Entry information : CsRboh01 (orange1.1g002259m,Cs5g02940.1)
Entry ID 13472
Creation 2015-12-09 (Qiang Li)
Last sequence changes 2015-12-10 (Qiang Li)
Sequence status complete
Reviewer Qiang Li
Last annotation changes 2018-05-18 (Qiang Li)
Peroxidase information: CsRboh01 (orange1.1g002259m,Cs5g02940.1)
Name (synonym) CsRboh01 (orange1.1g002259m,Cs5g02940.1)
Class Respiratory burst oxidase homolog    [Orthogroup: Rboh001]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Rutaceae Citrus
Organism Citrus sinensis    [TaxId: 2711 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value CsRboh01
start..stop
S start..stop
CclRboh01 1958 0 1..946 1..946
PtRboh03 1678 0 1..946 1..948
PtRboh02 1651 0 1..946 1..949
GmRboh12 1619 0 1..946 1..941
Literature and cross-references CsRboh01 (orange1.1g002259m,Cs5g02940.1)
Protein sequence: CsRboh01 (orange1.1g002259m,Cs5g02940.1)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   947
PWM (Da):   %s   107405.47 Transmb domain:   %s   o385-404i524-546o566-588i745-762o
PI (pH):   %s   9.75
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MRGSASHQRR WASDTVPGRA VVSSASSPGT ESNSAEEYVE VTIDLQDDDT IVLRSVEPAP PHVLSIEDGA GAGSETPSSA SLSPSIKRSS SNKLRHFSQE LKAEAVAKAK QFSQELKAEL  RRFSWSHGQA SRVLSASTSS SAQNGNGFDS ALAARALRKQ RAQLDRTRSG AQKALRGLRF ISNSSKTNGV DAWNEVQSNF NKLAKGGFLY RADFAQCIGM RDSKEFALEL FDALSRRRRL  KVDKISREEL YEYWSQITDQ SFDSRLQIFF DMVDKNEDGR IAEEEVKEII MLSASANKLS RLKEQAEEYA ALIMEELDPE GLGYIELWQL ETLLLQKDTY LNYSQALSYT SQALSQNLQG  LRKKNRIKRM STEFLYYLQE NWRRLWVLSL WILIMIGLFT WKFFQYKHKD AFHVMGYCLL TAKGAAETLK FNMALILLPV CRNTITWLRS TRLGFFVPFD DNINFHKTIA AAIVVGVILH  VGNHLACDFP RLISSSESDY HRYLSSSFGK HKPTYWDLVK GAEGITGILM VIFMAIAFIL ATRWFRRNLI KLPKPFDRLT GFNAFWYSHH LFVIVYILLI VHGILLFLVH KWYLKTTWMY  LAVPVLAYAG ERTLRFFRSG FSTVRLLKVA IYPGNVLTLQ MSRPPQFRYK SGQYMFVQCP AVSPFEWHPF SITSAPGDDY LSVHIRQLGD WTQELKRVFS EACEPPVAGK SGLLRADETT  KKSLPKLLID GPYGAPAQDY RNYDVLLLVG LGIGATPFIS ILKDLLNNIV KQEEQADSVS DFSRRSDNSV GSNDSNTNRV SPKRKKALKT TNAYFYWVTR EQGSFDWFKG VMNEVAELDQ 
RGVIEMHNYL TSVYEEGDAR SALITMVQAL NHAKNGVDIV SGTRVRTHFA RPNWKKVLSK LSSKHCNARI GVFYCGAPVL AKELSKLCYE FNQKGSTKFE FHKEHF* 

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Remarks Complete sequence from genomic.
