Entry information : StPrx45
Entry ID 12973
Creation 2014-10-16 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2014-10-16 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Harold Duruflé
Last annotation changes 2014-10-16 (Harold Duruflé)
Peroxidase information: StPrx45
Name StPrx45
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx016]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Solanaceae Solanum
Organism Solanum tuberosum (Potato)    [TaxId: 4113 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value StPrx45
start..stop
S start..stop
LePrx77 667 0 48..381 1..334
GhPrx05 413 3e-145 64..379 10..323
NtPrx81-1A 401 2e-140 64..378 7..320
ThasPrx44 398 5e-139 23..379 3..347
Literature and cross-references StPrx45
Protein sequence: StPrx45
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   381
PWM (Da):   %s   42181.65 Transmb domain:   %s   o15-37i58-75o
PI (pH):   %s   6.85
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MTFDKIYPVL LFKAILFYLL WTILLFPTHL FIIISYSSTI FSNITTTMAL FNKDPKSFIK LISIICFLQI SALNGQLRVG FYSESCHNVE SIVSSMVKEA SQREPRMPAI LLRLHFHDCF  VQGCDGSILI DNVKEAERNA FGHEGLGGFA EIQTAKTQLE VQCPGVVSCA DIVALAARDA VVMAGGESYE VETGRRDGRV SDLSFASKMP DVDDSIEVLK EKFKTKGFTE KDLVILSGAH  TIGTTACFFM PKRLYNFTGK SDADPSINPK FLPELRSKCP KNGNVNVRIS LDNLSERKFD DQIMHNIKNG FAVIASDARL YDDNITKAVV DSYLEITEKS NPNSSSFGND FGLAMVKLGR 
LEVKTGLLGE IRKVCNSFNK M 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic (3 introns). Incorrect prediction from Phytozome (large 5' is missing and extra intron after GEIR).
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGACATTTG ACAAAATATA TCCTGTTTTA TTATTTAAGG CAATTTTATT TTATTTACTT TGGACTATTT TATTATTTCC CACTCATCTA TTTATCATCA TATCATATTC CTCCACCATT  TTTTCTAATA TAACAACAAC AATGGCATTG TTCAACAAAG ATCCAAAGAG TTTCATTAAA TTAATTTCAA TTATTTGTTT CCTACAAATA TCAGCTCTAA ATGGACAACT TAGAGTTGGG  TTTTATTCTG AAAGTTGTCA TAATGTAGAG TCCATTGTTA GCTCTATGGT TAAAGAAGCT TCACAAAGAG AACCAAGAAT GCCAGCCATC TTACTTCGAC TCCATTTCCA TGATTGCTTT  GTCCAGGTTC TTTCTTATAT TTTTAACCAA ATTTTAGTAT GTCAATTTTA ACTCTTTTGA TTTTCATGTT GGTTGGAAAA TGAACTGGTA TTTGCAATAC GGTCTTTGGG CAATTCTTGT  TCGGAATTAG ACCTAAGTGT CATATCTAAG TTAGGTTCAA TCCTGTTTGA CTTCTGGTCC ATACTCCAGT TGGATCTGGA CATGAAAGCT GTTAGAGTGG GTTAGACATT AATTGGTGAT  TAGACTTATG GTTTGTTTAT ATATGTATTT GAGCCATTTT TTTTATGAGT TGAAGTATGG GGTTGAGTTA GACTTAAATA TCACATCTTA TATGGTATTG GAGTCCGAAT TTTGACTACA  TACTAGTCTA TGCTTTAGTT GGGCTTGAAC CTAAATAGGG TGTGTTAGAA TTCCACATTG ATTAAAAATA GACCGATGAT TTTTTTATAT AGAATTGGAT ACTTTTTCTT ACTAAGCTAT  TTTTTGTGGT TGAGTTAGAA AGAAGGTTGA TTACATTAAT TTATATTATT TGTACCAATA ACCTTCTTAA TTCTTCTTTT TGAAATGTGT TAAAAGGGTT GTGATGGATC AATTTTGATT  GATAATGTTA AAGAAGCTGA AAGAAATGCA TTTGGTCATG AAGGGCTTGG AGGATTTGCT GAGATCCAAA CAGCCAAAAC TCAATTGGAA GTCCAATGTC CTGGTGTTGT ATCTTGTGCT  GATATTGTCG