Entry information : AtrPrx18(AmTr_v1.0_scaffold00157.39)
Entry ID 12906
Creation 2014-04-18 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2014-04-18 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2020-11-10 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: AtrPrx18(AmTr_v1.0_scaffold00157.39)
Name AtrPrx18(AmTr_v1.0_scaffold00157.39)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx019]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Amborellaceae Amborella
Organism Amborella trichopoda    [TaxId: 13333 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value AtrPrx18
start..stop
S start..stop
GrPrx17 459 6e-164 24..336 13..322
BstrPrx57 452 3e-161 29..342 19..328
InPrx03 452 5e-161 5..340 3..327
VvPrx06 452 6e-161 24..342 12..326
Literature and cross-references AtrPrx18(AmTr_v1.0_scaffold00157.39)
Protein sequence: AtrPrx18(AmTr_v1.0_scaffold00157.39)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   348 (330)
PWM (Da):   %s   38448.18 (36402.1)  
PI (pH):   %s   5.25 (5.24) Peptide Signal:   %s   cut: 18 range:18-347
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MLREVSMIIF FVGLAMALNS MRGVSLGLGS SLRPGFYIET CPGAEAIVRE VIRQAMIREP RNAASVMRLQ FHDCLVNGCD ASLLLDDTPS MLGEKLALSN INSLRSYEVV DEAKQALEKL  CPGVVSCADV LIMAARDAVV LSGGPSWEVE LGRKDSLTAN QEDSNRIMPS PRANATFLVQ LFESFNLSVE SLVALSGSHS IGKARCFSIV HRLYNQSDTG KPDPYMDPVY RDRLDNLCPL 
NGDQNVTGDL DSTPQLFDNQ YFKDLVRMRG FLNSDQVLFS GGRRDTREHV LRFSRDQTAF FEAFKAGMVE LGRLPPQAAM GSEVRQNCRH VNQWLDAMLL ESMAPTH* 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic (introns 1 and 2). No EST.
Promoter
Send to BLAST
Send to cis Analysis
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
TGGTTCTCTA AAGAGTCCAT AAAATTGTAC AATCTTTCCA TGTAAAAAGT GTGCAGCATT CCTAAAACCA ATGTATTTTC CTTTATGGTG TGAATGCATT TATCGATATT TATTGTGCTC  GAGAAAAAGA GGAAGTGACT TGCCTCTCTC TTAAAAGGGT TGTATGAATG TGGTCATTCC AGCAAGGAAT ATGATATAAA GTTAGAAGGA AGTTGCAACT CCCTTGCTAA AACCATCCAA  TTCTGTCTCT AAAGATGTTA GAGGGACAGA GAACACAAAT AAACCCTCTT CCTAACTCAA ACAACTTTCT CTGTCTCTGC CCCTTCAAAC TGTCCACTGC CTTTGCAGTA CCAACAAAGA  AATTATGAAG AACACATACA CTGTGCTCCC TCAGGAGCAT ATTTTACTTC TACCCCCTCG GTGAGGTTAA TCTATGTGTT AATTTTTACC CGAGAGAGCG