Entry information : GrPrx38 (Gorai.011G129900)
Entry ID 13268
Creation 2015-06-22 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2015-06-22 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Achraf Jemmat
Last annotation changes 2015-11-05 (Achraf Jemmat)
Peroxidase information: GrPrx38 (Gorai.011G129900)
Name (synonym) GrPrx38 (Gorai.011G129900)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx009]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Malvaceae Gossypium
Organism Gossypium raimondii    [TaxId: 29730 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value GrPrx38
start..stop
S start..stop
GhPrx38 640 0 1..323 1..323
EcamPrx23 525 0 28..323 24..319
EgrPrx23 525 0 28..323 24..319
EguPrx23 525 0 28..323 24..319
Literature and cross-references GrPrx38 (Gorai.011G129900)
Protein sequence: GrPrx38 (Gorai.011G129900)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   324 (294)
PWM (Da):   %s   33997.69 (30683.1) Transmb domain:   %s   i12-34o
PI (pH):   %s   7.93 (7.70) Peptide Signal:   %s   cut: 30 range:30-323
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MASETCSPSN KLRFLLGMVL FLLMNMTTAQ LSSTFYSTTC PKALATIKSA VNSAVSNEAR MGASLLRLHF HDCFVNGCDG SILLDDTANM TGEKTAVPNS NSVRGFEVID TIKSQVESLC  PGVVSCADIV AVAARDSVVA LGGPSWTVLL GRRDSTTASL SAANSNIPAP TLNLSGLITA FSNKGFTAKE MVALSGSHTI GQARCTTFRT RIYNETNIDS TFATSLRANC PSTGGDNSLS 
PLDTTSSTSF DNAYFKNLQG QKGLLHSDQQ LFSGGSTDSQ VNAYSSNLGS FTTDFANAMV KMGNLSPLTG TSGQIRTNCR KTN* 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic (3 introns).
Promoter
Send to BLAST
Send to cis Analysis
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
TTCTTTTCTA TTTCTATTAA ATTGAAATTA ATGCACAATT TTATTTGCCT ATTTCATCCC TGTTCATTTA CATTCCTTTA GAAATGGGGG CTTTTTACGG GCACACGTTG CTTGATTCAC  ATATCTTTAA CAAATCTAAA CCGATGCATA ACATTTAACT TGTAATTTTT TTTTTTTGCA ATAATCATTT TTGAATATCA AATTAAACAC TTTCAAATTG TATTGTTGTA GTAAAAAGCC  ATTTACTTAC ATATATTTTA GGGGGAATTA AGTCTTCTTA ATTTTATTTC TAAGAATTTA ATCTCTATTA TTTTAAAATG TAGATTCACA TTTAAAATTC TTATTTGTTT ATGTATAAAA  ATCCTAATAT TCCCACAATC ATGAACTATT TTATTTGATC CAATCAAGAA GGTCTGTTTA TTATATGCAC CAGCATTACA TGCTTCTCCT CACGCAATTT ACAGATTTAA CAATTTCTTT  ACAAAATATT CATTGTCCCT CTTCAATGCT TAACAACTAC TAAGCAATTA TTATATATTC TTTCTTGTTT AGGTTATAAT GGACAAATAC CATCTTCTAC GACAATTTTT TTCTATTACT  GCATCCTAAA AAAAATTAAA GTGAATGTGG GATGCCATCA CTTTTAGCAA GAGGAATGAA TCCATTGGGT TTGGTTGGAT GAGAATGTAT TTATTACAAT TGAACTACAT TTACTAGTGT  TTTTTTATTT ATTATATGTC AAAAATATTA CTAGTTTTTA CAATCTTAAT TTTTTTATTA AACGTATAAC TAAACATTAA TACATTTTTT AATGAACACA CACACACACA