PGVVSCADVI  IMAARDAVAL AGGPDWVVRL GRKDSLTASQ EDSDNIMPSP RANATSLIDL FTKFNLSVKD LVALSGSHSI GEARCFSIMF RLYNQSGSGK PDPAIEPWFR EKLDKLCPLG GDENVTGDLD 
ATPKLFDNQY FKDLVAGRGF LNSDQTLFTF PQTREYVKLF SKDENEFFKA FVEGMLKMGE LQSGKGGEIR TNCRVVNSQA LDV* 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic (introns 1 and 2).
Promoter
Send to BLAST
Send to cis Analysis
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
GTTAATGTTA ACTATCTATA AATTTAAAAA AATCATTAAC AAAATTAAGA CATATTCTTA TAATATATAA AAGAATTAAA ACAACAAAGA TGAACACATG ATATGGGTGT CGTAATCCCA  TTTGTAAATT TATGTTATTC GACAAAATCA TTATTTTATA TCATTTATAT CGCGTTAAAT ATTATCCACT ATCTCACGCA CCTTTAGCCC ATTTGTTCGA CTTGCCTCTT CTGGTCGTGA  CAAAGGCTGA AAAGCCCTCT AATTTTTTGA CACCCATGCA AATGCTTTCT CAACAATCTC ATCATTTTTC ACCCAATAAA CAAAGAAAAT TATCTGCCTT CTCTCTCTTT AATTCTTTAT  CTTCAATTTT GTCTAAATGG ATTTTTTTCC GTCCTATTCT GTTATTTAAA TATTTTTAAT GTTATAAATT AATTAGACAC TAATTTAGTT GAATATAATA CTTTTTTAAC CCTTTCATTG  ATAAAGAAAA TTATTTTAAT TTTTCACCTT TTTTAATATT TAAACTTGAA TTGTTTATCA AATCACTCCA AAATGGATGA AAAAAATTAA TATTTGTTAA CTTTCTTTAA TGTAGACTGC  CACGTTAACA ATTAATTAAT TTTTAAAATT TTAAAAAATA TTTTTAAATA TTTTTATACT TTTTAAATAA ATATAATAAT ATTTTTGAAT TTTTTAAAAT TTAAAAATAA TTATTTATTG  ATGTGGTATT CATGCCACGC CGACAAAGTT AACAAACGTT AATTTTTCTA TTCATTTTGG AGTCATTTGA CAAACAATAT AAGTTTAAAA ATTAAAAAAC GAAAATAATT AAATAAAAAA  TTAAAATATA TTTTTTTATA AAATTAGAAG TTCAAATAAA TTATTATAGG AAGAATTACC GAACGATCAA AATTATTACT TACAATAGTT TTATTTTAAA AATATCATTG CATAAATATT  TTTATTTTTT TCATTCGCAT GGTAAATCTA CCATAAGAGT AGTTTTAGTT AAGATAACTG AACAAATTTA TCAATCCGTC TTTTTACTAT GGTAATTGCA TTATCGCACT TTTCAATTCA  TTTTAGTTTA AAAGTAACTC TGATGAAATT GCAATTTCTC AAAAATAAAT GGTATTACTT TTTGGGTTGG TAAAGTAAAT GTATTTTTTA AAAATATTTT ACTATATTTA TAAGATACTC  TATTTATAAA ATTTAAAAAT TTCATTAAAA ATGGGAAGAA TATTTTTTTT CTTCCAAATT TAATACCTTC TTAAATAGAG CGAATACTGT TTGTCTTATC CATACAAAAT CTTTTTGGAT  TTCAGTTTAC TATATATACA AATAACAAGT TGGTATAAAT AAGAATTGGT TAAAATACGC GTATAGTTAT ACTTTTTGAA AATTAGGAAT TTAGTTCATG TATTTATATT TTTTGAAATA  TTTTTTTTTA TTTTTTATAT TTTAAAATTC AGGTTAATTA TTATTTTTGT TAAATTTGAG TTAAGTATAA AATCTTTTTT AATTACATAA CTATTAAATG AGTAATTTTT TATTTTAAAA  TGTCACGACA ATAAATTTAA TAAAAAATTA GCTGTATTAA CAGTTGGACT TAAATTTTAA AATTAAAAAA AAGAGTAAAG AAACTAAATT GTAAATAGAT AAATTAATTT CTTAATTTTT  GAAGAATACA GAAATTATAG GAAAAAAGTT TGTAGTAATT TTTCTTTATC ATTGTTCTCT CTGTATATCA AATGATAAAA GAACATCTAT TTAAATCTTA AATTCACATC CGTTCCGAAT  TCCATCTTTA AACAACTCAC ATCTCGTATC CCTTGTTAAA AAGATTTATT ATATAGAAAC CAACCAACAC TATCATATCC CACCCACAGC TCCATGATAT AATACATTCA ACAAGTTTAA 
