Entry information : GbPrx23(Ginbil_Gb_06035)
Entry ID 13094
Creation 2015-02-20 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2015-02-20 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2020-11-23 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: GbPrx23(Ginbil_Gb_06035)
Name GbPrx23(Ginbil_Gb_06035)
Class Class III peroxidase     [Orthogroup: Prx282]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Ginkgoopsida Ginkgoaceae Ginkgo
Organism Ginkgo biloba    [TaxId: 3311 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value GbPrx23
start..stop
S start..stop
PabPrx103 487 2e-172 1..368 1..369
GbPrx18 347 3e-117 17..345 35..360
PtaPrx42 344 9e-117 37..338 32..334
GbPrx71 344 4e-116 4..345 34..372
Literature and cross-references GbPrx23(Ginbil_Gb_06035)
Protein sequence: GbPrx23(Ginbil_Gb_06035)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   444 (424)
PWM (Da):   %s   48217.23 (45949.1) Transmb domain:   %s   i5-27o
PI (pH):   %s   4.8 (4.72) Peptide Signal:   %s   cut: 21 range:21-444
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MGYNYYCIVL MVIVPHLAMG MSQMNSFSLW GRQFPLPAPI AGLDYTFYDN TCPQAEGIVR SRIDYFMDED ITQAAGLLRL FFQDCFVHGC DGSVLLTGSA SGPWDTNAAP NMLLRPEVYE  IIDDIKMHLE AECPQVVSCA DIISLAARDA ILAAEGPYFP IPTGRRDGIV LDTAEDTLKN IPPPTSNVSQ LLKLFKSKGL DVVDLVALSG AHTLGKAHCS SFSYRLQPLD PRLNKKFALK  LLQICPANNS TNATDIDYNS PREFDNKYYK HLKKQEGLFT SDEDLFYDAR TRELVMEFED SEFLFFLQFA LSAIQMSQMG VLTGADGEIR LNCSQPNFIQ PPASPSSAPI PSLPSPSLAH 
IPSIPILSAA ALPSSAKARH SPEPGALYPP SSAPIPSSVP TITRASPTLP PPASSIPSPS PFPPQSNTPS LRVNAFPEPE IALE 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic and RNA seq (gba_locus_11579_iso_1_len_1751_ver_2). No EST found. Very long 3'end. '
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGGTTATA ATTATTACTG CATAGTTTTG ATGGTGATTG TTCCACATTT GGCAATGGGT ATGTCACAGA TGAATTCCTT CAGCCTTTGG GGGCGACAAT TTCCATTGCC TGCACCAATA  GCTGGATTGG ATTATACCTT CTATGATAAT ACCTGCCCAC AGGCAGAAGG CATTGTTAGA TCCCGGATTG ATTATTTCAT GGACGAAGAC ATCACTCAAG CTGCTGGGTT GCTTCGCTTA  TTTTTTCAGG ACTGCTTTGT GCATGGATGT GATGGATCAG TACTCCTTAC AGGTTCTGCA AGTGGTCCCT GGGATACAAA TGCAGCCCCT AATATGTTAT TAAGGCCAGA GGTTTATGAG  ATAATTGATG ACATAAAGAT GCATCTGGAA GCTGAGTGCC CTCAAGTTGT TTCCTGTGCA GACATCATCT CTCTTGCTGC CAGGGATGCC ATTTTAGCTG CTGAAGGCCC ATACTTTCCC  ATTCCAACAG GCCGGAGAGA CGGCATCGTT TTGGACACTG CAGAAGACAC ATTAAAAAAT ATCCCACCAC CCACCTCAAA CGTTTCTCAG CTACTCAAAC TTTTCAAGTC CAAAGGATTG  GATGTTGTGG ATCTCGTTGC TCTCTCAGGA GCACACACCC TAGGCAAAGC TCACTGCAGT TCCTTCTCCT ACAGGCTTCA ACCCTTGGAC CCTCGCCTGA ACAAGAAGTT TGCTCTGAAG  TTGCTTCAGA TTTGTCCAGC AAACAACTCT ACCAATGCCA CTGACATTGA TTATAATTCT