Entry information : GrPrx33 (Gorai.005G077600)
Entry ID 12891
Creation 2014-03-17 (Maxime Neel)
Last sequence changes 2014-03-17 (Maxime Neel)
Sequence status complete
Reviewer Christophe Dunand
Last annotation changes 2014-03-19 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: GrPrx33 (Gorai.005G077600)
Name (synonym) GrPrx33 (Gorai.005G077600)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx003]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Malvaceae Gossypium
Organism Gossypium raimondii    [TaxId: 29730 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value GrPrx33
start..stop
S start..stop
GhPrx33 765 0 1..371 1..371
GrPrx32 568 0 15..361 1..343
PtPrx67 559 0 15..361 1..345
FvPrx01 541 0 25..371 12..355
Literature and cross-references GrPrx33 (Gorai.005G077600)
DNA ref. Phytozome 12:   Chr05 (8891135..8894551)
Protein sequence: GrPrx33 (Gorai.005G077600)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   372
PWM (Da):   %s   40556.59 Transmb domain:   %s   i21-43o
PI (pH):   %s   7.7
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MQRQGRKRNT KNLSMAKVTN FFVALLLISS LLLAPYLSIS EAADNSVPIV SGLSWTFYKT SCTKLESIIR TQLKKVFDND IGQAAGLLRL HFHDCFVQGC DGSVLLDGSA SGPGEQQAPP  NLSLRAKAFE IINDLRNRVE KACGRVVSCS DIVALAARDS VYLSGGPDYG IPLGRRDGLT FATVNATLQN LPPPFANATT ILSMLATKNF DPTDVVALSG GHTVGISHCT SFTTRLYPTQ  DPTMDKTFAN NLKVICPTVN STNTTVMDIR SPNKFDNKYY VDLMNRQGLF TSDQDLYTDS RTRGIVTSFA INETLFFEKF VVSMIKMGQL SVLTGNNGEI RANCSVRNAD NKSYLASVVE 
ELPVEEAWSD L* 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic (introns 1 and 2). No EST.
Promoter
Send to BLAST
Send to cis Analysis
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
CGGTTGAACC GAAAATTGGT GGTTTGATTG GTTAGTCTAC CAGTCAGATT CTAAAAATTT TAAGCTTCTT CGATGATATA TTTTAAATAA AATTAATCAT ATATTGTTTA AATTTGGAAG  GAAATGCGAA AAAAGAGTTT TTTTAAATCA GTTTTACATT TTAAAATCCA AAATTTAATT CTTATAAAAT TCAAATACAA CCTTTTTTAT TTATGATCGA AACAAAGAAA TTCAAATCTA  AATTTTTGAC CCAAATCATA CTTTCCAAAC AAAACATAAG GAAATTGATA TCCACGTTTG TCATATAAAG ATGAGAGCAT GAATAGGTAT GCCCAGCAAT ATGTTTGGGG TAATAGACAT  GGAAACATGT CTGCTTAAAC CTAATAGTTC AGCTTGAGTG AGAATGTGTC GACTCAACAT CCCATATCAT ATTTGTCATT ACACATTTAT GCAGGGATGA TAAAATCCAA ATTACTCAAT  AAATTTCGAA TCAATTCATT TTGAATGAAG TGAATTTTTT TTAAAAGTAG ATATGAGACA GGGTGGGTGG ATCTTTTTTT TTTCTTTTAG ATAGTGGGCC GTATGGAACG CTTATGATAA  TTGCTTGTAC TGCCCCACCC CGCCCCGCTC TATTATATGA AATTACCAAC CTATCCTTAT ATTTATATAA CTATTAAAGG GTAAAATGTA