Entry information : StPrx58 (PGSC0003DMG400016223 / Peroxidase 17)
Entry ID 12849
Creation 2014-02-05 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2014-07-31 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2014-07-31 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: StPrx58 (PGSC0003DMG400016223 / Peroxidase 17)
Name (synonym) StPrx58 (PGSC0003DMG400016223 / Peroxidase 17)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx021]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Solanaceae Solanum
Organism Solanum tuberosum (Potato)    [TaxId: 4113 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value StPrx58
start..stop
S start..stop
LePrx47 662 0 1..337 1..337
NtPrx08-1B 585 0 1..334 1..334
AhalPrx10 516 0 4..332 2..329
InPrx03 516 0 3..324 2..323
Literature and cross-references StPrx58 (PGSC0003DMG400016223 / Peroxidase 17)
Protein sequence: StPrx58 (PGSC0003DMG400016223 / Peroxidase 17)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   338 (318)
PWM (Da):   %s   37698.03 (35408.8)  
PI (pH):   %s   5.3 (5.13) Peptide Signal:   %s   cut: 20 range:20-337
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MGYTLLFFFI LLQSLNLFAI STTLKPNFYS HACPKAEFIV KEVMKKAMKR ETRSIASVMR LQFHDCFVNG CDASLLLDDT PNMLGEKLAL SNIDSLRSYE VVDDVKEALE KACPGVVSCA  DLLIIAARDA VVLSGGPYWE VKLGRLDSLT ASQEDSNQIM PSPRSNATYL IDLFSRFNLS VQDLVALSGS HSIGKGRCFS IVFRLYNQSG SGRPDPTIEP SFREKLDKLC PLGGDGNVTG 
DLDATPELFD NQYFKDLVNG RGFLNSDETL FTNSITREYV KEYSVDQERF FKDFAEGMVK MGDLQLGRPG EIRRDCRVVN SYRPRVEVLF ETSNKKG* 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic (introns 1 and 2).
Promoter
Send to BLAST
Send to cis Analysis
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
TCTATACAAG CGAAGAAAAA ATGGTGTTTT TCCTATCAAA ATGATAACTC ACATCATTTG TAAGTCTTGC TTTGGGAGTG CCGCCGCTGC CTCCACAAGG TACATCTCAC ATCTATGAGC  TGCTATAACT ATATGAGTTT TTGCCCTAGT AGCGAGAATA TTGATTGGGG GCTGGGTGGG CGGCGGAGGG TTATAAGTTC GATAAAAATA TTTTCCTGTT AAAATTTTAG TAGGTGTTTG  GTTACAATTT GGTTGAGATT CGAAAAATAA AAACTATTTT GAAGGGTATT TTTGAGATTA AAAGTTTTAA AGTTAATTTT TTTTTTTTTT AGTGAAAACT TGAAAATACT CCTAAAATAT  ATTTTTCATA CTTAAAATTA TCTATTTCAA ACTTGATAAA CAAATACTTA TTTGAAATAC TCCCAAAATA TCAAGTATCT CAAATATTCG ATTTATTAAC AAACAACTCT ATTTAGATAA  ATGACAAGAA ATTACTTTGT GTTTTTTTCG CCGCTCCTCA AATATAAGGA AAACAAATAG TACTTGATTA GTACCCCCTT TATCCCAAAA TAAGTATACA TAGATTTGTA TATTTAAAGC  TAAGCCTTAA GAAATACCTT GTGTGAAATC TTTTCTCGCG ATGATCGGTA TCTACCATGC ACTTTTGTTG AGTCACATTC GATTTGTCTT CAATTTACAT TTAATTGTCA ATGTTGAGTC  ACATCTAATT TGTCTTTAAT TTTCATCTAT TATCCCATGA TACGTCCAAA TATCAATATT