Entry information : AtrPrx17(AmTr_v1.0_scaffold00017.181)
Entry ID 12905
Creation 2014-04-18 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2014-04-18 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Christophe Dunand
Last annotation changes 2020-11-09 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: AtrPrx17(AmTr_v1.0_scaffold00017.181)
Name AtrPrx17(AmTr_v1.0_scaffold00017.181)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx004]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Amborellaceae Amborella
Organism Amborella trichopoda    [TaxId: 13333 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value AtrPrx17
start..stop
S start..stop
AtrPrx04 632 0 1..351 1..351
LjPrx02 491 5e-176 4..334 3..333
PpePrx02 488 1e-174 8..331 14..336
NtPrx15 484 3e-173 13..335 13..335
Literature and cross-references AtrPrx17(AmTr_v1.0_scaffold00017.181)
Protein ref. UniProtKB:   W1PL07
DNA ref. GenBank:   KI393256
mRNA ref. GenBank:   XM_006847059.2
Protein sequence: AtrPrx17(AmTr_v1.0_scaffold00017.181)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   351 (333)
PWM (Da):   %s   37926.35 (36028.2) Transmb domain:   %s   i7-26o
PI (pH):   %s   7.74 (7.41) Peptide Signal:   %s   cut: 19 range:19-351
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MAVSKVFLVL LPLAFVVAIS TIARAQTSEP PIVKGLSWSF YESSCPDLEE IVRNRLKQVF KKDITQAAGL LRVHFHDCFV QGCDGSVLLE GSASGPDEKD APPNLTLRPE AFEIIEDLRK  RVHKKCGHTV SCSDITALAA RDSVFLAGGP LYPIPLGRRD SLNFATRDAT LANLPGPTSN TSDLMKAFTN KNLDATDLVA LSGSHTIGIS HCSSFSNRLF PSQDPTLDKT FAKNLYKTCP 
TSNANATTVL DILTPNAFDN KYYVDLINRQ GLFTSDQDLF TDKQTRSIVT SFAANQSLFF EKFVLAMIKM GQMSVLTGVQ GDIRANCSAR NPSRFVVPFG GGGQEGVAAS F 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequece from genomic (introns 1 and 2). No EST.
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCGGTTT CTAAAGTGTT TTTGGTGTTA TTGCCCCTGG CTTTTGTGGT GGCTATTTCC ACCATTGCAA GAGCTCAGAC ATCTGAGCCT CCTATTGTGA AGGGGCTCTC ATGGAGCTTC  TATGAGTCCT CATGCCCTGA CCTTGAAGAA ATTGTTAGAA ACAGACTCAA ACAGGTCTTC AAAAAGGATA TCACACAAGC TGCTGGCTTG CTCCGTGTCC ATTTCCACGA CTGCTTTGTT  CAGGTGACTC TTTTTAACTT TTACCTTTGT TTTTTTCTTT TTTTGGTAAT TCACTATGGA AGCCGTACCT ATTTTTTCAA AGGGTGCCGT TTGTATAGAG CCAGGCTTTA AACAATCAAA  ATTCGAACCT ACTTTCAAAT AGTATCGAGA AATGTGGTTT CCATGCTGAA AATATTTGTG ATAGTTTTAA AATATATTTT TATTTTTAAT TATAAAATTT