ATTAATTATT ATAGAAAATT CATATATTTT  ATACTTAAAT ATTTTTTAAA GAATTATGTT TAAATATTTA CTTAACTTTA AAAAAATTAA AAATATTAAA AAGATGTAGC AAAAATTAAA TTGAAGTGAA GCAGAGTGGG GGTAGTGATT  TTCAAGATTA TATATCTATA GTGGAGCAGT GCAAGTGGTG GATTAGAAAA TGCTATGGAG TGGTGGTGTA TTTAGCAAAA TCTGCTCTTG TCCCACTCAA TTGTGGCATG CTTTGCGTAA  CCATTATAAT TAGTGTGTTC CACTTAATTG AGTGTAATTA CATCATTTCA ATTTTTAGAA AGATAGTGAG AACTGAATTA ATTAGGAGGA CAATTACAAA TAATTACATT AAAATTCAAT  TAATGTATGA CTTTCCAAAC ATGATTGTAT GTAATTAAAA TTATACAATA ACAATAATTT TAATTTTAGG ACATAATTAT TATTTTTAAA TATAATTGTA TGTTATTTTA TTAATCTTGT  TTAAATAATT TACAAAACTT TATTAACAAG AGATAACTTC CTACCTACTA AATATAACTA AACTACATAT TATTAATTAT TAATTATTTA TACTTGGTCA AGGACTAATT GATGAGAACA  AAGAGTATAT GTTTAATGTT AAAGAATAAC TTAACAAATA TGGAATGTTA GAGTAATTAG ATAAAATTAC ATTTATGTTT ATTTTATTAG TAATTAATGC ATTGTCTAAT ACTTTCCTAG  ACTAACATAT TATATACAAT GATTTGATTT TGAATTTTGT TATTTGTTTA GAATTTTTCT CTCAAGTATT ATTCACAATT TTTATAATAA TTAATATTTT CTTTTGAAAT TAAAATTATG  TAATTGCGTA ACTACAATTT ATACTATCAG ATAATTATTA TGTAATTACA TTTTATCACT TAAACACATT AATGGGGGTT CAAAATTTCT TATAATTACA AGAGTATACG TCTAGTAATA  GTAATTACAG TTTCATCCAA TTACTATGTA ATGTCCAAAC ACACTATTAA TTTAACGCTA CAGCATTCAA TTAAATCCTT TTCATAAAAT TAATATTTTT TCAACTATTA TAAAAATAAT  TATTTTGCTA TGTTGCCAAC GAATAAACAT TATCCCAACA TTGTTGGAAG AGTCACTATG AAGCCCAAAG AGAGTAAATT CGATATGAAA AATATAAAAT AAATGAATAA ATAAAATGAA 
ATAGCTTAAA AAAAGGGGAA GGCTAATATT AATTAAATCT TAATGAATGA CTTGAAAATG GCTATAAATA AGACTAGGCC 

Retrieve as FASTA  
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGCAGCGTC AAGGACGCAA AAGAAACACC AAGAATCTAT CCATGGCTAA AGTTACTAAC TTTTTCGTTG CTCTCCTTTT GATCTCTTCT CTTTTACTTG CTCCTTACTT ATCCATCTCC  GAGGCCGCCG ACAACTCGGT CCCGATCGTG AGTGGCCTCT CCTGGACTTT CTACAAAACT TCATGTACAA AGCTCGAATC CATTATTAGA ACTCAGCTGA AGAAGGTGTT CGACAACGAC  ATTGGCCAAG CTGCTGGCTT GCTCCGCCTT CATTTCCATG ATTGCTTTGT CCAGGTACGT TATAAAACCA TGTAAGCATC CGAAACAGCG ATTGAAACAT GGATGCGTCG TTTTGATTCG  TTTTGTCATT GATGTTTACT AGGGATGCGA CGGATCTGTG TTGCTGGACG GATCGGCGAG CGGGCCGGGT GAGCAACAGG CTCCGCCGAA CCTGAGCTTG AGGGCCAAGG CTTTCGAGAT  CATCAATGAC CTGCGCAACC GTGTCGAGAA AGCATGTGGA AGAGTGGTCT CTTGTTCTGA TATCGTCGCG CTTGCTGCTC GTGACTCCGT TTACTTGGTA TCATCAATCA ATGTTACTTT  TTATGTCATT TTCATTCAGT CGAATTTTTT TATTATTTAA TGAACAAAAA CACAAAAATC AATCTAAAAA ACTATAAAAA AAATTAACGA ATTTTTGTTG AATACATGCT TGGATTTAAT  ATTTAAAATA GTTAGCATAC GATATTATTT TCTAATGATC CTCTAGCCTT CTAATTTAAG ATTTTGGTTC TTTTTTATCA ATGAAAAACA ATGGTTCACA