Entry information : HvuNAnPrx02
Entry ID 13334
Creation 2015-08-03 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2015-08-03 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2016-02-23 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: HvuNAnPrx02
Name HvuNAnPrx02
Class Other non animal peroxidase    [Orthogroup: NAnPrx003]
Taxonomy Eukaryota Metazoa Cnidaria Hydrozoa Hydridae Hydra
Organism Hydra vulgaris    [TaxId: 6087 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value HvuNAnPrx02
start..stop
S start..stop
HvuNAnPrx10 531 0 1..342 54..395
HvuNAnPrx09 524 0 1..341 1..341
HvuNAnPrx04 498 2e-178 1..355 1..356
HvuNAnPrx08 492 5e-177 39..342 2..305
Gene structure Fichier Exons
ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize
N° 1 7013..8086 1074  
complement(join(7013..8086))


exon

Literature and cross-references HvuNAnPrx02
DNA ref. GenBank:   NW_004180599.1 (8065..6992)
mRNA ref. GenBank:   XM_002163229.3
Cluster/Prediction ref. Genebank:   100206471
Protein sequence: HvuNAnPrx02
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   358 (338)
PWM (Da):   %s   40135.42 (37876.2)  
PI (pH):   %s   7.47 (7.44) Peptide Signal:   %s   cut: 20 range:20-357
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
MVMLTGIWFA TLLLTHTMAT QIIPTFEDFE RAKTDLLTLI ESVKLNRDLP MIAGCVRLIF HDCIGKDNCD GCIDHTHSGN RGLKITSDRL DALYDASYKG KISRADFYAL AAVVALTRST  VDAPVKYLGL KYFKVGRKDC ETSPNQIQSI DPPFGTDGTH KTFEFFKNVF GFNIREAVTI LGGHTLGRCR LENTGFVGTF VDEQFSTVPP GPDTLAPTSV LDNAYYRMFI DIVPWIQVTI 
NGTRKQWQVP NRPIPNDKLP EFERTTLLLN SDMANSWIIT PTDENGAVSC TPTSESIPCQ HSLAHRYSVQ FARNNALWVK EFTKVFARMT ELNQNVLVDA PTAPMLKIKP YVKNYYK* 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic (no intron).
DNA
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGGTTATGT TAACTGGAAT TTGGTTTGCT ACGTTGTTGT TGACGCATAC AATGGCAACT CAAATCATAC CAACGTTTGA AGATTTTGAA CGTGCAAAAA CCGATCTTTT AACATTGATC  GAATCTGTTA AATTAAATAG AGATTTACCC ATGATTGCTG GCTGTGTTCG TTTAATTTTT CACGATTGTA TTGGTAAAGA TAATTGCGAT GGATGTATCG ATCACACGCA CAGTGGTAAC  AGAGGGTTAA AAATAACATC GGATCGCCTT GATGCTTTAT ATGATGCGTC TTATAAAGGA AAAATTTCCA GAGCAGATTT TTACGCTTTA GCTGCTGTTG TTGCTCTAAC TAGGTCGACA  GTTGATGCTC CAGTAAAATA CTTAGGATTA AAATACTTTA AAGTTGGCAG AAAAGATTGT GAAACATCCC CTAATCAAAT TCAAAGTATT GATCCACCAT TTGGCACCGA CGGTACACAT  AAAACTTTTG AATTTTTCAA AAACGTATTT GGCTTTAATA TAAGAGAAGC TGTGACAATT TTAGGAGGAC ACACGCTAGG AAGATGTAGG TTGGAAAACA CTGGTTTTGT AGGGACTTTT  GTAGATGAAC AATTTTCAAC AGTTCCTCCG GGCCCAGACA CTTTAGCACC AACAAGCGTT CTTGACAATG CTTATTATAG AATGTTCATT GATATTGTAC CATGGATACA AGTTACAATC  AATGGAACAA GAAAACAATG GCAGGTACCA AATCGCCCAA TACCCAATGA TAAATTGCCT GAGTTTGAAA GAACTACTTT ACTTTTAAAC TCAGATATGG CAAACTCTTG GATCATAACG  CCAACCGATG AAAACGGAGC GGTTTCTTGC ACTCCAACTT CAGAATCGAT TCCTTGTCAA CATTCGTTAG CTCATCGATA TTCTGTTCAA TTCGCACGTA ACAATGCGTT GTGGGTAAAA 
