Entry information : SpolAPx06 (Spipo11G0041800)
Entry ID 13246
Creation 2015-06-09 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2015-06-17 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2015-06-17 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: SpolAPx06 (Spipo11G0041800)
Name (synonym) SpolAPx06 (Spipo11G0041800)
Class Ascorbate peroxidase     [Orthogroup: APx003]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Monocotyledons Araceae Spirodela
Organism Spirodela polyrhiza (great duckweed)    [TaxId: 29656 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value SpolAPx06
start..stop
S start..stop
MtAPx05 338 2e-118 1..232 39..269
LeAPx06 330 9e-115 1..221 39..258
ZaAPx02 328 2e-114 1..243 39..288
LsaAPx02 327 1e-113 1..243 39..285
Literature and cross-references SpolAPx06 (Spipo11G0041800)
Protein sequence: SpolAPx06 (Spipo11G0041800)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   259
PWM (Da):   %s   28161.23 Transmb domain:   %s   o215-237i
PI (pH):   %s   7.28
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
WHDAGTYDSK TGTGGPNGSI RNEAELRHAA NSGLKTAVDF CLSVKVKCPR MSHADLFQVI HPNKLAGVVA VEITGGPTVD FDSLNSPEEG RLPDAKQGAA HLRVVFGRMG LSDKDIVALS  GGHTLGRAHA ERSGFDGQWT QDPLRFDNSY FINLLASENE GLLKLPTDRA LVDDPALRRY VELYSKDEEA FFRDYAESHK KLSELGFTPP SAARWLCVQG ALGATIAAAM ALSFCLVFYR 
RAKDPESHSK LKVGYLRC* 

Retrieve as FASTA  
Remarks Partial sequence from genomic. First exon is missing due to N in the sequence. Incorrect prediction from Phytozome (fusion of two ORF and extra sequence).
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAAAGAGC AGTGGGTTGA CAAGCATAGA CCGTGTTCCA TTGCTGAGCT TGCTGTACAT AAAAAGAAGG TTATTTGTCT TTTAAGTTGC ATTGCCTTTC TCGTTTGGTA TCCTATGTAG  TATTTACCCA GGATCGCACG AATCATTAAA ATTATTTTCT GCTTTTGTGA GCCGAACCGG GAAAGTCTGA ACCTTTTTGT TTGTCTGCAT GCATTTTTGT GGTGTTATGA TTGATCAGTT  TCCTAGGTGA ATCGGTCTCC TTGATTATGG ATAATCACAG ACATACATAT TCTTTTATCT ATTTCGATGC ATTGTGCACC GGGATTATCG AGTTACGCAT AAAAGTTTTC CAAAATTATT  TTTCATGTAT ATAAAGAGTG AATCGTTGAT CGGACCAAGC ATTTGTGCTA TTAAGCTGCT TATGTTTAAC AGTGAGCCCT GAATGCCAAC ATTGGTTATC CACACTGGAC CTGCACAGTA  AATGTCTACT TATATTCTCT TGCATAAAGT TGCATTTTCG TTTACATGCT TTATGTGCAT