AACGCACATT ATACTCCCGA  AGGAGTAGAC CATCTTTTGG CAACTATGAA ATACGGAGAG GTTTCCATCG TTTTCGTTTT CGTGACACAT TGCACTAGAC AAAAATCAAT TCGCTTTCTT TAGGGAAAGG TTTCTATGTT  TTTCCTAAAA TATAAAAGTT CTATCATCTT TTTTTTAATC ATAGAAGTTT TATCTTCTTT TAAACCCGCT ATTTTTTATC AAGAGAGCCA CGCATCATTT AATCTTAGAT CTGACGTTTC  AAAATATTTT ACTTTTAGTT TTTTTATACA AATTAATATA AAATTTGGTA CGTGTCATCT TTTCATTAGA ATGCATCTAT AAAAAATATG AAAAATAATT TTTCGATAAA ATATAATGAC  CAAAATACAT CTTGAAACTC TCAAAGGTAT TTTGATAATT TTATTTTATT GAAAATATTT TAATTTTTAT TTTTCACTAG TACGAATTTA ATAGAGGAAT GGACATCCAA AATTTGGTGT  CAAAATAGTT TATAGAAAAA AAATTAAAAA TAAAATAGTG TAGAGATGTG ATATTGTGAT TGGAACAATC TTAACCCTCC ATTCAGAATG GACAGTTGGA TAAAAGGGAA GATAAAACTT  CTATGATACA GAGAAAGCAT AAAAAGCTTG CCCATTTCTT ATGGGAACTT AGAGTGTAGT ACCCGTTTAT ATCTTGTCTG GATGGATATA AATAAACAGG TCCCTCAACC TTAAATCTCA  ATAATGGACG GGTGGAGGAT TCATGAGATT AGAGACAGAG AAGAAGTATT ATAGAAAAAT ATCAGCGGTA GCGTTGGACT AACTTTTTCA TTTAGTCCTA CTTGTCAAAT GACTTACTTC  AATAATTTCA TGGAGCCCCA AGACTCTAGT AATCTTTACC ATCATTTTTC ATAATTTGAA GCTCAAATTT CTTCCATAGT TAAAATTTGA CAATCTAAGG TCATAAGTAA CATTTTTTTT  TATTTTTGCA TAGGGTAAAG AGTAGATTTG GTGCAGCGGA CCACTGTAGT GCGCGTTTCT CTGTGACATG GACCTTTGAG CATTCATTAT ACCTCCTCTT ATTCCGTGAG TTCTTTGTCC  TGACACAATG GCGGTTCGCA GGTTCATAGA GAAATGAAGA GGGGAAAAAT AAGGAGATGA GGAGAGGGAG AATTATTGAG CTTGACGCAA TCCAACGTCT CAAAATCACG GAAAATGCCA  CGCGCCACCA CTACAACGCG TGCGTGTTAA AGAATAGAAA GATAGGGAAT TAAGTAAAAA GTTAGAGAAA AGAAAAGAAA AGAAAGGCGT GATAAATCAT AAATGTCGTA GGACGGCACT  AACAGAATCG CGTCGCATTT CGGAAATCCC TTCCATTTTA AGGAATAGGA AGAGGCCATA AAAGCTGTCT CCCCTAACCC GAATCTGATG CCATCCCCTC TTTCTCTCTC CTAAATACCC 
ACATATCTCT CTCTAACCCA ATACCTGCCT TTCTCTCTCT AACCCGAGCC CTTCACCTTT TGTGTCCCTC TACTCCCACC 

Retrieve as FASTA  
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGCTCAGAG AGGTCTCCAT GATTATCTTC TTTGTGGGTT TGGCCATGGC GTTGAACTCG ATGCGCGGGG TGAGTTTGGG CTTGGGATCG AGCTTGAGGC CCGGGTTTTA CATAGAGACA  TGCCCAGGGG CTGAGGCCAT AGTGAGGGAG GTGATCCGGC AAGCCATGAT TAGAGAGCCC AGGAACGCAG CCTCTGTTAT GCGCCTGCAA TTTCATGACT GCCTTGTTAA TGTTTGTCTC  TCTCTATCTT CATTTGTTTT CTTTTTTGTT CAGTAGTTAA CTCTCTCTCT CTTGAAGACA TGGATTTTCA GACTGTGATC CACTAAGATC AGCTTAAATA GCATCTCTAG TCCTGGTTTT  TTTAGCCTAA