AAAAAAACTA  GTTAATTAGA TAAATTTTGT AATAATTATT GTACAATGTA CATTAAGCGG TGGTGATAAA ATATACGTAC TTTTAAGGTT ATCAAGTATT GAATTTGAAA TCAAACCTTT AGTAATGAAT  AGAATTAGAG ATAGAAAGCT GTTTTATTTC TATTTTAAAG TTAAAACATT CTTTTATATT TTTGTATTTT TTATTTTAAG TAAAATATAT TCGTAAAAAT TTTGGTCTTA ATTAATATTT  TTTTTATCAC TTTAGTCCTC AATATTTAAA TTTAATTTAG TCTTTCTTAA ATATTTTAAT TTTTTTTAAA AAAGAATTTG TAAACATTTT GTATATTTTT TTAATAATTT AAAAGTACAT  GTGAGCTATT AAATAAGCTA TGAGATTTTT ACATAAAATT TGAACTACAT CTCCCTTGCT GCTTATTAAA GCAGTCGCCA CCACCGATCT TGATAATTTA ACAACTCCAG AGTCTGTAAT  TTCCACATTG AGGAGCTGCT TTTCCTAAAA ACAAATCGTT ATAGCAATTT TTTGTTTCAA ATTGATGAGC AGAATTTGCT CAAGTTTTGT CATCATAAAA TACAAACTCC GGCATGACAT  GATTTTCAAC TACTGTTATC GAATCTAGCA ACCCGCATAA TATATATATA TATATATATA TATATATGTT TATTGGCTGG AAAAAAAAAC CCTTTAATTT GATCTGCTTT TTCTGGGGTA  CAAACAACAA GAAAACACAG GTCAACAAGA AGGAAGTGGT GGGACAACAC GGTTTTGGTA TTTTCTTTAT TTCTTATTTT TAACTTTACT TTTTTTACGT TGAATTTAAA ACAAAAATGA  GATATGGTTT ATAATAATAA AAAATAAAGT AATTTTAAAA CAAAACAAAA CAAAACATTA TAATTGGCTC GGATATGCTT TAATTCTTAC ATAGTGTTTG TAGAGGAACA GGACAGATCC  TTGATTTGTA TATTCAATGA TTTTAGCTGT CACCCAAATT AACCCATTCT TTACTTGTAA AACAGTTCAT CCCCCTCCTC TAAGGCATGT AGGTCTATAT AAATAGAGCA ATTCCTCAAC 
ATCTATATAA TCACCTCTAT ACTTGAACCC TTACTTTGCT ATACATTCCT TTTTTTGATT TGTTGCCAAT TTGTTATCC 

Retrieve as FASTA  
Terminator +
Send to BLAST
Send to cis Analysis
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATCCCCCCCT GCCCCTTTTT TGTTTATATT CCCCATTTTG TATACTTTAC TATTTATCGG AATAAATGCA TAATTTAATG CTGTTCTCGT GATTTCTGGT GTAACTTATC AAATTGTTAT  ATTTCCTAAC TTTATGTACA AAATAAATTA TATTATTATA ATAGTATTTT TATTGTATAT TTTAATCAAA TTAATTAAAA ATAATAATTA AAATATTTTT ATGTACAAAA TAAATTATAT  TATTATAATG GTATTTTTAT TGTATATTTT AATAAAATTA ATTAAAAAAA TTCATATATA AAAAGATTTG AACTCATGAC AGTAGTATTT ATAGAATCTC AATTTTATCA CTTTAGTCAA  AACTTTATCT TTATTTCAAT TTTGATATAA TTTTTAAGTT CTTTACACAT GAAAAAAAAA TCACTCACAT GGTTATATCT CTACTAACTT TAAACCTCTG ATTGAGTTGG TATCATAATT  TAATCGGACA TCAACTCGAT TGGAGAAATG TTTGAAATAT CATTTTATAT ACAAAATAAT TCGTAACATT TTAACGTAAT ATAAAAAAAT TGAAACACAA ATCGAAAAGT AATTGAGGTT  TATTTAATAT TTTTAATCAA ATATATTTAT TTATTACAAT TTTTTTACTC ACAATCTAAA ATATATATGT TTTTATTATT AATTTTAAAT ACTATTTTTT AAAGTTGATT GAATATTATT  TTTAAACACC AACTTTTATT CTAAATGTGT GACATAATTA CTAATATATA TATCTATATA TATATAAAAG CTGATTATTA GAGTAGAATA ATTAGGTTCA TTCAAATCAG ACAAAGCCCA  TCTGTCACTC CAAATGGGTT GAAGAAAGAC CCATGAATTA TGTGGGTGAT GTCCTCATCA TTTGAGCCAA GCTTCTCCAA TATTGACCAT GATTGGATCA ATTTTATTTT ATTTACCAAT 
AAACTAGTTG TAATCCTCTT TCTTAGACCA TGCTTTCTTA 

Retrieve as FASTA  