AAATCACATC TGATCTGTTT TCAATTTTTA CGTGTCATCA TATAATACAC CTAACTATCA  ATGTTAAGTC ACATCTAATC ATTCTTACCA TTATGTTAAT TACATTTATA TCAAATGACT CAAATTGAAA CTTTGCAAAA TTTTGTTAAT CATATAGCAA GATAGGGAAT GTGTGCAAAA  AGTGTTTGTA ATTGTTTTTC TTCGTAGATT AGGGGTTGTT TGGTCTGAAG ACAAGTTATG TTGGAAATGG GAAATTAATA ATGCTGAAAT TCATTATGGT GATATTATAT TTTATTGATC  GCTTGATTTA TTAAATTAAA AATAACATGT ATTGCATAAC TTCTAAGAAG AAGTTGTTTG TTTTACAAAA AAAAAAAAAA TCCTTCATCC ATCTTATTTA GTAGAAAAAC AATTTGAGGA  CCTCATGGAT ATTTTTGTCA TTTTCATCAT TTTATCTCAA AATAATCAAT CTCTATTATT TCCACCTTCT CACAAAGTAA TATATCTAGA TACTAATCAC TATCTTGGTA TAACTATTCC  CAAAATCAAT AAATAAACAG GAGATAAAAG GATACTGAAT TTTTACTCTA GAATAGTCTA GATTCAGTCC TTGGAAATAA AAAACTTCTT GACAAGGAGC GTATTCAGTC CTCGGGAAAC  TTATTTAATT TCGAATTCAA TAAATTTAAT CTCGATACTA TTATTTTCAG TTTTTCACCT TCTCACAAAA TAATATATCA TGATACTAAT TACTAATCTT GGTGTAACTT TTCCAAAAGC  AATAAATAAA CAGGAGATGA GAAATTACTG AATTTTACCT TAGAACCGTC TAGATTTAGT CCTCGGAAAT AATAAACTTC TTGACCAGGA GCGTATTCAA TTATAGTCAA TAAATTTCGA  TTCCAATAAA TAAAAAGAAA AATACATCAC CTATTCTACT ACCAATGCAA CAAGTAGGTC CAATTGATTG AAAAATCAGA AAATAAATGA CAAAAATACA GAAGACCATG ACCCTACCCC  ACCCCACCTC ACCCCTAACC CCACTCAACC CAAAACAAAC TCTTCACAAT TGGCCACTTT GTCTCAACCA AAAAATCCTC TATATAATGC TGACAACACA TGCAAATTAG GAATTTCTTC 
CTTAAAGAAC CCAAGCCATC TCTCTCAAGA ACAAAAAAAA ACTAGTTTTT TCTTGAAAAA ACTAAACCCC CAAGAATCAA GA 

Retrieve as FASTA  
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGGTTATA CCCTTTTGTT CTTCTTCATT CTTCTCCAAA GTTTGAATCT TTTTGCTATT TCTACAACAT TAAAGCCAAA TTTTTACTCT CACGCTTGCC CAAAAGCTGA ATTTATAGTA  AAAGAAGTTA TGAAAAAAGC TATGAAAAGA GAAACAAGAA GCATAGCTTC TGTTATGAGA TTGCAATTTC ATGATTGTTT TGTTAATGTA AGAATTTCAA GAACCCCATT TACCCCCCCC  CCCCCCACCC ATCCCTCTTT ACATCCnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnC CCCCCACCCC CCCCCCCCCC CCCCCCCTTA  TTTTTTTTCA TAAAAATTGA TTCTTTTTGG TTGATGTTGT GTGTTCTTGA TTTTTTTTCC CATAAAAATT GATTCTTTTT GGTTAATGTT TTGAGTTTTT GATTTTTTCC CCATAAAGAT  TGGTTCTTTT TGGTTAATGT TTTGAGTTCT TGATTTTTTT GCCATAAAAA TTGATTCTTT TTGGTTACTG TTTTGAGTTC TTGATTTTTT TTCCCATAAA GATCGGTTCT TTTTGGCTAA  TGTTTTGTGT TGTTGATTTT TTTTTTTAGG GATGTGATGC TTCTTTGTTG TTGGATGATA CACCAAACAT GCTTGGTGAA AAGTTAGCTT TATCTAATAT AGATTCATTG AGGTCTTATG  AAGTTGTTGA TGATGTTAAA GAGGCTTTGG AGAAAGCTTG TCCTGGTGTT GTTTCTTGTG CTGATCTTTT AATCATTGCT GCTAGAGATG CTGTTGTTCT GGTAAATTTT TCAAGTCTTA  TCTTTTAACT TACATTTCCT AAAAGAGGAA AAAGATCATT GTTTTTTTAT TACTTTTGTG TGTGTGGGGT TGTGTGGTGG TGGGGTGAGG GTAGGGGAGG CAGGGGAGAG GAGGAGGGGG  AGGGGGCTCA TTTGTAAGTC TTGCTTTGGA GTGCCGCCGC CGCCTCCACA AGGTACATTT GGCGTCTATT AACCGCTATA ACTATATGAG