GAAGCCATTC AGAAAAACCT AAGTTGGTCT ATTAATTTCA GACAAACCCA TCCACCCTAG TCCCTCCCCT CAAAAAAAAA 

Retrieve as FASTA  
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGTCTCTCT ATCCTTCAGT GCTGTTTGTC CTACTAGTGA CAATGGCGGC CGCAGAGACT CTCCGACCAG GGTTTTACGC TCAAACATGT CCAGAAGCGG AAGCGATAGT GAGATATGAG  ATGATGAAGG CCATGATTAG GGAACCGAGA AGCGTTGCCT CCGTCATGCG CTTTCAGTTC CACGATTGTT TCGTTAATGT AAAAAAACCT TTTTTAACCC AAAAAAAAAA AAAAAAGAAA  AAAACCCTAC ACATATATGT TTTAATACGG CAAGCTACCA ATAACTTGTT TGCCTTTCTT CCCCTTTGTT TGTTACAGGG TTGTGATGCT TCTTTGCTGC TAGATGATAC GCCAAACATG  CTTGGGGAAA AACTAGCTCT TTCCAATATA AATTCGCTAA GATCATTCGA GGTTGTGGAT GAGGTGAAGG AAGCCTTGGA GAAGGCTTGT CCGGGCGTCG TTTCTTGTGC GGATGTCATA  ATCATGGCCG CCAGAGATGC TGTTGCTCTC GTAACTATTC CTACCTTTCT TATCTTCCTA TTTTATTATT CATGTTGAAG GTTTAAATTT AATACATCTT AAAAATATAC CCAACACTTT  TTCTTCTTTT TCTTTATATA AAAAGCTATA TGTTAAACAT TTTGCCAGAA ATTCAGCACG AATGGGCGCC TTTTGTCCCA ACTTTGTCAA CTAGGGCGAT TGATAAACTT AAAATATTGC  CCTAAATTAT TATATTCTTA GCCCCATCCA GCTTTTGTAA GAAGAATAAT TTTTTCCACT TAATGTTCAA AAAAACAGCA AAGATCAGTG ATGTTACAAA AATTAAAACA ATAGGAGCAT  TACTTTTTCC ATAAAAAATA GTAACATTTC TTGCACTTAA CGTTTCACAG TCATCAGTTA CGAAGTAATT ATAGTATTGT AGCTGTTAAG TCCACTTACT TTTCCCTCTT TTTGCCTTCC  CCAGTAGCCG TTTTTCATTT TATTTTCTTT AATCTTAAAA AATTTCACGA AAAGAAAAGA AAAAAGATGG GTTTACTCAT TTGTGGCCCT CCCAGCCCAA CAGATCTGGT CCGGCTTGGA  CACGACTTGT ATTTTTTATT CAATTTGACT TGCACTGAAT TTAAATTAAA TAATTCTAAA AAGATATTAA TATTAATAGG CTTGAGCCTT AAAATTTTTT AAATTTGGAC TACAACTCAT  GTACATATAT ATTTAGTAGG GATTTGAACC TCTAGATTAT CCTAACTTCT TAATCCTTCT ATTTTTGGTT ATCAAGTAAT TAATTCTACT TAGTGGAGTG ACAAAAACCC TTGGAAGTTT  GACAGTAGCA GATATTTCTA ATTGTATTTT GTTTTAAGCT AACTTTGTTA GTAACTTTCT AAGCCTTTTG CTTTACAATT TAGAGAGTTT CGACTTAGCA TACGAATCTG ATTAAATTAA  CTCATTTATT ATTAAAAAAT AATTAAATAA ATCTAAATTT AAAATATTTT GTTTGGAATA AAAATGTAAA TGAAAAAAAT TAAATTTTAT ATCATTTTAA GTAGTGAATA