AAAGCTTAAA AAATAGTGTA  GGTCGAGCAT ATCTAAGAAA ACTTGAAATC TATTTTTTTT CATATGTCCA TGCTTCTTGA TGTTGAGGTG ATCAATTTGA ACATATTTGA GCATCAAAGC AACCTATTCT AATGAAATTT  TTGAGGTGGG ATCCAATTTA ATTGTTTAGA GGCTCGCTCC ATATAAACTT CTCTCTCTAT GTGATTGTTA TCTGGTTGGT CTTGTAATTA TGTGGATTGT TTGTCTCAAT GCTTCCTTCG  CTTTCTGGTT AGTACATTGT TGGTTTGTAT CTACGTGAGT TCTCTCTCTC TCCATGTCTA ACCCTGGCCC GAGGGTAGGG TAGGTCCAAG CCACGTTATG ACCAACCCTT AGGGTTAGGG  CTGGACTTGG GCCGGCCCGA GGAGGACCAG GGCTGGTTTT GGTAGGGCTT GACGTCAATA GAGCTAGCCC AGAACAAACA TGCCCGCTGC CAGCCCTATT ATTCGATTAT TGGTTAGGGT  CCCGGCCCTC TCCATCTCCA TTGCCTCGTT TTGTATGGTT CTGAATACTC TCTCACATTA TTCAAAACCC AAAAAAAAAA ATCTCACTTA TTTCTTCGAA AATGGGTTAC TTATGAGCAT  GATAAATCAT CTCTATTGTC CATTTTGATT TGATTATTTA TGAGTGAAAA ATGTGTGTTT AGGGTTGCGA TGGGTCGGTA TTGTTGGAAG GTTCAGCAAG CGGACCCGAT GAGAAGGATG  CACCCCCCAA TCTCACTCTT CGTCCCGAAG CATTCGAAAT CATTGAGGAT TTGAGAAAAA GGGTTCACAA GAAGTGCGGC CACACCGTCT CTTGCTCAGA TATCACTGCC CTCGCTGCTC  GTGACTCTGT TTTCCTCGTA TGACACCCTC TCCCTCTCTC TCATCTATGC TCATGTATCA TGTACAATGT TCACAAACTC AGCTAGTCCT GCTTCGAACT AGGCGTTGCG GATCTGGTTT  TCGCCGGTTT TGGTGATTTG GGTATTCTAA AAAAATAAAA TAAAAGAATA TATATATATA TATAATCCTA AAAAATAAGG GATTTTTTTC TTATGTGTTT TTTAATGTTT TTAATCATTT  TGACAAATAT TGGAAATTGT TCTCGCCTTG AATATTTATT TTCACATTTT TTTATTCTTT TTGAAAAATT TTAAAAATAC CTCTAGATAC GAATCAATTT TTTAAAATCC ATTTTTTAAA  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ACCCAATCAT GGAGTAATTG TATGATCCCT AATTTTATGG ATGCAACGGT TAATGTCAAT TAAAAAAATT CTAAATATAT GAGTGGCAAG ACAAAAAGAG ATATGATTCC AAATGAATAC  ATTTGGGATA ACTTAGGTGT GGCTCCAATA AGCATTAACA TGAGATAAAT TAGATTTAGG CAAGCTGGCC ATATGCAATG CATACCCAAT GCAACACCTA TTGTTAGGAG GTGCGACCTA  TTGTTAGGAG GTGCGAGTTA GTTCAAGTGG AATGCTAAAA AAGAGCAATA GGTAGGCCTT GAGAACATAG TTAAATTTAG TGAGAAAATA TATAAGGATT TATGGCTTCA TTAAGGACAT  AGCCCTTGAT AACCACGATT CGTCTAGCTA ACTGCAAATA GTTGAAAAAG GCTGTGATGA TGATGATGAA ATGGTACTCT TTATATATTT GAAAAAAAAA AATGTCTCTA GATTAAACAG  AGACCATTCA ATTTTGTAAA GGTGAGATCT AGGTGTTAGA GAGCTTAAAA TTCAAAAATT TTACTTTAAA AATAATCATC TAGTAATTCT TAGGTGGATT CCAAAATTTT GGATTGAAAA  AATCCTCGTA AATAGATTAT CTAGCCCAAA AAGAGTAGGT GTATGTTATA CTCCCTCAGA CGAGAATGAT ACATGGTCTC TTTTCTTATT TGATGTTTTT AGGGGTGCTA CCACTGGGCT  AGATTATATA ATCTCTTTTT TTGGGTTAAC ATCACTTAAA CCTCTTCACT ATATTATGCT ATTTATCACT AGGGAAAGTA TAAAGAGACC ACTTACCTAC CTTTGGTACA