GCCTTAATTG TAGTTGTATT TTTTTCTAAT TTGTGCCATT TGTTTTGTAT CCCAGGTCGA  GGAAGTGCGA GTCTGGTTGG AAGAGAGAAT AAACGCACCA AAGGTGATTT TGTCTGGTTG ATTGAAAAAT TCATTTCTTC TAGAAAAATA TTCATAATAG TAATCGCATT GTTTTTGAGA  CCGTATAGAG CCTTGGAAGT ACGATCTTAT TTGCCAAACC TGAATGATAA ATTCCTCAAA ATCTTTTATC TCCACTGGGA TTGCTTGGGA TTTTTGTCCC CTTTCCTCTG AACTGATGCT  TCTACCATAG TTTTGTGTAT ATTTTTAACG GATATACGTT AAATTAATAT GTTTTCGTGT AATGTTTAAT AAAATTATTC GTTACTTTTG GTAACCAATG TTGTAATGTT TTTGAAATAT  TTCTTTGGAG TTAACTTTTG AACCTTGATA TAAATTATCC TATTACTTGT TTTTGTTCCT TTTTCTCTGG GTCCATATTA TTGTTGATCA TGTTTCCATT GGTCGTCAGC TTCTGGCGAG  GACATGGGAA TATTAACACT CTGGTATCTA GTCATCACTG TATTTTATCC ACATAAGTTA TGATGAACTT TTCGATGATG TTGAAGGTCG AACACTGTAA ACTATCAAAA CATGTGATGA  ACACAATGGC TCTTCTGGGA ACCGTTAACT TATAAGCAAT GTTTAACCAA AACTGATGGA CACAATTTCT CCCTATGTTT CTAGATGTTA GATTGGCTGC GAAGTACACG TTTTTTTGTT  ATTTTGTCTG AGAAACTCTT TCTTGGTTCC TATATATCAC AATTTCCTAT AGTTTTCTCC TAGTTGTCTT TTTTTACAAT ATCCGAATAA AGGCCCGTCA AGTTTCTTGT AGGTCGTATG  CTTAACCAAA GCTTGTACTT TATTTCCAGG AAGGTATGCG CAATTATACT CTTCTCATTA CTGGACAAGC TGGAGTTGGG AAATCGGTAT GTTTTGTTTA GACATTGTGG CAATTTATTT  CTTTAATAAT ATTTCCTTTG TATCATAACT TGTGTGTTGG TTGTTCGATG TGTTTTCAAC AATTTCCTTT GATATGTAAA TAATTTTTTG TAAATGCTTG TTCACTGTTA GTGTATGAGT  TTTACTAATT GCTGTAGTTT TGAAGATTCG TCATTTTTTT GGTGCATGTG ATATCATCTG ATAGTTAAAT GTTGGATAAC GTCATCTTTT TAAATCTTTA AATCTCTATT GTATTTGTGA  TGAATTAAAC TTGAGTACTT TTTCAGAATG GTTGCTTGAG AGTATTTCCA AATCTCTGTT TTCTTCATAT CACCCTAATC ATTTTATGCA TTAAGTTAGG ATGATGTAAG GAGTTTTGTG  GAAGAAGTTT TCTCTCTGCT TTGTATTATA GACCTGTCGG TGAATGACCA TTGACTGTGT TGATGGACCA TGATATTTTG GGAAGGTATA GCTTGCACAT GTAAGAATAG TTCAGATCAT  TCATTTTCTA TTCATGAAAG TTCTTGCATC CATCGCAGGC TGTCATCCAT GCCATTAGTT CACAGCTTGA AGCTGAACTG TGTGAATGGA AGACCCCCAC ACCAACTCTC TGGAAGGAGC  ATATGCACAA CTCTAATTCA GGTTTAGTTT CTTTTTCGGT CATTCCTCCT ACGATCATCT GGCAAACTGG CCTAAGCTCT GTGACTATTT TCAGATCATG TGATTTTTTG TGTTGAATGC  TTTTGTGTGA ATAGGTGTGA GCTACATGTC AAAACTGGAC GAGTTTGAGA CATTTGTGAA TACCGTGAGG AAGTATCCTG TGCTTCCATC AACTCACGTA AATGGATTGA GAAAGCCTAT  TATCATGTTA ATTGATGATC TTCCTGTGAC GAGTGGGAAA GTTGCTCATG GAAGATTATG TGAATGCTTA CGTGCTCTGG CCTGTTCAAC TCAAGTTCCA ACTGTTATTT TGGTAACAGA  