Entry information : LePrx47 (Solyc11g010120.1.1[2.3])
Entry ID 12847
Creation 2014-02-05 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2014-02-05 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Messaoudi
Last annotation changes 2014-08-22 (Messaoudi)
Peroxidase information: LePrx47 (Solyc11g010120.1.1[2.3])
Name (synonym) LePrx47 (Solyc11g010120.1.1[2.3])
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx021]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Solanaceae Solanum
Organism Lycopersicon esculentum (Tomato)    [TaxId: 4081 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value LePrx47
start..stop
S start..stop
StPrx58 662 0 1..337 1..337
NtPrx08-1B 578 0 1..334 1..334
InPrx03 519 0 3..330 2..329
AtPrx17 508 0 4..324 2..322
Literature and cross-references LePrx47 (Solyc11g010120.1.1[2.3])
DNA ref. Phytozome 11:   SL2.40ch11 (3243625..3246066)
Protein sequence: LePrx47 (Solyc11g010120.1.1[2.3])
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   338 (318)
PWM (Da):   %s   37670.85 (35381.6)  
PI (pH):   %s   4.9 (4.81) Peptide Signal:   %s   cut: 20 range:20-337
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MGYTLLFFFI LLQSLNLFAI STTLKPYFYS RTCPKAEFIV KEVMKKAMKR ETRSIASVMR LQFHDCFVNG CDASLLLDDT PNMLGEKLAL SNINSLRSYE VVDEIKEALE QACPGVVSCA  DLLIIAARDA VVLSGGPYWE VKLGRLDSLT ASQEDSNQIM PSPRSNATYL IDLFSRFNLS VQDLVSLSGS HSIGKGRCFS IVFRLYNQSG SGRPDPSIEP PFREKLDKLC PLGGDGNVTG 
DLDATPELFD NQYFKDLMNG RGFLNSDETL FTNSITREYV EEYSVDQERF FNDFAEGMVK MGDLQSGRPG EIRRDCRVVN SYRPGVAVLF ETSNKKG* 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic (introns 1 and 2)
Promoter
Send to BLAST
Send to cis Analysis
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
GACAAGAAAT CACTTTGTAT TTTTCGCCTC CCCCTCGATT ATAAGGAAAA CAAATAGTAC TTGATTAGTA TCCATTTGTC CCAAAATAAG TATACATAGA TTTGTATGTT TTACATGTGT  ATCGCATCAT TTTACGGCTT TATGAAAAAT TTCATAGGAC ACGCGAGACA CACGTGCAAA ACACGTGTCC GTAAACTAGT TACGATCTAT ACAAGCTAGA AAAAAAGGAT GTATTTTTCC  TATCAAAATG ATGGCTCAAA TCATTTGTAA GTCTTGCTTT AGGAGTGGCG ATGTTACCTC CACAAGCCAC TATAATTATA TGAATTCTTG ACCTAGTAGC GAGAATATCA ATCGGAGGTT  AGGTGGGTGA CAGAGGATTA TAAGTTCAAT AAAAATATTT TCTGATTAAA ATTTTAGTAG GTGTTTGGTT ACGATTTGGT TGAGATTCAA AAATAAAAAT TATTTTGAAG GGTATTTTTG  AGATTAAAAG TTGTAAAGTT AGAAGTTTTC TTTTTACTGA AAACTTGAAA TACTTCTAGA ATATAATTTT CATACTTAAA ATTATGTATC TCAAACTTGA TAAACAAATA CTTCTTTGAT  ATACTCCCAA AATATTAAAT ATTTCAAATA TTCGATTTAT TAACAAACAA CTCTATTAGA TAAATGATAA GAAATCACTT TGTATTTTTC GCCTCGCCCA CGATTATAAG GAAAACAAAT  AGTACTTGAT TAGTACCCAT TTGTCCCAAA ATAAGTATAC ATAGATTTGT ATATATAAAG GTATCCTTAA GAAATGACTG GTGTGAAATC TTTTCTCGCG ATGATCGATA TCTACTATGC  ATTTTTGTTG AGTCACATTC