AGTTGGTCTC  AATTAATCTT GATCATTGGA TGTGAAATTG GTGGTTGCGT TTATTTCATT GACCAGCTCA AAGTTCAAAA GAAATTTTTT TGAACTTTGT AACACATCCA AGCTATCATA TTTCATATAA  GTAAGTGTGA CCTCCCTATA CCAATGATAA ATGGTTTCAT TGTATACTAT CCCTTATCGC TATAATAATT ACATCTTTAG TATTTTTAAA AAAATTCTAA AATTTCTTCT AGTTCTCAAA  CCTACACACA CCAATGCATT TTGGTAATTT GGCACCAGTT AACTTGCCCA AGTCAAATAA CAATAATACC AATGATTTAT GAGGGTTAGT AGCACAAAAA TTTTGAAATA ACGATTAGAT  CCCAATTCTC AAAGCTGAAC TCACTTTTGT TTTATTTGTA AGCCCTTGTT TTGTTTCGAT TGTAAGCCCT TGTTTTGTTT CCCAACTCTA AATGATAATT TAACTCGGAC CACTATATGA  AACAACTATG AAGATGCCCC TAATCGTTCA CAGTTACTTT AATGGGGGGG GTTAATTTTG GGTAGGTACG TTAATAGGCT GTGTATAGGC CAGCAAGCTC ACGCCGAACC CGGCTCAAAA  CCATGTAAGG GTCCCAGCCT GTAGTCCGCC TACGTTTGTC ATGGGGCCGG TCAGATCTGG CCTTATAATA GCATAGGGAA ACTTCTTTTC ACAAAGTGTA TTAAAAATAT TTGGGCTGGG  AAAGCCTACG CCTGGCCTGA AAAAACTTCG GGCCCCAAGC CCTGCCCGTC CCCCTTGCTG GCATTAAAAT ATGGCCCGAA CCCAGCCCCA AACTTTGCCT GTCTTGAAAG CCCATCGGCC  GGCCTCACCT TGTTAGCAGC CCTAATTGTA AAGGTATTAT GTGACTTGAA AAGTAAACAT TCTTGTGGTG GTTGTGATCA TTTTTTACGA CCTTAGTGAT GGTGCAAAGG AGCTTGAGGA  TTTCAACTAT ATTTGTTTGT TTTTTGTTTT TTTGTGGCTT TGTTGATTTT GTCCCATAAA AATATGAGAA AAGTTTCTAT ACTTCCCCTA CAACATAAAA GATATATGCT TCCCCTCCCA  TCCAACCATT TAATTTATAT AAAGTGAGTC ACTCACTGTT TGATCTAAAT CTTAGTCTTA GAGTATTTTA TTTTTATTTT TTTCTACAAA TTGTATGATC ATGAAATTTG ATACGTATCA  TCTTCTCAAT GGGGTGCGCC TACGAAAAAT ATTAATTTTT TATAAAATAT AATAATCAAA ATACCCCTTG ACATTTTCAA GGGTATTTTA GTCATTTTAT TTTATTGGAT ATATTTGTTT  TATATTTTTT ACAAGTGCGG GTTTAAGAGA GGAGTGGACT TCCAAAATTT GGTGTTAAAA TAATTTTAAA AAAAAATTAA AAATTAAATG GTGTAGAAAC GTGACATTGT GATTGAGGCT  ATCTCAGTCG TTTATTCAGA ATAAATGGTT GGATAAGGAG TAGTATATAA GCCTTGTGAT GTAGGGAAAG CACAAAAAGC TTGCCCTTAA AATATATTAG GGGGATCAAC AATTGATCTG  TAAGGGTATT AGAGATAAAA TGTTTATTGA TGTGCCCATA CATTTACCAT GTATACTATT GTGTATGGAA GAATGTAGTC TTTAGGATCA TCAGAGTCCA TTGTAATGAT GGATGGGGAT  GGAGAAAAGT GGCAGTCACT GCAACAAGGC ATGATCTTTC TCTATTCAAG GAAGAACAAG TAAATAAGCC ATTATCTCTG TCTATAATAT AAGGGAAGAG CAGAAGCAAA ATAAAGCTAA  ACAAGAAGGG TGCGGTTTGT ATGGAGCCGA GGCTCTAAAC AATCAAATTG AAGCCTATCT TCAAATAGTA TCAAGAAAAG TTATTTTAAT ATTAGAAATC TTTGTGATAG CCTTCAAATA  TATTTTTATA TTTAATTATA AATTTTAAAG CTTAAAAAAT AGTGTAGATG ACAACTTGAA AATCTTGAAA ACTGACCGTC CAAAAACCCG TTACAAGATG CACTATTTCC AAAACTTGAA  ATCTATTCTT TTTTTCGTAT ATTCATCTTG ATGTTGATAT GATCAATTTA AGGATATTTG