Entry information : PcapCcP01
Entry ID 12865
Creation 2014-03-03 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2014-03-03 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2014-03-03 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: PcapCcP01
Name PcapCcP01
Class Cytochrome C peroxidase    [Orthogroup: CcP004]
Taxonomy Eukaryota Phytophthora
Organism Phytophthora capsici    [TaxId: 4784 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value PcapCcP01
start..stop
S start..stop
PiCcP01 606 0 1..333 1..330
PparaCcP01 600 0 1..333 1..330
PraCcP01 570 0 19..333 20..335
PsojCcP01 530 0 19..304 17..302
Literature and cross-references PcapCcP01
Cluster/Prediction ref. JGI gene:   536870
Protein sequence: PcapCcP01
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   428
PWM (Da):   %s   48078.34 Transmb domain:   %s   i39-61o
PI (pH):   %s   6.81
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MLRRVAVRAA QASAASAAKT RSFATSQLRT ASKKKQPSAI VLAAAGVAAV GGLALTDLVN AREKPVDLDA IKKEIVEIFD EDNYMGPTMV RLAWHSSGSY SKHDGSGGST GGTIRFDPEI  NHGGNAGLHL AVKALEKVKK NHPEITYADL YILAGVTMIE EMGGPEIPFR LGRPDAKSGK EPTQTPDDRL PNADMGSKEK TTQHVRDVFY RMGFDDRDIV ALVGAHAIGR CYPTRSGYSG  PWTNAEWTFS NEFFRELIEN KWTIKKWNGP MQYEDPTGKL MMLPADIVLI QDPKFKKIVE EYAKDEDLWF KDFSKAFVKL TENGVKFPET SGWPTQTSIQ ELLKRLSEPD RVETEEDPVM 
ADGRIEWDTR GWNKTKIQSA IDTLYEEIEH SDDDSRRKLA TTMLLRLMET HEGGYMLWIM WRRRYRA* 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic (4 introns).
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGCTTCGTC GTGTTGCCGT CCGCGCCGCC CAAGCGTCCG CCGCCTCCGC CGCCAAGACG CGCAGTTTCG CCACGTCGCA GCTGCGCACA GCCAGCAAGA AGAAGCAGCC AAGCGCCATC  GTCCTGGCTG CGGCAGGCGT CGCCGCTGTC GGTGGCCTCG CCCTTACCGA CCTGGTGAAC GCACGCGAGA AGCCTGTGGA CCTGGATGCC ATCAAGAAGG AGATCGTAGA GATCTTCGAC  GAAGACAACT ACATGGGACC CACGATGGTG CGCTTGGCTT GGCACTCGAG CGGCAGCTAC AGCAAGCACG ATGGCAGTGG TGGCTCTACC GGAGGAACCA TCCGTTTCGA CCCGGAGATC  AACCACGGTG GCAACGCTGG CCTACACCTG GCTGTGAAGG CGCTGGAGAA GGTCAAGAAG AACCACCCGG AGATCACGTA CGCTGATCTG TACATTCTGG CCGGCGTCAC TATGATTGAG  GAGATGGGAG GTCCTGAGAT CCCCTTCCGT CTTGGCCGCC CTGATGCCAA GAGTGGCAAG GAGCCCACAC AGACGCCGGA TGACCGTCTG CCTAACGCTG ACATGGGCAG CAAGGAGAAG  ACGACGCAGC ACGTGCGCGA CGTCTTCTAC CGCATGGGAT TCGACGACCG TGACATTGTT GCCCTTGTGG GAGCTCACGC TATTGGACGC TGCTACCCTA CGCGCAGCGG CTACAGCGGC  CCGTGGACCA ACGCAGAGTG GACGTTCTCC AACGAGTTCT TCCGTGAGCT GATTGAGAAC AAGTGGACGA TCAAGAAGTG GAACGGTCCG ATGCAGTATG AAGACCCTAC GGGTAAGCTC  ATGATGCTGC CGGCCGACAT TGTGCTGATC CAGGACCCCA AGTTTAAGAA GATCGTGGAG GAGTACGCCA AGGACGAGGA CCTATGGTTC AAGGACTTCT CCAAGGCTTT CGTCAAGCTT  ACTGAGAACG GCGTCAAGTT CCCGGAGACT