TTTTTGCCTA GTAGCGAGGA TATCGATTGG  GGGGTGGGGT AGGGCGGCGG AGCATTACAA GTTCGATATA AATATTTTCC CATTAAAATT TTTAGTAGGT GTTTGGTTAT GATTTGTTTG AGATTCGAAA AATAAAAATT ATTTTAAAGG  GTATTTTTGA GATAAAAAAT TTTAAAGTTT CTTTTTTGAG TGAAAACTTG AAAATACTCC TAAAATATAT TTTTCATACT TAAAATTATG TATTTTCAAG CTTGATAAAT AAATACTTAT  TTGAAATTAT CTTTAAATAT CACGTATTCC AAATATTCAA TTTATTCATG AACAAACAAC TCTATTTAGA TAAACGACAA AGAAATCACT TTGTATTTTT CGTCCCCCTC AAATATAAGG  AAAACAAATA GTACTTGATT AGTACCCCTT CCATCCCAAA ATAAGTTGTT TTTATAATAA TTCAAGACTA AAATTAGTAA TAGTTTCCAA TTATACCCTT ACATCAATTC TCAAGAAACA  TCTACTAATA AATAAGCGCA ACTTAGTCAA ACAATCCATT ATATTTACTT GTTTTTTTTA ATGAGTGTGA AATGAGCTAA AACGATTGCT GTTATTTGTT TTTATCTTTG TACTCATCAG  AGTGGAGGTC CATATTGGGA AGTAAAGTTG GGAAGACTAG ACAGTTTAAC AGCAAGCCAA GAAGACTCAA ACCAAATCAT GCCAAGTCCA AGATCAAATG CAACATATCT CATTGATCTT  TTCAGTAGAT TCAATCTCTC TGTCCAAGAT CTTGTAGCCC TCTCTGGCTC TCATTCCATT GGCAAAGGAA GATGTTTCTC CATTGTGTTT AGGCTATACA ATCAGTCCGG CTCGGGGCGT  CCTGACCCTA CCATTGAGCC ATCTTTCAGA GAAAAGTTAG ACAAACTTTG TCCACTTGGT GGTGATGGGA ATGTGACTGG AGATTTAGAT GCAACACCTG AGCTGTTTGA TAATCAGTAT  TTCAAAGATT TGGTGAATGG GAGAGGGTTT TTGAATTCTG ATGAAACACT TTTTACTAAC TCTATAACAA GGGAGTATGT TAAGGAGTAT AGTGTTGATC AAGAAAGGTT TTTTAAGGAT  TTTGCTGAAG GAATGGTTAA GATGGGTGAT CTACAATTGG GGCGTCCTGG TGAGATAAGA CGCGATTGTA GGGTGGTTAA TAGCTATCGA CCCCGTGTTG AAGTCTTGTT TGAAACTTCA 
AACAAAAAAG GGTAA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGGTTATA CCCTTTTGTT CTTCTTCATT CTTCTCCAAA GTTTGAATCT TTTTGCTATT TCTACAACAT TAAAGCCAAA TTTTTACTCT CACGCTTGCC CAAAAGCTGA ATTTATAGTA  AAAGAAGTTA TGAAAAAAGC TATGAAAAGA GAAACAAGAA GCATAGCTTC TGTTATGAGA TTGCAATTTC ATGATTGTTT TGTTAATGGA TGTGATGCTT CTTTGTTGTT GGATGATACA  CCAAACATGC TTGGTGAAAA GTTAGCTTTA TCTAATATAG ATTCATTGAG GTCTTATGAA GTTGTTGATG ATGTTAAAGA GGCTTTGGAG AAAGCTTGTC CTGGTGTTGT TTCTTGTGCT  GATCTTTTAA TCATTGCTGC TAGAGATGCT GTTGTTCTGA GTGGAGGTCC ATATTGGGAA GTAAAGTTGG GAAGACTAGA CAGTTTAACA GCAAGCCAAG AAGACTCAAA CCAAATCATG  CCAAGTCCAA GATCAAATGC AACATATCTC ATTGATCTTT TCAGTAGATT CAATCTCTCT GTCCAAGATC TTGTAGCCCT CTCTGGCTCT CATTCCATTG GCAAAGGAAG ATGTTTCTCC  ATTGTGTTTA GGCTATACAA TCAGTCCGGC TCGGGGCGTC CTGACCCTAC CATTGAGCCA TCTTTCAGAG AAAAGTTAGA CAAACTTTGT CCACTTGGTG GTGATGGGAA TGTGACTGGA  GATTTAGATG CAACACCTGA GCTGTTTGAT AATCAGTATT TCAAAGATTT GGTGAATGGG AGAGGGTTTT TGAATTCTGA TGAAACACTT TTTACTAACT CTATAACAAG GGAGTATGTT  AAGGAGTATA GTGTTGATCA AGAAAGGTTT TTTAAGGATT TTGCTGAAGG AATGGTTAAG ATGGGTGATC TACAATTGGG GCGTCCTGGT GAGATAAGAC GCGATTGTAG GGTGGTTAAT 
AGCTATCGAC CCCGTGTTGA AGTCTTGTTT GAAACTTCAA ACAAAAAAGG GTAA 

Retrieve as FASTA