TCTAAATTTG TGGTATAACT  TAAACTACAA ATATAAATGT CAATTGAGTT TCAACTCGAT TGGCATGGAT ATTGTTGCTA ATGTAGGAGG ATATGTGTTT AAGTACGTTG AAGCGTATTA TTCTCTTATT TATGGATTGG  GGAAGAGCTA CAGATAATTC TAAGCATTGT CTCCAAAGAA GCAGATATGA TCAGAACCTA TAAAAAATTA TTAAAAAAAT ATAAATATAT AATTTAATAA AAAGTTAAAA AGTAATATTT  TCAAACAAAA TTAATTTATT TATTTAGACT TAAATAAAGT GATGATTAAA ACTCTTATTA AATATTCGTT TGATTCGAGT TTAAACTATG TATAGAAAAC AATGACGATT AACTTAGCCT  ACTTGTTGGA GGGGTAGTTG GAAATTAAAA CGCGGTGTGT GGGTGAGTGG CATACGCCTC AGCTAACTTT TTTTTTTTCT CACAATGGGG CCATAAGGTC TTAAATTGTA CCAAATGTGC  ATTAATGGTC AATTTCTTGG TGTCATAAAG CCTAAATTTA TTAAAGCCTA GGTGAAAGCA GTTGTACATG GGGACCTTTC ATTCATAGTA TAAATATGAA TATGAATTTT GAGAAAAATA  TTATACTTAA ATAAGTTTTT CAATAGGATG AGAATAATTT TTTATATTAT TAAATTAATA TTAGAATAAT ATTTTATTTT TATCAATAAA TTTTAAATAT TAAAAATATA TTTTATGATC  CTAAGACTAC TCATAACCTC TATTAATCTT CTGCATTGAC AATAATATTT ATACCAATTA AATTAAGATT TGATCCACAA TTACCGAATC ATGTTTTAAC TATCTTTTAT ATTATATTAT  ACCTGAATTT GTTAGATGTA TGTTTGATTA AGTTAATAAG GTAATTTACT GTCACCAATA GATATTTCAT CAAAGTTGGA AGCACGTGTC ATATGAAATT TCCCTGAAGC TCACCAACTC  CTATAATATT TAATTTTTTA TTCTTTTTAA AAGGTCAAGC TATTATGTCA TCGTCATGGA GCTTGAAATT TTGACTTAAA ATCCCACCCC CCCATTTTGG TTTCACAGTC AGGTGGACCA  GACTATGGCA TACCATTGGG AAGAAGAGAT GGACTGACTT TCGCCACCGT AAACGCCACA TTGCAGAACC TACCACCGCC CTTCGCCAAC GCCACCACCA TCCTTTCCAT GCTCGCCACC  AAAAACTTCG ACCCCACCGA CGTTGTAGCT CTCTCCGGCG GGCACACCGT CGGCATCAGC CATTGCACAT CTTTCACCAC CAGGCTCTAC CCTACCCAAG ACCCTACCAT GGACAAAACC  TTTGCCAACA ATCTCAAGGT AATATGTCCC ACGGTAAATT CAACCAACAC GACGGTGATG GACATAAGGA GCCCCAACAA ATTCGATAAT AAGTATTACG TGGACCTGAT GAACCGTCAA  GGGCTGTTTA CCTCGGATCA AGACTTGTAC ACTGATAGCA GGACGAGGGG GATTGTTACT AGCTTTGCCA TTAATGAGAC GCTCTTCTTC GAGAAGTTTG TGGTGTCGAT GATAAAGATG  GGACAGCTGA GTGTGTTGAC TGGTAACAAT GGCGAAATTC GTGCTAATTG CTCGGTGAGG AATGCTGATA ATAAGTCGTA CTTGGCGTCT GTGGTGGAAG AGCTACCGGT GGAGGAAGCT 
TGGTCTGACC TTTAA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGCAGCGTC AAGGACGCAA AAGAAACACC AAGAATCTAT CCATGGCTAA AGTTACTAAC TTTTTCGTTG CTCTCCTTTT GATCTCTTCT CTTTTACTTG CTCCTTACTT ATCCATCTCC  GAGGCCGCCG ACAACTCGGT CCCGATCGTG AGTGGCCTCT CCTGGACTTT CTACAAAACT TCATGTACAA AGCTCGAATC CATTATTAGA ACTCAGCTGA AGAAGGTGTT CGACAACGAC  ATTGGCCAAG CTGCTGGCTT GCTCCGCCTT CATTTCCATG ATTGCTTTGT CCAGGGATGC GACGGATCTG TGTTGCTGGA CGGATCGGCG AGCGGGCCGG GTGAGCAACA GGCTCCGCCG  AACCTGAGCT TGAGGGCCAA GGCTTTCGAG ATCATCAATG ACCTGCGCAA CCGTGTCGAG AAAGCATGTG