CCCAGGGAAT TTGACAACAA GTACTACAAA CACCTGAAGA AGCAGGAAGG ACTGTTCACT  TCTGATGAAG ACCTGTTCTA TGATGCTAGA ACCAGAGAGT TGGTGATGGA ATTTGAGGAT TCTGAGTTCT TGTTCTTCCT TCAATTTGCT CTGTCTGCCA TTCAAATGAG CCAAATGGGT  GTTCTTACAG GTGCAGATGG AGAGATCAGG TTGAACTGCT CACAACCCAA CTTCATACAA CCGCCTGCAT CACCATCCTC TGCACCAATT CCTTCACTTC CATCACCATC TCTTGCACAC  ATTCCTTCAA TTCCAATTCT ATCTGCTGCT GCTCTTCCTT CTTCTGCTAA AGCAAGGCAC TCACCAGAGC CTGGTGCTCT CTATCCACCA TCCTCTGCAC CAATTCCTTC ATCAGTGCCT  ACTATAACTC GAGCTTCTCC TACTCTTCCG CCTCCCGCGT CTTCCATTCC ATCTCCATCT CCGTTCCCTC CCCAATCCAA TACTCCGTCA TTGCGTGTTA ATGCTTTTCC GGAGCCTGAG 
ATCGCATTGG AGTGA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
CTGCAGTATT CTTCTGAACT AATATAAGAC TACAACTATT AAATTAATCA TGATCAATGA TTATCAGAGA AACTGTATTC AACTGCTCCT TTAAAGCTTA TACCATATAT AATTTTCTAT  CTTTTCTCAT AGTTTAGTTT AGTCAATGCA CAAGCAGAGG ATCGATCTCA CAGTCTGCCA TTGAAAGGAG AAGAAATCAT TGATCAGAAA AATGGGTTAT AATTATTACT GCATAGTTTT  GATGGTGATT GTTCCACATT TGGCAATGGG TATGTCACAG ATGAATTCCT TCAGCCTTTG GGGGCGACAA TTTCCATTGC CTGCACCAAT AGCTGGATTG GATTATACCT TCTATGATAA  TACCTGCCCA CAGGCAGAAG GCATTGTTAG ATCCCGGATT GATTATTTCA TGGACGAAGA CATCACTCAA GCTGCTGGGT TGCTTCGCTT ATTTTTTCAG GACTGCTTTG TGCATGGATG  TGATGGATCA GTACTCCTTA CAGGTTCTGC AAGTGGTCCC TGGGATACAA ATGCAGCCCC TAATATGTTA TTAAGGCCAG AGGTTTATGA GATAATTGAT GACATAAAGA TGCATCTGGA  AGCTGAGTGC CCTCAAGTTG TTTCCTGTGC AGACATCATC TCTCTTGCTG CCAGGGATGC CATTTTAGCT GCTGAAGGCC CATACTTTCC CATTCCAACA GGCCGGAGAG ACGGCATCGT  TTTGGACACT GCAGAAGACA CATTAAAAAA TATCCCACCA CCCACCTCAA ACGTTTCTCA GCTACTCAAA CTTTTCAAGT CCAAAGGATT GGATGTTGTG GATCTCGTTG CTCTCTCAGG  AGCACACACC CTAGGCAAAG CTCACTGCAG TTCCTTCTCC TACAGGCTTC AACCCTTGGA CCCTCGCCTG AACAAGAAGT TTGCTCTGAA GTTGCTTCAG ATTTGTCCAG CAAACAACTC  TACCAATGCC ACTGACATTG ATTATAATTC TCCCAGGGAA TTTGACAACA AGTACTACAA ACACCTGAAG AAGCAGGAAG GACTGTTCAC TTCTGATGAA GACCTGTTCT ATGATGCTAG  AACCAGAGAG TTGGTGATGG AATTTGAGGA TTCTGAGTTC TTGTTCTTCC TTCAATTTGC TCTGTCTGCC ATTCAAATGA GCCAAATGGG TGTTCTTACA GGTGCAGATG GAGAGATCAG  GTTGAACTGC TCACAACCCA ACTTCATACA ACCGCCTGCA TCACCATCCT CTGCACCAAT TCCTTCACTT CCATCACCAT CTCTTGCACA CATTCCTTCA ATTCCAATTC TATCTGCTGC  TGCTCTTCCT TCTTCTGCTA AAGCAAGGCA CTCACCAGAG CCTGGTGCTC TCTATCCACC ATCCTCTGCA CCAATTCCTT CATCAGTGCC TACTATAACT CGAGCTTCTC CTACTCTTCC  GCCTCCCGCG TCTTCCATTC CATCTCCATC TCCGTTCCCT CCCCAATCCA ATACTCCGTC ATTGCGTGTT AATGCTTTTC CGGAGCCTGA GATCGCATTG GAGTGAAATT TCAGCAATTC  GAGCAGCATC TTAATGCAAT CCACTCGATA AAAGGGATAT TTTTTTCTTT TTTAATTTAA CAGCGTGGAA GAGAGATTTT TAAAAAAAAT GCAATGTAAG ATGCTTTGTT TAGTTTTGTT 
TTACGCTTTA TAAGAGGGGT GAAGCTAATG CCTTTAGCCT AGAAGATCTC CATCAAGTTT TTCTAGCACC A 

Retrieve as FASTA