Entry information : GbPrx16(Ginbil_Gb_36391 / Peroxidase43)
Entry ID 13088
Creation 2015-02-19 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2015-02-19 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Christophe Dunand
Last annotation changes 2020-11-23 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: GbPrx16(Ginbil_Gb_36391 / Peroxidase43)
Name GbPrx16(Ginbil_Gb_36391 / Peroxidase43)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx016]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Ginkgoopsida Ginkgoaceae Ginkgo
Organism Ginkgo biloba    [TaxId: 3311 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value GbPrx16
start..stop
S start..stop
WnoPrx03 494 6e-178 1..323 1..322
PtaPrx29 466 6e-167 16..323 13..320
GbPrx26 431 4e-153 1..323 3..327
AtrPrx53 411 2e-145 7..323 6..321
Literature and cross-references GbPrx16(Ginbil_Gb_36391 / Peroxidase43)
Protein sequence: GbPrx16(Ginbil_Gb_36391 / Peroxidase43)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   323 (299)
PWM (Da):   %s   34572.95 (31875.5)  
PI (pH):   %s   4.64 (4.48) Peptide Signal:   %s   cut: 25 range:25-323
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MGKHYLFAII VYFVSIGLRL SCEGMEVGFY SPTCPDAESV VRATVQKSFQ SDKTIAAALL RLHYHDCFVQ GCDGSVLIAG PKAENTASGH SGLRGFDVIE NAKKQLEGIC PGVVSCADIV  ALAARDAVAL SNGPDYDVPT GRRDGVVSSA KDASDMPDPT DSIQLLQQKF AAKGLSTSDL VVLNGAHTIG TTACFFIKDR LYNFPPAGDA DPTINPSYLG DLRAVCPWDG DDNVRLPLDR 
GSEFNFDKQF FDNVMQGNGV LESDANMYED ASTRPYIDSY FGLLGGLLGP SFESDFAEAM IRMGQINVKT GSNGRIRRVC SAF 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic (incorrect prediction from SymDB, splicing error) and RNA seq (gba_locus_21387_iso_8_len_1621_ver_2). No EST found.
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGGAAAGC ATTACTTATT CGCCATTATA GTATATTTTG TGAGCATAGG CCTGAGATTA AGCTGTGAAG GCATGGAAGT GGGGTTTTAC TCTCCCACAT GTCCTGATGC TGAATCCGTG  GTCCGGGCGA CTGTGCAGAA GAGCTTTCAA TCCGATAAAA CAATCGCAGC AGCGCTATTG CGCCTTCACT ATCATGATTG CTTCGTTCAA GGTTGCGATG GATCTGTACT CATCGCTGGT  CCAAAGGCCG AGAATACAGC TTCGGGTCAT TCTGGATTGC GTGGATTCGA TGTTATAGAA AATGCTAAGA AACAACTTGA AGGGATTTGT CCAGGAGTCG TTTCATGTGC TGATATAGTC  GCACTGGCCG CCAGAGACGC TGTAGCACTG AGTAATGGAC CAGACTATGA TGTGCCCACT GGAAGAAGGG ATGGTGTTGT GTCGTCTGCA AAGGACGCTT CTGACATGCC TGATCCCACC  GATTCAATCC AACTCCTTCA ACAAAAGTTC GCTGCAAAGG GCCTCTCCAC CTCTGATCTT