Entry information : AeuRboh04_Ae201684 (Ae201684_12933.1)
Entry ID 12902
Creation 2014-04-02 (Catherine Mathe)
Last sequence changes 2014-04-02 (Catherine Mathe)
Sequence status complete
Reviewer Christophe Dunand
Last annotation changes 2015-10-15 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: AeuRboh04_Ae201684 (Ae201684_12933.1)
Name (synonym) AeuRboh04_Ae201684 (Ae201684_12933.1)
Class Respiratory burst oxidase homolog    [Orthogroup: N/D] N/D
Taxonomy Eukaryota Saprolegniaceae Aphanomyces
Organism Aphanomyces euteiches    [TaxId: 100861 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value AeuRboh04_Ae201684
start..stop
S start..stop
PiRboh02 204 1e-57 33..623 88..704
PraRboh02 202 8e-57 33..623 88..704
PiRboh01 192 2e-52 33..623 249..867
PraRboh01 188 5e-51 33..623 252..870
Gene structure Fichier Exons
ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize
N° 1 7179..9050 1872  
complement(join(7179..9050))


exon

Literature and cross-references AeuRboh04_Ae201684 (Ae201684_12933.1)
Protein sequence: AeuRboh04_Ae201684 (Ae201684_12933.1)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   624
PWM (Da):   %s   69809.95 Transmb domain:   %s   o128-145i217-239o272-294i301-323o333-355i
PI (pH):   %s   8.7
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
MSGKLHSAFV QEATPTVLEF HGDPPKSNQA AAVFAIIDKL HRGTLTHAQL VEAMRSTAAK CKLTLYGDVE GLLSTLLHGQ KSVSVDQFVE NVNAIANGEH IFRPTVMDPQ RPQMAQGWSR  YQPPSAPMVI WWLLYAALNA AVFTWKFNQY EQRRSAFNLS GYSICVARAA AQVNLLNGFF LLWPVLTRVH YVVSKVSPAL ASSLQLQHRT GFHIAYGVMF YISGWIHVLG QCLSIFYAIP  HASNATWAKS ALSHSIDFAG QPKPDPMDFV LSLPGWTGVI MTLCSFVATS LKIIYWKSHS VIWNKWAHGF DLVMFFLTFV HGIHHWLEPA QAITFLGVPT VLYIVVEVFP RYYCTVTQTL  TKYTKTAHAL TLYLPKTQRF DGCLPGTFLR LNVPALSRSE WHPFSITGQD EHYVIVHIQP CGDWTRQLYE VVHPNLYVRI DGPIPAPAVD VVEYPVVVLI GAGFGVTPYM SVLQHQMKIP  SGQIIYLHWM SNKQEMFRSY ANLLEGASSL PTVHIQTYLT GDYTKSRPDE TKLLKLVQVL AHVQQDVDLV TGLSLANPTK LGRPQWHSTL MSIMQKHPNT LIGIFFCGPP ALKTALAQTI 
RQVEMECNQE GNSVKTAFHP EVF* 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic (no intron). Scaffold35:7179..9050 (- strand)
DNA