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAGAGGCT CAGCCAGTCA CCAGCGCCGG TGGGCCTCCG ATACTGTTCC CGGACGGGCG GTGGTGAGTT CGGCGTCTTC ACCGGGAACT GAGTCTAACT CGGCAGAGGA ATATGTTGAG  GTTACAATTG ATCTTCAAGA CGATGATACA ATTGTCCTTA GAAGCGTCGA GCCGGCGCCA CCTCATGTGC TTAGCATCGA GGACGGAGCC GGAGCTGGAA GTGAGACTCC GTCGTCGGCC  TCTCTATCGC CATCCATAAA ACGAAGCTCG TCGAATAAGT TGAGACATTT TTCGCAAGAG CTAAAGGCGG AAGCAGTGGC AAAAGCGAAG CAATTCTCGC AGGAGCTGAA AGCCGAGCTG  AGGAGGTTCT CTTGGAGCCA TGGACAGGCT TCTCGCGTGC TCTCGGCTTC AACTTCCTCG TCAGCACAGA ATGGCAATGG ATTCGACTCG GCTTTAGCGG CTCGAGCTTT GAGAAAGCAG  CGTGCTCAGC TGGACCGGAC CCGGTCCGGC GCCCAGAAGG CTCTTCGTGG ATTGAGGTTC ATAAGTAATA GTAGTAAAAC AAACGGCGTC GACGCATGGA ATGAAGTTCA AAGTAATTTT  AATAAGCTTG CCAAGGGCGG CTTTCTCTAT CGTGCCGATT TCGCACAATG CATAGGTTCT TCTCATATCC GCCCGCTTTT TTTTTTTCAT TTTTCGGTTA ACCTCGCTTT AATCAACGCT  TTGATAATTA AAATTTTTGT TCGTATTATA ATCACAGGAA TGAGAGATTC TAAAGAGTTT GCATTGGAGC TTTTTGATGC TTTAAGTAGG AGAAGAAGAT TAAAAGTTGA CAAGATTAGC  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ACAGGAGTTT TTTACTGTGG AGCACCAGTT TTGGCTAAAG AACTCAGCAA ACTTTGCTAT GAGTTCAATC AGAAAGGCTC TACCAAGTTT GAATTCCATA AAGAACACTT CTAA 

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CDS
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.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAGAGGCT CAGCCAGTCA CCAGCGCCGG TGGGCCTCCG ATACTGTTCC CGGACGGGCG GTGGTGAGTT CGGCGTCTTC ACCGGGAACT GAGTCTAACT CGGCAGAGGA ATATGTTGAG  GTTACAATTG ATCTTCAAGA CGATGATACA ATTGTCCTTA GAAGCGTCGA GCCGGCGCCA CCTCATGTGC TTAGCATCGA GGACGGAGCC GGAGCTGGAA GTGAGACTCC GTCGTCGGCC  TCTCTATCGC CATCCATAAA ACGAAGCTCG TCGAATAAGT TGAGACATTT TTCGCAAGAG CTAAAGGCGG AAGCAGTGGC AAAAGCGAAG CAATTCTCGC AGGAGCTGAA AGCCGAGCTG  AGGAGGTTCT CTTGGAGCCA TGGACAGGCT TCTCGCGTGC TCTCGGCTTC AACTTCCTCG TCAGCACAGA ATGGCAATGG ATTCGACTCG GCTTTAGCGG CTCGAGCTTT GAGAAAGCAG  CGTGCTCAGC TGGACCGGAC CCGGTCCGGC GCCCAGAAGG CTCTTCGTGG ATTGAGGTTC ATAAGTAATA GTAGTAAAAC AAACGGCGTC GACGCATGGA ATGAAGTTCA AAGTAATTTT  AATAAGCTTG CCAAGGGCGG CTTTCTCTAT CGTGCCGATT TCGCACAATG CATAGGAATG AGAGATTCTA AAGAGTTTGC ATTGGAGCTT TTTGATGCTT TAAGTAGGAG AAGAAGATTA  AAAGTTGACA AGATTAGCAG AGAAGAGCTT TACGAGTACT GGTCACAAAT CACCGATCAA AGCTTTGATT CTCGGCTTCA GATCTTCTTC GATATGGTCG ACAAGAACGA