ATATTCTAAG GATGATTCTA ATGACGTCAG AGGAGGTTAT ATGGAGGAGC TAGTATCATC CCTAGAGAGA TCTGGAGCAT ATAAGGTAAT ATTATTCTAA ATAAGTATAT CCCAGATGCT  GAACTTTATT GTAACTTACT TGCATTGTTC TGTCTCGCAG GTGTGTTTCA ATCCTCTTAC TGCTAATTCG ATAAAAAAAA CTCTTTCCCT TATATGCCGA AAAGAGGAGT ACAATGTGCC  TGAAGAAGTC TTGAATCAGA TTGCGAGACT AAGTCAGGGC GACATCCGGC ATGCAATAAC GTCACTGCAA TACTTTTGTC TCAGTCCTGA ATCAAAGGAA TCTGCTACCC ATCCTGAAGG  AAATTCAGAT CTTGCTGCCT TGTCATCTTT AGTAATTGAC GTGGATAATT TTCCAAGTGG AAGAGTTACC ATACCATTTG GTAGAGACGA GACGCTCACT TTGTTTCATG CCTTGGGAAA  ATTTCTACAC AACAAGAGGG TGAATGGAGA TCCATCTTCC CTGGGTATAT TCTGATCCAT TTGCTAACTT ATTTGGCATC TGTATTGACG CAAAGTTTGC ATCCTTTGCT AGTTGCACTA  TCCGTTGCTC TCTCCAGTCT ATGATGCATG GATGGCTTAC AACTTCTTGC TTTTACTGCT TTGTAAATTT TCATCACCCT AACTCTACAG GTCCAAGACC AACTTTATTA AAATTCTGAG  ATTCACCTCA GGAACATTGG ACTCCATAGG GTCATTTAAT CCCTAGCGAG ATGTTGGAGA AGATGCAGAT GCCCTGAGAG ATGATTTTGG GAATCAGAAA AAGACAGAAT AGGCAGAAGG  GCAAGATGAA GAAATATGGC TTTAGGGATA TAGGAAGATA GTATGATTGT GTACATAAAA GAAGGAGATA GTATCAGGAA TGACATATTA TGACCAAAAT AAGCTAAGAA GCCTAGGAGA  TGGGCTGAAA GGAAAAATAC AGGTCGTAAT TACCCTGAAA GGAGCTTGAC CTTGATCAAC TTCTCTGATC CTTGAAAGTT TTATGGTGGG AACATAAATT CAGGGCCAAG TAGCCTCTCA  CTCATGTTGG TGGTTTGTGG TTTAATTTAA CTAGCAAAGA TCCTTTAGGA GAACTGCCCT ATGACTGCCC GAGGCCCGTA ATTACATAAT CGGTGCCTAT CGCTAGAAGG TTGCAGTTTC  TTGTTAGTAA TTTTTTTTTG TCTCCTCTCT GGGCATCGGA TGGCACAGAA CGTGAATAAA AATAAAAACG CAGAAAATTA CTCATCCAGC TGTGAACAAG CATGAACTGT GACTCTCCTT  CTATACTTTG CCATTATATT TCCTCTTCAC ACTTTTATGC TATGTGTGAG ATGGGCTTTT TTTAGGAATA TTTTCGGTGA ATGACAATGT TGTAATATGA TCCAGGAATG CAAAAGGGCG  CCCTGAGCGA GAGGCTTATG AGGCTTCCAC TTAAAATGGA TGCTCCAGAA GATGTCCTTT GCCAAGCTCA TGCTCAAGCG AGGCCAGTCG TCGATTTTCT CCATGAGAAT GGTAATCATA  CTATCATCGC CTTGGGTTTC TGTTTCTGCT ATGCATGGAG CAGTATTTTC CTTGATGCTC GATCTCAACT AGAGATATGG TCCCTGTGTC CGGTGGCATA ACCTAAATAA TGCAAAACAT  AAACGAAGAA GACTCTTATG AATGCGTTCC TCCCTTGTCC ACAATGTTGC AATTTCTTTC AAGAACTCGG TGATTTGTAA AGTTTGTACG AGTTTCCGAT CAAACATTGG CAAACGAGCA  TGAAGCCAAT CAAAATTGGA TTTTTTTAAA ACTAATTGGG ATTTTTTTTA ATCGCCAACC TTGGAAGCAC CGTTTTCCCC CCCTTGGGAA ACGGTGCTTC CAATCTTCTC CCCTTTTCTC  CGATCTGAAT TGAGCGAATT TCATCACAGT TCCGCTGGTC CGATTATAAT