GAATTTACAA AAGTTTTTGC TCGCATGACC GAGTTAAATC AAAATGTTTT AGTTGATGCT CCAACTGCAC CTATGTTAAA AATTAAACCC TATGTTAAAA ATTATTACAA GTAA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGGTTATGT TAACTGGAAT TTGGTTTGCT ACGTTGTTGT TGACGCATAC AATGGCAACT CAAATCATAC CAACGTTTGA AGATTTTGAA CGTGCAAAAA CCGATCTTTT AACATTGATC  GAATCTGTTA AATTAAATAG AGATTTACCC ATGATTGCTG GCTGTGTTCG TTTAATTTTT CACGATTGTA TTGGTAAAGA TAATTGCGAT GGATGTATCG ATCACACGCA CAGTGGTAAC  AGAGGGTTAA AAATAACATC GGATCGCCTT GATGCTTTAT ATGATGCGTC TTATAAAGGA AAAATTTCCA GAGCAGATTT TTACGCTTTA GCTGCTGTTG TTGCTCTAAC TAGGTCGACA  GTTGATGCTC CAGTAAAATA CTTAGGATTA AAATACTTTA AAGTTGGCAG AAAAGATTGT GAAACATCCC CTAATCAAAT TCAAAGTATT GATCCACCAT TTGGCACCGA CGGTACACAT  AAAACTTTTG AATTTTTCAA AAACGTATTT GGCTTTAATA TAAGAGAAGC TGTGACAATT TTAGGAGGAC ACACGCTAGG AAGATGTAGG TTGGAAAACA CTGGTTTTGT AGGGACTTTT  GTAGATGAAC AATTTTCAAC AGTTCCTCCG GGCCCAGACA CTTTAGCACC AACAAGCGTT CTTGACAATG CTTATTATAG AATGTTCATT GATATTGTAC CATGGATACA AGTTACAATC  AATGGAACAA GAAAACAATG GCAGGTACCA AATCGCCCAA TACCCAATGA TAAATTGCCT GAGTTTGAAA GAACTACTTT ACTTTTAAAC TCAGATATGG CAAACTCTTG GATCATAACG  CCAACCGATG AAAACGGAGC GGTTTCTTGC ACTCCAACTT CAGAATCGAT TCCTTGTCAA CATTCGTTAG CTCATCGATA TTCTGTTCAA TTCGCACGTA ACAATGCGTT GTGGGTAAAA 
GAATTTACAA AAGTTTTTGC TCGCATGACC GAGTTAAATC AAAATGTTTT AGTTGATGCT CCAACTGCAC CTATGTTAAA AATTAAACCC TATGTTAAAA ATTATTACAA GTAA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
TTTAGTCATG GTTATGTTAA CTGGAATTTG GTTTGCTACG TTGTTGTTGA CGCATACAAT GGCAACTCAA ATCATACCAA CGTTTGAAGA TTTTGAACGT GCAAAAACCG ATCTTTTAAC  ATTGATCGAA TCTGTTAAAT TAAATAGAGA TTTACCCATG ATTGCTGGCT GTGTTCGTTT AATTTTTCAC GATTGTATTG GTAAAGATAA TTGCGATGGA TGTATCGATC ACACGCACAG  TGGTAACAGA GGGTTAAAAA TAACATCGGA TCGCCTTGAT GCTTTATATG ATGCGTCTTA TAAAGGAAAA ATTTCCAGAG CAGATTTTTA CGCTTTAGCT GCTGTTGTTG CTCTAACTAG  GTCGACAGTT GATGCTCCAG TAAAATACTT AGGATTAAAA TACTTTAAAG TTGGCAGAAA AGATTGTGAA ACATCCCCTA ATCAAATTCA AAGTATTGAT CCACCATTTG GCACCGACGG  TACACATAAA ACTTTTGAAT TTTTCAAAAA CGTATTTGGC TTTAATATAA GAGAAGCTGT GACAATTTTA GGAGGACACA CGCTAGGAAG ATGTAGGTTG GAAAACACTG GTTTTGTAGG  GACTTTTGTA GATGAACAAT TTTCAACAGT TCCTCCGGGC CCAGACACTT TAGCACCAAC AAGCGTTCTT GACAATGCTT ATTATAGAAT GTTCATTGAT ATTGTACCAT GGATACAAGT  TACAATCAAT GGAACAAGAA AACAATGGCA GGTACCAAAT CGCCCAATAC CCAATGATAA ATTGCCTGAG TTTGAAAGAA CTACTTTACT TTTAAACTCA GATATGGCAA ACTCTTGGAT  CATAACGCCA ACCGATGAAA ACGGAGCGGT TTCTTGCACT CCAACTTCAG AATCGATTCC TTGTCAACAT TCGTTAGCTC ATCGATATTC TGTTCAATTC GCACGTAACA ATGCGTTGTG  GGTAAAAGAA TTTACAAAAG TTTTTGCTCG CATGACCGAG TTAAATCAAA ATGTTTTAGT TGATGCTCCA ACTGCACCTA TGTTAAAAAT TAAACCCTAT GTTAAAAATT ATTACAAGTA 

Retrieve as FASTA