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCTTCCG AAACTTGTTC CCCTTCTAAC AAGTTGAGAT TCCTCCTAGG AATGGTTTTA TTTCTTCTTA TGAATATGAC CACTGCCCAG TTGTCCTCTA CCTTTTATTC AACAACATGC  CCTAAAGCAC TTGCCACCAT TAAATCAGCA GTCAACTCTG CTGTGTCCAA TGAAGCTCGC ATGGGGGCTT CTTTGCTTCG TCTTCATTTC CACGATTGCT TTGTCAATGC AAGTCGTCTT  TTCTTTTCTT TTAATGAGTT CCATTTGCAT GTCTGTAATG ATGAAATTTA TATTCTGGAA TTCGGTTATT ATTACTACTA CAAAAGATAC AAAACAAAAA ATGTCTTGAC CGACAGTCAA  CACAACATAT GATTGCTATT TTAGATGCCA TCATTTTTTA CTGTGTCAGA GACATTAGAA AAACTTGCTG CATGATTGTT TAGTTAAAAC AATTTATTCA TTTAAATATA GTATATTAAA  AAAACCCTTG TTTTATTCTT TTGTAATTTT GCATGCCGTC ATCATTTCAC GTTTGCTTTT GAGAGATGTT ACAGATGCGT CCGATGTTTT TACATATTTG GAGATACTCG TATATCAAAC  ACAAATTGCA CCATAAACTT AAAATTCATG TTTAGGAACA TGATTCTAAC GGTCCAGACA AATGAAGCAT AAAACTTTAT GAGCTCTGCT ACGTAGAGAA CGCAGGGTAT TTCGTAATAA  CTATTCATCC ACAATCTGTA AATAGTTTAG ACAAAAAAGT ATTTGACTTT GAACAAAACA AAAGCTGGGA AATGGTTTTA AAGAATCTAG CTAACATGAT CATGTATGAA ATAAAAGTTT  GTTATGTAAT GAATTGCAGG GATGCGATGG ATCCATACTG TTGGATGATA CAGCAAATAT GACAGGAGAA AAAACAGCTG TTCCAAACAG CAATTCAGTC AGGGGATTTG AAGTTATTGA  TACCATCAAA TCTCAGGTGG AGAGTTTGTG CCCTGGAGTT GTTTCTTGTG CTGATATTGT TGCAGTTGCT GCTCGTGATT CTGTTGTTGC TGTAAGTCAA ATGATCTTGG TTATTTTACG  GTTCTGTTCT CTTCGCTGCT GGAAAGGATA GTTCGAGCTA GAACTCGAAA TATGAAACCC GAGCTGGATC GAGTCTTAAT TTTATAATTT CGACTTGATT CGAGATAATA ATCAAACTGT  TCCAACTCAC TTGATTAGGC TTATTTAATT AATCAGAAAT GAGCTCAGTT TTCATGCTTC GATGCTTCTT TTTCCCAGCT TGGAGGGCCT AGTTGGACAG TTCTTTTGGG TAGAAGAGAT  TCAACCACTG CAAGCTTGAG TGCTGCTAAT TCCAACATCC CTGCGCCAAC TTTGAATCTT AGTGGTCTCA TCACTGCTTT TTCAAACAAA GGTTTCACTG CTAAAGAAAT GGTAGCCCTC  TCAGGTATAA CCATCAAAGA ACATATTCTT ACCAAATTCA TGCAAACATT AGAGGAAATG AATGATGTTA ATTTATGGGT TTAATTTGGT CAGGATCTCA CACCATCGGA CAAGCCAGGT  GCACCACTTT CCGGACAAGA ATCTACAATG AAACCAACAT CGACTCCACC TTCGCGACAT CGTTAAGAGC GAACTGCCCT AGCACTGGTG GAGACAACAG CCTGTCCCCA CTGGATACCA  CAAGCTCCAC ATCATTTGAC AATGCATATT TCAAGAATTT GCAGGGGCAG AAAGGGTTAT TACACTCTGA TCAACAACTA TTTAGTGGGG GTTCCACAGA TTCTCAGGTT AATGCTTATA 
GTTCCAACTT GGGATCTTTC ACCACAGATT TTGCTAATGC GATGGTAAAG ATGGGAAACC TTAGCCCACT CACTGGAACA AGCGGTCAAA TCAGAACGAA TTGCAGGAAA ACCAATTGA 

Retrieve as FASTA  
CDS