CTTTAGCTGC TAGAGATGCT GTTGTTATGG TAATGCTATA CTGTTTTTTA AAATTTTAGT TTTATGTATA TATACGAGTT AAAATATTTA ATTTTTTTTT TTTTACATGA  GATACATTTA TATAACCCTA AATAAAATTT CTGACTCTGT CAGGCTGGTG GAGAATCTTA TGAAGTAGAG ACAGGTAGAA GGGATGGAAG AGTATCAGAT TTGTCATTTG CATCCAAAAT  GCCAGATGTG GATGACTCAA TTGAAGTTCT CAAAGAAAAA TTCAAAACCA AAGGCTTTAC AGAAAAGGAT CTTGTCATTT TGAGTGGTAT GTATGATGAT CATATAATTT TACACATACT  CATTTTTATG ATAAATATAA GTAACAAATA ATAAGCCATC TATTTATTTT TCATATAAGT GAGGGGAAAA AACACAGTTA CATTAGGAGG TAAACATTCA ACATATCTCT AATTATTAGC  AACAATCAAT TAGGAATTTT TCAATGTTTA ACTAAAGATT TTAGGTTCAA ATTCCAGAAA TGAATTGGAG AACTCTTGAT AGGAAGTGTG TTCTTCTTAA ATAAATCTTA CACGATGCAA  ATTTGAATTA GTCAACTCAA GCTAAAAGGT ATTAGATATT AGATGATTAT ACAAAATATA ACTGACAATT AAAGTATCAT AAATATTTGA CCAAGACTAA AAGTGCTTTA CTGAAAAAGA  CAAAACTGCT AGAATATATT TAACGTAACG GACCACACTT TGAGCATAGT CTCAAACACA TACATTTTGT TTTCTAGCTA CAACAATATC ATACATTTTT GTCACTTTAT TATAACTTTT  GACATGTTAA AAGTTTAAAC ATCTTCTAAT CCTGACTCTG CCTCTGTGTT AAACATCTTG CGCAGGGGCA CATACAATTG GCACAACAGC TTGTTTTTTC ATGCCTAAAA GATTATACAA  TTTTACTGGA AAATCAGATG CAGATCCATC TATCAATCCT AAATTCCTCC CAGAATTAAG AAGCAAATGT CCCAAAAATG GGAACGTAAA CGTTCGAATA TCGCTCGATA ACCTTAGTGA  AAGGAAATTT GATGATCAAA TAATGCACAA CATAAAGAAT GGATTTGCAG TTATAGCATC AGATGCAAGG CTTTATGATG ATAATATTAC AAAAGCAGTG GTTGATTCTT ATCTTGAGAT  TACAGAGAAA TCAAATCCTA ATTCATCATC ATTTGGAAAT GATTTTGGTT TAGCAATGGT AAAATTGGGA AGGCTTGAGG TGAAGACTGG ATTACTAGGA GAGATTAGAA AGGTTTGTAA 
TTCTTTTAAT AAAATGTAG 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGACATTTG ACAAAATATA TCCTGTTTTA TTATTTAAGG CAATTTTATT TTATTTACTT TGGACTATTT TATTATTTCC CACTCATCTA TTTATCATCA TATCATATTC CTCCACCATT  TTTTCTAATA TAACAACAAC AATGGCATTG TTCAACAAAG ATCCAAAGAG TTTCATTAAA TTAATTTCAA TTATTTGTTT CCTACAAATA TCAGCTCTAA ATGGACAACT TAGAGTTGGG  TTTTATTCTG AAAGTTGTCA TAATGTAGAG TCCATTGTTA GCTCTATGGT TAAAGAAGCT TCACAAAGAG AACCAAGAAT GCCAGCCATC TTACTTCGAC TCCATTTCCA TGATTGCTTT  GTCCAGGGTT GTGATGGATC AATTTTGATT GATAATGTTA AAGAAGCTGA AAGAAATGCA TTTGGTCATG AAGGGCTTGG AGGATTTGCT GAGATCCAAA CAGCCAAAAC TCAATTGGAA  GTCCAATGTC CTGGTGTTGT ATCTTGTGCT GATATTGTCG CTTTAGCTGC TAGAGATGCT GTTGTTATGG CTGGTGGAGA ATCTTATGAA GTAGAGACAG GTAGAAGGGA TGGAAGAGTA  TCAGATTTGT CATTTGCATC CAAAATGCCA GATGTGGATG ACTCAATTGA AGTTCTCAAA GAAAAATTCA AAACCAAAGG CTTTACAGAA AAGGATCTTG TCATTTTGAG TGGGGCACAT  ACAATTGGCA CAACAGCTTG TTTTTTCATG CCTAAAAGAT TATACAATTT TACTGGAAAA TCAGATGCAG ATCCATCTAT CAATCCTAAA TTCCTCCCAG AATTAAGAAG CAAATGTCCC  AAAAATGGGA ACGTAAACGT TCGAATATCG CTCGATAACC TTAGTGAAAG GAAATTTGAT GATCAAATAA TGCACAACAT AAAGAATGGA TTTGCAGTTA TAGCATCAGA TGCAAGGCTT  TATGATGATA ATATTACAAA AGCAGTGGTT GATTCTTATC TTGAGATTAC AGAGAAATCA AATCCTAATT CATCATCATT TGGAAATGAT TTTGGTTTAG CAATGGTAAA ATTGGGAAGG 
CTTGAGGTGA AGACTGGATT ACTAGGAGAG ATTAGAAAGG TTTGTAATTC TTTTAATAAA ATGTAG 

Retrieve as FASTA