Entry information : SpolPrx02 (Spipo2G0041600 [2.0])
Entry ID 12971
Creation 2014-09-23 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2015-05-28 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2015-05-28 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: SpolPrx02 (Spipo2G0041600 [2.0])
Name (synonym) SpolPrx02 (Spipo2G0041600 [2.0])
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx006]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Monocotyledons Araceae Spirodela
Organism Spirodela polyrhiza (great duckweed)    [TaxId: 29656 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value SpolPrx02
start..stop
S start..stop
StPrx28 447 7e-160 1..302 29..331
LePrx06 444 2e-158 1..302 30..332
CsaPrx68 439 2e-156 2..302 29..330
CanPrx01 436 3e-155 1..302 30..332
Literature and cross-references SpolPrx02 (Spipo2G0041600 [2.0])
DNA ref. Phytozome 12:   pseudo2 (3513909..3515003)
Protein sequence: SpolPrx02 (Spipo2G0041600 [2.0])
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   304
PWM (Da):   %s   32246.02  
PI (pH):   %s   6.5
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MGQGTRVGFY STTCPRAEAI VRSTVRAHLS ADRTLAAGLL RMHFHDCFVQ GCDGSILIDG PSSEKTAPPN LSVRGYEVID DAKTQLEAAC PGVVSCADIL ALAARDAVAL TGGPSWGVPT  GRRDGRVSSA SDVNLPSFTD SVDSQKLQFS QRGLTTKDLV TLSGAHTLGT AQCQLFRYRL YNFTSDGGPD PTIDADFLTQ LRALCPADGD GTRRVALDSG SEGNFDLSYF NNLQRGRGVL 
ESDQSLFTDA STRRFVQGYT GLLAGLVGSF RIEFGASMVK MSNIGVNTGT IGEIRRVCSS FNP* 

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Remarks Complete sequence from genomic (introns 2 and 3).
Promoter
Send to BLAST
Send to cis Analysis
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnTCTCTC TCTCTCTCTC TCTCTCTCTC TCTCTCTCTC TCGCTCGCTC GCTATCTATC  TATATATATA TCGGTCTCTA TCTATCTATA TATGTATACA TATCTATCTA TGTATATATA TATATATATA CATATATCTC CCTCTCCCTC TCCGTCTCTC TACCTTGTTT ATCTATATTT  TCTAGTTCTC TATGTATCTA CTTCTTTCAT CCCCACTCCG CGTCTTCTCT TTCCCCCCCT TCTCTCTCTG TTCCGTCCGC CAGTCCATCT CTGTACGACT CTCCATCTCG ATCTCGATCT  TCTCTTCTCC GTAGAAAATG TAAGTCATGG CGGGGGAGGG GAGAGGCGAG AAAATACTGC ATACGTCCAA GGAGAGGCTT CTCCGTCGGA CAAAGCCCAG TTGGTGAAAC GAAAGAGTGG  GGGAGCCAGA CGAAGACAGA GATGGCGCAC TGAACTTTGT TAGAAGCCGC GAAGTCGTCC CTCCGCAAGG GCAGCTTCTT CGTCCCCAGC CGAGCTCTTC CATAGCGAGA GGCCCCCACT  GGGCCAGACC TAAATGGCAC TCATCCAGCC GCCTTCTCTT ACTCGCTGAC CACGCTCGCC TATAAATCCC TTCTCCCCCT CTTCCCCATT CCTCACCTCC CTCCTCACCA TTCGCAGCTC 
CTTCTTCCTC TCCATCCTCT CCCATGGCTA CTCTCGTTGC AGCCATCTCT CTCCTCCTGC TCGCAGCGGC AGGCGGCGCC 

