Entry information : GbAPx05 (gba_locus_3573_iso_1_len_1512_ver_2)
Entry ID 13085
Creation 2015-02-18 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2015-02-18 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2015-02-18 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: GbAPx05 (gba_locus_3573_iso_1_len_1512_ver_2)
Name (synonym) GbAPx05 (gba_locus_3573_iso_1_len_1512_ver_2)
Class Ascorbate peroxidase    [Orthogroup: APx004]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Ginkgoopsida Ginkgoaceae Ginkgo
Organism Ginkgo biloba    [TaxId: 3311 ]
Cellular localisation Thylakoid lumen
Tissue type Leaves
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value GbAPx05
start..stop
S start..stop
CclAPx01 452 1e-160 19..358 4..349
SpolAPx05 448 4e-159 49..358 21..332
MguAPx05 444 2e-157 15..358 1..344
MeAPx02 440 6e-156 61..358 52..349
Literature and cross-references GbAPx05 (gba_locus_3573_iso_1_len_1512_ver_2)
EST ref. GenBank:   EX936143.1 [Fragment]
Protein sequence: GbAPx05 (gba_locus_3573_iso_1_len_1512_ver_2)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   358
PWM (Da):   %s   39419.22  
PI (pH):   %s   8.7
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MATAMATLPL HVHPLSRLSF LSTVSNYPVT STERFSTRFF FNQDQVCYPK VKASILEQGN YSRREALMSF GMTIGVAVIW SSSPGLQTAH AADLIQRRQR GEFLALIKDS LRTALKAQPE  LIPSIMRLAL NDAITYDKAN KTGGANGSIR LSSEINRPEN EGLVSVVKLL EDVKKDIDAS AKGGPLSYAD LIQFAGQAAT KSTFLNAAIR KCGGNEQKGQ ILYSAYGSNG QWGLFERQFG 
RTDAEEVDPE GRVPQWEQTS VVEMKRKFSN VGLGPRQLAV MSAFLGPDQA ATEAKLASDP EVAPWVDKYQ RSRETVSQTD YEVDLINAFT KLSCLGQNIN YEAYTYPPNK IDLRKLKL 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from RNA seq and 1 EST.
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCAACAG CAATGGCTAC TCTACCACTT CATGTCCACC CTCTTTCCAG ATTGTCATTC CTTTCCACCG TGTCCAACTA CCCTGTCACA TCTACTGAAC GCTTTTCAAC AAGGTTTTTC  TTCAATCAAG ATCAAGTTTG TTATCCAAAA GTCAAGGCTT CAATCCTTGA ACAGGGAAAT TATAGTCGAA GAGAAGCCTT GATGAGCTTT GGTATGACAA TAGGTGTGGC TGTGATATGG  AGCTCATCAC CTGGGCTTCA AACAGCTCAT GCTGCTGACT TGATTCAACG GCGACAGCGT GGTGAATTCT TAGCTCTGAT TAAGGACTCG CTGAGGACAG CCTTAAAGGC TCAACCAGAA  CTCATTCCAT CAATCATGAG GTTGGCCTTG AATGATGCAA TAACTTATGA CAAGGCTAAC AAAACTGGTG GAGCAAATGG ATCAATCAGA CTTAGTTCAG AGATAAACAG ACCAGAAAAT  GAAGGACTAG TATCTGTAGT TAAGCTATTG GAGGATGTCA AGAAGGATAT TGATGCATCT GCCAAAGGTG