Entry information : TmatAPx-CcP01
Entry ID 13105
Creation 2015-03-18 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2015-03-18 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2015-03-18 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: TmatAPx-CcP01
Name TmatAPx-CcP01
Class Hybrid Ascorbate-Cytochrome C peroxidase    [Orthogroup: APx-CcP001]
Taxonomy Eukaryota Fungi Basidiomycota Agaricomycetes Tricholomataceae Tricholoma
Organism Tricholoma matsutake    [TaxId: 40145 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value TmatAPx-CcP01
start..stop
S start..stop
LbiAPx-CcP 630 0 1..572 1..573
LameAPx-CcP01 629 0 1..572 1..565
HsubAPx-CcP02 613 0 16..562 17..560
HcyAPx-CcP02 613 0 14..592 19..599
Literature and cross-references TmatAPx-CcP01
DNA ref. JGI genome:   scaffold_41 (483610..485785)
Cluster/Prediction ref. JGI gene:   1252519
Protein sequence: TmatAPx-CcP01
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   598 (577)
PWM (Da):   %s   65181.25 (62875.1)  
PI (pH):   %s   5.84 (5.65) Peptide Signal:   %s   cut: 21 range:21-597
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MLHFPFCFSL VLILAASCLS YPDIRYDTLE RLVYEGRKAD GSSLASIVHP CRYRPGTNGS IAAEWLRFAF HDAITHNKSD GSGGVDGSIA YELGRSENLA VGLNNSLGDF AAYPNKYTSR  SDIIALAAVF AVATCGGPVI PYRAGRSDSW TAGPPGVPVP QQDIQTLISM FQNSGFDSSE MIQLVACGHT LGGVRSTDFP ELVPPGPNPA APQFSNFDTS SSYDNLVVTQ YLDGITQNPL  VVNSHKNMTS DMRIFSSDSN TTVRSMVSPA AYSSTCQSIL ERMINLVPGN VTLTPPITLL PVKVQDVQLT FERNTLVFKA SLRLLQEIGA PINTNRTVTM LWCDKRGGTA NCNGVTRSAL  PASTVNEDPN LSPMTQRQNY SFINYNFVFP VDPVASISGF WFRVDEKNGS TPSVYNNGGS NYVVEQDQLL FVPMLSHQVL ADSSQPQRRG GSGPSGVNYF KEYTIVAAVR EDSNISRVYM 
HAVDMATPNF TAPFNSTIVL QRNDTIAPTQ GYSFYTSSAF PHNGFQLTLD MYGVTPNGTL YYQDFMQTTF LDNTPYVAPT LVSNTTKSQS SSGRLIDEWW KAQLYLSAAG LLLRTLI* 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic (7 introns)