GTTGTTCTCA ATGGAGCACA TACAATAGGG ACAACTGCCT GCTTCTTCAT AAAAGACCGC  CTCTACAACT TCCCACCAGC TGGAGACGCA GATCCAACCA TCAATCCCAG TTATTTGGGG GACCTGAGAG CAGTTTGCCC ATGGGATGGC GATGATAATG TGCGATTGCC TCTTGACAGA  GGCTCCGAGT TCAACTTCGA CAAACAATTT TTCGACAATG TGATGCAAGG AAACGGAGTG CTGGAATCTG ATGCAAACAT GTATGAAGAT GCTTCCACTC GTCCTTACAT AGACTCGTAC  TTTGGGCTTC TAGGTGGTCT GTTAGGCCCC TCCTTTGAAT CGGATTTTGC AGAGGCAATG ATCCGAATGG GTCAGATCAA CGTTAAAACT GGATCAAATG GAAGGATTCG CAGAGTTTGC 
TCGGCCTTTT AA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
CCTCTGTCTG CTTTCTAGCC TCTTTTTTCG GCTACAAGTT GCTGAGATTT GTCTTCTACT CGTGACAGAC ACAGATGGAG GACACGAACG TGCACCGACA GATAATCTAG ATAAATACAT  TGGGAAGCAT CACTGGCACA CCCACTTTGA AAAATCTAGA TTCGATTTGC ACTCTATTCC ATGGGATTTG AACAGCTCGA GACACGTCTT TGTTGCTGTT GTATGTGTGC GGGTTGGGTT  GTTTCTGTGA TTATTAATGC TTTATGTATC CATAAATCTG ACACATAAAT ACCTCTGCCA ATCAGAAGGG ATTGAAGCTG GTTAATTATC CTCTGAGTAG GAGACATAGG AAATCGGAAT  GGGAAAGCAT TACTTATTCG CCATTATAGT ATATTTTGTG AGCATAGGCC TGAGATTAAG CTGTGAAGGC ATGGAAGTGG GGTTTTACTC TCCCACATGT CCTGATGCTG AATCCGTGGT  CCGGGCGACT GTGCAGAAGA GCTTTCAATC CGATAAAACA ATCGCAGCAG CGCTATTGCG CCTTCACTAT CATGATTGCT TCGTTCAAGG TTGCGATGGA TCTGTACTCA TCGCTGGTCC  AAAGGCCGAG AATACAGCTT CGGGTCATTC TGGATTGCGT GGATTCGATG TTATAGAAAA TGCTAAGAAA CAACTTGAAG GGATTTGTCC AGGAGTCGTT TCATGTGCTG ATATAGTCGC  ACTGGCCGCC AGAGACGCTG TAGCACTGAG TAATGGACCA GACTATGATG TGCCCACTGG AAGAAGGGAT GGTGTTGTGT CGTCTGCAAA GGACGCTTCT GACATGCCTG ATCCCACCGA  TTCAATCCAA CTCCTTCAAC AAAAGTTCGC TGCAAAGGGC CTCTCCACCT CTGATCTTGT TGTTCTCAAT GGAGCACATA CAATAGGGAC AACTGCCTGC TTCTTCATAA AAGACCGCCT  CTACAACTTC CCACCAGCTG GAGACGCAGA TCCAACCATC AATCCCAGTT ATTTGGGGGA CCTGAGAGCA GTTTGCCCAT GGGATGGCGA TGATAATGTG CGATTGCCTC TTGACAGAGG  CTCCGAGTTC AACTTCGACA AACAATTTTT CGACAATGTG ATGCAAGGAA ACGGAGTGCT GGAATCTGAT GCAAACATGT ATGAAGATGC TTCCACTCGT CCTTACATAG ACTCGTACTT  TGGGCTTCTA GGTGGTCTGT TAGGCCCCTC CTTTGAATCG GATTTTGCAG AGGCAATGAT CCGAATGGGT CAGATCAACG TTAAAACTGG ATCAAATGGA AGGATTCGCA GAGTTTGCTC  GGCCTTTTAA GTGGCCGAAT ACAATATCAT TGTTGACTTG AATACATATG CAAACCGGTA ATGTAATTTC TGTTCGAGAT GTAAATACTG AATAGAACAA TAAGAGCTAA AGCTATATGA  TGTTCCAATG TTTTCTCGTG TAATGTAACC TTAATGCATA CCTCGAAATC TATTCCTGTG CCTTGTCCTG AATCTAAAAC CTTTGTTTGG GTACTACTGT AAGCGACTTA TGGATACACT 
GGTTAAGAGT TTGTGGCAAC AAAAATCAAT TTTGTGTTTA TAAGTTTGGC TTGAAATTGT G 

Retrieve as FASTA