Retrieve as FASTA  
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGGGCAAG GAACCAGAGT GGGCTTCTAC AGCACCACCT GCCCGAGAGC GGAGGCCATC GTCAGGTCCA CCGTGAGGGC TCACCTCTCC GCCGACCGTA CCCTCGCCGC CGGCCTGCTG  CGGATGCACT TCCACGACTG CTTCGTGCAG GGCTGCGACG GCTCCATCCT CATCGACGGG CCCTCCTCGG AGAAGACGGC GCCGCCGAAC CTCTCCGTGA GGGGCTACGA GGTCATCGAC  GACGCCAAGA CCCAGCTCGA GGCCGCCTGC CCCGGCGTCG TCTCCTGCGC AGACATCCTC GCCCTCGCCG CTCGCGACGC CGTTGCGCTG GTAGTTAAAA AAAGATTGAT TCATTCATCG  ATTGATTGGT TTGATTCTGA TTTTATTCGT CCCGTTTTTT CTGGTGGGTT GCAGACGGGA GGTCCGAGCT GGGGAGTGCC CACCGGACGG CGAGATGGGC GCGTCTCCTC CGCCTCCGAC  GTTAACCTCC CCTCCTTCAC CGACTCCGTC GACTCCCAGA AGCTCCAGTT CTCTCAGAGA GGCCTAACCA CCAAGGACCT CGTCACTCTC AGCGGTAAGC ACCCTCTGAG ACCAGCACCA  GCACGCCTGG AGATAGCGAG AGAGAGAGAG AGGTCACCGG GCTATCTGAC ACGGGCATTA TGGGATGAAA CAGGGGCACA CACTCTGGGA ACAGCGCAGT GCCAGCTCTT CAGGTACAGG  CTCTACAACT TCACCAGCGA TGGCGGGCCA GACCCGACCA TCGACGCCGA CTTCCTCACG CAGCTGCGGG CTCTCTGCCC CGCCGACGGC GACGGCACCA GGCGGGTGGC GCTGGACAGC  GGCAGCGAAG GGAACTTCGA CCTGAGCTAC TTCAACAACC TGCAGAGAGG GAGGGGGGTG CTGGAGTCGG ACCAGAGCCT CTTCACCGAC GCCTCCACCC GGAGGTTCGT CCAGGGCTAC  ACCGGCCTTC TCGCCGGCCT GGTCGGGTCC TTCCGCATCG AGTTTGGGGC CTCCATGGTG AAGATGAGCA ACATCGGAGT CAACACCGGC ACCATTGGGG AGATCCGCAG AGTCTGCTCC 
TCTTTCAACC CCTAA 

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CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGGGCAAG GAACCAGAGT GGGCTTCTAC AGCACCACCT GCCCGAGAGC GGAGGCCATC GTCAGGTCCA CCGTGAGGGC TCACCTCTCC GCCGACCGTA CCCTCGCCGC CGGCCTGCTG  CGGATGCACT TCCACGACTG CTTCGTGCAG GGCTGCGACG GCTCCATCCT CATCGACGGG CCCTCCTCGG AGAAGACGGC GCCGCCGAAC CTCTCCGTGA GGGGCTACGA GGTCATCGAC  GACGCCAAGA CCCAGCTCGA GGCCGCCTGC CCCGGCGTCG TCTCCTGCGC AGACATCCTC GCCCTCGCCG CTCGCGACGC CGTTGCGCTG ACGGGAGGTC CGAGCTGGGG AGTGCCCACC  GGACGGCGAG ATGGGCGCGT CTCCTCCGCC TCCGACGTTA ACCTCCCCTC CTTCACCGAC TCCGTCGACT CCCAGAAGCT CCAGTTCTCT CAGAGAGGCC TAACCACCAA GGACCTCGTC  ACTCTCAGCG GGGCACACAC TCTGGGAACA GCGCAGTGCC AGCTCTTCAG GTACAGGCTC TACAACTTCA CCAGCGATGG CGGGCCAGAC CCGACCATCG ACGCCGACTT CCTCACGCAG  CTGCGGGCTC TCTGCCCCGC CGACGGCGAC GGCACCAGGC GGGTGGCGCT GGACAGCGGC AGCGAAGGGA ACTTCGACCT GAGCTACTTC AACAACCTGC AGAGAGGGAG GGGGGTGCTG  GAGTCGGACC AGAGCCTCTT CACCGACGCC TCCACCCGGA GGTTCGTCCA GGGCTACACC GGCCTTCTCG CCGGCCTGGT CGGGTCCTTC CGCATCGAGT TTGGGGCCTC CATGGTGAAG 
ATGAGCAACA TCGGAGTCAA CACCGGCACC ATTGGGGAGA TCCGCAGAGT CTGCTCCTCT TTCAACCCCT AA 

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