Entry information : GbPrx21(>Ginbil_Gb_17935 / Peroxidase47)
Entry ID 13092
Creation 2015-02-20 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2015-02-20 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2020-11-23 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: GbPrx21(>Ginbil_Gb_17935 / Peroxidase47)
Name GbPrx21(>Ginbil_Gb_17935 / Peroxidase47)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx027]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Ginkgoopsida Ginkgoaceae Ginkgo
Organism Ginkgo biloba    [TaxId: 3311 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type Leaves
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value GbPrx21
start..stop
S start..stop
PtaPrx02 525 0 7..322 6..323
AtrPrx37 459 2e-164 1..322 7..319
AcoPrx39 446 5e-159 5..322 6..321
LsaPrx17 437 6e-156 5..322 6..316
Literature and cross-references GbPrx21(>Ginbil_Gb_17935 / Peroxidase47)
EST ref. GenBank:   GE649390.1 [Fragment]
Protein sequence: GbPrx21(>Ginbil_Gb_17935 / Peroxidase47)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   322 (300)
PWM (Da):   %s   35198.44 (32795.1)  
PI (pH):   %s   5.2 (5.63) Peptide Signal:   %s   cut: 23 range:23-322
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MEVGLLVLFT ALLFISAKVG EGLSLDYYAF RCPFAESIVR ETVDRAMQRD ITTAAGLLRM HFHDCFVEGC DASILIDSTR DNKAEKDSPA NLSLHGYEII DEAKQRIEQS CPGVVSCADI  IAIAARDAVV LAGGPMYDVP KGRKDGSRSK IEDTRNLPAP TLDASQLIKA FTQHGLSVQE MVALSGGHTL GVARCSSFKN RLAKFDSAHD VDPSINSQFL ATLKRSCIKT SSDIDDNATV 
AFDSTKNMFD NSYYMNIQSG AGLLTSDQTL LSSPKTRGIV NMYAMNQASF FFDFSQAMIR MGVVDVKEDD EGDIRLNCHK LN* 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic, RNA seq ( gba_locus_7170_iso_2_len_2038_ver_2) and 1 EST.
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGAAGTTG GTCTGTTAGT GCTATTCACA GCGCTGCTCT TCATAAGTGC CAAAGTTGGG GAGGGCTTAA GTTTAGATTA CTATGCTTTT AGATGTCCAT TTGCCGAATC TATTGTCAGA  GAGACTGTGG ATAGGGCTAT GCAACGAGAT ATTACTACTG CAGCAGGACT ATTGAGAATG CATTTCCATG ACTGCTTTGT GGAGGGATGC GATGCCTCTA TTCTAATAGA CTCTACCCGT  GACAATAAAG CTGAGAAGGA CTCTCCTGCC AATCTCAGTT TACATGGCTA CGAAATTATT GACGAGGCAA AACAAAGAAT TGAACAAAGC TGTCCGGGCG TTGTATCTTG TGCAGACATT  ATTGCCATAG CAGCTCGAGA TGCAGTAGTT CTGGCTGGAG GTCCCATGTA TGATGTACCA AAGGGGCGAA AGGATGGAAG CCGATCAAAA ATAGAGGATA CCAGAAACCT GCCCGCTCCA  ACATTAGATG CTTCTCAGCT TATCAAAGCT TTCACTCAGC ATGGCTTATC TGTGCAAGAG ATGGTGGCTC TATCAGGAGG CCATACACTG GGAGTAGCAC GATGCTCCTC CTTCAAAAAT  CGTCTGGCCA AATTTGATTC TGCCCACGAC GTGGACCCAT CAATAAACTC CCAATTCTTG GCTACATTGA AGAGAAGCTG CATCAAGACA AGCAGCGATA TAGACGACAA TGCAACAGTG  GCATTCGATT CTACAAAAAA CATGTTTGAC AATTCGTATT ACATGAACAT TCAATCAGGA GCGGGCCTGT TGACGTCCGA TCAGACATTG CTGTCGAGCC CTAAGACGAG GGGAATAGTG  AACATGTATG CCATGAACCA GGCTTCCTTC TTCTTCGACT TTTCTCAAGC CATGATCAGA ATGGGAGTGG TGGACGTCAA GGAGGACGAC GAGGGTGACA TTCGTTTGAA TTGTCATAAG 