AATTTACATT TAATTGTCAA TGTTGAGTCA CGTTTAATTT GTAATTATTT TTCATCTATC ATCCCACAAT ACGTCCAAAT ATCAATATTA AATTCAAAAA  GTGTTAATTG TTTTTCTCCC TAGACTAGGG TTTGTTTGGT CTGATGACAA ATTACGGTGA AAACCACAAA TTACTAATGT TGAAATTCAT TTATATTATA TTTTATTGAT CGCTTGATTT  ATTAAATTAA AAATAACATG TATTGCACAA TTTTTAAGAA GAATTTGTTT GTTTTACAAA AAAAAAATCC CATTCCATCT TATTTAGTAG AAAAACGATT TGAGGACCTC ATGGATATTT  TCGTCATTTT ATCTCAAAAT AATTAATCTC TATACTATTA TTATCACTTT CTCGCAAAGT AATATATTCA GATACTAATC ACTACCTTGG TATAACTATT CCCAAAATCA ATAAATAAAC  ATGAAATAAA AGGATGTTGA ATTTTTGTTT AAGAACAATC TAGATTCAAT CCTCGAAAAT GAAAAATTCT TCACAAGGAG CGTATCCAAT TTGAGTCAAT AAATTTAATC TCGATTCTAT  TATTTTCACC TTCTCATAAA GTATATGTTC AGATACTTGT TACTAATCTT AACATAACTT TTTGCAAAAT CAATAAATAA ACAGAAAATA AATAAAAAAA TTAAATTTTA CTCCAGAATC  GTCTAGATTT AGTCCTCAAA AATAATGAAA TCTTGACCAA AAACATATTC AATTATAGTC AATAAATTTA AATTAATCAA TCAATAAACT TCCATTCGAG CAATTCAAAT AAAAAGAAAA  ATACATCACC TATTCTACTA CCAATGCAAC AAGTAGGTCC AATTGATTGA AATTATCAGA AAATAAATGA CAAAAATGAT TATGAAAATT ATACATAAGA CCATGACCCT ACCCCACCCC  CTAACCCCAC CCAACCCAAA ACAAACTCTT CACAATTGGC CACTTTGTCT CAACCAAAAA ATCCCCTATA TAATGCTGAC AACACATCCA AATTAGGATT TTCTCTCTTT AAGAACCCAC  CCATCTCTCT CAAAAGCAAA AAAAAAAAAA AAACACTAGT TTTTTCTAGA GAACAAAAAA AAAAAAAACA AGAATCAAGA ATGGGTTACA CCCTTTTGTT CTTCTTCATT CTTCTCCAAA 
GTTTGAATCT TTTTGCTATT TCTACAACAT TAAAACCCTA TTTTTACTCC AGAACTTGCC 

Retrieve as FASTA  
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGGTTACA CCCTTTTGTT CTTCTTCATT CTTCTCCAAA GTTTGAATCT TTTTGCTATT TCTACAACAT TAAAACCCTA TTTTTACTCC AGAACTTGCC CAAAAGCTGA ATTTATAGTC  AAAGAAGTTA TGAAAAAAGC TATGAAAAGA GAAACAAGAA GCATAGCTTC TGTCATGAGA TTGCAATTTC ATGATTGTTT TGTTAATGTA AGAATTTCAA GAACCCCATT TACCCCCCCA  CCCTCACCCC ACCCCTTTCC CCCCATAAAG ATTGGTTCTT TTTGGTTGAT GTTTTGTGTT CTTGAATTTA TGCCATAAAA ATTGGTTCTT TTTTGGTTAA TGTTTTGAGT TCTTGATTTT  TTTCGCCATA AAGATTGGTT CTTTTTGGTT AATGTTTTGT GTTCTGATTT TTTTGCCATA AAGATTGGTT CTTTTTGGTT AATGTTTGTG TTCTTGATTT TTTCCCCATA AAGATTGATT  CTTTTTGGCT AATGTTTTGT GTTGTTTGAT TTTTTTTAGG GATGTGATGC TTCTTTGTTG TTGGATGATA CACCAAACAT GCTTGGTGAA AAGTTAGCTT TATCTAATAT AAATTCATTG  AGGTCTTATG AAGTTGTTGA TGAAATTAAA GAGGCTTTGG AGCAAGCTTG TCCTGGCGTT GTTTCTTGTG CTGATCTTTT AATCATTGCT GCTAGAGATG CTGTTGTTCT GGTAATTTTT  TTTTTAGTCT TTTATCTTTT TACTTTCATT TCTTAAAAAG GAAAAAGATC ATTGTTTTTT TTATTACTTT TTTGTGTGGG GTAGTGTGGT AGTGGGGTAG GGGAGGCAGG GACAAATGGA  GGAGGGGGGG TTCATCACTT TGGGAGTGTT GCCGTCGCCT TCACAAGGTA CATTTGGCGT CTATAAGCGG CGAAAGTATG AGTTTGCCCT AGTAGTGATA TCGAGTGGGG GTGGGGGTGG  GGCGGAGTGG GAGCGGCGAA GCGTTACAAA TTTGATATAA ACATTTTCCC ATTAAATTTT AGTAGGTTTT TGGTATTGAT TCGGTTGAGA TATGAAAAGT TAAAATTATT TTGAAGGGTA  TTTTTGAAAT AAAAAAATTT TAAATTAGAA