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGCTTCACT TTCCTTTTTG TTTTTCACTA GTCCTTATCC TTGCTGCCTC ATGTCTCTCG TATCCGGATA TCCGATATGA CACTCTTGAA CGCCTTGTGT ATGAGGGACG CAAAGCAGAT  GGTTCTAGCT TAGCATCCAT TGTTCATCCA TGCCGATACA GGCCTGGCAC CAATGGTTCC ATTGCCGCTG AATGGCTACG CTTCGTAAGT ATTCCTTTTT CTCGATGTAT TCTCGGTGTC  ATAGTTGAAT CCAGGCTTTT CATGACGCGA TCACGCACAA TAAGTCTGAT GGAAGCGGAG GTGTAGACGG CTCAATAGCA TATGAGCTTG GCCGGTCAGA GGTGCGTCTG GTCTTACCTT  CAACAGCCGA AGTTAAACGT GTACTCATCT AACAGAACCT CGCTGTCGGA TTGAATAACT CATTAGGAGA CTTCGCGGCG TATCCCAACA AATACACATC TCGTAAGTCT ATTTTCAAAT  GATAGCGGAA GATATAATAG CCCTTACAGT TCATTGGCAG GCTCCGACAT AATAGCACTT GCCGCTGTCT TTGCTGTTGC AACCTGCGGC GGGCCTGTCA TTCCATATCG AGCTGGTCGC  TCTGATTCTT GGACCGCAGG GCCTCCTGGA GTTCCGGTGC CGCAGCAGGA CATCCAAACG CTTATCTCGA TGTTTCAAAA TTCAGGCTTT GATTCTTCAG AAATGATCCA GCTCGTCGCA  TGTGGTCATA CACTCGGTGG TGTGCGAAGT ACCGATTTCC CTGAGCTTGT CCCTCCTGGC CCAAACCCGG CCGCTCCACA GTTCTCCAAC TTCGATACCT CCTCCTCTTA CGACAATTTG  GTGTAAGCAT GGCCCACACC TTTTGCGAAC TTTCATTGAT ATATTGTTAC GTGTCCTCAG GGTGACGCAA TACCTAGATG GAATCACTCA AAATCCTCTT GTCGTTAACT CACACAAAAA  TATGACGTCC GATATGAGGA TCTTTTCTTC AGACTCCAAT ACCACCGTGC GCAGGTCAGT CCATCTCAAG TATTACGTTA CTTCATTATC TTCATATTGA TCTTTCTCTA GCATGGTATC  GCCGGCTGCG TACTCCAGCA CATGTCAAAG CATCTTGGAA AGGATGATCA ACCTGGTCCC AGGCAATGTT ACACTCACCC CACCAATCAC GTTGCTCCCT GTCAAAGTCC AGGATGTTCA  GCTAACCTTT GAGCGGAACA CGCTTGTATT CAAAGCTTCT CTTCGTGTAA GCGCCATTCA GTATATTAAC TTTTTCATCT CGCTGATGGC ATTGAAATTC AGCTGCTACA AGAAATTGGA  GCCCCCATCA ACACGAATCG CACTGTTACG ATGTTGTGGT GCGACAAACG CGGGGGAACC GCGAATTGCA ATGGCGTAAC GAGGTCCGCT CTGCCTGCAA GCACAGTTAA TGAAGACCCC  AACCTTTCCC CCATGACACA ACGCCAAAAC TACTCTTTCA TCAATTACAA CTTCGTTTTC CCCGTCGACC CTGTTGCTTC CATTTCCGGG TTCTGGTTCA GGGTGGACGA GAAGAACGGC  AGCACTCCTT CTGTGTATAA TAACGGCGGG AGTAACTATG TGGTAGAGCA AGACCAGCTC CTTTTCGTCC CGATGCTCAG CCACCAGGTT TTGGCAGACT CGTCCCAGCC ACAGCGAAGA  GGGGGAAGTG GTCCTTCCGG GGTGAATTAT TTCAAAGAAT ACACTATTGT CGCTGCGGTA TGGTCATGCA AGCCGTTTTG CCATGTTTAT CTCACCCGCC TCGTAGGTCC GAGAAGACAG  CAATATCTCA AGAGTCTACA TGCACGCAGT GGACATGGCC ACCCCGAACT TCACTGCGCC ATTCAATAGT ACTATTGTCC TGCAGCGCAA CGACACCATC GCGCCTACGC AAGGGTACTC  GTTCTATACT AGCTCCGCCT TCCCACACAA CGGGTTCCAA TTGACGCTGG ATATGTATGG CGTCACGCCC AATGGGACCC TGTATTACCA AGACTTCATG CAAACGACAT TCCTGGACAA  TACGCCGTAT GTTGCACCGA CGTTAGTATC AAATACGACC AAATCACAGT CGTCATCCGG GAGACTGATC GACGAGTGGT GGAAGGCGCA GTTATATTTA TCTGCTGCTG GTCTATTGCT 