CTCAATTAA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
TAGAGAAACT TCCAGAAATG TTGTCCATAA ACATACCGAC TTCTTGCAAT GTGTGCAGGC TAGATATTGA CCAATGACTT ATCGTGTGAA TTATTACTCT GTGAAAAGAA TTCCGCGTTT  TCTGATAAGA TTCTGTGTCT ATAAATGCAT GTTGGCAGTA GTGCAGAAAT ATTTCTCAGC TAAGCAGCTT GAGTACATGT GTTTGCAGAA ACATGTCTTA AGCTATAGCC ACTGATATTA  GAACTCAAAT ACATTACAAA ATGTTCTCGT GATTCTTGAC CATAAGACTA TAAGTTTCTA CTGATCAACT TGTTTGCAGA AAGAATTTTT TCATTGTTGA GCCCTTCTTG CTTTTTTTAC  TTAATCTGCT CCTTGGTTTA TATAAATAAT ATATTAATTG TGCATTGACT GCATTCTAGA AAAATGGAAG TTGGTCTGTT AGTGCTATTC ACAGCGCTGC TCTTCATAAG TGCCAAAGTT  GGGGAGGGCT TAAGTTTAGA TTACTATGCT TTTAGATGTC CATTTGCCGA ATCTATTGTC AGAGAGACTG TGGATAGGGC TATGCAACGA GATATTACTA CTGCAGCAGG ACTATTGAGA  ATGCATTTCC ATGACTGCTT TGTGGAGGGA TGCGATGCCT CTATTCTAAT AGACTCTACC CGTGACAATA AAGCTGAGAA GGACTCTCCT GCCAATCTCA GTTTACATGG CTACGAAATT  ATTGACGAGG CAAAACAAAG AATTGAACAA AGCTGTCCGG GCGTTGTATC TTGTGCAGAC ATTATTGCCA TAGCAGCTCG AGATGCAGTA GTTCTGGCTG GAGGTCCCAT GTATGATGTA  CCAAAGGGGC GAAAGGATGG AAGCCGATCA AAAATAGAGG ATACCAGAAA CCTGCCCGCT CCAACATTAG ATGCTTCTCA GCTTATCAAA GCTTTCACTC AGCATGGCTT ATCTGTGCAA  GAGATGGTGG CTCTATCAGG AGGCCATACA CTGGGAGTAG CACGATGCTC CTCCTTCAAA AATCGTCTGG CCAAATTTGA TTCTGCCCAC GACGTGGACC CATCAATAAA CTCCCAATTC  TTGGCTACAT TGAAGAGAAG CTGCATCAAG ACAAGCAGCG ATATAGACGA CAATGCAACA GTGGCATTCG ATTCTACAAA AAACATGTTT GACAATTCGT ATTACATGAA CATTCAATCA  GGAGCGGGCC TGTTGACGTC CGATCAGACA TTGCTGTCGA GCCCTAAGAC GAGGGGAATA GTGAACATGT ATGCCATGAA CCAGGCTTCC TTCTTCTTCG ACTTTTCTCA AGCCATGATC  AGAATGGGAG TGGTGGACGT CAAGGAGGAC GACGAGGGTG ACATTCGTTT GAATTGTCAT AAGCTCAATT AACAACATTC AAAAAATTAG TGTGGAATCT CGTATTTTAT AATATCTCAA  CCATTAGATA AGAGAAAATA GCTCCCTTCG GCCCCACAAC CCACAATCGT TCACATAAAG CTGCCTTCGC CTTTGAAATA AGAGAAAATT ATTCATTGGT GGTGGAGGCA CCTTTTGCAT  CTCATTGTAC AATTGTATTC ATTTTATTTT CCATTGCACA ATAGAGCTAT AGGTGTCATC CACTATACAT GTATAATATA TAATGCAATA ATGGAATCTA TATTACTCTA TATGTAAATT  TCTTTGAGAG CAATTTTCTA GGATTTGTCG AAGTGCTACT CCACTTGTAC TCCCCCACTT GTACTCCCCA CACCCAAGCC ACTTGCTCAC CTCACTTTTT TCTAGATTGT TAACTATTTG 
TTATAGAGAG ACTCCTTTTT TTATTTTCAA CATTGTGAAT CATTTACAAA GAAGAGAG 

Retrieve as FASTA