Entry information : GbAPx03 (gba_locus_509_iso_3_len_1283_ver_2)
Entry ID 13079
Creation 2015-02-18 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2015-02-18 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Achraf Jemmat
Last annotation changes 2015-11-10 (Achraf Jemmat)
Peroxidase information: GbAPx03 (gba_locus_509_iso_3_len_1283_ver_2)
Name (synonym) GbAPx03 (gba_locus_509_iso_3_len_1283_ver_2)
Class Ascorbate peroxidase    [Orthogroup: APx003]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Ginkgoopsida Ginkgoaceae Ginkgo
Organism Ginkgo biloba    [TaxId: 3311 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value GbAPx03
start..stop
S start..stop
PtaAPx05 494 4e-179 3..292 1..290
BnAPx03-1Aa_other 466 5e-168 4..292 3..287
HaAPx03 463 4e-167 5..292 4..285
LsaAPx02 457 7e-165 5..292 4..285
Literature and cross-references GbAPx03 (gba_locus_509_iso_3_len_1283_ver_2)
Protein sequence: GbAPx03 (gba_locus_509_iso_3_len_1283_ver_2)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   292
PWM (Da):   %s   31712.16 Transmb domain:   %s   o263-285i
PI (pH):   %s   6.88
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MPMAPVVNAA YLKSIDKARR DLRAFIAEKN CAPIMLRLAW HDAGTYDAKT KTGGANGSIR NEEECAHSAN NGLKIALEFC EQIKAKHPNI TYADIYQLAG VVAVEVTGGP TIDFVPGRKD  SLASPREGRL PDAKKGGQHL RDVFYRMGLT DKDIVALSGG HTLGRAHPER SGFEGAWTKQ PLKFDNSYFI ELLKGESEGL LQLPTDKCLL EDAGFRPYVE LYAQDEDAFF KDYADSHKKL 
SELGFRDPSS TSSGSGFEVS TSTVLAQGAV GVAVAAAVVV LSYLYEVRRR VK 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from RNA seq. No EST.
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGCCAATGG CACCAGTCGT AAATGCTGCG TATTTGAAAT CCATTGACAA AGCACGCCGA GACCTTCGGG CTTTCATCGC TGAGAAGAAC TGTGCACCTA TCATGCTTCG TCTCGCATGG  CATGATGCTG GCACTTATGA TGCAAAGACA AAGACAGGTG GTGCAAATGG TTCAATTCGA AATGAGGAGG AGTGCGCTCA CAGTGCAAAT AATGGCTTGA AAATTGCACT AGAATTTTGC  GAACAAATCA AGGCCAAACA CCCAAACATT ACATATGCAG ATATTTACCA GCTAGCTGGT GTAGTTGCGG TTGAAGTTAC AGGAGGCCCC ACCATTGACT TTGTCCCTGG TCGGAAGGAT  TCATTGGCGT CACCACGAGA AGGGCGGCTT CCTGATGCCA AGAAAGGTGG ACAACATTTA CGAGATGTCT TTTATAGAAT GGGTCTAACA GACAAGGATA TTGTGGCTCT TTCTGGAGGG  CACACATTGG GAAGGGCGCA CCCAGAGAGG TCAGGCTTTG AAGGAGCATG GACCAAGCAG CCTCTAAAGT TTGATAACTC CTATTTTATA GAACTTCTCA AAGGGGAGTC TGAAGGATTG  CTCCAGTTGC CTACAGACAA ATGCCTATTA GAGGATGCTG GTTTCCGTCC TTATGTGGAA CTTTATGCTC AGGATGAGGA TGCATTTTTC AAGGACTATG CAGACTCGCA CAAGAAACTT  TCTGAACTGG GATTCAGAGA TCCAAGCTCA ACTTCTTCAG GATCTGGTTT TGAAGTAAGC ACATCTACAG TGCTTGCACA GGGGGCAGTT GGAGTGGCAG TTGCTGCAGC AGTTGTGGTT 
TTGAGCTACC TATATGAGGT TCGAAGAAGA GTAAAGTAA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
AAGCGTTATA GGATGAAATT AATTTTGAAA GGGGCCAAGG AGGGCGTAAA AATAGAAAAT AAGGCGACAG GATCGACCAA TAAAAGCCAA ACGAGTGATC AAATCATAAT TAAGTGTCGT  CTCTAAAAAT AGCAGCACTT TTGGAAGCAT CTAGAAGAGC AGAGATAATC TCTTGGACTC TTCCCCAATC GATGAAGAGG GCCTAAGTTG ACTGCTATAT AATTGGGCAC CATCCGTTCA  AGTTCTTGTC GTGCAGATAA TAGGTGGTTC CGTCATTCCC CACCTGCAAT TTAAAGATAG AAGGATCAAA ACTGTTTCTT GAGGCATCCA AAAGCTAGTG AAGGAGAATT ATGCCAATGG  CACCAGTCGT AAATGCTGCG TATTTGAAAT CCATTGACAA AGCACGCCGA GACCTTCGGG CTTTCATCGC TGAGAAGAAC TGTGCACCTA TCATGCTTCG TCTCGCATGG CATGATGCTG  GCACTTATGA TGCAAAGACA AAGACAGGTG GTGCAAATGG TTCAATTCGA AATGAGGAGG AGTGCGCTCA CAGTGCAAAT AATGGCTTGA AAATTGCACT AGAATTTTGC GAACAAATCA  AGGCCAAACA CCCAAACATT ACATATGCAG ATATTTACCA GCTAGCTGGT GTAGTTGCGG TTGAAGTTAC AGGAGGCCCC ACCATTGACT TTGTCCCTGG TCGGAAGGAT TCATTGGCGT  CACCACGAGA AGGGCGGCTT CCTGATGCCA AGAAAGGTGG ACAACATTTA CGAGATGTCT TTTATAGAAT GGGTCTAACA GACAAGGATA TTGTGGCTCT TTCTGGAGGG CACACATTGG  GAAGGGCGCA CCCAGAGAGG TCAGGCTTTG AAGGAGCATG GACCAAGCAG CCTCTAAAGT TTGATAACTC CTATTTTATA GAACTTCTCA AAGGGGAGTC TGAAGGATTG CTCCAGTTGC  CTACAGACAA ATGCCTATTA GAGGATGCTG GTTTCCGTCC TTATGTGGAA CTTTATGCTC AGGATGAGGA TGCATTTTTC AAGGACTATG CAGACTCGCA CAAGAAACTT TCTGAACTGG  GATTCAGAGA TCCAAGCTCA ACTTCTTCAG GATCTGGTTT TGAAGTAAGC ACATCTACAG TGCTTGCACA GGGGGCAGTT GGAGTGGCAG TTGCTGCAGC AGTTGTGGTT TTGAGCTACC 
TATATGAGGT TCGAAGAAGA GTAAAGTAAA AATGTGTCTT TCCTTGGCAA TTGAATGAGA ATTCACTACA TTGGTTAACG GCA 

Retrieve as FASTA