GAGAACTTTG ATATAA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGCTTCACT TTCCTTTTTG TTTTTCACTA GTCCTTATCC TTGCTGCCTC ATGTCTCTCG TATCCGGATA TCCGATATGA CACTCTTGAA CGCCTTGTGT ATGAGGGACG CAAAGCAGAT  GGTTCTAGCT TAGCATCCAT TGTTCATCCA TGCCGATACA GGCCTGGCAC CAATGGTTCC ATTGCCGCTG AATGGCTACG CTTCGCTTTT CATGACGCGA TCACGCACAA TAAGTCTGAT  GGAAGCGGAG GTGTAGACGG CTCAATAGCA TATGAGCTTG GCCGGTCAGA GAACCTCGCT GTCGGATTGA ATAACTCATT AGGAGACTTC GCGGCGTATC CCAACAAATA CACATCTCGC  TCCGACATAA TAGCACTTGC CGCTGTCTTT GCTGTTGCAA CCTGCGGCGG GCCTGTCATT CCATATCGAG CTGGTCGCTC TGATTCTTGG ACCGCAGGGC CTCCTGGAGT TCCGGTGCCG  CAGCAGGACA TCCAAACGCT TATCTCGATG TTTCAAAATT CAGGCTTTGA TTCTTCAGAA ATGATCCAGC TCGTCGCATG TGGTCATACA CTCGGTGGTG TGCGAAGTAC CGATTTCCCT  GAGCTTGTCC CTCCTGGCCC AAACCCGGCC GCTCCACAGT TCTCCAACTT CGATACCTCC TCCTCTTACG ACAATTTGGT GGTGACGCAA TACCTAGATG GAATCACTCA AAATCCTCTT  GTCGTTAACT CACACAAAAA TATGACGTCC GATATGAGGA TCTTTTCTTC AGACTCCAAT ACCACCGTGC GCAGCATGGT ATCGCCGGCT GCGTACTCCA GCACATGTCA AAGCATCTTG  GAAAGGATGA TCAACCTGGT CCCAGGCAAT GTTACACTCA CCCCACCAAT CACGTTGCTC CCTGTCAAAG TCCAGGATGT TCAGCTAACC TTTGAGCGGA ACACGCTTGT ATTCAAAGCT  TCTCTTCGTC TGCTACAAGA AATTGGAGCC CCCATCAACA CGAATCGCAC TGTTACGATG TTGTGGTGCG ACAAACGCGG GGGAACCGCG AATTGCAATG GCGTAACGAG GTCCGCTCTG  CCTGCAAGCA CAGTTAATGA AGACCCCAAC CTTTCCCCCA TGACACAACG CCAAAACTAC TCTTTCATCA ATTACAACTT CGTTTTCCCC GTCGACCCTG TTGCTTCCAT TTCCGGGTTC  TGGTTCAGGG TGGACGAGAA GAACGGCAGC ACTCCTTCTG TGTATAATAA CGGCGGGAGT AACTATGTGG TAGAGCAAGA CCAGCTCCTT TTCGTCCCGA TGCTCAGCCA CCAGGTTTTG  GCAGACTCGT CCCAGCCACA GCGAAGAGGG GGAAGTGGTC CTTCCGGGGT GAATTATTTC AAAGAATACA CTATTGTCGC TGCGGTCCGA GAAGACAGCA ATATCTCAAG AGTCTACATG  CACGCAGTGG ACATGGCCAC CCCGAACTTC ACTGCGCCAT TCAATAGTAC TATTGTCCTG CAGCGCAACG ACACCATCGC GCCTACGCAA GGGTACTCGT TCTATACTAG CTCCGCCTTC  CCACACAACG GGTTCCAATT GACGCTGGAT ATGTATGGCG TCACGCCCAA TGGGACCCTG TATTACCAAG ACTTCATGCA AACGACATTC CTGGACAATA CGCCGTATGT TGCACCGACG 
TTAGTATCAA ATACGACCAA ATCACAGTCG TCATCCGGGA GACTGATCGA CGAGTGGTGG AAGGCGCAGT TATATTTATC TGCTGCTGGT CTATTGCTGA GAACTTTGAT ATAA 

Retrieve as FASTA