Entry information : GbPrx49(Ginbil_Gb_33424)
Entry ID 13141
Creation 2015-04-14 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2015-04-14 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2020-11-23 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: GbPrx49(Ginbil_Gb_33424)
Name GbPrx49(Ginbil_Gb_33424)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx029]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Ginkgoopsida Ginkgoaceae Ginkgo
Organism Ginkgo biloba    [TaxId: 3311 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value GbPrx49
start..stop
S start..stop
GbPrx29 524 0 21..344 5..328
SmPrx80-1_13 385 1e-134 18..344 6..327
SmPrx80-2_66 384 3e-134 30..344 10..321
ApuncPrx29 367 2e-127 41..344 32..333
Literature and cross-references GbPrx49(Ginbil_Gb_33424)
Protein sequence: GbPrx49(Ginbil_Gb_33424)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   344
PWM (Da):   %s   37508.59  
PI (pH):   %s   10.36
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MHKNHSRRLG LKDNMVGYLR RVMVIILLVL VTLFGRGVEG KLSVNFYGRT CPQMESVIRA VMVQKLKEAP LITAPSTLRL FFHDCFINGC DGSVLISSTQ TNQAERDAPP NLSLAGDAFD  VVVRAKRALE KTCPGVVSCA DILAVLARDA TVLVNGPSWP VLKGRRDGRV SSAAYANANL PGSNFHVNQL IKNFASKGLS AMDMVILSGA HTIGNSHCNE VTKRLYEFSP SRPTDPTIEG 
SFAKVLKQAC PAAGGDPNVV QPFDRLTPFK FDNLYYTNLV KRRGLLTSDQ VLFSDPRTRT AVVQFASNQT RFFKAFAGAM LKLGNVGVKT GLHGEIRRDC TKFN 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic (uncorrect prediction from SymDB, splicing error) and RNa seq (gba_locus_53879_iso_1_len_973_ver_2, fragment are missing). No EST found.
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGCACAAAA ATCATTCAAG AAGACTAGGC CTTAAGGACA ACATGGTTGG GTACTTGAGG AGAGTCATGG TGATTATTCT GCTTGTTTTG GTCACTTTGT TCGGAAGGGG TGTGGAAGGG  AAGCTGTCTG TGAACTTTTA TGGAAGGACA TGTCCTCAGA TGGAGTCTGT CATTAGGGCT GTTATGGTGC AGAAGCTTAA GGAGGCCCCC TTAATCACTG CTCCTTCTAC TCTTAGGCTC  TTCTTCCATG ATTGCTTTAT TAATGTAAAA TATTCATCCA CCATAGATAA GCAAGCCATT GTCTTCTCAT GAAATATATA TATATATATA TATATTGTCT TCTATTCTCA GGCTCTTCTT  CCATGACTGC TTTATCAATG TAATATATTC ATCCACCATA AATAAGCAAG CCATTGTCTC CTCCTGAAAT ATTATATACA GTGTATATAT ATATATATAT ATATATACAG CCATGAACAG  ATGTTCTAGC ACAAGTAGCA ACTTAGAGTT GGGCATGTAT ATCTTATATT ATATAATTAC AGTGAATATT GCTGCAGGGA TGTGATGGAT CAGTGTTGAT TTCATCTACT CAAACTAATC  AAGCTGAAAG AGATGCACCT CCCAATCTGT CATTGGCAGG AGATGCATTT GATGTGGTTG TGAGAGCCAA AAGGGCATTG GAGAAGACCT GTCCAGGAGT GGTTTCATGT GCTGATATTC  TTGCTGTCTT AGCCCGAGAT GCTACTGTAC TGGTATATTG CTTCAACCCA AGCTTTTGAT GAAGTAAGTA CATATATACA TACATACATA CATACATACA TATATATATA GATAGATAGA  TAGATAGATA GATAGATAGA TATAGATATA AATATATATG TATGTATATG