Entry information : HbAPx02
Entry ID 13117
Creation 2015-04-08 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2016-01-04 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Achraf Jemmat
Last annotation changes 2016-01-04 (Achraf Jemmat)
Peroxidase information: HbAPx02
Name HbAPx02
Class Ascorbate peroxidase    [Orthogroup: APx002]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Euphorbiaceae Hevea
Organism Hevea brasiliensis    [TaxId: 3981 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value HbAPx02
start..stop
S start..stop
MeAPx01 644 0 1..359 17..375
MeAPx05 642 0 1..359 16..373
PbAPx04 591 0 50..358 1..309
PtAPx08 595 0 1..358 1..353
Literature and cross-references HbAPx02
mRNA ref. GenBank:   KF932265.1
Protein sequence: HbAPx02
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   359
PWM (Da):   %s   39074.99  
PI (pH):   %s   8.69
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MASLTGTASS RLLPSVYRAR ISLSSSSSAS SYLSPLSLSS SSSYSLSPLK CLRSSPLLPH FFLNQKRSSM STVAAASDPA QLRSAREDIK VLLKSKFCHP ILVRIGWHDA GTYNKNIEEW  PKRGGANGSL RFEIELKHGA NAGLVNALNL LQPIKDKYSG VTYADLFQLA SATAIEEAGG PKVPMKYGRV DISAPEQCPE EGRLPSAGPP KPADHLREIF YRMGLNDQEI VALSGAHTLG 
RSRPDRSGWG KPETKYTKNG PGAPGGQSWT VEWLKFDNSY FKDIKERRDE DLLVLPTDAV IFEDPSFKVY AEKYAEDQEA FFKDYAEAHA KLSNLGAKFD PPQGIVLDGV AGEKFVAAN 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from CDS.
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCGTCGC TTACTGGCAC CGCCTCTTCT CGTCTTCTGC CTTCCGTTTA TCGAGCTCGA ATCTCTCTCT CTTCATCTTC TTCTGCTTCT TCCTATCTTT CTCCCCTCTC TCTCTCCTCC  TCTTCCTCTT ATTCTCTGTC TCCTCTCAAA TGTCTCCGAT CTTCTCCCCT CCTTCCTCAT TTCTTCTTAA ATCAGAAACG ATCGTCGATG AGTACGGTAG CTGCGGCGTC GGATCCTGCT  CAGCTGAGGA GTGCGAGAGA AGATATCAAA GTGCTTCTCA AGTCTAAGTT TTGCCATCCT ATTCTGGTTC GAATAGGATG GCATGATGCT GGTACATATA ACAAGAACAT AGAGGAATGG  CCTAAGAGAG GTGGAGCCAA TGGAAGTCTC AGATTTGAAA TTGAGTTGAA ACATGGAGCC AATGCTGGCC TGGTGAATGC ATTGAACCTT CTTCAGCCTA TCAAGGACAA GTACTCTGGT  GTGACATATG CAGATTTGTT CCAGTTGGCC AGTGCTACTG CTATAGAGGA AGCTGGAGGG CCCAAAGTCC CCATGAAGTA TGGAAGGGTG GATATTTCAG CACCCGAACA GTGTCCTGAA  GAGGGGAGGC TTCCTAGCGC TGGCCCCCCT AAACCTGCGG ATCATTTGCG AGAAATTTTT TACAGAATGG GTTTAAATGA CCAGGAAATA GTTGCATTAT CTGGTGCACA CACCCTAGGA  AGGTCCAGAC CTGATCGCAG TGGTTGGGGA AAACCTGAGA CAAAGTATAC GAAAAATGGA CCAGGAGCAC CAGGAGGACA ATCCTGGACG GTAGAATGGC TGAAGTTTGA CAACTCCTAC  TTCAAGGATA TCAAAGAAAG AAGGGATGAA GATTTACTTG TATTGCCAAC TGATGCTGTT ATTTTCGAAG ATCCTTCATT CAAGGTATAT GCCGAGAAAT ATGCTGAAGA TCAGGAGGCG  TTCTTCAAGG ACTATGCTGA AGCCCATGCC AAGCTCAGCA ACCTTGGAGC CAAATTTGAT CCTCCCCAGG GTATTGTGTT AGATGGAGTT GCAGGAGAGA AATTTGTGGC AGCCAACTAA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
GAGGAGGGAC AAATAGAAGT GCAACTACAA ATCGCCAATG GCAGAGTGCT TGTCACACTT GACACTATCG CCGTCGCCAA CAAAAATGGC GTCGCTTACT GGCACCGCCT CTTCTCGTCT  TCTGCCTTCC GTTTATCGAG CTCGAATCTC TCTCTCTTCA TCTTCTTCTG CTTCTTCCTA TCTTTCTCCC CTCTCTCTCT CCTCCTCTTC CTCTTATTCT CTGTCTCCTC TCAAATGTCT  CCGATCTTCT CCCCTCCTTC CTCATTTCTT CTTAAATCAG AAACGATCGT CGATGAGTAC GGTAGCTGCG GCGTCGGATC CTGCTCAGCT GAGGAGTGCG AGAGAAGATA TCAAAGTGCT  TCTCAAGTCT AAGTTTTGCC ATCCTATTCT GGTTCGAATA GGATGGCATG ATGCTGGTAC ATATAACAAG AACATAGAGG AATGGCCTAA GAGAGGTGGA GCCAATGGAA GTCTCAGATT  TGAAATTGAG TTGAAACATG GAGCCAATGC TGGCCTGGTG AATGCATTGA ACCTTCTTCA GCCTATCAAG GACAAGTACT CTGGTGTGAC ATATGCAGAT TTGTTCCAGT TGGCCAGTGC  TACTGCTATA GAGGAAGCTG GAGGGCCCAA AGTCCCCATG AAGTATGGAA GGGTGGATAT TTCAGCACCC GAACAGTGTC CTGAAGAGGG GAGGCTTCCT AGCGCTGGCC CCCCTAAACC  TGCGGATCAT TTGCGAGAAA TTTTTTACAG AATGGGTTTA AATGACCAGG AAATAGTTGC ATTATCTGGT GCACACACCC TAGGAAGGTC CAGACCTGAT CGCAGTGGTT GGGGAAAACC  TGAGACAAAG TATACGAAAA ATGGACCAGG AGCACCAGGA GGACAATCCT GGACGGTAGA ATGGCTGAAG TTTGACAACT CCTACTTCAA GGATATCAAA GAAAGAAGGG ATGAAGATTT  ACTTGTATTG CCAACTGATG CTGTTATTTT CGAAGATCCT TCATTCAAGG TATATGCCGA GAAATATGCT GAAGATCAGG AGGCGTTCTT CAAGGACTAT GCTGAAGCCC ATGCCAAGCT  CAGCAACCTT GGAGCCAAAT TTGATCCTCC CCAGGGTATT GTGTTAGATG GAGTTGCAGG AGAGAAATTT GTGGCAGCCA ACTAATCTGG AAAGGATTAA GAAACAAGTA ACTTGTTTTG  TAGTGCTGTA TCTTTTAATA ATACAGGATG AAGCTATTCG CATCGTAAGA GTACACATCT AAAACTTGGC AGTCTAACTG AAGGAGAAGC AGAAGATACA AGCAGAGTAT GAAGCGCTTA 
GTGGAAGCCC TGATAAATCT CTACAGTAAC TATTTTTCTA AATATCGTGA TTGTGATTGC TGTTTTGGCC TTTTT 

Retrieve as FASTA