GACCTCTTTC ATACGCTGAT CTCATTCAGT TTGCAGGACA AGCAGCAACA  AAAAGTACCT TTCTTAATGC TGCCATTCGA AAATGTGGTG GTAATGAACA GAAAGGTCAG ATATTGTACT CTGCATATGG ATCAAATGGC CAGTGGGGTT TGTTTGAGAG ACAATTCGGA  CGAACTGATG CTGAAGAAGT TGATCCGGAA GGGAGGGTTC CACAATGGGA ACAAACATCA GTTGTCGAAA TGAAACGTAA ATTTTCAAAT GTGGGCCTTG GTCCACGACA GTTGGCTGTG  ATGTCTGCGT TTCTCGGCCC TGATCAAGCA GCAACAGAAG CAAAGTTAGC CTCAGATCCA GAAGTAGCTC CTTGGGTTGA CAAGTATCAG CGTAGCAGAG AGACAGTTTC ACAGACTGAC 
TATGAGGTAG ATCTCATCAA TGCATTCACA AAGCTTAGTT GTTTGGGCCA AAATATAAAT TACGAAGCAT ACACATATCC TCCCAACAAA ATAGATCTAA GGAAATTGAA GTTGTAG 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
TTGCAACCTG CCGAATAAGA GGATATGTGG ATAACGTATC ATACCAATGG GAATTATGAT CCCACATATA CTTAAACTAC ACACACTCCT CCGACTGGTG TGGGTCGAGC TCAAGAATGG  CAACAGCAAT GGCTACTCTA CCACTTCATG TCCACCCTCT TTCCAGATTG TCATTCCTTT CCACCGTGTC CAACTACCCT GTCACATCTA CTGAACGCTT TTCAACAAGG TTTTTCTTCA  ATCAAGATCA AGTTTGTTAT CCAAAAGTCA AGGCTTCAAT CCTTGAACAG GGAAATTATA GTCGAAGAGA AGCCTTGATG AGCTTTGGTA TGACAATAGG TGTGGCTGTG ATATGGAGCT  CATCACCTGG GCTTCAAACA GCTCATGCTG CTGACTTGAT TCAACGGCGA CAGCGTGGTG AATTCTTAGC TCTGATTAAG GACTCGCTGA GGACAGCCTT AAAGGCTCAA CCAGAACTCA  TTCCATCAAT CATGAGGTTG GCCTTGAATG ATGCAATAAC TTATGACAAG GCTAACAAAA CTGGTGGAGC AAATGGATCA ATCAGACTTA GTTCAGAGAT AAACAGACCA GAAAATGAAG  GACTAGTATC TGTAGTTAAG CTATTGGAGG ATGTCAAGAA GGATATTGAT GCATCTGCCA AAGGTGGACC TCTTTCATAC GCTGATCTCA TTCAGTTTGC AGGACAAGCA GCAACAAAAA  GTACCTTTCT TAATGCTGCC ATTCGAAAAT GTGGTGGTAA TGAACAGAAA GGTCAGATAT TGTACTCTGC ATATGGATCA AATGGCCAGT GGGGTTTGTT TGAGAGACAA TTCGGACGAA  CTGATGCTGA AGAAGTTGAT CCGGAAGGGA GGGTTCCACA ATGGGAACAA ACATCAGTTG TCGAAATGAA ACGTAAATTT TCAAATGTGG GCCTTGGTCC ACGACAGTTG GCTGTGATGT  CTGCGTTTCT CGGCCCTGAT CAAGCAGCAA CAGAAGCAAA GTTAGCCTCA GATCCAGAAG TAGCTCCTTG GGTTGACAAG TATCAGCGTA GCAGAGAGAC AGTTTCACAG ACTGACTATG  AGGTAGATCT CATCAATGCA TTCACAAAGC TTAGTTGTTT GGGCCAAAAT ATAAATTACG AAGCATACAC ATATCCTCCC AACAAAATAG ATCTAAGGAA ATTGAAGTTG TAGGTTTTGT  GCAATGCTTA AACTCCATCT CTCTGCATCT TTGTTGCTTA ATTTTTTGTC TTGATTCATT AAATATTTTG CCTAGACACT GCTTACCTTC TTTACTCCAA CAATCTGTGT CATGTGAGTG  TATAGTCATT GAGGATCTTT GTAGGTATTA ACATGCAAGT TGAGATTATA AAAGAGTGCA ATTGACATAA TGGGTGGCTT GTCATGTGCA AAGGATTTAT GCAACCTTCA ATTTTTCCAC 
ATAATGTAAT TGTGCATGTA TTCATAAAAA ACTAAGAGTG TAATATCAAG GACTAATTAT GCACATTTGT TG 

Retrieve as FASTA