CTCTGCGACT TTATGATATG AGATTGAGCT GGATGGATTC AAGCCTAAGC TGTTTCCGAT CCGGCTAATA  TTCTTAACCA GGTTATGTGT GATCCAACCT GCTTCCCCCA TGCATTCCAG TTGTGGTAGC TGGATCAATC TAACTCAGAA CCAACAACTG GGTTCTCCCT CCCCATCCTC CCTGAGCACT  AAACCAGACT ACCCGGTCTG TATGATCCTC CTCTCCTTCA ACATGGTCCC TCTAGTCAAA CAAGTGCTTC AAATCATCTA GTCACGCTTC ATCATCATTC CACGCTCATG AAAAACCTAA  TACTGGCTTA TATTCTGGGA CTGATCAGGC TTGTCTACTA CTCTCAGTGC TTGATTTCTT GAGCGATGAA GCGGTGGACG ATGCCTGGAT CATAGCCTCC TACCTCAGCG ACGCCGACCA  TCTCCTCTCC GCCTCTTTCT CCCCAACGCG GGTACAGATG GTGAAGGGAA GCCATGGGCC TGAAACCCTC TTGCAGTCTG CTGCTGCCTG TGTTTCCGTC CGGGGGGTCT TATTCGGGAA  CTCACAGCCT TCAACGTCCA GGTTCAGTCT CCTCTCCCTC CCCGCTGATT CAAGTTTCTC TGGTAATAAT TTTGTCCCCC TTCGTCTAGG TGGCATTCGA TTCGACGCCC CAAGCTTTGG  GAAGTCGAGC AGTCGTCCAG ACGCAACAAG GTGGTTCCAC CCGTCTTCTT CTCCTTCGGA AAACCCTAGA TTTGGACTGT AATTACTTAT TCATCTAGTG TGGAGCTCGC AGGCTCTCAT  GGCGTCGGAG AGGTTTGAGC TTCAAGCCCA CTGCGGCTTG CAGGCCCTGG CCAGTATAGC AGAGCTGGCT TCTGAACACA AGCCCATGGC GAGATGGCCG GGGCTGGTGC GGCCAGATGG  CCAAGATGGA GGCCTCGTTT TGCAGGATAA CGAGGAGGAC GAGGATGACA TCCAAGAATG GTAATGCCTT CCAAACCAGG GTTTTTTTTC CCCGTTTTTT GTTCATGGGG TGTGTGATTT  GATGCTCCTC ATCCAAATCC TCATCCTCCC TGTATAGTCT GAGCTTCCCC TTCTTGCGGC GGGTGTAAAT CTTTTTAAGC CAGTGTGGTG GTGCTGATTA TGGGAATGTA CATGTTCTTC  CTAGTAGAGT AGATTAGAGA GAGAGAGnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnT CCTCTCTCTC TCTCTCTCTC TCTCTCTCTC  TCTCTCTCTG TATTCCGGCC GCTGCTGCCT GCATATCCGC GGCTGCTCCT CTCGCAGATG GCACGACGCC GGCACCTACG ACTCCAAAAC GGGCACCGGC GGCCCCAACG GCTCCATTAG  AAACGAGGCT GAGCTCCGGC ACGCCGCCAA CTCCGGCCTG AAGACAGCCG TTGACTTCTG CTGTGAGCTT CACCCCCCCT CCCCTCCTCT TGAGCCCTCC TCCCTCCACA TGAAGTAGCT  TTTCCATGTG CTGGATTCCT AACTCCCTTC CATCTCCCCT GTTCTTTCCC AGTGTCGGTG AAGGTCAAGT GCCCAAGAAT GTCCCATGCA GACCTCTTCC AGGTTATCCA TCCCAACAAG  GTCTTCTGCA TCTGCTACAG ATAAATTTTT TAATGCTATT TTTAGGATTT TTATATGAAA GTATTTAATG AAGTAGAAGG AAACTAGTTC GATCCAGTCT TTGATTAAAA GACTGTCTCA  GACTGATCCG GTCTTCCTTG TCAGCTCGCC GGCGTTGTTG CAGTCGAGAT CACCGGGGGA CCCACCGTTG ACTTTGTCCC CGGCAGACCG GTGACGACTC CGCTCATCCG CAGTTGACTT  TTTCTGCAAT GGGTCGTGAA AAAAAACCCT TCTTTGACAG CGGCTTCCAC CATCCACCCC TCTTCTCTCA GGACTCGTTG AACTCCCCTG AAGAAGGAAG ACTCCCCGAT GCTAAGCAAG  