TTAACTTTAT  TTGATTCTTT TTAATAGTAT ATAAATTATA TTAATTTGAG GAACATTGGG CTCTCCATTT TGATTTTGTG TAATTTATCT AGTGGTGGAG TCGGAAAATT TTTTTGGGAC CAGAATTAAA  TTGTATATTT TTATAATAGT AAAAATATAA TTTTACCATT TTAATAATTT ATATCTTTAT AATTTTTTAT AATTTTTAAA GGATTAAATT AAATTTTTAT ATTTTTTAAA ATTAAAGTAT  AATTTTATAA TTACTAATTT AAAATGTTAT AAATTATAAA AGTGGTAAAT GAAAATCTTT CGCGACCCGG CTCCCCCACT GATTTTTCAC CGGAACTGAT GTGGTTGGAA TGTGAGTTAA  TGCAGGCAGG GGGGCCCGAC TGGGTGGTGA GGCTAGGAAG AAAAGATAGC TTGACAGCCA GTCAAGAGGA TTCCGACAAC ATAATGCCAA GCCCAAGAGC TAACGCAACT TCTCTCATCG  ATCTCTTCAC CAAATTCAAT CTATCCGTCA AGGATCTGGT AGCCCTCTCA GGCTCACACT CCATTGGAGA AGCAAGGTGT TTCTCAATCA TGTTCAGGCT CTACAACCAA TCAGGCTCCG  GCAAGCCTGA CCCTGCCATC GAACCATGGT TTAGAGAAAA GCTTGACAAG CTTTGCCCAC TTGGTGGAGA TGAGAATGTG ACCGGAGATC TGGATGCAAC ACCCAAGCTG TTCGATAACC  AGTATTTCAA GGACTTGGTT GCAGGGAGAG GGTTTCTGAA TTCGGATCAA ACCCTGTTCA CATTCCCACA GACCAGAGAG TATGTGAAGC TATTTAGCAA GGATGAAAAC GAGTTTTTCA 
AGGCATTCGT AGAAGGAATG TTGAAGATGG GTGAGTTGCA GTCGGGGAAG GGTGGTGAGA TAAGAACCAA TTGCAGGGTG GTGAATAGTC AGGCTTTGGA TGTATAA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGTCTCTCT ATCCTTCAGT GCTGTTTGTC CTACTAGTGA CAATGGCGGC CGCAGAGACT CTCCGACCAG GGTTTTACGC TCAAACATGT CCAGAAGCGG AAGCGATAGT GAGATATGAG  ATGATGAAGG CCATGATTAG GGAACCGAGA AGCGTTGCCT CCGTCATGCG CTTTCAGTTC CACGATTGTT TCGTTAATGG TTGTGATGCT TCTTTGCTGC TAGATGATAC GCCAAACATG  CTTGGGGAAA AACTAGCTCT TTCCAATATA AATTCGCTAA GATCATTCGA GGTTGTGGAT GAGGTGAAGG AAGCCTTGGA GAAGGCTTGT CCGGGCGTCG TTTCTTGTGC GGATGTCATA  ATCATGGCCG CCAGAGATGC TGTTGCTCTC GCAGGGGGGC CCGACTGGGT GGTGAGGCTA GGAAGAAAAG ATAGCTTGAC AGCCAGTCAA GAGGATTCCG ACAACATAAT GCCAAGCCCA  AGAGCTAACG CAACTTCTCT CATCGATCTC TTCACCAAAT TCAATCTATC CGTCAAGGAT CTGGTAGCCC TCTCAGGCTC ACACTCCATT GGAGAAGCAA GGTGTTTCTC AATCATGTTC  AGGCTCTACA ACCAATCAGG CTCCGGCAAG CCTGACCCTG CCATCGAACC ATGGTTTAGA GAAAAGCTTG ACAAGCTTTG CCCACTTGGT GGAGATGAGA ATGTGACCGG AGATCTGGAT  GCAACACCCA AGCTGTTCGA TAACCAGTAT TTCAAGGACT TGGTTGCAGG GAGAGGGTTT CTGAATTCGG ATCAAACCCT GTTCACATTC CCACAGACCA GAGAGTATGT GAAGCTATTT  AGCAAGGATG AAAACGAGTT TTTCAAGGCA TTCGTAGAAG GAATGTTGAA GATGGGTGAG TTGCAGTCGG GGAAGGGTGG TGAGATAAGA ACCAATTGCA GGGTGGTGAA TAGTCAGGCT 
TTGGATGTAT AA 

Retrieve as FASTA