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ACASSSnCST nSCADSTRAn DATGAGCGGC AAGTTGCACA GCGCATTCGT CCAAGAGGCG ACCCCAACTG TCTTGGAATT CCACGGCGAC CCTCCGAAAT CAAACCAGGC GGCGGCTGTC  TTTGCCATCA TCGACAAATT GCACCGTGGA ACGTTGACTC ATGCTCAGCT TGTGGAAGCG ATGCGATCGA CAGCTGCAAA GTGTAAACTG ACCCTGTATG GTGACGTGGA GGGCCTTCTT  TCAACACTCC TCCATGGTCA AAAAAGTGTG TCTGTCGATC AGTTCGTGGA AAATGTCAAT GCGATCGCGA ACGGAGAACA TATCTTTCGT CCGACTGTGA TGGATCCTCA ACGACCTCAA  ATGGCCCAAG GATGGAGCAG ATACCAACCA CCATCGGCGC CTATGGTGAT CTGGTGGCTT CTCTATGCAG CTCTCAATGC GGCCGTGTTC ACGTGGAAAT TCAATCAGTA CGAGCAACGC  CGATCTGCGT TCAATTTGTC GGGCTATTCC ATTTGCGTGG CACGAGCAGC AGCCCAAGTG AATCTCCTCA ACGGCTTTTT CCTTCTTTGG CCAGTCCTTA CTCGTGTCCA TTACGTTGTG  TCCAAGGTGA GCCCAGCTTT GGCATCCTCC CTTCAGCTCC AGCATCGCAC TGGGTTTCAC ATTGCTTACG GAGTCATGTT TTACATATCT GGCTGGATTC ATGTGCTTGG CCAATGCTTG  AGTATTTTCT ACGCCATTCC CCATGCTTCC AATGCAACTT GGGCCAAGTC TGCGCTCTCC CATTCCATCG ACTTTGCAGG ACAGCCCAAA CCCGATCCCA TGGACTTTGT GCTCTCCCTC  CCTGGCTGGA CTGGTGTGAT CATGACCTTG TGCAGTTTCG TCGCAACTAG CCTGAAGATC ATCTACTGGA AGTCGCACAG CGTAATTTGG AACAAATGGG CTCATGGCTT TGACTTGGTC  ATGTTTTTCT TGACATTTGT GCATGGCATC CACCACTGGC TCGAACCTGC TCAAGCAATT ACGTTTTTGG GCGTCCCAAC CGTGCTTTAC ATCGTTGTTG AAGTCTTTCC CCGCTATTAT  TGCACGGTCA CACAAACCTT GACCAAGTAT ACCAAAACTG CCCACGCACT CACGTTGTAT TTACCAAAGA CACAACGTTT TGATGGATGT CTACCTGGCA CATTCCTTCG TCTCAATGTC  CCTGCGCTTA GCCGGTCTGA GTGGCACCCC TTTAGCATCA CGGGGCAGGA TGAGCACTAT GTGATTGTGC ACATTCAGCC TTGCGGAGAC TGGACGAGAC AGCTCTACGA AGTTGTGCAT  CCAAATCTGT ACGTCCGGAT CGACGGACCA ATTCCAGCCC CAGCAGTCGA TGTTGTGGAG TATCCCGTGG TTGTCTTGAT CGGAGCTGGC TTTGGTGTGA CTCCATACAT GTCCGTGCTA  CAGCATCAAA TGAAAATCCC ATCAGGACAA ATAATTTATT TACACTGGAT GTCCAACAAG CAAGAAATGT TCCGTTCGTA TGCGAATCTC CTCGAAGGGG CGTCTAGCTT ACCCACAGTG  CATATTCAAA CCTACTTGAC GGGGGACTAT ACAAAATCCC GTCCTGACGA GACCAAGTTG CTCAAACTTG TCCAAGTGCT AGCTCATGTT CAACAAGATG TCGATTTGGT GACAGGTCTC  TCATTGGCAA ACCCAACCAA ATTGGGACGC CCTCAGTGGC ATTCTACCCT GATGAGCATC ATGCAGAAGC ATCCGAACAC CCTCATCGGA ATTTTTTTCT GTGGACCCCC TGCTCTTAAA 
