Entry information : GrPrx10 (Gorai.004G093200)
Entry ID 13271
Creation 2015-06-23 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2015-06-23 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Achraf Jemmat
Last annotation changes 2015-11-05 (Achraf Jemmat)
Peroxidase information: GrPrx10 (Gorai.004G093200)
Name (synonym) GrPrx10 (Gorai.004G093200)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx003]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Malvaceae Gossypium
Organism Gossypium raimondii    [TaxId: 29730 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value GrPrx10
start..stop
S start..stop
GhPrx10 710 0 1..347 1..347
PtPrx01 478 8e-171 11..347 9..345
PkPrx03 475 7e-170 11..347 10..347
PtPrx98 471 2e-168 11..347 9..348
Literature and cross-references GrPrx10 (Gorai.004G093200)
Protein sequence: GrPrx10 (Gorai.004G093200)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   348 (319)
PWM (Da):   %s   37414.42 (34286.8)  
PI (pH):   %s   4.6 (4.57) Peptide Signal:   %s   cut: 29 range:29-347
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MPEKMACFQY IVAALCFAVL LEGSLSKAQL TPTFYDETCP NVTAIIRHVL VNASFSDPRI GASLIRLHFH DCFVQGCDAS ILLDDPVNGE KEAIPNNNSA RGYEVIDAMK AALESACPNT  VSCADILAIA SEQSVSTLAG GPSWAVPLGR RDGFTANRTL ANSNLPGFNN TLDRLKNRFS NVGLNTSIDL VALSGAHTFG RAQCLTFTSR LYNFTGVGDT DPTLNTTYLE ELRQICPQGG 
NSSVLTNLDP TTPDGFDNNY FTNLQVNRGL LRSDQNLFST EGADTIEIVN RFSSNQTAFF ESFVESMIRM GNISPLTGTE GEIRSNCRAV NSATIRSNSD AALVSSI* 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequnec from genomic (3 introns).
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGCCTGAGA AAATGGCTTG TTTTCAATAT ATAGTAGCTG CTCTATGCTT TGCAGTTTTA CTTGAGGGAT CGTTATCAAA AGCTCAACTG ACCCCGACAT TTTACGATGA AACATGCCCA  AACGTGACAG CCATTATCCG ACATGTGCTC GTGAATGCTT CGTTTTCAGA TCCAAGGATT GGTGCCAGTC TCATCAGGCT TCACTTCCAT GATTGTTTTG TTCAAGTAAA ACAATCTTTA  ACACATGGTC ATTTGTTTAT TTTTTCGATT ACAGTCACCG CAGTCAAATT GAAAAAAAAA TTGTTTTTTT TTTTAAAAAG ACACCTTGTG TTTGTTTTCA GGGATGTGAT GCGTCGATTT  TATTGGACGA TCCTGTAAAT GGTGAGAAAG AAGCTATTCC AAATAATAAT TCAGCTAGGG GTTATGAAGT TATTGATGCC ATGAAGGCTG CCTTAGAGAG TGCTTGCCCC AACACTGTTT  CCTGCGCTGA TATTCTCGCT ATTGCATCTG AGCAATCTGT CAGCACTCTG GTAAGTAATT TATTAAAATT AGTTCAGTAC AATACAACAA ATCTGGTCTA AAATTAGTTC ATGATTGCAG  GCAGGCGGTC CTTCATGGGC AGTTCCACTA GGAAGAAGGG ATGGGTTCAC AGCAAACCGG ACACTCGCCA ACTCAAACTT GCCAGGTTTC AACAATACTC TCGACCGATT AAAGAACAGG  TTTAGCAATG TGGGGCTTAA CACCAGCATT GATCTAGTAG CCTTGTCTGG TAATCTTTCT TTATTTGCCT GAAATAACCA AAAGTATACA TTAAGGTCCT TTTTACTGTG ACAAGGTGTG  ACTTTTTTAC TTTTTTTTTG GATGTCAGGT GCTCACACAT TTGGCAGAGC TCAGTGTTTA ACTTTTACCA GTCGATTGTA CAATTTTACG GGAGTGGGTG ATACAGATCC GACCTTGAAC  ACCACATACT TGGAAGAACT ACGCCAAATA TGCCCACAGG GTGGAAATAG TAGTGTGTTG ACAAATCTTG ATCCCACAAC ACCTGATGGT TTCGACAATA ACTACTTCAC GAATCTACAA  GTTAATCGAG GCTTGCTTCG AAGCGATCAG AATTTATTTT CGACTGAGGG TGCTGATACA ATTGAAATTG TGAATAGGTT TAGTAGTAAT CAAACAGCTT TCTTCGAAAG CTTTGTGGAA  TCTATGATCA GAATGGGAAA TATAAGCCCT TTAACTGGTA CGGAAGGAGA AATTAGATCA AATTGCCGCG CCGTGAATTC AGCAACTATC AGATCCAACT CAGATGCTGC TCTCGTCAGC 