GTTTATTTAC CTGCATTTGC TCTGAGGAAA TTTATGAATT TACGATAATA TAATTTCTCT CTCATCGCTT CGCGTCGTCG GGGACCCTGG GAACACGTCG GCCCATCACG TTATTGGGCT  GCATCCGGTC ACATTATTTC AGGTGCGGCC CACTTGAGGG TGGTCTTCGG TCGCATGGGT CTCTCCGACA AGGACATCGT GGCGCTCTCC GGCGGGCACA CGCTGGTGAT AACATAATAT  CTAATTAAAT TGAGGGTTTT TTTTCATAAA TTTACGTAAC AATTTCCCAA AATTGGAAGC ATATTTTGAA GACGAGCCTC TCCCTGCGTG AACTTGTCTA ACAGGGGCGG GCGCACGCAG  AGAGGTCGGG CTTTGACGGC CAGTGGACGC AGGACCCGCT CAGATTTGAC AACTCCTACT TCATGTGAGC TCATCCAAAG TCAACTCCAT CTTCCTCCCT CGCCTCTCTC TCATCATAAG  TCAACGCTGA CTCTCTGGGC TCTTCTAGAA ACCTGTTGGC CAGTGAAAAC GAGGGACTGC TGAAGCTGCC CACGGACAGA GCCCTGGTTG ACGACCCCGC ACTCCGGCGC TATGTTGAGC  TCTATTCCAA GGTATTAACC GCCATCGATC ATAAGAAAGA ACGGCCGAAT TTTCTCTTAT TGGTTTGACC CTGAGGCCCA GAAAAGGCCG GGTTTTAGCT ATCTCCTGGT CCGTTGACAT  CGCTAGGACA GGAGTCAACT TTTTCCGCCC TCTTTTTTGT AGCTTTTAGA TATATTGTAG TTGACTTATC GCCACTTGGG TCTGGCAGGA CGAGGAAGCG TTCTTCAGGG ACTACGCCGA  GTCGCACAAG AAGCTCTCCG AGCTGGGTTT CACTCCACCA AGCGCGGCCC GCTGGTTATG CGTTCAGGGT GCTCTTGGTG CCACCATTGC CGCCGCCATG GCTCTGAGCT TCTGCCTTGT  CTTTTACAGG AGAGCCAAGT AGATCTACCC TCCTCAATGG CTAATGAAAT CAGCTCTTCT CTCCCCAATA AACCCGGGAG CCTGATGGTG TTGGTTCCTG GACGGTGTGG CCTTGTTCTT 
GGAGGGACCC AGAGTCCCAT TCGAAGCTCA AGGTTGGCTA CTTACGGTGC TGA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
TGGCACGACG CCGGCACCTA CGACTCCAAA ACGGGCACCG GCGGCCCCAA CGGCTCCATT AGAAACGAGG CTGAGCTCCG GCACGCCGCC AACTCCGGCC TGAAGACAGC CGTTGACTTC  TGCTTGTCGG TGAAGGTCAA GTGCCCAAGA ATGTCCCATG CAGACCTCTT CCAGGTTATC CATCCCAACA AGCTCGCCGG CGTTGTTGCA GTCGAGATCA CCGGGGGACC CACCGTTGAC  TTTGACTCGT TGAACTCCCC TGAAGAAGGA AGACTCCCCG ATGCTAAGCA AGGTGCGGCC CACTTGAGGG TGGTCTTCGG TCGCATGGGT CTCTCCGACA AGGACATCGT GGCGCTCTCC  GGCGGGCACA CGCTGGGGCG GGCGCACGCA GAGAGGTCGG GCTTTGACGG CCAGTGGACG CAGGACCCGC TCAGATTTGA CAACTCCTAC TTCATAAACC TGTTGGCCAG TGAAAACGAG  GGACTGCTGA AGCTGCCCAC GGACAGAGCC CTGGTTGACG ACCCCGCACT CCGGCGCTAT GTTGAGCTCT ATTCCAAGGA CGAGGAAGCG TTCTTCAGGG ACTACGCCGA GTCGCACAAG  AAGCTCTCCG AGCTGGGTTT CACTCCACCA AGCGCGGCCC GCTGGTTATG CGTTCAGGGT GCTCTTGGTG CCACCATTGC CGCCGCCATG GCTCTGAGCT TCTGCCTTGT CTTTTACAGG 
AGAGCCAAGG ACCCAGAGTC CCATTCGAAG CTCAAGGTTG GCTACTTACG GTGCTGA 

Retrieve as FASTA