TTATGTTTCA AAATTCAGGG ATATATTCAT GTGTATATTA GGTGCTCTCT TGAGAGCATG GAGGTTTGTC CGAGGGAGGG GAGAGATGAC AAGTGCCGTC GTCCAATCGT  CACCGTACAT CTGCAATGGA CAGTAGATAC GAGTAGGGAA AATGGGCATG CATATTATGT TTTTCCCTTT GGAGGCATAA ACAATTAAGA CATAAGAATA AATAAATAAA AGTGCTTTCC  TTGAGGTCAA ACTTCATCAT AAATGGGATA TGTGCTAGGG GTATTTTAGA AATAATTTTA AAAATAAGGA AAAAATTGTA AAAAATAAGT ATTTATGTCC AAAATACTTC CCAACCTTTT  TTTTTCAGAA CAACAGATTT TTTTTAAAAC AAAATTATAA TATTTTTTTT TTAAGTTAGA GTGGCCTAGC TAGTTGACTA CCCTAACCGG CCACGGCCAA TCGCGAGTTC TGGATATAAC  CCTCTTATTT TCGAGTCAAC CTCGATGATT TTGCGAACAC GGGTGTTGCA TCATATTTAA ATATATATAT ATATACATAT ATAAAAAAAG TTGAAGCCCT AAACAAATAA ACTAAAGTGC  ATTGGGTGTG ACATGCGGTT TGGATTAAGG TCAAAGATTT ATTTGTTCAT CACACAAGAT GCAAACAAAA TCACTTGCCC CACCCACCAC TAAAAAAATA AAACAACCAC ACTTTCAAGC  ACTAATAATT TTATAAGATA AAACAAAAAG ATGAAAAGAA TGATGCTAAA GGTGCTTCTT TTTGTAGGGT TGTGACGCTT CACTGTTGCT AGATGACACG CCCAGCATGC TCGGTGAGAA  GTTGGCCCTC TCCAACATAA ACTCACTGAG GTCTTATGAG GTTGTAGATG AAGCCAAACA GGCTTTGGAA AAACTTTGCC CAGGCGTTGT CTCTTGTGCA GATGTACTTA TCATGGCAGC  AAGAGACGCT GTAGTCTTGG TACTCTCTCA ACACCCCCTA TCCTTTTCCG TTAAAACGCA CTTTCAAATA GTGTCGGGAA ATGTGGTTTC GATACTGGAA ATGTTTGTGA TAGCTTTAAA  ATATATTTTT ATTTTTAATT ATAAAATTTT AAAGCTTCAA AAATAATGTA GATCGAGCAT ATATATGAGA ATTTGAGAAT CTTGAAAGTT GACGGTCCAA AAATGCATTG TAAGATGTAA  AATTTGAAAT CCATTTTTTT CTCATGTCCA TGCATATTGA TGTCGAGATG ATCTATTTGA GGATATTTGG GCATCAAAAC ATCTCTTCTA GTGAAATTTT TGAGTAGGCT CTAATTTGAT  TGTTTAGATC CTCGGTTCCA TATAAACTTT TTCCTTTTTT TTAACACAAG CACAATTCTT TCATTAATCT AATTACCAAT GCTCTCACTT TAATCCATTT ATCGATGAAA TAGTTTCTTT  TGTGCACTGA GATGGGCCCT TGGTAAGCTA TAGTGCTCCC TTTTGTGTAG GTTTCTTAGT TTAGTGGCAT GGACCTCTTA CTCTCAATAA TGGGCTCTCA AAGCCCACTG TGTGCTGGTA  CTCGCCTCGA CTAGGGGACA TATCCCTTGG CGAGGTGAGT TACTCCAGAG TGCCGAGTCC AGCACAGGGC CAAAAGACCC AAAAAACAAC TGAAAAAAAT AAAAACATTG ATCAAAAGTA  AATTAAAAAT AGAGAAAACA TGGATTAAAA AAAAACAACT TACAGTTCGG ATTAATTTAA AAATCCAAAA AAAAAAGTAT AAAAATATGA TTATGGGAAA AAGCCTCACC AATCTTTACC  AAATATATCT AAAACAATTG TATAACACAA CTTTATTTTT TATAATATTT TCATTTTTTG AATCTTTTTT AAGTACACGA GTTGTCACAT AATAAGGGTA GTCATCAGAT TCGGCCGAGA  CCTAGTATAC TGGTCCCGGT ACACTGGCCC ACTCTCCTAT AGAGCTCTCT CTAGTAGGGT GAATTTTGAA