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.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCTTCCG AAACTTGTTC CCCTTCTAAC AAGTTGAGAT TCCTCCTAGG AATGGTTTTA TTTCTTCTTA TGAATATGAC CACTGCCCAG TTGTCCTCTA CCTTTTATTC AACAACATGC  CCTAAAGCAC TTGCCACCAT TAAATCAGCA GTCAACTCTG CTGTGTCCAA TGAAGCTCGC ATGGGGGCTT CTTTGCTTCG TCTTCATTTC CACGATTGCT TTGTCAATGG ATGCGATGGA  TCCATACTGT TGGATGATAC AGCAAATATG ACAGGAGAAA AAACAGCTGT TCCAAACAGC AATTCAGTCA GGGGATTTGA AGTTATTGAT ACCATCAAAT CTCAGGTGGA GAGTTTGTGC  CCTGGAGTTG TTTCTTGTGC TGATATTGTT GCAGTTGCTG CTCGTGATTC TGTTGTTGCT CTTGGAGGGC CTAGTTGGAC AGTTCTTTTG GGTAGAAGAG ATTCAACCAC TGCAAGCTTG  AGTGCTGCTA ATTCCAACAT CCCTGCGCCA ACTTTGAATC TTAGTGGTCT CATCACTGCT TTTTCAAACA AAGGTTTCAC TGCTAAAGAA ATGGTAGCCC TCTCAGGATC TCACACCATC  GGACAAGCCA GGTGCACCAC TTTCCGGACA AGAATCTACA ATGAAACCAA CATCGACTCC ACCTTCGCGA CATCGTTAAG AGCGAACTGC CCTAGCACTG GTGGAGACAA CAGCCTGTCC  CCACTGGATA CCACAAGCTC CACATCATTT GACAATGCAT ATTTCAAGAA TTTGCAGGGG CAGAAAGGGT TATTACACTC TGATCAACAA CTATTTAGTG GGGGTTCCAC AGATTCTCAG  GTTAATGCTT ATAGTTCCAA CTTGGGATCT TTCACCACAG ATTTTGCTAA TGCGATGGTA AAGATGGGAA ACCTTAGCCC ACTCACTGGA ACAAGCGGTC AAATCAGAAC GAATTGCAGG 
AAAACCAATT GA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
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.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
CATTATAATT GGCTCGGATA TGCTTTAATT CTTACATAGT GTTTGTAGAG GAACAGGACA GATCCTTGAT TTGTATATTC AATGATTTTA GCTGTCACCC AAATTAACCC ATTCTTTACT  TGTAAAACAG TTCATCCCCC TCCTCTAAGG CATGTAGGTC TATATAAATA GAGCAATTCC TCAACATCTA TATAATCACC TCTATACTTG AACCCTTACT TTGCTATACA TTCCTTTTTT  TGATTTGTTG CCAATTTGTT ATCCATGGCT TCCGAAACTT GTTCCCCTTC TAACAAGTTG AGATTCCTCC TAGGAATGGT TTTATTTCTT CTTATGAATA TGACCACTGC CCAGTTGTCC  TCTACCTTTT ATTCAACAAC ATGCCCTAAA GCACTTGCCA CCATTAAATC AGCAGTCAAC TCTGCTGTGT CCAATGAAGC TCGCATGGGG GCTTCTTTGC TTCGTCTTCA TTTCCACGAT  TGCTTTGTCA ATGGATGCGA TGGATCCATA CTGTTGGATG ATACAGCAAA TATGACAGGA GAAAAAACAG CTGTTCCAAA CAGCAATTCA GTCAGGGGAT TTGAAGTTAT TGATACCATC  AAATCTCAGG TGGAGAGTTT GTGCCCTGGA GTTGTTTCTT GTGCTGATAT TGTTGCAGTT GCTGCTCGTG ATTCTGTTGT TGCTCTTGGA GGGCCTAGTT GGACAGTTCT TTTGGGTAGA  AGAGATTCAA CCACTGCAAG CTTGAGTGCT GCTAATTCCA ACATCCCTGC GCCAACTTTG AATCTTAGTG GTCTCATCAC TGCTTTTTCA AACAAAGGTT TCACTGCTAA AGAAATGGTA  GCCCTCTCAG GATCTCACAC CATCGGACAA GCCAGGTGCA CCACTTTCCG GACAAGAATC TACAATGAAA CCAACATCGA CTCCACCTTC GCGACATCGT TAAGAGCGAA CTGCCCTAGC  ACTGGTGGAG ACAACAGCCT GTCCCCACTG GATACCACAA GCTCCACATC ATTTGACAAT GCATATTTCA AGAATTTGCA GGGGCAGAAA GGGTTATTAC ACTCTGATCA ACAACTATTT  AGTGGGGGTT CCACAGATTC TCAGGTTAAT GCTTATAGTT CCAACTTGGG ATCTTTCACC ACAGATTTTG CTAATGCGAT GGTAAAGATG GGAAACCTTA GCCCACTCAC TGGAACAAGC  GGTCAAATCA GAACGAATTG CAGGAAAACC AATTGAATCC CCCCCTGCCC CTTTTTTGTT TATATTCCCC ATTTTGTATA CTTTACTATT TATCGGAATA AATGCATAAT TTAATGCTGT 
TCTCGTGATT TCTGGTGTAA CTTATCAAAT TGTTATATTT CCTAACTTTA TGTACAAAAT AAATTATATT ATTATAATAG TATTTTTA 

Retrieve as FASTA