Entry information : FvPrx17-1A (gene16250-v1.0-hybrid)
Entry ID 12850
Creation 2014-02-05 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2014-02-05 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2014-04-10 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: FvPrx17-1A (gene16250-v1.0-hybrid)
Name (synonym) FvPrx17-1A (gene16250-v1.0-hybrid)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx017]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Rosaceae Fragaria
Organism Fragaria vesca    [TaxId: 57918 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value FvPrx17-1A
start..stop
S start..stop
PpePrx25 577 0 1..326 1..322
PpePrx27 570 0 1..321 1..319
FvPrx17-1B 560 0 1..319 1..316
PpePrx52 553 0 1..319 1..316
Literature and cross-references FvPrx17-1A (gene16250-v1.0-hybrid)
Protein sequence: FvPrx17-1A (gene16250-v1.0-hybrid)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   330 (309)
PWM (Da):   %s   36642.44 (34417.1)  
PI (pH):   %s   5.26 (5.24) Peptide Signal:   %s   cut: 21 range:21-329
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MSPFFLPLLL LLRIITGAAA VQLRPGYYSG MCPEAETIVR DVMKKAFARE PRSLASVMRF QFHDCFVNGC DASMLLDDTP TMLGEKLSLS NINSLRSYEV VDEVKEALEK VCPGVVSCAD  IIIMASRDAV ALTGGPDWQV KLGRLDSLTA SQEASDNVMP SPRANATFLI DLFAKFNLSV KDLVALSGSH SIGQGRCFSI MFRLYNQSGT GRPDPAFEPM YRKKLNKLCP LNVDQNVTGD 
LDATPIIFDN QYFKDLASGR GFLNSDQTLF TFPETRGFVK QFSIDQEEFF KAFVEGMIKM GDLQIEQPGE IRKNCRVANR RAVETFWES* 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic (introns 1 and 2).
Promoter
Send to BLAST
Send to cis Analysis
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
TGTATGATAT AGTGTCACTA ACAACATTAC ACTCGGCCAC ATGAAATGAA GCTGAAGCAA CCTCTCTAGA ACCAGCAAAA ATATGCTCTC CATTGTGATT TCTAATGACA AACCCAATAG  CGCCAAACTA CTGCTAAGGA CCGACCTATC AAAAATAAGT TTAATGAAGC TTTCTTGGAG AGGATGCAAT CGAATGACTT AAGGATGAAA TTGACTTCTT CTAGAGTTGA TATTCTCTAC  CGCACATGCC TTAGGATTGC GCTTTCGATA TGCCTCACCA GAGTTTTCCG CATCATGAAC AACACTCACA TGATAGGGAG GTTTGTTTCT GAAAGTGAGG TTGTTTATAT TTCTAGTCTC  CGTAATCTTC CAGCAAATAG TAATGCAATT CTTTGCAACA TATTTATCAT GATCCTCCTT GAACCAGAAG AGGAACAACT CATCATAAGA AGAAGATCAC ATTAGGTCAA ATCTAGCAGC  ATTCCATGTG CTCTAATGAG CAATTCGAGA ACTAATTTTC AACCTTACAC TTACTAAAGT CCAAGCAAAA