AAATCGCAAA CTATTTTCGT AACTAGCAAG ATATGAAACC GCATTCCTAA  AAATGCCTGA ATGTATAGCC TGGTTGAGTT TGAGGGCCTG CTTTCCCATG AAACAAACAT AGGAAAGTGG GGCAGTCAAT GGAAATCTCT GTCTGGGAGG AGAGATATTT CCGTTTGAAC  AAACGTACTC TCAATGAAGG ATCCCTCTAC TTTCTTCAAA GGTGTGCTAG AAGGACCTCC ACTGTGTTTG ACAATTGGTG CCGGTTTGTT GCATTAGGTA ATTACGATAC ACAAGGCTTG  TTAGGTTTTG TTGGTTTCTA GGTTTTTACT CGCTAGTACT ATTTAGATTT TAGAGTACCG ATTGCTATGG TGGTCCATGT CATGTTACGG TGTGTGGGCC CAAATTCAAG GAGTTTGGTA  GGGTTCTCAC TCATTGATCT GGACAAGTCG TAGGAATGAA CTATAGTCCA AATGAGCCAT CTGCATTAAA CTTTTTTAAG TACCATGCAC TTCAGCTAAG GGAATATATT CCCGGTTGTA  GGGTGGGAAA TTTCCGGGCT TGGGCTGGGC CCGTCCCGGA CCTAGCCCAG CCTTGATTCC CATAGCCCCA GCCTCAACCC TAGCCCAGCC TTGATATGGG CAAAGAAGCC CTACCCTATG  GGGGACTAGG CAGGTCCAAA TGAAAAAAAG TCCAAAAGCA GAAAAAGAAT ATAGAACAAA AGGTTTGGGC TGGGCTGAAC CTAGTTGGCC CTATCTCGGC CCAAGCCTAA CCCAGCCTTT  GGGCTGTAGT GGCCTGACTC TCAAGCCACA TTGTTTGGCC CAAACTGATC CATTACCACC TCTACCTGGT TGTATTAGCA ATACTATGAT CCACTTCACT ACATCAAATG TTTAATCTAC  ACTATAATAA GGGCAATCTT TCTATATTTT TCCTAATATA TAGAAGCTAT ATACTTCCCT ATGTCCAACT GCTCGATTTG AATGAAAGAT GTAGTTGGAC CTAATCACAA TGTCCCCTTT  CTACACAGCT TGATTTTTAA CTTTTTTGCA CAAAATATTT TGTCACCAAA GTTTGGACGT CCACTCCTCT CTTAAAATAG AACCTACAAA AAATATTTAA AATTTTATTT CTAATATAAA  ATGACCAAAA TATCTTTGAA ATTTTTAGGG GTATATTGGA CATTTTATTT TATTAAAAAT ATTTTTAGAA TAATTTTTGA GGTACTGCCG ATTGAGATGA TGACACATAC CAAATTTCAT  ATTCATACAA TTTTTTTAAA AAATTAAAAA TAAAATACTC AAAAACGTCG GATTGAGATC AAATGGTCAG TAGCTCACTT GATCAAATTG GACAGCTTGA TGAGAGGAAA GTATATAAGT  TCTATACAGT AAAACATATA TAGAAAGCTT TCCCTTAGAA TAACAGGTTG GTTACATTAG CAATAATGGT TGCATTAGCA ATACTATGAT CCACATGAAC ATATGGAATG CACAATTATA  TATTTTTTTT AATTAATTGG ACTCGGCTAC ATGAATCTTA AATAATCATA ACCTATCATT TTTTAATAAT GGGTTGAGTG ATGTGAGAGA GAATTGTACC TGCCAAACAT AATATTAATT  CATTGCTATT TCCCATTCTC TCTCCAACAC CGTCCAACCA ACCTACTGAT TGGATGCGGT AACCCTTATG ACAACTTTCA TGTGGTCATG TAGATCATAA TATATTTTCA TTCGCCCAAA  CTTAAGAACC CGTGTTTATA TGTGGACGGT TAGATAATAT TTTCTCGAAA TGTTGAAACT TTGGACGTTT AAGTTCTAGA TTTCGAGCTT GATTGTTTAG TTGTTGAGGA TTGTAACACT  CCATCCCAAG CTCGAATAGT GAACTACCTA TTTTTAATAA GAAAAATGTT TTCATATATT TTATTTTGGT GCACTATTTC TCAACAAATC TAAAATTTTA AAAAGTCACG AGATTTCACA  AGACATATTT