GACATCAAAA CAACCTCTTC TAGTAAAATT TTTGAGGTAG GCTCTAATTT GATGGGTTTG  AGCCTCAGCT CTATATAAAC TTTTCCCAAA AAACAAATAG TGGCAAAATA AATAAATCTC TCTTATAAGG AAGACTAAAA ATTTACCTGT TAAATTTAAA CAATCATCTG TGTATGATTG  AGGACTGGTA ATGTATCTCT TTAAAATGAT GCACACAACA CGACAGATGA GGATGATAAT ATATCTCTTT AAAATGCACA ACACATTCCC ACTGTCGATG CGTTGCACTC ACTTGAAACT  CTTCTGTATC GTTCCAATTT TATCGTATGT CTTGGAGACT TGAAATTTTC ATCCATATGT GCAGGCAGGA GGCCCCTTGT ACCCCATTCC CCTAGGCCGA CGCGACAGCC TCAACTTTGC  CACCCGGGAT GCAACTTTGG CGAACCTCCC AGGCCCGACC TCCAACACCT CCGACCTCAT GAAAGCCTTC ACCAATAAAA ACCTGGACGC CACCGACCTC GTCGCCCTAT CAGGCAGCCA  CACAATCGGC ATCTCCCACT GCTCCTCGTT CTCCAACCGC CTCTTCCCCT CCCAAGACCC CACCCTCGAC AAAACCTTCG CAAAAAACCT CTACAAAACT TGCCCCACTT CCAATGCCAA  TGCTACCACT GTGCTTGACA TTCTAACCCC AAATGCATTT GATAACAAAT ACTATGTTGA CCTCATTAAT CGACAAGGTC TGTTCACTTC CGATCAAGAT TTGTTTACTG ACAAGCAGAC  GAGATCAATC GTCACCAGCT TTGCCGCGAA CCAGTCATTG TTTTTTGAGA AGTTTGTGTT GGCGATGATC AAGATGGGGC AGATGAGTGT GCTTACTGGG GTACAGGGAG ATATTAGGGC 
TAATTGCTCT GCAAGGAACC CTTCAAGGTT TGTGGTACCC TTTGGTGGAG GGGGACAAGA GGGAGTTGCT GCCTCCTTTT AG 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCGGTTT CTAAAGTGTT TTTGGTGTTA TTGCCCCTGG CTTTTGTGGT GGCTATTTCC ACCATTGCAA GAGCTCAGAC ATCTGAGCCT CCTATTGTGA AGGGGCTCTC ATGGAGCTTC  TATGAGTCCT CATGCCCTGA CCTTGAAGAA ATTGTTAGAA ACAGACTCAA ACAGGTCTTC AAAAAGGATA TCACACAAGC TGCTGGCTTG CTCCGTGTCC ATTTCCACGA CTGCTTTGTT  CAGGGTTGCG ATGGGTCGGT ATTGTTGGAA GGTTCAGCAA GCGGACCCGA TGAGAAGGAT GCACCCCCCA ATCTCACTCT TCGTCCCGAA GCATTCGAAA TCATTGAGGA TTTGAGAAAA  AGGGTTCACA AGAAGTGCGG CCACACCGTC TCTTGCTCAG ATATCACTGC CCTCGCTGCT CGTGACTCTG TTTTCCTCGC AGGAGGCCCC TTGTACCCCA TTCCCCTAGG CCGACGCGAC  AGCCTCAACT TTGCCACCCG GGATGCAACT TTGGCGAACC TCCCAGGCCC GACCTCCAAC ACCTCCGACC TCATGAAAGC CTTCACCAAT AAAAACCTGG ACGCCACCGA CCTCGTCGCC  CTATCAGGCA GCCACACAAT CGGCATCTCC CACTGCTCCT CGTTCTCCAA CCGCCTCTTC CCCTCCCAAG ACCCCACCCT CGACAAAACC TTCGCAAAAA ACCTCTACAA AACTTGCCCC  ACTTCCAATG CCAATGCTAC CACTGTGCTT GACATTCTAA CCCCAAATGC ATTTGATAAC AAATACTATG TTGACCTCAT TAATCGACAA GGTCTGTTCA CTTCCGATCA AGATTTGTTT  ACTGACAAGC AGACGAGATC AATCGTCACC AGCTTTGCCG CGAACCAGTC ATTGTTTTTT GAGAAGTTTG TGTTGGCGAT GATCAAGATG GGGCAGATGA GTGTGCTTAC TGGGGTACAG 
GGAGATATTA GGGCTAATTG CTCTGCAAGG AACCCTTCAA GGTTTGTGGT ACCCTTTGGT GGAGGGGGAC AAGAGGGAGT TGCTGCCTCC TTTTAG 

Retrieve as FASTA