TCGGGTTGGC GTAAGTTCTT TGGCGGTAAC TAAGCGCCTC ATTTTCGAGG GAAGGAACCT CCTTTTGTGT GTATGAGCGT AACCAGCTTC  AAGCTTATGG TATCTCTACC ACACAGCAAC GCAGACCAGC ATCCAGGAGC TGCTCAAGCG TCTAAGTATG TAACCAATAC ATCGCCATGA TGAAACGGCC TCTCTAACCT TGTTGTTGAT  CGATGCCAGT CCTATTTCCA ACTGTGTAGG ATAGTAGTCT CCAGCCGACT ATGAGCAGAA GCAATTCTCG TCGTGGACGA AGGCGTGATG TATCTCTTCC GTATGAACAT ACTTATCCGT  GGGAGGATGA GCGTGGATCT ACGATAGATC GCACTGTGGA GGTCAATGAA GAGGCAAAGC GTGTGTATGC GATGCAGGAA CAGTTGGCAC CTATGCTTAC ACTGGATCGA CCGCTGAATC  CAGCAGCAAG TGAGCATATT CAAGATGTGG GGCGTCGTGT ACTGATTCTT CGCGATACGA CCAAGGGAGC ACGCAAACAG AATGGAAATC ACAGTCCTCA ACAATCTCCG AAGCGTGTGA  TTCCAAGTCG ATTCCCTGAA GTTGCACCGG ACTTGGATGA TGAAGATGCA GGTGAGCCGG ATCGAGTGGA AACAGAAGAA GATCCCGTTA TGGCAGACGG ACGAATTGTA AGAGATCTCG  ACAGCGTTTG CTGGATGTTG ATGCTGATGC TTTCTTGGCG TTTAGGCAAC TATGCTGATG GATCAGGAAT GGGACACACG AGGATGGAAC AAAACCAAAA TCCAAAGTGC TATCGACACC  CTGTACGAAG AGATTGAGCA CTCCGACGAT GATTCGCGAC GTAAACTTGC AACTACCATG CTTCTCCGTT TGATGGAGAC TCATGAAGGT GGGTATGTAA GCGTTTCTTA ATGCAAGATC 
TGGTGTTGTA GTTGCTAGTG CTCACATTTT GATCCTTACT GTAGATGCTG TGGATTATGT GGAGACGTCG TTACCGAGCC TGA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGCTTCGTC GTGTTGCCGT CCGCGCCGCC CAAGCGTCCG CCGCCTCCGC CGCCAAGACG CGCAGTTTCG CCACGTCGCA GCTGCGCACA GCCAGCAAGA AGAAGCAGCC AAGCGCCATC  GTCCTGGCTG CGGCAGGCGT CGCCGCTGTC GGTGGCCTCG CCCTTACCGA CCTGGTGAAC GCACGCGAGA AGCCTGTGGA CCTGGATGCC ATCAAGAAGG AGATCGTAGA GATCTTCGAC  GAAGACAACT ACATGGGACC CACGATGGTG CGCTTGGCTT GGCACTCGAG CGGCAGCTAC AGCAAGCACG ATGGCAGTGG TGGCTCTACC GGAGGAACCA TCCGTTTCGA CCCGGAGATC  AACCACGGTG GCAACGCTGG CCTACACCTG GCTGTGAAGG CGCTGGAGAA GGTCAAGAAG AACCACCCGG AGATCACGTA CGCTGATCTG TACATTCTGG CCGGCGTCAC TATGATTGAG  GAGATGGGAG GTCCTGAGAT CCCCTTCCGT CTTGGCCGCC CTGATGCCAA GAGTGGCAAG GAGCCCACAC AGACGCCGGA TGACCGTCTG CCTAACGCTG ACATGGGCAG CAAGGAGAAG  ACGACGCAGC ACGTGCGCGA CGTCTTCTAC CGCATGGGAT TCGACGACCG TGACATTGTT GCCCTTGTGG GAGCTCACGC TATTGGACGC TGCTACCCTA CGCGCAGCGG CTACAGCGGC  CCGTGGACCA ACGCAGAGTG GACGTTCTCC AACGAGTTCT TCCGTGAGCT GATTGAGAAC AAGTGGACGA TCAAGAAGTG GAACGGTCCG ATGCAGTATG AAGACCCTAC GGGTAAGCTC  ATGATGCTGC CGGCCGACAT TGTGCTGATC CAGGACCCCA AGTTTAAGAA GATCGTGGAG GAGTACGCCA AGGACGAGGA CCTATGGTTC AAGGACTTCT CCAAGGCTTT CGTCAAGCTT  ACTGAGAACG GCGTCAAGTT CCCGGAGACT TCGGGTTGGC CAACGCAGAC CAGCATCCAG GAGCTGCTCA AGCGTCTAAG TGAGCCGGAT CGAGTGGAAA CAGAAGAAGA TCCCGTTATG  GCAGACGGAC GAATTGAATG GGACACACGA GGATGGAACA AAACCAAAAT CCAAAGTGCT ATCGACACCC TGTACGAAGA GATTGAGCAC TCCGACGATG ATTCGCGACG TAAACTTGCA 
ACTACCATGC TTCTCCGTTT GATGGAGACT CATGAAGGTG GGTATATGCT GTGGATTATG TGGAGACGTC GTTACCGAGC CTGA 

Retrieve as FASTA