TCAATATAA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGCCTGAGA AAATGGCTTG TTTTCAATAT ATAGTAGCTG CTCTATGCTT TGCAGTTTTA CTTGAGGGAT CGTTATCAAA AGCTCAACTG ACCCCGACAT TTTACGATGA AACATGCCCA  AACGTGACAG CCATTATCCG ACATGTGCTC GTGAATGCTT CGTTTTCAGA TCCAAGGATT GGTGCCAGTC TCATCAGGCT TCACTTCCAT GATTGTTTTG TTCAAGGATG TGATGCGTCG  ATTTTATTGG ACGATCCTGT AAATGGTGAG AAAGAAGCTA TTCCAAATAA TAATTCAGCT AGGGGTTATG AAGTTATTGA TGCCATGAAG GCTGCCTTAG AGAGTGCTTG CCCCAACACT  GTTTCCTGCG CTGATATTCT CGCTATTGCA TCTGAGCAAT CTGTCAGCAC TCTGGCAGGC GGTCCTTCAT GGGCAGTTCC ACTAGGAAGA AGGGATGGGT TCACAGCAAA CCGGACACTC  GCCAACTCAA ACTTGCCAGG TTTCAACAAT ACTCTCGACC GATTAAAGAA CAGGTTTAGC AATGTGGGGC TTAACACCAG CATTGATCTA GTAGCCTTGT CTGGTGCTCA CACATTTGGC  AGAGCTCAGT GTTTAACTTT TACCAGTCGA TTGTACAATT TTACGGGAGT GGGTGATACA GATCCGACCT TGAACACCAC ATACTTGGAA GAACTACGCC AAATATGCCC ACAGGGTGGA  AATAGTAGTG TGTTGACAAA TCTTGATCCC ACAACACCTG ATGGTTTCGA CAATAACTAC TTCACGAATC TACAAGTTAA TCGAGGCTTG CTTCGAAGCG ATCAGAATTT ATTTTCGACT  GAGGGTGCTG ATACAATTGA AATTGTGAAT AGGTTTAGTA GTAATCAAAC AGCTTTCTTC GAAAGCTTTG TGGAATCTAT GATCAGAATG GGAAATATAA GCCCTTTAAC TGGTACGGAA 
GGAGAAATTA GATCAAATTG CCGCGCCGTG AATTCAGCAA CTATCAGATC CAACTCAGAT GCTGCTCTCG TCAGCTCAAT ATAA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
CGTGAATAAG CTGCCAACCA CCTTTGTCCG TCTATAAATG AAGATGATTT AAGATTCTGA AACTCACCTT CCATCTCATT TAAACTAAAT ACAGGAGTCA TTTGTTTTGG GGGAATGCCT  GAGAAAATGG CTTGTTTTCA ATATATAGTA GCTGCTCTAT GCTTTGCAGT TTTACTTGAG GGATCGTTAT CAAAAGCTCA ACTGACCCCG ACATTTTACG ATGAAACATG CCCAAACGTG  ACAGCCATTA TCCGACATGT GCTCGTGAAT GCTTCGTTTT CAGATCCAAG GATTGGTGCC AGTCTCATCA GGCTTCACTT CCATGATTGT TTTGTTCAAG GATGTGATGC GTCGATTTTA  TTGGACGATC CTGTAAATGG TGAGAAAGAA GCTATTCCAA ATAATAATTC AGCTAGGGGT TATGAAGTTA TTGATGCCAT GAAGGCTGCC TTAGAGAGTG CTTGCCCCAA CACTGTTTCC  TGCGCTGATA TTCTCGCTAT TGCATCTGAG CAATCTGTCA GCACTCTGGC AGGCGGTCCT TCATGGGCAG TTCCACTAGG AAGAAGGGAT GGGTTCACAG CAAACCGGAC ACTCGCCAAC  TCAAACTTGC CAGGTTTCAA CAATACTCTC GACCGATTAA AGAACAGGTT TAGCAATGTG GGGCTTAACA CCAGCATTGA TCTAGTAGCC TTGTCTGGTG CTCACACATT TGGCAGAGCT  CAGTGTTTAA CTTTTACCAG TCGATTGTAC AATTTTACGG GAGTGGGTGA TACAGATCCG ACCTTGAACA CCACATACTT GGAAGAACTA CGCCAAATAT GCCCACAGGG TGGAAATAGT  AGTGTGTTGA CAAATCTTGA TCCCACAACA CCTGATGGTT TCGACAATAA CTACTTCACG AATCTACAAG TTAATCGAGG CTTGCTTCGA AGCGATCAGA ATTTATTTTC GACTGAGGGT  GCTGATACAA TTGAAATTGT GAATAGGTTT AGTAGTAATC AAACAGCTTT CTTCGAAAGC TTTGTGGAAT CTATGATCAG AATGGGAAAT ATAAGCCCTT TAACTGGTAC GGAAGGAGAA  ATTAGATCAA ATTGCCGCGC CGTGAATTCA GCAACTATCA GATCCAACTC AGATGCTGCT CTCGTCAGCT CAATATAATA TTTGCTGAAC TGAAGGCTAA GAAAAATGGG CAGAAGAGAA  GCTATTTTCC TACTCAAAAT CAAAACGAAT AATATATTGT AACTCTTTAA TGCCTACAAT AAAACCCTAC GACGTTTGTT GATTTACAAA AACTATTTTC TGTAACTTTT TGTGTTTATT 
ACTTAGAAGT TAATATAAAA TAAGTTTAAG AGTTGAAATC TTGATTTATC 

Retrieve as FASTA