ACCGCATTAG CACAAACAAT CCGCCAAGTC GAAATGGAAT GCAATCAAGA AGGAAATTCT GTTAAGACAG CTTTCCATCC TGAGGTGTTT TAA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGAGCGGCA AGTTGCACAG CGCATTCGTC CAAGAGGCGA CCCCAACTGT CTTGGAATTC CACGGCGACC CTCCGAAATC AAACCAGGCG GCGGCTGTCT TTGCCATCAT CGACAAATTG  CACCGTGGAA CGTTGACTCA TGCTCAGCTT GTGGAAGCGA TGCGATCGAC AGCTGCAAAG TGTAAACTGA CCCTGTATGG TGACGTGGAG GGCCTTCTTT CAACACTCCT CCATGGTCAA  AAAAGTGTGT CTGTCGATCA GTTCGTGGAA AATGTCAATG CGATCGCGAA CGGAGAACAT ATCTTTCGTC CGACTGTGAT GGATCCTCAA CGACCTCAAA TGGCCCAAGG ATGGAGCAGA  TACCAACCAC CATCGGCGCC TATGGTGATC TGGTGGCTTC TCTATGCAGC TCTCAATGCG GCCGTGTTCA CGTGGAAATT CAATCAGTAC GAGCAACGCC GATCTGCGTT CAATTTGTCG  GGCTATTCCA TTTGCGTGGC ACGAGCAGCA GCCCAAGTGA ATCTCCTCAA CGGCTTTTTC CTTCTTTGGC CAGTCCTTAC TCGTGTCCAT TACGTTGTGT CCAAGGTGAG CCCAGCTTTG  GCATCCTCCC TTCAGCTCCA GCATCGCACT GGGTTTCACA TTGCTTACGG AGTCATGTTT TACATATCTG GCTGGATTCA TGTGCTTGGC CAATGCTTGA GTATTTTCTA CGCCATTCCC  CATGCTTCCA ATGCAACTTG GGCCAAGTCT GCGCTCTCCC ATTCCATCGA CTTTGCAGGA CAGCCCAAAC CCGATCCCAT GGACTTTGTG CTCTCCCTCC CTGGCTGGAC TGGTGTGATC  ATGACCTTGT GCAGTTTCGT CGCAACTAGC CTGAAGATCA TCTACTGGAA GTCGCACAGC GTAATTTGGA ACAAATGGGC TCATGGCTTT GACTTGGTCA TGTTTTTCTT GACATTTGTG  CATGGCATCC ACCACTGGCT CGAACCTGCT CAAGCAATTA CGTTTTTGGG CGTCCCAACC GTGCTTTACA TCGTTGTTGA AGTCTTTCCC CGCTATTATT GCACGGTCAC ACAAACCTTG  ACCAAGTATA CCAAAACTGC CCACGCACTC ACGTTGTATT TACCAAAGAC ACAACGTTTT GATGGATGTC TACCTGGCAC ATTCCTTCGT CTCAATGTCC CTGCGCTTAG CCGGTCTGAG  TGGCACCCCT TTAGCATCAC GGGGCAGGAT GAGCACTATG TGATTGTGCA CATTCAGCCT TGCGGAGACT GGACGAGACA GCTCTACGAA GTTGTGCATC CAAATCTGTA CGTCCGGATC  GACGGACCAA TTCCAGCCCC AGCAGTCGAT GTTGTGGAGT ATCCCGTGGT TGTCTTGATC GGAGCTGGCT TTGGTGTGAC TCCATACATG TCCGTGCTAC AGCATCAAAT GAAAATCCCA  TCAGGACAAA TAATTTATTT ACACTGGATG TCCAACAAGC AAGAAATGTT CCGTTCGTAT GCGAATCTCC TCGAAGGGGC GTCTAGCTTA CCCACAGTGC ATATTCAAAC CTACTTGACG  GGGGACTATA CAAAATCCCG TCCTGACGAG ACCAAGTTGC TCAAACTTGT CCAAGTGCTA GCTCATGTTC AACAAGATGT CGATTTGGTG ACAGGTCTCT CATTGGCAAA CCCAACCAAA  TTGGGACGCC CTCAGTGGCA TTCTACCCTG ATGAGCATCA TGCAGAAGCA TCCGAACACC CTCATCGGAA TTTTTTTCTG TGGACCCCCT GCTCTTAAAA CCGCATTAGC ACAAACAATC 
CGCCAAGTCG AAATGGAATG CAATCAAGAA GGAAATTCTG TTAAGACAGC TTTCCATCCT GAGGTGTTTT AA 

Retrieve as FASTA