TCTAACCCCG TGATCCAATT TGCCTGTTTT GAACAGGTTT TTTTCCTAAA CAAATATTTG TATCTCTAGA GGGTAAAATT GTCCTAAAAG TAAAATTGAA CTGTTTTAAA  GTGGTTATTA GCAGTAGGAA GTTATTTTAG GCACTCACGG AGACTGTCGA ACACCTACAA GTCCTGCGTA AATTTCCAGC CACCAATTGG TCGTTTTGGC TTGTGCTTTT CGTAGTTGAA  GGGAATAAAA ATCAAAATTC TTGTATCTTA AAGACTCAAA TCGAATAAAT TCAAAATTCT TGTACCTTAA ACACTCTTAT GGAATGCGAA TTTCAGAGTG GAGGGCCGAG CTGGGAGGTG  GAGCTAGGCC GAAAAGACAG CCTAACCGCT AACCAAGAAG ACTCAAACCG AATCATGCCA AGTCCTCGAG CCAACGCCAC CTTCCTCGTC CAACTCTTCG AGTCATTTAA CCTCTCAGTC  GAGAGCCTTG TGGCCCTTTC AGGCTCACAT AGCATCGGCA AAGCCCGCTG TTTCTCGATT GTGCATCGCC TCTACAACCA GTCAGACACC GGCAAGCCCG ACCCGTACAT GGACCCTGTC  TACAGAGACA GACTCGACAA TCTCTGTCCC CTTAATGGTG ACCAGAACGT GACAGGCGAT CTTGACTCCA CACCTCAACT CTTCGACAAC CAATATTTCA AAGACTTAGT GAGAATGCGA  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GAGCTTGGGC GGCTGCCACC CCAGGCAGCC ATGGGTAGCG AGGTGCGGCA GAACTGTCGG CACGTAAATC AATGGTTGGA TGCTATGCTC TTGGAATCGA TGGCTCCTAC GCATTAG 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGCTCAGAG AGGTCTCCAT GATTATCTTC TTTGTGGGTT TGGCCATGGC GTTGAACTCG ATGCGCGGGG TGAGTTTGGG CTTGGGATCG AGCTTGAGGC CCGGGTTTTA CATAGAGACA  TGCCCAGGGG CTGAGGCCAT AGTGAGGGAG GTGATCCGGC AAGCCATGAT TAGAGAGCCC AGGAACGCAG CCTCTGTTAT GCGCCTGCAA TTTCATGACT GCCTTGTTAA TGGTTGTGAC  GCTTCACTGT TGCTAGATGA CACGCCCAGC ATGCTCGGTG AGAAGTTGGC CCTCTCCAAC ATAAACTCAC TGAGGTCTTA TGAGGTTGTA GATGAAGCCA AACAGGCTTT GGAAAAACTT  TGCCCAGGCG TTGTCTCTTG TGCAGATGTA CTTATCATGG CAGCAAGAGA CGCTGTAGTC TTGAGTGGAG GGCCGAGCTG GGAGGTGGAG CTAGGCCGAA AAGACAGCCT AACCGCTAAC  CAAGAAGACT CAAACCGAAT CATGCCAAGT CCTCGAGCCA ACGCCACCTT CCTCGTCCAA CTCTTCGAGT CATTTAACCT CTCAGTCGAG AGCCTTGTGG CCCTTTCAGG CTCACATAGC  ATCGGCAAAG CCCGCTGTTT CTCGATTGTG CATCGCCTCT ACAACCAGTC AGACACCGGC AAGCCCGACC CGTACATGGA CCCTGTCTAC AGAGACAGAC TCGACAATCT CTGTCCCCTT  AATGGTGACC AGAACGTGAC AGGCGATCTT GACTCCACAC CTCAACTCTT CGACAACCAA TATTTCAAAG ACTTAGTGAG AATGCGAGGG TTCTTGAACT CGGACCAAGT GCTCTTTTCT  GGTGGGAGAA GGGACACAAG AGAACATGTT TTGAGGTTTA GTCGTGACCA GACAGCGTTC TTTGAGGCAT TTAAGGCCGG CATGGTGGAG CTTGGGCGGC TGCCACCCCA GGCAGCCATG 
GGTAGCGAGG TGCGGCAGAA CTGTCGGCAC GTAAATCAAT GGTTGGATGC TATGCTCTTG GAATCGATGG CTCCTACGCA TTAG 

Retrieve as FASTA