GTCTTAGCCC CAAATAACAT TCAATATTTT AGTCTTCGAG TGAGAAGTAG  TGTTCTCACA CGAAGATATG AGAAAATTTT GTTAGACTGC GTTTAGAATC AGCGTTGTTT GGTTTAGTAT CATTTGGTCT AGTAACACAA TCTACTATAT AAGTGAAGGA GACTCTAAGT  TCGACTCATG ACAAGACTAG TCATTATGTT TCTTGGTTGT TGATATGATA TATATAAAGC TAACTCAGCT AAGTGTTTAG TGTACTTGTT AAAGTAGGAG ACATAACTAT GCATGGTATT  ATTAATGAAA GTCTATAAAT TTAAAACAAG CAAACAGAAA TGGAGACATA ATTACATTAA TACAACATTA CTAGTCAAAA TAGTTCTAGA ATTTCAAAAT TATTGTAGCT AGAAACGCAA  CACATCACTG AGTGTGCGTA GTGTGTACAT ATGCGCGTGC GCGGCGTGAT AGAAAGTCAT ATATATAACT AAATATTTGT AATAATTTGA CCGTTACAGA ATTATTTTTG TTGTCAGAAA  ACAAAAGTGA AGTATTTGAA TTGTTATTAT GGGCTTTAAC TCACCAACGC ACACTAAAAG TCTTTCGAAA TCATGTCGGA TGTCATACGT CACACGGCTC TACAACCAAC CTGTGGTTGA  TTACGAGAAA AAAAAACCAA AGCACTTGAT CCTTTGCCAC GTACTTTAAG ATGCTCTTCT TTGCGAATCG ACGTCGCACC ACCACCCCTT ATATTGTAAG CTAAGTTGTA CGTCTTGTAG  ATTACTTAAA TACGTTCTTG TAGATTACTC AAATACGTTC CGGTTTAGTC ATAAAGAATA ACAACATCCT TTTTTTTTTC TAATATCTTG TGGTAAAAAA AAAAAACTCT TTCCTTTTCA  CGCTAGATTT GAAGTCAAAA ACAAATCAAA ATCTCTTTCC CTCAATTGGA GATCCACTAC AATTAACCAT TGAAACGCCT GACTACTGAA GTAATGCAGT GCTACACAGC TGGATTTCCC  AAAGCTGCAC CCCATTTATT ACCCCATACC CAAAAATAGA TCTCCCAGAC TCAGACAAAA CCTCAAAACT ACAAAATGGC ATCAGCAAAA CTAGAAACTT ACACAGTCTC CCGGTCAGAG  CATCATCGTG GGTGTCGCAA TTGTTGACGC AGTCACCAGT CCCCACTCCC AGTCCTCTCT TCCAGTCGGC TCTCTCTTAC CCAATTGCCT TCCCCTGCTT CCTGTTATCA CAACAAACCC  TCTCATCTTT TGACACACAC TCACAGACAC CAACGAAATT CCAAGCCTTC TCTCTCTTTT TTCTCAAACC CCTCATTATG AACCATCCTT TTAGCACCCC ACCAATCCCA AACAGTAAAA 
GGGTAACACC CTCTTCACCT TTTCACCTAT ATATACATGC ACATAATTAG ATTGGACCAC TCCACAAACT GAAACATACA 

Retrieve as FASTA  
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGTCTCCTT TCTTCCTTCC TCTCCTCCTC CTCCTCCGCA TAATAACCGG GGCGGCCGCC GTGCAGCTCC GTCCCGGTTA TTACTCCGGG ATGTGCCCGG AAGCCGAAAC CATAGTCAGG  GATGTCATGA AGAAGGCCTT TGCTAGAGAG CCCCGGAGCC TTGCGTCTGT CATGCGCTTT CAGTTCCATG ATTGCTTTGT TAATGTGAGT ATGACAAAGC AAAAGGCTTT AATTTGGTTA  TAGGCCTTTT TGTGTTGATG GTTTTAAGTT GTGTGTTGTA GGGGTGTGAT GCTTCTATGT TACTTGATGA CACACCAACC ATGCTTGGGG AAAAGCTTTC TCTTTCAAAC ATAAACTCAC  TGAGATCTTA TGAGGTTGTT GATGAAGTCA AGGAAGCCTT GGAGAAGGTC TGTCCTGGTG TTGTTTCTTG TGCTGACATC ATCATCATGG CTTCTAGAGA TGCTGTTGCT CTGGTATGCA  TCTCTCTCTA TCTCCCTCTT ATCTATTTTT