AGTTTCTTTT TCGAGTGAAA ACTTGTAAAT ACTCCCAAAA TATATTTTCC ATACTTAAAA TTATGTATAT TCAAGCTTGA TAAAGAAATA  ATTATTTGAA ATCATCTTTA AAAATCAAGT ATTTCAAGTA TTCAATTTAT TCATGAAGAA ACAACTCTGT TTAGATTATC GATAAAAATC ACTTCGTATT TTTCGTCGCC CCTCATGTAT  AAAGAAAACA AATGGTATTT GATTAGTCCC TCGTCCCAAA ATAAGTTGTT AATTTATTCA TAAACATACA ACTTTGTTTA GATTATCGAT AAGAAATCAC TTTGTATTTT CTGCCGCCCC  TCGAACGTAA AGAAACCAAA TGGTATTTGA TTAGTCTCCC ATCCCAAAAT AAGTTGTTAA TTTATTCATG AAAAAACAAC TCTGTTTAGA TTATCGATAA GAAATCACTT CGTATTATCA  GCCGCTCCTC GAAGGTAAAG AAAACAAATG GTATTTGATT AGCCCCCTCC CCCCTCCCAA AATAAGTTGT TTTTATAATA ATAATTCAAG ACTGAAATAA GCAATAGTTT CCAATTATAC  CCTTGCATCA ATTCTTAAGA AATATCTACT AATAAATATT GCACAACTTA GTCAAACTAT CTATTATATT TACTTGTTTT TCGTGATGAG TGTGAAATAA GCTAAAACAA CTACTGTTAT  TTGTTTTCTA TCTTTTTACT CTATTAGAGT GGAGGTCCAT ATTGGGAAGT AAAGTTGGGA AGACTAGACA GTTTAACAGC AAGCCAAGAA GACTCAAACC AAATCATGCC AAGTCCAAGA  TCAAATGCAA CCTATCTCAT TGATCTTTTT AGTAGATTCA ATCTTTCAGT CCAAGATCTT GTATCCCTCT CTGGCTCTCA TTCCATTGGC AAAGGAAGAT GTTTCTCCAT TGTGTTTAGG  CTATACAATC AGTCCGGCTC GGGGCGTCCT GACCCCTCCA TTGAACCACC ATTTAGAGAA AAGCTAGACA AACTTTGTCC ACTTGGTGGC GATGGGAATG TGACCGGAGA TTTAGATGCA  ACGCCTGAGC TGTTTGACAA TCAGTATTTC AAAGATTTGA TGAACGGGAG AGGGTTTCTG AATTCTGATG AAACGCTTTT TACTAACTCT ATAACGAGGG AGTATGTTGA GGAGTATAGT  GTTGATCAAG AAAGGTTTTT TAATGATTTC GCCGAAGGAA TGGTTAAGAT GGGTGATCTA CAGTCGGGGC GTCCTGGTGA GATAAGACGC GATTGTAGGG TGGTTAATAG CTATAGACCT 
GGTGTTGCAG TCTTGTTTGA GACTTCAAAC AAAAAAGGGT AA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGGTTACA CCCTTTTGTT CTTCTTCATT CTTCTCCAAA GTTTGAATCT TTTTGCTATT TCTACAACAT TAAAACCCTA TTTTTACTCC AGAACTTGCC CAAAAGCTGA ATTTATAGTC  AAAGAAGTTA TGAAAAAAGC TATGAAAAGA GAAACAAGAA GCATAGCTTC TGTCATGAGA TTGCAATTTC ATGATTGTTT TGTTAATGGA TGTGATGCTT CTTTGTTGTT GGATGATACA  CCAAACATGC TTGGTGAAAA GTTAGCTTTA TCTAATATAA ATTCATTGAG GTCTTATGAA GTTGTTGATG AAATTAAAGA GGCTTTGGAG CAAGCTTGTC CTGGCGTTGT TTCTTGTGCT  GATCTTTTAA TCATTGCTGC TAGAGATGCT GTTGTTCTGA GTGGAGGTCC ATATTGGGAA GTAAAGTTGG GAAGACTAGA CAGTTTAACA GCAAGCCAAG AAGACTCAAA CCAAATCATG  CCAAGTCCAA GATCAAATGC AACCTATCTC ATTGATCTTT TTAGTAGATT CAATCTTTCA GTCCAAGATC TTGTATCCCT CTCTGGCTCT CATTCCATTG GCAAAGGAAG ATGTTTCTCC  ATTGTGTTTA GGCTATACAA TCAGTCCGGC TCGGGGCGTC CTGACCCCTC CATTGAACCA CCATTTAGAG AAAAGCTAGA CAAACTTTGT CCACTTGGTG GCGATGGGAA TGTGACCGGA  GATTTAGATG CAACGCCTGA GCTGTTTGAC AATCAGTATT TCAAAGATTT GATGAACGGG AGAGGGTTTC TGAATTCTGA TGAAACGCTT TTTACTAACT CTATAACGAG GGAGTATGTT  GAGGAGTATA GTGTTGATCA AGAAAGGTTT TTTAATGATT TCGCCGAAGG AATGGTTAAG ATGGGTGATC TACAGTCGGG GCGTCCTGGT GAGATAAGAC GCGATTGTAG GGTGGTTAAT 
AGCTATAGAC CTGGTGTTGC AGTCTTGTTT GAGACTTCAA ACAAAAAAGG GTAA 

Retrieve as FASTA