GAAGAGTGGT CTCTTGTTCT GATATCGTCG CGCTTGCTGC TCGTGACTCC  GTTTACTTGT CAGGTGGACC AGACTATGGC ATACCATTGG GAAGAAGAGA TGGACTGACT TTCGCCACCG TAAACGCCAC ATTGCAGAAC CTACCACCGC CCTTCGCCAA CGCCACCACC  ATCCTTTCCA TGCTCGCCAC CAAAAACTTC GACCCCACCG ACGTTGTAGC TCTCTCCGGC GGGCACACCG TCGGCATCAG CCATTGCACA TCTTTCACCA CCAGGCTCTA CCCTACCCAA  GACCCTACCA TGGACAAAAC CTTTGCCAAC AATCTCAAGG TAATATGTCC CACGGTAAAT TCAACCAACA CGACGGTGAT GGACATAAGG AGCCCCAACA AATTCGATAA TAAGTATTAC  GTGGACCTGA TGAACCGTCA AGGGCTGTTT ACCTCGGATC AAGACTTGTA CACTGATAGC AGGACGAGGG GGATTGTTAC TAGCTTTGCC ATTAATGAGA CGCTCTTCTT CGAGAAGTTT  GTGGTGTCGA TGATAAAGAT GGGACAGCTG AGTGTGTTGA CTGGTAACAA TGGCGAAATT CGTGCTAATT GCTCGGTGAG GAATGCTGAT AATAAGTCGT ACTTGGCGTC TGTGGTGGAA 
GAGCTACCGG TGGAGGAAGC TTGGTCTGAC CTTTAA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
AAAATGGCTA TAAATAAGAC TAGGCCATGC AGCGTCAAGG ACGCAAAAGA AACACCAAGA ATCTATCCAT GGCTAAAGTT ACTAACTTTT TCGTTGCTCT CCTTTTGATC TCTTCTCTTT  TACTTGCTCC TTACTTATCC ATCTCCGAGG CCGCCGACAA CTCGGTCCCG ATCGTGAGTG GCCTCTCCTG GACTTTCTAC AAAACTTCAT GTACAAAGCT CGAATCCATT ATTAGAACTC  AGCTGAAGAA GGTGTTCGAC AACGACATTG GCCAAGCTGC TGGCTTGCTC CGCCTTCATT TCCATGATTG CTTTGTCCAG GGATGCGACG GATCTGTGTT GCTGGACGGA TCGGCGAGCG  GGCCGGGTGA GCAACAGGCT CCGCCGAACC TGAGCTTGAG GGCCAAGGCT TTCGAGATCA TCAATGACCT GCGCAACCGT GTCGAGAAAG CATGTGGAAG AGTGGTCTCT TGTTCTGATA  TCGTCGCGCT TGCTGCTCGT GACTCCGTTT ACTTGTCAGG TGGACCAGAC TATGGCATAC CATTGGGAAG AAGAGATGGA CTGACTTTCG CCACCGTAAA CGCCACATTG CAGAACCTAC  CACCGCCCTT CGCCAACGCC ACCACCATCC TTTCCATGCT CGCCACCAAA AACTTCGACC CCACCGACGT TGTAGCTCTC TCCGGCGGGC ACACCGTCGG CATCAGCCAT TGCACATCTT  TCACCACCAG GCTCTACCCT ACCCAAGACC CTACCATGGA CAAAACCTTT GCCAACAATC TCAAGGTAAT ATGTCCCACG GTAAATTCAA CCAACACGAC GGTGATGGAC ATAAGGAGCC  CCAACAAATT CGATAATAAG TATTACGTGG ACCTGATGAA CCGTCAAGGG CTGTTTACCT CGGATCAAGA CTTGTACACT GATAGCAGGA CGAGGGGGAT TGTTACTAGC TTTGCCATTA  ATGAGACGCT CTTCTTCGAG AAGTTTGTGG TGTCGATGAT AAAGATGGGA CAGCTGAGTG TGTTGACTGG TAACAATGGC GAAATTCGTG CTAATTGCTC GGTGAGGAAT GCTGATAATA  AGTCGTACTT GGCGTCTGTG GTGGAAGAGC TACCGGTGGA GGAAGCTTGG TCTGACCTTT AAACACTTAA TAAGCTATTC AAGCATGTAA CATGTTAACT ATGTGACTGT TTAGCATTTA  ATGTATGACA GTGGGGCGAC TGAGGTTTGT ATTTTACTGT GTATGGGAGA TTATGTTCTA CAGTTTTTAC TCGTTTTCGT TTCGGGTTTT ATTGAAAAAA ATTGCAGACT TTTACTCCTT  TCTCTCTTTA TATATAAGGT AAAAATGGTG CCGTTGACAA AATAATAAGA TAGTGACGCA TGACGTATTA CATGTATTTC ATGTTCACGT ACATGATTAA TTTTTAACAA TAAAAATAAA 
TAAAATTTTT 

Retrieve as FASTA