TATATATATA TACATACATA TACATATACA TATACATACA TACATACATA TTTATATATG TATGTATACA  CAATAATATA TATATATATA CATATATGTA TATATACATA TACACATATA TACACACACA GATAGAGAGA CAGATATGGA CATAATTATA TACATAATTA ACTTGGTTAT GGGGTTAAGG  TCAATGGACC ATCATGGCCA GTACTGAAAG GGCGCAGGGA TGGACGAGTA TCTTCAGCAG CATATGCCAA CGCCAACTTA CCAGGATCCA ATTTTCATGT CAACCAGCTG ATAAAAAACT  TCGCTTCCAA AGGGCTCTCT GCCATGGATA TGGTTATTCT TTCTGGTAAA ACTATTATAT TTACATTCAT TTCACTTGAC AATTAGCCAT TCTAAAATCT GGAAACAGAC CAATTAAGAA  ATAGCAGAAA CACCATTGGA ATTCATCAAA ATATGTTATA TATATGCATT AACATTTACA TTGAGCAGGA GCACATACAA TAGGCAATTC ACACTGCAAC GAAGTGACCA AAAGGCTCTA  CGAATTCAGC CCATCAAGAC CAACAGACCC TACGATTGAA GGGTCATTTG CAAAAGTACT GAAACAAGCA TGCCCTGCTG CTGGTGGCGA CCCCAACGTA GTTCAGCCAT TCGACCGCCT  CACTCCCTTC AAGTTTGATA ATTTATACTA CACAAACCTT GTGAAACGCC GAGGACTTCT CACGTCGGAC CAAGTTCTCT TCTCGGACCC TCGGACTCGT ACAGCTGTGG TGCAGTTCGC  CAGCAACCAG ACTCGTTTCT TCAAAGCTTT TGCAGGTGCC ATGCTGAAAC TGGGAAATGT TGGAGTTAAG ACTGGTCTTC ATGGCGAGAT CAGAAGGGAC TGTACCAAAT TCAACTGATT  GAATATAAAA AGGTATAATG AGAATGTTAA CAAACATGTT CACATGATGG GATTTCTATG TTTGATCATT GGTTTATGTT GTTATTGGGT TGTTGGGTAG TGTGTCACGT CTAAACCTAA  GTTGATTGAA ATAGAATGAA GGGATAAGCA TTCAAAGATT TTTGGTATGG ACGTCACGTA TTGCTCATGT ATTGCTCAGC AAGAATGGCT TTAACACGGA CAAAATTTTC TTATAATAGT 
TAAACAATGT GTAGTTGGTA TTTTTTTTCT TCTAATAGTT AAACAATGTG TAGTAAGTAA TTTTCTTTGT CAAGTATTGA ATAATTAACT ACAGAAGATT ATATTGATAG AGTT 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGCACAAAA ATCATTCAAG AAGACTAGGC CTTAAGGACA ACATGGTTGG GTACTTGAGG AGAGTCATGG TGATTATTCT GCTTGTTTTG GTCACTTTGT TCGGAAGGGG TGTGGAAGGG  AAGCTGTCTG TGAACTTTTA TGGAAGGACA TGTCCTCAGA TGGAGTCTGT CATTAGGGCT GTTATGGTGC AGAAGCTTAA GGAGGCCCCC TTAATCACTG CTCCTTCTAC TCTTAGGCTC  TTCTTCCATG ATTGCTTTAT TAATGGATGT GATGGATCAG TGTTGATTTC ATCTACTCAA ACTAATCAAG CTGAAAGAGA TGCACCTCCC AATCTGTCAT TGGCAGGAGA TGCATTTGAT  GTGGTTGTGA GAGCCAAAAG GGCATTGGAG AAGACCTGTC CAGGAGTGGT TTCATGTGCT GATATTCTTG CTGTCTTAGC CCGAGATGCT ACTGTACTGG TCAATGGACC ATCATGGCCA  GTACTGAAAG GGCGCAGGGA TGGACGAGTA TCTTCAGCAG CATATGCCAA CGCCAACTTA CCAGGATCCA ATTTTCATGT CAACCAGCTG ATAAAAAACT TCGCTTCCAA AGGGCTCTCT  GCCATGGATA TGGTTATTCT TTCTGGAGCA CATACAATAG GCAATTCACA CTGCAACGAA GTGACCAAAA GGCTCTACGA ATTCAGCCCA TCAAGACCAA CAGACCCTAC GATTGAAGGG  TCATTTGCAA AAGTACTGAA ACAAGCATGC CCTGCTGCTG GTGGCGACCC CAACGTAGTT CAGCCATTCG ACCGCCTCAC TCCCTTCAAG TTTGATAATT TATACTACAC AAACCTTGTG  AAACGCCGAG GACTTCTCAC GTCGGACCAA GTTCTCTTCT CGGACCCTCG GACTCGTACA GCTGTGGTGC AGTTCGCCAG CAACCAGACT CGTTTCTTCA AAGCTTTTGC AGGTGCCATG 
CTGAAACTGG GAAATGTTGG AGTTAAGACT GGTCTTCATG GCGAGATCAG AAGGGACTGT ACCAAATTCA ACTGA 

Retrieve as FASTA