AGATGGAAGA  ATCGCGGAGG AGGAAGTAAA AGAGATTATT ATGTTAAGTG CTTCTGCCAA TAAGTTATCA AGATTGAAGG AGCAAGCAGA AGAATACGCA GCTTTGATAA TGGAAGAGCT AGATCCCGAA  GGACTTGGAT ACATAGAGCT ATGGCAATTG GAGACGCTTT TGCTACAAAA GGACACGTAT CTGAACTACA GCCAAGCGCT GAGCTACACT AGCCAAGCTT TGAGCCAAAA CTTACAAGGC  TTGAGAAAAA AGAACAGAAT CAAAAGAATG AGCACGGAGT TTCTGTATTA TCTGCAAGAG AATTGGCGAA GGCTTTGGGT ATTGTCACTG TGGATTTTGA TTATGATCGG GTTATTTACA  TGGAAGTTTT TCCAATACAA ACACAAAGAT GCTTTTCATG TAATGGGTTA TTGTCTTCTC ACGGCCAAGG GTGCAGCAGA GACCTTAAAA TTCAACATGG CTCTAATTCT TTTGCCTGTT  TGTAGAAATA CAATTACGTG GCTTAGGTCC ACCAGGTTGG GTTTCTTTGT GCCTTTTGAC GACAACATCA ACTTTCATAA GACAATAGCT GCAGCAATTG TAGTCGGTGT AATTCTGCAT  GTCGGGAACC ATCTCGCATG TGATTTCCCA AGGCTAATAA GCTCTTCAGA AAGTGACTAC CATCGGTATC TGAGTTCGTC TTTTGGAAAA CATAAACCCA CATACTGGGA CCTTGTCAAA  GGGGCAGAAG GTATTACAGG AATTCTTATG GTCATATTCA TGGCAATTGC ATTCATTTTA GCAACTCGTT GGTTCAGAAG GAACCTCATT AAGCTGCCAA AGCCCTTCGA TAGGCTCACT  GGTTTCAATG CTTTCTGGTA TTCACACCAT TTGTTCGTCA TTGTCTATAT TCTGCTCATC GTCCACGGCA TATTACTTTT CCTCGTTCAC AAATGGTACC TAAAGACGAC ATGGATGTAT  CTTGCTGTTC CTGTTCTTGC GTATGCTGGA GAAAGGACCC TGCGATTTTT TCGTTCTGGC TTTTCTACTG TCAGGCTTCT AAAGGTCGCA ATATATCCTG GAAATGTTCT CACATTGCAA  ATGTCAAGGC CTCCACAATT TCGGTACAAG AGCGGACAGT ACATGTTTGT TCAGTGTCCT GCTGTGTCTC CATTCGAGTG GCATCCATTT TCTATCACAT CTGCTCCTGG TGATGACTAC  CTTAGTGTTC ACATCCGGCA GTTAGGTGAC TGGACTCAAG AGCTTAAAAG GGTATTTTCT GAGGCCTGTG AGCCTCCTGT AGCTGGGAAA AGTGGGCTGC TCAGGGCTGA TGAAACAACA  AAGAAAAGTC TGCCAAAGCT CTTAATAGAT GGGCCTTATG GTGCCCCGGC ACAAGACTAC CGAAATTATG ATGTCCTGCT TCTAGTTGGT CTTGGGATTG GAGCAACACC CTTCATCAGC  ATTCTGAAGG ATCTGCTTAA CAACATTGTG AAACAGGAGG AACAAGCTGA TTCTGTGTCA GATTTCAGTA GGAGATCAGA CAATAGTGTT GGAAGCAATG ATTCTAACAC CAACAGGGTT  TCTCCAAAGC GGAAAAAGGC TCTGAAGACC ACCAATGCTT ACTTCTACTG GGTAACTAGG GAGCAAGGCT CATTTGATTG GTTCAAAGGT GTCATGAATG AAGTTGCAGA GCTTGATCAG  AGGGGTGTCA TTGAGATGCA CAACTACTTG ACTAGTGTGT ATGAGGAAGG TGATGCCAGA TCAGCTCTAA TCACAATGGT TCAAGCTCTT AATCATGCCA AGAACGGAGT TGACATTGTT  TCTGGCACTA GGGTGAGAAC CCATTTTGCA AGGCCTAATT GGAAGAAGGT TCTGTCTAAA TTAAGTTCAA AGCACTGCAA TGCCAGGATT GGAGTTTTTT ACTGTGGAGC ACCAGTTTTG 
GCTAAAGAAC TCAGCAAACT TTGCTATGAG TTCAATCAGA AAGGCTCTAC CAAGTTTGAA TTCCATAAAG AACACTTCTA A 

Retrieve as FASTA