ATCATTACCA AACCGAAAAG GTAAAATCTA GTTTTGTTAA TTAACTTAAT TTGTTACAAG ACCATGTTTG GAAGTCTACC CCATATCAAA  GTGGGATTTG CAGTGAGGTA TTCTTTCTGT AATTAAAGGA TGAAATGAGT AAAGCTGGCA AAAGATGTTT TCTTTCTTCT TTTGTCCTGT CAATTGATGC TAAAGAGTTA TGATTTATGA  ACTCCTGAAC CCAAAAGGTG TTTATCTTTT TACTGCTGTA TCTGCAATCT TGATTTGCAG TACCTTGCTA TTAATTTTTT TTTCCTTTTT TGAGGAAATG ATACTATTTA TGTGAATTAA  GAGAGTTCTT TTGTCGTTGT GGTTTGTCCT TGTGATAGAC TGGAGGACCA GATTGGCAAG TAAAGCTAGG AAGATTGGAC AGCTTAACAG CAAGCCAAGA AGCCTCAGAC AACGTTATGC  CTAGTCCAAG AGCCAATGCA ACCTTCCTCA TTGATCTCTT TGCCAAATTC AATCTTTCTG TCAAAGACCT GGTTGCGCTT TCAGGGTCAC ACTCCATCGG CCAAGGGCGG TGCTTCTCCA  TCATGTTTCG GCTGTACAAC CAATCCGGCA CAGGCAGGCC GGACCCTGCT TTTGAACCAA TGTATAGAAA AAAGCTAAAC AAACTATGCC CTTTGAATGT GGACCAAAAC GTGACTGGAG  ACCTTGATGC TACTCCTATA ATATTTGATA ATCAGTACTT CAAGGACTTG GCTTCCGGGA GAGGGTTTCT TAATTCGGAT CAAACACTTT TCACATTTCC GGAGACAAGA GGATTTGTGA  AGCAGTTCAG CATTGATCAA GAAGAATTTT TCAAGGCTTT TGTTGAGGGG ATGATAAAGA TGGGTGACTT GCAGATTGAG CAACCTGGGG AGATAAGGAA AAATTGCAGG GTGGCTAATC 
GTCGCGCTGT CGAAACATTC TGGGAGTCTT GA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGTCTCCTT TCTTCCTTCC TCTCCTCCTC CTCCTCCGCA TAATAACCGG GGCGGCCGCC GTGCAGCTCC GTCCCGGTTA TTACTCCGGG ATGTGCCCGG AAGCCGAAAC CATAGTCAGG  GATGTCATGA AGAAGGCCTT TGCTAGAGAG CCCCGGAGCC TTGCGTCTGT CATGCGCTTT CAGTTCCATG ATTGCTTTGT TAATGGGTGT GATGCTTCTA TGTTACTTGA TGACACACCA  ACCATGCTTG GGGAAAAGCT TTCTCTTTCA AACATAAACT CACTGAGATC TTATGAGGTT GTTGATGAAG TCAAGGAAGC CTTGGAGAAG GTCTGTCCTG GTGTTGTTTC TTGTGCTGAC  ATCATCATCA TGGCTTCTAG AGATGCTGTT GCTCTGACTG GAGGACCAGA TTGGCAAGTA AAGCTAGGAA GATTGGACAG CTTAACAGCA AGCCAAGAAG CCTCAGACAA CGTTATGCCT  AGTCCAAGAG CCAATGCAAC CTTCCTCATT GATCTCTTTG CCAAATTCAA TCTTTCTGTC AAAGACCTGG TTGCGCTTTC AGGGTCACAC TCCATCGGCC AAGGGCGGTG CTTCTCCATC  ATGTTTCGGC TGTACAACCA ATCCGGCACA GGCAGGCCGG ACCCTGCTTT TGAACCAATG TATAGAAAAA AGCTAAACAA ACTATGCCCT TTGAATGTGG ACCAAAACGT GACTGGAGAC  CTTGATGCTA CTCCTATAAT ATTTGATAAT CAGTACTTCA AGGACTTGGC TTCCGGGAGA GGGTTTCTTA ATTCGGATCA AACACTTTTC ACATTTCCGG AGACAAGAGG ATTTGTGAAG  CAGTTCAGCA TTGATCAAGA AGAATTTTTC AAGGCTTTTG TTGAGGGGAT GATAAAGATG GGTGACTTGC AGATTGAGCA ACCTGGGGAG ATAAGGAAAA ATTGCAGGGT GGCTAATCGT 
CGCGCTGTCG AAACATTCTG GGAGTCTTGA 

Retrieve as FASTA